Repositório RCAAP

Apathy in presymptomatic genetic frontotemporal dementia predicts cognitive decline and is driven by structural brain changes

Introduction: Apathy adversely affects prognosis and survival of patients with frontotemporal dementia (FTD). We test whether apathy develops in presymptomatic genetic FTD, and is associated with cognitive decline and brain atrophy. Methods: Presymptomatic carriers of MAPT, GRN or C9orf72 mutations (N = 304), and relatives without mutations (N = 296) underwent clinical assessments and MRI at baseline, and annually for 2 years. Longitudinal changes in apathy, cognition, gray matter volumes, and their relationships were analyzed with latent growth curve modeling. Results: Apathy severity increased over time in presymptomatic carriers, but not in non-carriers. In presymptomatic carriers, baseline apathy predicted cognitive decline over two years, but not vice versa. Apathy progression was associated with baseline low gray matter volume in frontal and cingulate regions. Discussion: Apathy is an early marker of FTD-related changes and predicts a subsequent subclinical deterioration of cognition before dementia onset. Apathy may be a modifiable factor in those at risk of FTD.

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2025-10-28T12:20:21Z

Creators

Malpetti, Maura Jones, P. Simon Tsvetanov, Kamen A. Rittman, Timothy Swieten, John C. Borroni, Barbara Sanchez‐Valle, Raquel Moreno, Fermin Laforce, Robert Graff, Caroline Synofzik, Matthis Galimberti, Daniela Masellis, Mario Tartaglia, Maria Carmela Finger, Elizabeth Vandenberghe, Rik Mendonça, Alexandre de Tagliavini, Fabrizio Santana, Isabel Ducharme, Simon Butler, Chris R. Gerhard, Alexander Levin, Johannes Danek, Adrian Otto, Markus Frisoni, Giovanni B. Ghidoni, Roberta Sorbi, Sandro Heller, Carolin Todd, Emily G. Bocchetta, Martina Cash, David M. Convery, Rhian S. Peakman, Georgia Moore, Katrina M. Rohrer, Jonathan D. Kievit, Rogier A. Rowe, James B. GENFI - Genetic Frontotemporal dementia Initiative

Caracterização das águas subterrâneas e dos seus percursos na Colina do Castelo: contributo para a valorização do património hidrogeológico

A Colina do Castelo, onde se inclui Alfama, é uma zona da cidade de Lisboa rica em recursos hidrológicos, frios e termais, que foram aproveitados ao longo dos tempos pelas populações e onde se encontram identificadas dezenas de estruturas de abastecimento de águas de diferentes tipologias. No âmbito do presente trabalho caracterizam-se diferentes tipos de águas subterrâneas ocorrentes em Alfama e as suas origens, identificando os seus percursos e as estruturas de captação e adução. Especial atenção é dada às nascentes conhecidas como águas termais de Alfama. É feita uma proposta de geopercurso pelas águas de Alfama e estruturas associadas, bem como uma descrição cuidada de cada emergência, contribuindo para o conhecimento hidrogeológico, histórico e cultural da Colina do Castelo. A metodologia utilizada ao longo deste trabalho consistiu na recolha de informação sobre os recursos hídricos, inventariação dos pontos de água subterrânea e estruturas associadas. Através da análise de logs de sondagens geotécnicas e dos registos do nível piezométrico foram identificadas asformações mais permeáveis e definido o sentido de fluxo subterrâneo nos sistemas aquíferos identificados. Foi realizada amostragem para identificação da atual composição fisicoquímica e da composição isotópica das águas subterrâneas de Alfama, nomeadamente das águas termais. As águas amostradas apresentam condutividade elétrica entre 641,8 µS/cm e 1 648 µS/cm, com pH variando de 6,75 a 8,40 e temperatura entre 18,4 ºC e 21,2 ºC. As águas identificadas como antigas nascentes termais têm atualmente temperatura inferior a 21,2 ºC, mais baixa do que o intervalo de temperaturas de 24 ºC a 34 ºC apontado por diversos autores, por se encontrarem misturadas com outras águassubsuperfíciais. As águas amostradas apresentam fácies cloretada a bicarbonatada, com algum sulfato, e de sódica a cálcica. A composição em isótopos estáveis reflete origem meteórica distinguindo-se apenas a água da cisterna no Museu do Fado que reflete forte enriquecimento em isótopos pesados. As águas amostradas não apresentam qualidade para serem utilizadas para consumo humano, dada a sua forte mineralização e a sua contaminação por nitratos. No entanto, as menos mineralizadas podem ser utilizadas para outros fins menos nobres, sendo assim possível a sua reutilização. Embora com menor temperatura na emergência, as nascentes conhecidas como termais podem, em profundidade, corresponder a um recurso hidrotermal, hidromineral e geotérmico importante. O geopercurso proposto pelas águas de Alfama e estruturas associadas, na forma de um folheto intitulado “Percursos de água em Alfama”, passa por sítios de grande interesse hidrogeológico, histórico e cultural, tais como o Chafariz d’El Rei, o Chafariz de Dentro, o Poço da Capela de N. Sra. dos Remédios e atual Museu do Fado.

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2025-10-28T12:24:33Z

Creators

Brás, Filipa Pedro

Determinação da inclinação e orientação de módulos fotovoltaicos a partir da sua produção

Os sistemas fotovoltaicos de pequena escala representam uma fatia considerável de toda a produção PV. Porém, na maior parte das vezes apenas é reportada a sua produção e não se tem em conta muitos dos parâmetros importantes para descrever o seu desempenho. A orientação e inclinação dos módulos são dois desses parâmetros e o objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia para os determinar a partir dos dados de geração do sistema fotovoltaico, sem necessidade de inspeção física. A produção de energia fotovoltaica depende em primeira aproximação da irradiação solar, o que permite estimar a orientação a partir do ângulo de azimute na hora do pico de produção. Por outro lado, a inclinação está associada ao ângulo de incidência para o qual a forma da curva de geração fotovoltaica melhor se aproxima da irradiação solar direta em dias de céu limpo. Neste trabalho foram utilizados dados de três módulos do mesmo modelo instalados com a mesma orientação mas com inclinações diferentes: vertical, inclinação ótima e horizontal; os módulos estão localizados na cidade de Faro e medidos no ano de 2014. Foi aplicado para cada dia um filtro de céu limpo baseado num modelo sinusoidal do percentil 90 de 15 dias anteriores de medições que formam a curva de produção fotovoltaica diária sem interferência meteorológica. Em seguida, procedeu-se à determinação da orientação e inclinação dos módulos em estudo. Os resultados sugerem que a orientação dos módulos é estimada com maior precisão do que a inclinação, apresentando menores taxas de erro relativamente a dados com medições entre 1 e 5 minutos. A estimativa de orientação apresenta resultados precisos com menos de um mês de dados enquanto que para a inclinação são necessários pelo menos seis meses de medições.

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2025-10-28T12:13:20Z

Creators

Antunes, Rodrigo Miguel Lopes

EmoEEG - recognising people's emotions using electroencephalography

As emoções desempenham um papel fulcral na vida humana, estando envolvidas numa extensa variedade de processos cognitivos, tais como tomada de decisão, perceção, interações sociais e inteligência. As interfaces cérebro-máquina (ICM) são sistemas que convertem os padrões de atividade cerebral de um utilizador em mensagens ou comandos para uma determinada aplicação. Os usos mais comuns desta tecnologia permitem que pessoas com deficiência motora controlem braços mecânicos, cadeiras de rodas ou escrevam. Contudo, também é possível utilizar tecnologias ICM para gerar output sem qualquer controle voluntário. A identificação de estados emocionais é um exemplo desse tipo de feedback. Por sua vez, esta tecnologia pode ter aplicações clínicas tais como a identificação e monitorização de patologias psicológicas, ou aplicações multimédia que facilitem o acesso a músicas ou filmes de acordo com o seu conteúdo afetivo. O interesse crescente em estabelecer interações emocionais entre máquinas e pessoas, levou à necessidade de encontrar métodos fidedignos de reconhecimento emocional automático. Os autorrelatos podem não ser confiáveis devido à natureza subjetiva das próprias emoções, mas também porque os participantes podem responder de acordo com o que acreditam que os outros responderiam. A fala emocional é uma maneira eficaz de deduzir o estado emocional de uma pessoa, pois muitas características da fala são independentes da semântica ou da cultura. No entanto, a precisão ainda é insuficiente quando comparada com outros métodos, como a análise de expressões faciais ou sinais fisiológicos. Embora o primeiro já tenha sido usado para identificar emoções com sucesso, ele apresenta desvantagens, tais como o fato de muitas expressões faciais serem "forçadas" e o fato de que as leituras só são possíveis quando o rosto do sujeito está dentro de um ângulo muito específico em relação à câmara. Por estes motivos, a recolha de sinais fisiológicos tem sido o método preferencial para o reconhecimento de emoções. O uso do EEG (eletroencefalograma) permite-nos monitorizar as emoções sentidas sob a forma de impulsos elétricos provenientes do cérebro, permitindo assim obter uma ICM para o reconhecimento afetivo. O principal objetivo deste trabalho foi estudar a combinação de diferentes elementos para identificar estados afetivos, estimando valores de valência e ativação usando sinais de EEG. A análise realizada consistiu na criação de vários modelos de regressão para avaliar como diferentes elementos afetam a precisão na estimativa de valência e ativação. Os referidos elementos foram os métodos de aprendizagem automática, o género do indivíduo, o conceito de assimetria cerebral, os canais de elétrodos utilizados, os algoritmos de extração de características e as bandas de frequências analisadas. Com esta análise foi possível criarmos o melhor modelo possível, com a combinação de elementos que maximiza a sua precisão. Para alcançar os nossos objetivos, recorremos a duas bases de dados (AMIGOS e DEAP) contendo sinais de EEG obtidos durante experiências de desencadeamento emocional, juntamente com a autoavaliação realizada pelos respetivos participantes. Nestas experiências, os participantes visionaram excertos de vídeos de conteúdo afetivo, de modo a despoletar emoções sobre eles, e depois classificaram-nas atribuindo o nível de valência e ativação experienciado. Os sinais EEG obtidos foram divididos em epochs de 4s e de seguida procedeu-se à extração de características através de diferentes algoritmos: o primeiro, segundo e terceiro parâmetros de Hjorth; entropia espectral; energia e entropia de wavelets; energia e entropia de FMI (funções de modos empíricos) obtidas através da transformada de Hilbert-Huang. Estes métodos de processamento de sinal foram escolhidos por já terem gerado resultados bons noutros trabalhos relacionados. Todos estes métodos foram aplicados aos sinais EEG dentro das bandas de frequência alfa, beta e gama, que também produziram bons resultados de acordo com trabalhos já efetuados. Após a extração de características dos sinais EEG, procedeu-se à criação de diversos modelos de estimação da valência e ativação usando as autoavaliações dos participantes como “verdade fundamental”. O primeiro conjunto de modelos criados serviu para aferir quais os melhores métodos de aprendizagem automática a utilizar para os testes vindouros. Após escolher os dois melhores, tentámos verificar as diferenças no processamento emocional entre os sexos, realizando a estimativa em homens e mulheres separadamente. O conjunto de modelos criados a seguir visou testar o conceito da assimetria cerebral, que afirma que a valência emocional está relacionada com diferenças na atividade fisiológica entre os dois hemisférios cerebrais. Para este teste específico, foram consideradas a assimetria diferencial e racional segundo pares de elétrodos homólogos. Depois disso, foram criados modelos de estimação de valência e ativação considerando cada um dos elétrodos individualmente. Ou seja, os modelos seriam gerados com todos os métodos de extração de características, mas com os dados obtidos de um elétrodo apenas. Depois foram criados modelos que visassem comparar cada um dos algoritmos de extração de características utilizados. Os modelos gerados nesta fase incluíram os dados obtidos de todos os elétrodos, já que anteriormente se verificou que não haviam elétrodos significativamente melhores que outros. Por fim, procedeu-se à criação dos modelos com a melhor combinação de elementos possível, otimizaram-se os parâmetros dos mesmos, e procurámos também aferir a sua validação. Realizámos também um processo de classificação emocional associando cada par estimado de valores de valência e ativação ao quadrante correspondente no modelo circumplexo de afeto. Este último passo foi necessário para conseguirmos comparar o nosso trabalho com as soluções existentes, pois a grande maioria delas apenas identificam o quadrante emocional, não estimando valores para a valência e ativação. Em suma, os melhores métodos de aprendizagem automática foram RF (random forest) e KNN (k-nearest neighbours), embora a combinação dos melhores métodos de extração de características fosse diferente para os dois. KNN apresentava melhor precisão considerando todos os métodos de extração menos a entropia espectral, enquanto que RF foi mais preciso considerando apenas o primeiro parâmetro de Hjorth e a energia de wavelets. Os valores dos coeficientes de Pearson obtidos para os melhores modelos otimizados ficaram compreendidos entre 0,8 e 0,9 (sendo 1 o valor máximo). Não foram registados melhoramentos nos resultados considerando cada género individualmente, pelo que os modelos finais foram criados usando os dados de todos os participantes. É possível que a diminuição da precisão dos modelos criados para cada género seja resultado da menor quantidade de dados envolvidos no processo de treino. O conceito de assimetria cerebral só foi útil nos modelos criados usando a base de dados DEAP, especialmente para a estimação de valência usando as características extraídas segundo a banda alfa. Em geral, as nossas abordagens mostraram-se a par ou mesmo superiores a outros trabalhos, obtendo-se valores de acurácia de 86.5% para o melhor modelo de classificação gerado com a base de dados AMIGOS e 86.6% usando a base de dados DEAP.

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2025-10-28T12:21:41Z

Creators

Galvão, Filipe Miguel Dias

Inter- and intraspecific variation of spider mite susceptibility to fungal infections: Implications for the long-term success of biological control

Spider mites are severe pests of several annual and perennial crops worldwide, often causing important economic damages. As rapid evolution of pesticide resistance in this group hampers the efficiency of chemical control, alternative control strategies, such as the use of entomopathogenic fungi, are being developed. However, while several studies have focused on the evaluation of the control potential of different fungal species and/or isolates as well as their compatibility with other control methods (e.g., predators or chemical pesticides), knowledge on the extent of inter- and intraspecific variation in spider mite susceptibility to fungal infection is as yet incipient. Here, we measured the mortality induced by two generalist fungi, Beauveria bassiana and Metarhizium brunneum, in 12 spider mite populations belonging to different Tetranychus species: T. evansi, T. ludeni, and T. urticae (green and red form), within a full factorial experiment. We found that spider mite species differed in their susceptibility to infection by both fungal species. Moreover, we also found important intraspecific variation for this trait. These results draw caution on the development of single strains as biocontrol agents. Indeed, the high level of intraspecific variation suggests that (a) the one-size-fits-all strategy may fail to control spider mite populations and (b) hosts resistance to infection may evolve at a rapid pace. Finally, we propose future directions to better understand this system and improve the long-term success of spider mite control strategies based on entomopathogenic fungi.

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2025-10-28T12:29:40Z

Creators

Zélé, Flore Altıntaş, Mustafa Santos, Inês Cakmak, Ibrahim Magalhães, sara

Population‐specific effect of Wolbachia on the cost of fungal infection in spider mites

Many studies have revealed the ability of the endosymbiotic bacterium Wolbachia to protect its arthropod hosts against diverse pathogens. However, as Wolbachia may also increase the susceptibility of its host to infection, predicting the outcome of a particular Wolbachia-host-pathogen interaction remains elusive. Yet, understanding such interactions and their eco-evolutionary consequences is crucial for disease and pest control strategies. Moreover, how natural Wolbachia infections affect artificially introduced pathogens for biocontrol has never been studied. Tetranychus urticae spider mites are herbivorous crop pests, causing severe damage on numerous economically important crops. Due to the rapid evolution of pesticide resistance, biological control strategies using entomopathogenic fungi are being developed. However, although spider mites are infected with various Wolbachia strains worldwide, whether this endosymbiont protects them from fungi is as yet unknown. Here, we compared the survival of two populations, treated with antibiotics or naturally harboring different Wolbachia strains, after exposure to the fungal biocontrol agents Metarhizium brunneum and Beauveria bassiana. To control for potential effects of the bacterial community of spider mites, we also compared the susceptibility of two populations naturally uninfected by Wolbachia, treated with antibiotics or not. In one population, Wolbachia-infected mites had a better survival than uninfected ones in absence of fungi but not in their presence, whereas in the other population Wolbachia increased the mortality induced by B. bassiana. In one naturally Wolbachia-uninfected population, the antibiotic treatment increased the susceptibility of spider mites to M. brunneum, but it had no effect in the other treatments. These results suggest that natural Wolbachia infections may not hamper and may even improve the success of biological control using entomopathogenic fungi. However, they also draw caution on the generalization of such effects, given the complexity of within-host-pathogens interaction and the potential eco-evolutionary consequences of the use of biocontrol agents for Wolbachia-host associations.

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2025-10-28T12:13:20Z

Creators

Zélé, Flore Altıntaş, Mustafa Santos, Inês Cakmak, Ibrahim Magalhães, S

Next‐generation biological control: the need for integrating genetics and genomics

Biological control is widely successful at controlling pests, but effective biocontrol agents are now more difficult to import from countries of origin due to more restrictive international trade laws (the Nagoya Protocol). Coupled with increasing demand, the efficacy of existing and new biocontrol agents needs to be improved with genetic and genomic approaches. Although they have been underutilised in the past, application of genetic and genomic techniques is becoming more feasible from both technological and economic perspectives. We review current methods and provide a framework for using them. First, it is necessary to identify which biocontrol trait to select and in what direction. Next, the genes or markers linked to these traits need be determined, including how to implement this information into a selective breeding program. Choosing a trait can be assisted by modelling to account for the proper agro-ecological context, and by knowing which traits have sufficiently high heritability values. We provide guidelines for designing genomic strategies in biocontrol programs, which depend on the organism, budget, and desired objective. Genomic approaches start with genome sequencing and assembly. We provide a guide for deciding the most successful sequencing strategy for biocontrol agents. Gene discovery involves quantitative trait loci analyses, transcriptomic and proteomic studies, and gene editing. Improving biocontrol practices includes marker-assisted selection, genomic selection and microbiome manipulation of biocontrol agents, and monitoring for genetic variation during rearing and post-release. We conclude by identifying the most promising applications of genetic and genomic methods to improve biological control efficacy.

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2025-10-28T12:25:26Z

Creators

Leung, Kelley Ras, Erica Ferguson, Kim B. Ariëns, Simone Babendreier, Dirk Bijma, Piter Bourtzis, Kostas Brodeur, Jacques Bruins, Margreet A. Centurión, Alejandra Chattington, Sophie R. Chinchilla‐Ramírez, Milena Dicke, Marcel Fatouros, Nina E. González‐Cabrera, Joel Groot, Thomas V. M. Haye, Tim Knapp, Markus Koskinioti, Panagiota Le Hesran, Sophie Lyrakis, Manolis Paspati, Angeliki Pérez‐Hedo, Meritxell Plouvier, Wouter N. Schlötterer, Christian Stahl, Judith M. Thiel, Andra Urbaneja, Alberto Zande, Louis Verhulst, Eveline C. Vet, Louise E. M. Visser, Sander Werren, John H. Xia, Shuwen Zwaan, Bas J. Magalhaes, S Beukeboom, Leo W. Pannebakker, Bart A.

The distribution of herbivores between leaves matches their performance only in the absence of competitors

Few studies have tested how plant quality and the presence of competitors interact in determining how herbivores choose between different leaves within a plant. We investigated this in two herbivorous spider mites sharing tomato plants: Tetranychus urticae, which generally induces plant defenses, and Tetranychus evansi, which suppresses them, creating asymmetrical effects on coinfesting competitors. On uninfested plants, both herbivore species preferred young leaves, coinciding with increased mite performance. On plants with heterospecifics, the mites did not prefer leaves on which they had a better performance. In particular, T. urticae avoided leaves infested with T. evansi, which is in agreement with T. urticae being outcompeted by T. evansi. In contrast, T. evansi did not avoid leaves with the other species, but distributed itself evenly over plants infested with heterospecifics. We hypothesize that this behavior of T. evansi may prevent further spread of T. urticae over the shared plant. Our results indicate that leaf age determines within-plant distribution of herbivores only in absence of competitors. Moreover, they show that this distribution depends on the order of arrival of competitors and on their effects on each other, with herbivores showing differences in behavior within the plant as a possible response to the outcome of those interactions.

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2025-10-28T12:26:46Z

Creators

Godinho, Diogo Janssen, Arne Li, Dan Cruz, Cristina Magalhaes, S

Existence and qualitative properties of solutions to nonlinear Schrödinger equations on metric graphs

Nesta dissertação é abordada a equação de Schrödinger não linear no contexto de grafos métricos. Em particular, são seguidos com grande detalhe os artigos de Adami R., Serra E., Tilli P., [NLS ground states on graphs, Calc. Var. (2015) 54:743–761] e [Threshold phenomena and existence results for NLS ground states on metric graphs, J. Funct. Anal. (2016) 271(I):201-223]. O foco destes artigos é a existência ou não existência de soluções de energia mínima, com massa fixa, para o funcional de energia da equação de Schrödinger com um fator não linear do tipo potência em grafos métricos.

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2025-10-28T12:22:21Z

Creators

Agostinho, Francisco Cristovão

Are reproductive barriers involved in the maintenance of a latitudinal cline?: insights from a set of populations of Drosophila subobscura adapting to a common environment

Speciation results from the evolution of reproductive isolation between populations. Reproductive barriers can evolve as a direct product of local adaptation, in which individuals discriminate to avoid less fit progeny, or as a by-product of such adaptation. Drosophila subobscura possesses fascinating latitudinal clines for several quantitative traits. However the neutral genetic differentiation among populations is low. Therefore, the maintenance of such clines suggests that reproductive barriers exist between populations. The main goal of the present work was to test whether reproductive barriers between populations from two extremes of the cline exist and, if so, if they decrease or increase over time when these populations invade a new common environment. For that we founded two populations of Drosophila subobscura from Adraga (Portugal) and Groningen (Netherlands). First, the initial differentiation and early adaptation in life-history traits of both populations were characterized. We found that during the first 11 generations the populations showed differences in several life-history traits. However, in general, the populations of both foundations did not exhibit temporal changes across generations. As for the reproductive barriers we found that at an early (fifth) generation, both populations demonstrated a (marginally significant) preference for assortative mating. However, hybrid breakdown was not detected among populations. Five generations later, assortative mating faded away, indicating a relaxation of the selective pressures in the new environment. This study was important as it suggests that, while pre-zygotic barriers may play a role in the maintenance of a latitudinal cline, they fade away quickly during adaptation in a novel, common environment. The study also revealed the need to add a temporal component to studies of reproductive isolation.

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2025-10-28T12:08:41Z

Creators

Bárbaro, Ana Margarida dos Santos, 1988-

The return of the trophic chain: Fundamental vs. realized interactions in a simple arthropod food web

The mathematical theory describing small assemblages of interacting species (community modules or motifs) has significantly improved our understanding of the emergent properties of ecological communities. It is not clear whether all interactions accounted for in such models will be realized in real communities. Here, we use community modules to experimentally explore whether the number of trophic links among species scales with community complexity (i.e. by adding species known to feed on each other from pairwise trials) in a simple mite community present in avocado orchards (Persea americana). By varying the presence of each of two predators (Euseius stipulatus and Neoseiulus californicus), one herbivore as shared prey (Oligonychus perseae) and pollen of Carpobrotus edulis as an alternative food resource, we mimicked communities with simple trophic chains, intraguild predation and/or apparent competition. We then assessed predation rates and the conversion of food into offspring in those communities. We found that increasing the number of potential interactions did not result in more complex realized community modules. Instead, all species effectively fed upon a single food item, hence all community modules actually corresponded to one or two linear trophic chains. Therefore, trophic links assumed to occur when species are assembled in pairs do not necessarily occur when other components of the community are present. Consequently, food web structure may be much less complex than predicted by theory.

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2025-10-28T12:20:34Z

Creators

Torres‐Campos, Inmaculada Magalhães, sara Moya‐Laraño, Jordi Montserrat, Marta

Spatial modelling of temporal dynamics in stream fish communities under anthropogenic change

Aim: Understanding temporal changes in aquatic communities is essential to address the freshwater biodiversity crisis. In particular, it is important to understand the patterns and drivers of spatial variation in local community dynamics, generalizing temporal trends from discrete locations to entire landscapes that are the main focus of management. Here, we present a framework for producing spatially continuous views of community dynamics, focusing on stream fish affected by hydropower development. Location: River Sabor, NE Portugal. Methods: We sampled stream fish at thirty sites between 2012 and 2019. Community trajectory analysis was used to quantify the directionality and velocity of community change, and the geometric resemblance of community trajectories between sites. Geostatistical models for stream networks were used to relate metrics describing community dynamics to environmental variables, while controlling for Euclidean and hydrologic spatial dependencies, and to map spatial variation in community dynamics across the watershed. Results: Trajectories in multivariate space underlined strong temporal dynamics, with local communities deviating and returning to previous states, but without evidence for directional changes. Accordingly, directionality values were low and not consistently affected by environmental variables. The velocity of community change varied markedly across the watershed and it was strongly affected by stream order and elevation, with faster changes observed in lowland streams draining into hydroelectric reservoirs and with a high proportion of exotic species. Pairwise distances between community trajectories were strongly related to hydrologic and environmental distances between sites. Main conclusions: Local stream fish communities were in a loose equilibrium across the watershed, but they fluctuated at a faster rate closer to a hydroelectric reservoir. Integrating community trajectory analysis and geostatistical modelling provides a relatively simple framework to understand how, where and why temporal community dynamics vary across dendritic stream networks and to visualize spatial patterns of community change over time in relation to anthropogenic impacts.

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2025-10-28T12:29:12Z

Creators

Mota‐Ferreira, Mário Filipe, Ana Filipa Magalhães, Maria Carona, Sara Beja, Pedro

Major inconsistencies of inferred population genetic structure estimated in a large set of domestic horse breeds using microsatellites

STRUCTURE remains the most applied software aimed at recovering the true, but unknown, population structure from microsatellite or other genetic markers. About 30% of structure-based studies could not be reproduced (Molecular Ecology, 21, 2012, 4925). Here we use a large set of data from 2,323 horses from 93 domestic breeds plus the Przewalski horse, typed at 15 microsatellites, to evaluate how program settings impact the estimation of the optimal number of population clusters Kopt that best describe the observed data. Domestic horses are suited as a test case as there is extensive background knowledge on the history of many breeds and extensive phylogenetic analyses. Different methods based on different genetic assumptions and statistical procedures (dapc, flock, PCoA, and structure with different run scenarios) all revealed general, broad-scale breed relationships that largely reflect known breed histories but diverged how they characterized small-scale patterns. structure failed to consistently identify Kopt using the most widespread approach, the ΔK method, despite very large numbers of MCMC iterations (3,000,000) and replicates (100). The interpretation of breed structure over increasing numbers of K, without assuming a Kopt, was consistent with known breed histories. The over-reliance on Kopt should be replaced by a qualitative description of clustering over increasing K, which is scientifically more honest and has the advantage of being much faster and less computer intensive as lower numbers of MCMC iterations and repetitions suffice for stable results. Very large data sets are highly challenging for cluster analyses, especially when populations with complex genetic histories are investigated.

Ano

2025-10-28T12:20:48Z

Creators

Funk, Stephan Michael Guedaoura, Sonya Juras, Rytis Raziq, Absul Landolsi, Faouzi Luís, Cristina Martínez, Amparo Martínez Musa Mayaki, Abubakar Mujica, Fernando Oom, Maria do Mar Ouragh, Lahoussine Stranger, Yves‐Marie Vega‐Pla, Jose Luis Cothran, Ernest Gus

Non-genetic inheritance: Evolution above the organismal level

No summary/description provided

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2025-10-28T12:10:34Z

Creators

Sukhoverkhov, Anton Gontier, Nathalie

Enfoques de investigación interdisciplinar: entre el Arte y la Filosofía de la Ciencia

Las últimas décadas del siglo XX fueron escenario de innumerables transformaciones a nivel epistémico (Khun, 1962; Feyerabend 1975). Lejos de la matriz axiomática reduccionista y logicista, los epistemólogos analizaron: 1) la diversidad de los modos de producción del conocimiento científico, 2) ampliaron la comprensión de lo que es el conocimiento y 3) teorizaron sobre las complejidades e interrelaciones, tanto en el interior de dominios específicos, como entre diferentes dominios. Surgieron naturalmente Filosofías de la Ciencia externalistas, interdisciplinarias y abiertas. Es en este contexto donde surgen un conjunto de investigaciones que cuestionan la posibilidad y naturaleza de la relación entre Arte y Ciencia. Desde aquellos las colocan en oposición, hasta aquellos que defienden la integración del campo tecnocientífico con el campo de las Humanidades y las Artes. En concreto, esta propuesta es una apuesta por el triángulo formado por el Arte Contemporáneo, la Física Contemporánea y la Filosofía. Esta investigación, desarrollada en el seno de un equipo interdisciplinar con sede en la Universidade de Lisboa, versa sobre el análisis del concepto de “relación” como vínculo entre la Filosofía de la Ciencia (Realismo Estructural Ontológico) y el Arte Contemporáneo. Es, igualmente, una tentativa de explorar cómo el Arte puede contribuir para la comprensión de las preocupaciones y desafíos de la Ciencia Contemporánea, próximos de la hipótesis de la obra de arte como metáfora epistemológica enunciada por U. Eco (1962). Este proyecto pretende complementar un programa de investigación que ha sido muy prolífico en los últimos años (el estudio de las relaciones entre Arte y Ciencia), contribuyendo para una mejor comprensión de este fenómeno, clarificando ambigüedades e imprecisiones. También es expectable que tanto el material publicado como el análisis crítico de la literatura contribuyan para el enriquecimiento de los programas de las disciplinas universitarias en “Ciencia y Arte” en el panorama internacional.

Ano

2025-10-28T12:22:21Z

Creators

Fuentes Cid, Sara Cordovil, João L

Reticulate evolution everywhere

No summary/description provided

Ano

2025-10-28T12:18:14Z

Creators

Gontier, Nathalie

Macroevolutionary issues and approaches in evolutionary Biology

No summary/description provided

Ano

2025-10-28T12:20:48Z

Creators

Gontier, Nathalie SERRELLI, EMANUELE

A tela orgânica: um estudo visual

This project discusses the practical and theoretical developments of the research “The Organic Screen: a visual study” initiated in the Master in Multimedia, Audiovisual Arts, Faculty of Fine Arts, University of Lisbon. It is a series of rehearsal films, which have as their subject organic matter and its possible poetics, visual narratives and reflective capacity - in a perspective focused on organic elements and their “imaginations”. From the concepts of haptic image and its tactility in contact relations between the skin of the film and the skin of the viewer, I seek logic for the image-time in a relationship of proximity and intimacy with nature, reproduced in three films presented here. Finally, the research seeks to glimpse the possibility of an image prior to language, against the logic of a cartesian view. The study of organicity as a new way of looking, building and understanding life, in images that seek to corrupt the boundaries of the screen.

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2025-10-28T12:18:41Z

Creators

Cosentino, Anna Clara

Reforma da Saúde Familiar em Portugal : avaliação da implantação

Primary healthcare in Portugal is undergoing a major reform, of which family health units (FHU) are one of the more visible results. This study aimed to evaluate the FHU implementation process from 2006 onwards. Methods from a previous study of primary healthcare implementation in Brazil were used. Dimensions studied included comprehensiveness of care, organization of care, and the political-institutional perspective. The main improvements identified included better availability of care, team work, technical quality of care, innovative management practices, sustainability of the model, working conditions and infrastructure improvements. Main challenges remaining include integration with hospital care, political and institutional gray areas, need for better information systems, integration within health centers and workflow organization. These data may be useful for management decision-makers when making adjustments and corrections in the reform process. Os cuidados de saúde primários de Portugal estão em processo de reforma, sendo as Unidades de Saúde Familiar (USF) uma das principais marcas desse processo. Este estudo teve como objectivo avaliar o processo de implantação das USF a partir de 2006. Utilizou-se metodologia de análise de implantação na mesma área de atenção primária em saúde de um estudo anterior no Brasil. Na análise foram empregadas as dimensões do cuidado integral, da organização dos cuidados e político-institucional. Evidenciaram-se como avanços principais a acessibilidade, trabalho em equipe, qualidade (técnico-científica) dos cuidados, inovações nas práticas de gestão, na sustentabilidade (condições de trabalho) e infraestrutura. Principais desafios: integração com especialidades hospitalares, indefinições político-institucionais, sistemas informatizados, integração nos centros de saúde e organização do processo de trabalho. Estes dados poderão vir a informar os decisores de gestão sobre correções a efetuar no processo de reforma.

Ano

2025-10-28T12:18:55Z

Creators

Rocha, Paulo de Medeiros Sá, Armando Brito de