Repositório RCAAP

Analisou-se as emissões de ozono troposférico, O3, históricas, num local de tráfego urbano da cidade de Lisboa em 2017 (rotunda de Entrecampos) e as suas causas e correlações com fatores climáticos (temperatura, radiação global e precipitação) e ambientais (concentrações de emissões primárias de NOX- óxidos de azoto). A análise dividiu-se em período escolar, fora do período escolar; por estações Verão, Outono, Inverno e Primavera; semana versus fins de semana; e, dia versus noite. Os dados coletados são horários, o que dá cerca de 8760 dados por parâmetro, ou seja, cerca de 61320 dados no total. Verificou-se que existe uma relação inversa entre as emissões de monóxido de azoto (NO) e de ozono (O3), para qualquer situação, independentemente do intervalo temporal estudado. Concluiu-se que, quer a nível do ciclo diário quer a nível sazonal as emissões de O3 são afetadas pelas emissões de NO e de NO2, sendo NO o poluente primário. Foram selecionados diversos horizontes temporais, tendo-se apurado que uma diminuição no tráfego e nas emissões de NOX implicou um aumento das emissões de ozono troposférico. Tal ocorreu com particular incidência aos fins-de-semana e em períodos de férias escolares. Constatou-se que a radiação e a temperatura também são causadoras de alterações na concentração de O3, havendo neste caso uma correspondência direta entre os fatores climáticos e as emissões do poluente. Tal observou-se de forma mais óbvia para qualquer ciclo diurno, quando comparados os valores de radiação global com os valores das emissões de ozono. Viu-se, contrariamente, que não há aparente relação entre a precipitação e as emissões do poluente (O3) estudado. Observou-se que os valores limite legais para os poluentes foram ultrapassados em poucas ocasiões durante o período considerado. Os valores de concentração máxima para O3 são cerca de 70 ppb e ocorreram no Verão, mais precisamente em Agosto, de dia num fim-de semana. Os valores mínimos (abaixo de 5 ppb) ocorreram principalmente em dias de semana de noite (geralmente de terça a sexta-feira) e na sua grande maioria nos meses de inverno e outono.

O Brexit tem provocado alguma incerteza nos mercados, nomeadamente no europeu. Muitos estudos, estimativas e especulações foram feitas sobre os impactos económicos, no investimento, em termos sociais e até políticos. No âmbito da minha atividade profissional numa instituição financeira (até setembro de 2019) tive a responsabilidade de acompanhar as dívidas soberanas numa ótica de apetência pelo risco bem como a concentração a este tipo de ativos, sabendo que este tema era também uma preocupação do Banco Central Europeu. O objetivo deste trabalho foi compreender melhor o evento Brexit e o impacto sobre as yields das dívidas soberanas europeias mais importantes com maturidade a 10 anos, nomeadamente, a Alemanha, Holanda, Reino Unido, Irlanda e Dinamarca. Os critérios de seleção foram a proximidade geográfica, importância na UE e alguns dos países periféricos que estiveram sujeitos a um plano de resgate recentemente (após a crise de 2012). Para isso foram utilizadas as yields trimestrais históricas bem como variáveis económico financeiras (dívida em % do PIB, taxas de desemprego e taxas interbancárias de referência), com objetivo de desenhar modelos que fossem capazes de reproduzir, de forma mais aproximada possível, a realidade e serem utilizados para forecasting. As variáveis foram analisadas no que respeita às correlações estática e dinâmica, estacionaridade, causalidades de Granger e cointegrações (por via do VECM) entre si, testes que foram realizados com o objetivo de selecionar as variáveis para um modelo. As conclusões foram que efetivamente existe uma correlação estática e de longo prazo entre algumas destas soberanias. Foram criados dois modelos, ambos estatisticamente significativos tendo incidido sobre duas principais soberanias: a alemã (que habitualmente é utilizada como benchmark da taxa de juro sem risco) e a do Reino Unido, naturalmente por ser a soberania sobre foco da discussão deste tema do Brexit. Não obstante, e pela informação analisada, reconhece-se que outras relações poderiam ser modelizadas. No final da dissertação, os dois modelos foram utilizados para exercício de forecasting e foram realizadas outras simulações com dados mais recentes, de modo a perceber como as yields alemã e inglesa se comportariam. Foi equacionada a inclusão neste trabalho outras dívidas soberanas (portuguesa, grega, espanhola e italiana) e outras maturidades (a 5 anos e 3 meses). Contudo, devido à dimensão limite da dissertação, foi decidido não incluir. No entanto, foi possível constatar que algumas yields possuíam comportamento semelhante ao que a dívida a 10 anos demonstrou pelo que acreditamos que seria matéria merecedora de uma análise similar à que foi realizada neste trabalho.

O caribu, Rangifer tarandus groenlandicus, é uma das treze subespécies de rena que habita as regiões circumpolares do hemisfério Norte, sendo nativa da Gronelândia. A maioria dos estudos de investigação feitos no passado foram, regra geral, de curta duração, limitados e frequentemente mal desenhados ou extremamente enviesados. Ao ser caçado há pelo menos 4000 anos, o caribu possui elevada importância para as populações locais. Como tal, métodos com maior eficiência e precisão precisam de ser considerados para que a informação e monitorização obtidas para esta subespécie sejam mais sólidas e robustas. Desde o início do milénio, o Instituto para os Recursos Naturais da Gronelândia (Greenland Institute for Natural Resources - GINR) tem vindo a melhorar as metodologias utilizadas no controlo e monitorização das espécies presentes na Gronelândia, sendo o caribu uma das espécies de foco. No Oeste da Gronelândia, local onde existem populações nativas de caribus, não existem predadores naturais, o que torna as próprias características populacionais inerentes desta subespécie, características do habitat e a atividade antropogénica nos principais fatores responsáveis pelo controlo da população. A partir do ano de 2000, o GINR tem feito estudos aéreos de monitorização periódica do R. t. groenlandicus. O intuito destes estudos é o de estimar a sua densidade e abundância nas regiões de interesse, obtendo assim um panorama geral da sua abundância, distribuição e relação com algumas covariáveis recolhidas. Posteriormente, os seus resultados são usados para auxiliar a gestão de outras atividades como a caça, construção, entre outras. Recorriam-se a vários métodos baseados em estudos mais antigos mas, mais recentemente, os métodos de amostragem por distâncias têm vindo a ganhar destaque na investigação ecológica, tanto pela sua aplicabilidade em múltiplas situações como pela precisão das estimativas fornecidas. Primeiramente foi feita uma análise exploratória dos dados. Esta revelou que foram detetados cerca de 5 000 caribus em grupos maioritariamente até 4 indivíduos e localizados na sub-área de Sisimiut. Também mostrou ser concordante com os resultados obtidos em estudos anteriores e sugeriu elevada precisão inerente à amostra observada. Posteriormente procedeu-se à aplicação de métodos de amostragem por distâncias e ajustamento de um modelo espacial. Os métodos de amostragem por distâncias são usados para a estimação da densidade e abundância de objetos de interesse com base na distância dos mesmos ao observador. Esse objeto de interesse pode ser um ser vivo como uma espécie de animal ou de planta, ou pistas produzidas pelos mesmos (maioritariamente em animais) como ninhos, carcaças, fezes ou até no campo quer no ar ou em alto-mar, se deslocam ao longo de um transeto ou permanecem estáticos num determinado ponto por um intervalo de tempo fixo, observando a área em redor. Sempre que um objeto de interesse, no caso deste estudo, caribus individuais ou em grupo, é detetado, as distâncias perpendiculares dos mesmos à linha central do transeto são medidas e registadas. Outras covariáveis consideradas importantes na deteção dos objetos de interesse também podem ser recolhidas no momento da amostragem e analisadas em conjunto com as distâncias osbervadas. Estas distâncias permitem depois estimar uma função de deteção, a partir da qual se pode obter uma estimativa da probabilidade de deteção dos objetos de interesse. Esta estimativa representa a proporção de objetos de interesse detetados durante a amostragem e a sua relação com a distância ao observador é expressa pela função de deteção. Posteriormente, pode-se estimar a densidade e abundância totais ou estratificadas em caso de existência de sub-áreas dentro da área em estudo, o que acontece neste projeto. Após a seleção do modelo de amostragem por distâncias mais apropriado à amostra recolhida, procedeu-se ao ajustamento de um modelo aditivo generalizado (Generalized Additive Model - GAM) para determinar o número de caribus estimado em cada quadrícula de 1.5 × 1.5, considerando a probabilidade de deteção estimada anteriormente e a influência de outras covariáveis ambientais georreferenciadas também recolhidas e de interesse a priori. As covariáveis ambientais consideradas neste projeto foram o aspeto geográfico, a elevação e o declive. Recorrendo aos resultados do GAM obtido, um modelo de densidade espacial (Density Surface Model - DSM) dos objetos de interesse foi determinado através da extrapolação para a região de estudo. Este modelo representa a distribuição dos caribus ao longo da região de estudo como função das várias covariáveis consideradas sob a forma de um mapa de gradiente de cor. Para complementar o DSM, também foi criado um segundo mapa de gradiente de cor onde cada quadrícula representa a incerteza associada a cada estimativa obtida no DSM. Relativamente à distribuição espacial estimada pelo DSM para a espécie de estudo, este prevê que o caribu se encontra maioritariamente na sub-área de Sisimiut e minoritariamente na sub-área de Angujaartorfiup Nunaa, como previsto pela especialista. De acordo com o modelo selecionado, em termos de densidade, os caribus aparentam preferir superfícies direcionadas para Sul em detrimento das direcionadas para Norte. Além disto, a espécie de estudo parece apresentar uma relação negativa com o aumento da elevação e do declive. Estes resultados são concordantes com os obtidos em estudos anteriores realizados na mesma altura do ano. Para o presente projeto, focado na região Norte do Oeste da Gronelândia, a análise de amostragem por distâncias estimou uma probabilidade de deteção média de 0.54 e uma estimativa de abundância com base no delineamento amostral de cerca de 60 469 (IC 95%: 51 932, 70 410) caribus em toda a região de estudo. A sub-área de Sisimiut apresentou o maior foco da população, seguida pelas sub-áreas Angujaartorfiup Nunaa e Sisimiut Sul, com estimativas de 46 724, 9 814 e 3 931 caribus, respetivamente. O DSM estimou uma abundância de cerca de 73 895 (IC 95%: 65 983, 82 757) caribus em toda a região Norte. É de notar que os intervalos de confiança se sobrepõem parcialmente, sugerindo que a diferença entre estas estimativas não é estatisticamente significativa. Em ambas as metodologias a incerteza associada às estimativas obtidas foi relativamente baixa, sendo um indicador de precisão e consistência dos mesmos. A diferença entre as estimativas de abundância pode ser justificada pelas características dos métodos aplicados. A amostragem por distâncias convencional é uma metodologia cuja extrapolação é design-based, o que significa que certas regiões ou características não amostradas ou mal representadas pelos transetos considerados não serão tidas em conta nas estimativas. Por outro lado, o GAM é uma abordagem model-based, considerando a informação sobre toda a região de estudo na modelação através das covariáveis ambientais fornecidas. Este segundo tipo de abordagem tem como vantagem a representação espacial da informação, permitindo assim o melhor entendimento e visualizção de possíveis padrões espaciais na abundância do caribu e, consequentemente, o afinamento das suas medidas de gestão. Outra vantagem adicional é permitir uma estimativa e respetiva incerteza associada em qualquer sub-área de interesse desde que esteja devidamente definida. Para ter uma estimativa da abundância, basta integrar sob a superfície de densidade estimada. Por fim, comparando estas as estimativas pontuais com as obtidas em estudos anteriores, as primeiras são ligeiramente menores. Apesar disso, não existe evidência estatística que indique um decréscimo estatisticamente significativo na abundância dos caribus na região Norte do Oeste da Gronelândia. Recomenda-se, para estudos futuros e se possível, uma amostragem mais rigorosa no que diz respeito à categorização de covariáveis de interesse como a claridade, a profundidade e cobertura da neve, assim como a inclusão de outras covariáveis como a vegetação. Estas covariáveis poderão fornecer informação adicional sobre a distribuição da espécie de estudo.

Os sistemas estuarinos desde sempre captaram a atenção do ser humano. Os estuários estão entre os ecossistemas mais produtivos do mundo, têm uma elevada biodiversidade, que é característica destes sistemas, e oferecem zonas mais protegidas, com enorme importância para funções de proteção, alimentação e berçário para várias espécies. São, portanto, áreas influenciadas pela atividade do Homem, que se habituou a explorar estes sistemas nas vertentes económicas e sociais, por exemplo, através da construção de portos, da atividade piscatória ou do turismo marítimo. Como consequência desta exploração, existe impacto da atividade antropogénica na dinâmica dos estuários, que deve ser devidamente avaliada. No entanto, a análise deste tipo de ambientes apresenta inúmeros desafios. Além do forçamento antropogénico, os estuários têm fortes interações com a atmosfera, condição que confere uma variação sazonal aos parâmetros físico-químicos da água. Adicionalmente, a mistura diária de água doce, vinda do rio, com água salgada, que entra pela foz, promove uma variação constante desses parâmetros e influencia a componente biológica da região. Estes fatores, bem como a recorrente interação com a costa, conferem uma condição natural complexa aos estuários. O presente estudo aborda este dinamismo e a variabilidade dos parâmetros físico-químicos no estuário do Sado, o segundo maior estuário de Portugal e um dos maiores da Europa. Devido à sua rica biodiversidade, produtividade e valor estético, o estuário do Sado foi definido como reserva natural em 1980, a fim de promover a sua preservação, evitando possíveis impactos antropogénicos nos seus processos e características naturais. Os primeiros estudos oceanográficos realizados no estuário do Sado decorreram nos anos 70. No entanto, após 40 anos, ainda é um desafio conseguir compreender na íntegra a dinâmica deste estuário e é crucial estudá-lo utilizando uma abordagem que integre observações in situ (com um regime de amostragem frequente, feito em profundidade e que acompanhe o ciclo de maré) com dados de satélite, para permitir uma análise temporal e espacial mais completa. Seguindo esse objetivo, foram realizadas campanhas in situ entre setembro de 2018 e setembro de 2019 no estuário do Sado, para recolher dados físico-químicos (temperatura, salinidade, fluorescência, turbidez, intensidade e direção das correntes) e biológicos (concentração de clorofila a). Essas campanhas foram realizadas com uma periodicidade mensal utilizando um CTD (Condutividade, Temperatura, Profundidade), um correntómetro e uma sonda multiparamétrica, e recolheram-se amostras de água para posterior quantificação de concentrações de clorofila a e matéria em suspensão (SPM). Adicionalmente, em novembro de 2018 e junho de 2019, a recolha de dados foi feita ao longo do ciclo de maré, em condições de marés vivas e de marés mortas. Os resultados indicaram que a região da embocadura do estuário é espacialmente homogénea, verificando-se, ocasionalmente, uma ligeira estratificação da coluna de água. A variabilidade dos parâmetros físico-químicos observada aparentou ser consequência de forçamentos antropogénicos e da variabilidade sazonal ou pontual das condições meteorológicas. Na região do estuário analisada, foi possível observar valores de salinidade tipicamente oceânicos, podendo concluir-se que o rio teve pouca influência na região mais exterior do estuário. Após comparados os resultados obtidos com os de estudos anteriores, pareceu ter existido uma diminuição da influência do rio na embocadura do estuário nos últimos anos, uma vez que se obtiveram valores de salinidade mais elevados ao longo do ano em análise, e uma maior amplitude térmica da água. A circulação no estuário aparentou ser feita através dos dois canais de navegação, sendo o canal sul, a via mais relevante de entrada e saída de água. Observou-se que a maré teve um papel determinante na direção da circulação no estuário. Ademais, a direção da corrente foi uniforme ao longo da coluna de água, contrariando estudos anteriores Com vista a melhorar o conhecimento sobre a dinâmica deste sistema estuarino, avaliou-se também a variabilidade intra-anual e interanual da temperatura da superfície do mar (TSM) e da concentração de clorofila a através de deteção remota por satélite. O primeiro desafio, foi o de perceber quais os sensores mais apropriados para um estudo em sistema estuarino, que apresentassem dados fiáveis e com elevada qualidade espacial e temporal. Estudou-se a viabilidade em utilizar a base de dados de TSM do Group for High Resolution Sea Surface Temperature (GHRSST) através da versão 4.1 da análise Multiscale Ultrahigh Resolution (MUR) disponibilizada pelo grupo. Estes dados foram validados com sucesso, por terem apresentado uma boa concordância com os valores de temperatura recolhidos in situ, principalmente na região do estuário mais próxima do oceano. No entanto, revelaram ter uma baixa resolução espacial. Ainda assim, foi percetível a sensibilidade deste produto em detetar variações sazonais ao longo do estuário. Foi feita uma análise deste parâmetro de junho de 2002 a setembro de 2019 e viu-se que anos de TSM mais baixas, parecem estar associados a anos de índice NAO positivo. Para analisar a concentração de clorofila a no estuário, utilizaram-se os produtos do Sentinel3 OLCI (Ocean and Land Colour Instrument) para serem validados com os dados in situ, e os produtos MERIS, para se alcançar uma maior cobertura temporal e fazer-se uma análise histórica da variação de clorofila a no estuário de 2002 a 2012. A análise da clorofila estimada a partir do Sentinel-3 deu uma indicação de que esses dados eram mais apropriados para a área de estudo, devido à resolução espacial do sensor e à boa aplicação a águas costeiras. Foi possível observar concentrações mais elevadas de clorofila a nos canais mais interiores do estuário. Adicionalmente, as concentrações máximas de clorofila a foram encontradas durante a primavera em todo o estuário. No entanto, a correlação entre os valores de satélite e os obtidos in situ não foi a ideal (R 2 = 0,33). Uma das fontes de erro associada aos dados do Sentinel-3 poderá ser a presença de matéria em suspensão que parece ter interferido na quantificação de clorofila a, principalmente durante a campanha de 8 de novembro de 2018. Dos resultados obtidos no presente estudo, foi também detetada uma tendência para um decréscimo da concentração de clorofila a na região, de 2002 a 2012. De 2002 a 2019, também a TSM tendeu a diminuir no estuário. No entanto, seria importante complementar o presente estudo com uma análise estatística que detetasse a significância das tendências observadas. Dada a complexidade dos ambientes costeiros, os algoritmos disponíveis (quer de correção atmosférica, quer de determinação de variáveis biogeoquímicas) ainda não são totalmente eficientes e outros componentes oticamente ativos (e.g., partículas em suspensão ou matéria orgânica dissolvida) podem interferir nas estimativas da concentração de clorofila a. No entanto, quando foram analisadas as bases de dados MERIS e Sentinel-3, utilizaram-se os algoritmos desenvolvidos para águas costeiras e foi possível observar que, com o tempo, houve um aumento da qualidade dos produtos de satélite disponíveis. Como tal, é importante que se continuem a desenvolver novos algoritmos direcionados para ambientes costeiros, utilizando como base os resultados obtidos pelos exercícios de validação de produtos de satélite já realizados por vários autores em diferentes áreas do planeta. O presente estudo permitiu uma caracterização da dinâmica do estuário do Sado na atualidade a partir das campanhas in situ e pareceu indicar que poderão ter existido algumas alterações na sua natural dinâmica nos últimos anos. No entanto, seria importante prolongar a análise in situ seguindo uma abordagem frequente acompanhando ciclos de maré completos. Posteriormente, mantendo-se a tendência dos resultados obtidos, seria importante perceber o que esteve na origem destas alterações e quais as consequências que estas poderão ter no futuro do ecossistema.

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Em Lisboa, durante o período de pandemia covid19,a ação dos movimentos sociais urbanos acirrou-se, capitalizando a visibilidade para o direito à habitação, como direito humano básico e imperativo incondicional de saúde pública, para cumprir os deveres de quarentena e isolamento social, impostos pelo Estado de Excepção. Descrevendo o processo de lutas urbanas, participação e contestação, e ganhos na moratória contra os despejos e pagamento dos alugueres, concluímos que os atores nessa luta urbana têm poder limitado sobre as mudanças que iniciam ou fazem um esforço para infligir, se não estiverem envolvidos em uma ação concertada e politicamente integrada, até porque as conquistas que obtêm são temporárias e excepcionais, à semelhança do próprio estado de emergência imposto pela covid19.

Olfactory receptors (ORs), encoded by the largest vertebrate multigene family, enable the detection of thousands of unique odorants in the environment and consequently play a critical role in species survival. Here, we advance our knowledge of OR gene evolution in procellariiform seabirds, an avian group which relies on the sense of olfaction for critical ecological functions. We built a cosmid library of Cory's Shearwater (Calonectris borealis) genomic DNA, a model species for the study of olfaction-based navigation, and sequence OR gene-positive cosmid clones with a combination of sequencing technologies. We identified 220 OR open reading frames, 20 of which are full length, intact OR genes, and found a large ratio of partial and pseudogenes to intact OR genes (2:1), suggestive of a dynamic mode of evolution. Phylogenetic analyses revealed that while a few genes cluster with those of other sauropsid species in a γ (gamma) clade that predates the divergence of different avian lineages, most genes belong to an avian-specific γ-c clade, within which sequences cluster by species, suggesting frequent duplication and/or gene conversion events. We identified evidence of positive selection on full length γ-c clade genes. These patterns are consistent with a key role of adaptation in the functional diversification of olfactory receptor genes in a bird lineage that relies extensively on olfaction.

Data generation, collection, storage, and accessibility are growing exponentially, and most fields of science are already undergoing a big data revolution. Vast pools of electronic data are collected in billions of devices and medical records systems embedded in health organizations all over the world. However, although it is clear that this explosion of digital information could lead to major breakthroughs, such large datasets are still challenging to work with, and there are several obstacles in translating this real-world data into real-world evidence, with tangible benefits for research and, ultimately, clinical practice.

Esta comunicação descreve dois estudos de um programa de investigação sobre o professor de Mate-mática e a tecnologia. Visam saber qual de que modo a calculadora comum (no ensino básico) e a calculadora gráfica (no secundário) está a ser integrada nas práticas profissionais e procuram também saber qual pode ser o papel da formação inicial e contínua. Os resultados de estudos de caso qualitativos indicam que há professores que usam a calculadora na sala de aula sem que isso signifique uma mudança nos objectivos, tarefas e práticas de ensino. Indicam, igualmente, que a cultura de escola e a formação podem ter uma influência importante sobre as concepções e as práticas dos professores.

Mi investigación buscó entender por qué Agbogbloshie, un centro de reciclaje de metales provenientes de residuos eléctricos y electrónicos ubicado en la ciudad de Accra en Ghana, ha comenzado a ser objeto de prácticas turísticas. Mi objetivo principal fue reflexionar sobre las razones éticas y estéticas que permiten que este paisaje tóxico se torne turísticamente deseable, así como las consecuencias éticas y estéticas que surgen debido al fenómeno turístico. Para explicar por qué Agbogbloshie se forma como un paisaje turístico, estudié tanto su conformación tóxica en la cual se entrelazan actores humanos y no-humanos, como la generación y circulación de discursos y representaciones de la toxicidad en fotografías, documentales y películas ficcionales. También describí las prácticas turísticas que se han consolidado en los últimos años para visitar tanto el exterior como el interior del centro de reciclaje. Para profundizar en las motivaciones de los visitantes y en los impactos que ha traído el turismo realicé una etnografía que incluyó una observación participante, donde puse mi cuerpo en la práctica estudiada al hacer los recorridos turísticos, y unas entrevistas realizadas a los guías y a los turistas con los que pude compartir o contactar. También me apoyé en el método de netnografía, para revisar información virtual sobre otras experiencias turísticas dispuestas en blogs de viaje. Los resultados de mi investigación colocan a Agbogbloshie como un paisaje tóxico que ha sido visibilizado a través de miradas ético-políticas y de estéticas realistas y sublimes que critican la crisis ambiental y refuerzan contra-narrativas al capitalismo global, lo que ha generado una mistificación y han hecho de este lugar una atracción turística. Mis reflexiones también señalan que las motivaciones turísticas están atravesadas por dilemas morales, experiencias multi-sensoriales, búsquedas por lo sublime, calls for action, y que el turismo ha traído impactos como la construcción de discursos de dolor, el refuerzo de jerarquías al interior del centro y el desarrollo de tensiones en los encuentros entre visitantes y locales, en especial debido a que la fotografía se convierte en un objeto de deseo y de conflicto.

O sistema aquífero das Aluviões do Tejo desenvolve-se nos depósitos aluvionares do Holocénico e em terraços fluviais do Plistocénico. Está localizado na zona central da Bacia do Baixo Tejo, inserida na Região Hidrográfica do Tejo e Ribeiras do Oeste (RH5A). A sua localização geográfica estratégica e a alta produtividade, culminaram na sua extensiva exploração para abastecimento público de água, para uso agrícola e industrial. A exploração do sistema aquífero vem causando perturbações no potencial hidráulico, originando, por vezes, inversão do sentido do fluxo subterrâneo e intrusão de água salina. Por sua vez a expansão urbana e as modificações na cobertura e no uso do solo, têm contribuído para a ocorrência de contaminações, sendo conhecidas elevadas concentrações de nitrato, ferro e manganês. De suporte hidrogeológico maioritariamente poroso, o sistema aquífero apresenta particular vulnerabilidade à poluição. A conexão hidráulica ao rio Tejo facilita a propagação das contaminações, funcionando este rio como origem ou destino de poluentes. Por esta razão, o sistema aquífero das Aluviões do Tejo é alvo das medidas de controlo e monitorização da qualidade das suas águas pela Agência Portuguesa do Ambiente (APA), e é objeto principal de estudo desta dissertação. Na construção do modelo que caracteriza geometricamente o sistema e o seu funcionamento hidráulico, destacam-se duas fases mais importantes, a do levantamento e do processamento dos dados (60 logs de sondagens, 60 ensaios de bombagem e 75 resultados de análises físicoquímicas) e a fase da aplicação de métodos geoestatísticos e de interpolação espacial. Na caracterização do estado físico-químico da massa de água, foram aplicadas técnicas de análise multivariada. O modelo mostra uma correlação negativa entre a profundidade do sistema aquífero e a sua produtividade, apesar da presença de níveis intercalados de baixa permeabilidade. Esta relação é espacialmente bem definida entre os setores montante e jusante. A montante, a espessura produtiva do aquífero varia entre os 19 e os 29 m não ultrapassando os 40 m de profundidade. Naquele setor encontram-se valores de caudal específico superiores a 1500 m2 /dia e condutividade hidráulica que ultrapassa os 60 m/dia. No setor jusante, a profundidade da base do aquífero ultrapassa os 70 m, apresentando caudal específico inferior a 900 m2 /dia e condutividade hidráulica média de 30 m/dia.

A associação simbiótica entre as raízes e fungos micorrízicos do solo é extremamente importante para a nutrição e desenvolvimento das plantas. Apesar de haver já algum conhecimento sobre os genes (genoma/transcritoma) e proteínas (proteoma) envolvidos no processo de micorrização, sabe-se muito pouco sobre as alterações dos metabolitos da planta hospedeira quando esta se encontra em simbioses com o fungo micorrízico. Assim, a identificação do conjunto de metabolitos ou compostos biológicos (metaboloma) envolvidos na micorrização reveste-se de especial interesse para completar a informação fornecida pelo genoma/transcritoma e proteoma. Estes são os últimos produtos da expressão dos genes e, por isso, são extremamente informativos acerca das alterações moleculares que estão a acontecer nos organismos vivos. Sabe-se que os organismos vivos sujeitos a stresses ambientais (e.g. seca, salinidade do solo) ou durante interações com microrganismos simbióticos ou patogénicos, podem produzir metabolitos específicos ou sofrer alterações na quantidade de metabolitos já produzidos. A identificação destas alterações permite saber, a nível molecular, o que está a acontecer quando uma planta estabelece, por exemplo, uma relação simbiótica com um fungo da rizosfera. Neste estudo pretendeu-se contribuir para a identificação das alterações no metaboloma do sobreiro quando este se encontra em simbiose com um fungo micorrízico do solo. O metaboloma da raíz micorrizada do sobreiro foi extraído usando quatro frações compostas por diferentes solventes: água, metanol, acetonitrilo e clorofórmio (orgânica). Foram extraídas seis réplicas de plantas de sobreiros – sendo três micorrizadas e três utilizadas como grupo de controlo não micorrizado, para efeitos de comparação. Através da aplicação de métodos estatísticos tais como Rank Products, Modelos Lineares e Análise Discriminante por Mínimos Quadrados Parciais (PLS-DA) , foi possível a identificação dos metabolitos diferencialmente acumulados que possibilitarão a descoberta de novas informações sobre a identidade dos metabolitos envolvidos na simbiose entre o sobreiro e o fungo micorrízico, promovendo novos conhecimentos sobre as vias metabólicas implicadas na micorrização.

Neurosurgery has been considered as a treatment or a therapy option for brain lesions with satisfactory outcomes regarding the maximal resection of the lesioned area and the minimal post-surgical neurological dysfunctions by avoiding eloquent areas. For the last two decades, resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) has emerged as an effective non-invasive neuro-imaging technique that can be used for pre-surgical functional brain mapping at rest. The analysis of these maps can focus on both the local function of specific regions (segregation) and the functional connections between them (integration) for the assessment of lesion-induced changes. The brain network can be characterized resorting to graph theory analysis for the calculation of these segregation and integration properties which is more facilitated on thresholded binarized matrices. These can be obtained by proportional thresholds revealing the top strongest connections that are present in the network. This study intends to analyse and compare the segregation and integration properties of lesioned and non lesioned hemispheric networks from a group of 7 patients with brain tumors and a cavernous malformation. Moreover, it also aims to evaluate the effect of the proportional thresholds in those properties. By using rs-fMRI and graph theory analysis, the network features of lesioned and non lesioned hemispheres were investigated, over a range between 20%-40% (at intervals of 5%) of proportional thresholds. The results reflected more integrated and segregated networks as more connections were included in the networks. The lesioned network revealed higher global integration and local processing at the highest density of 40%. However, the lesioned small-world organization was less optimal when comparing to the non lesioned network. In conclusion, our findings indicated that the lesion-induced perturbations disturbed the functional connectivity of the lesioned hemisphere. Nevertheless, compensatory mechanisms should be accounted for the pre-surgical evaluation of the affected and unaffected brain areas.

Climate change is unprecedently threating living organisms. The increasing of carbon dioxide in the atmosphere is the major driver of climate change, causing a dramatic rise of temperature. Global warming and high CO2 concentration have significant consequences on plants performances. Most of the studies focus on the effect of climate change on growing season, since photosynthesis during winter is negligible. However, mild winters are becoming more frequent and plants performances could become more noteworthy. At high-latitudes where milder winters are linked to wider cloud cover plants respiration could exceed photosynthesis causing a negative carbon balance. Nonetheless, temperature rise during winter could affect growth and phenology leading to less carbon storage and phenological mismatches. To understand plants performances, growth and phenology under mild winter five species of seedlings (Picea abies, Abies alba, Larix X eurolepis, Fagus sylvatica and Quercus robur) were set under different temperature and light treatments indoor and outdoor for one month between January and February. Plants performances were measured on evergreen conifers during the whole month. An increased level of dark respiration and a lower carbon uptake was found in plants exposed to warmer temperatures. Growth and phenology were monitored on the five species revealing species-specific responses. An overall advancement in phenology was observed in plants placed at warmer temperatures. Light treatments triggered a phenology advancement in Picea abies and Quercus robur. This study evidences the importance of including winter temperatures and light to calculate annual carbon balance, and plants growth and phenology.

O tempo de vida efetivo dos portadores de carga minoritários é um parâmetro crucial para a caracterização de materiais empregues na indústria fotovoltaica. A medição deste parâmetro numa fase inicial do fabrico de células solares, permite a remoção das wafers com imperfeições, garantindo a qualidade do produto final. A presente investigação teve como objetivo o estudo de técnicas de otimização de wafers de silício que, posteriormente, seriam utilizadas em células fotovoltaicas. Essa otimização é alcançada pela melhoria dos valores de tempo de vida medidos na superfície das wafers. Os instrumentos de medição utilizados foram o WCT-120 da Sinton Instruments e o WT-1000 da Semilab Semiconductors. Estes fornecem valores de tempo de vida baseados na técnica de decaimento fotocondutivo. No entanto, nesta técnica as medições são influenciadas pelos focos de recombinação nas wafers, culminando em medidas aparentes à superfície que não refletem o tempo de vida em volume. Para colmatar esta situação, utilizam-se métodos de passivação da superfície que, se realizados de forma eficaz, permitem reduzir o efeito de recombinação nesta, aproximando o tempo de vida medido à superfície do tempo de vida em volume. Nesta investigação foi possível obter-se esse efeito de passivação para os processos de oxidação química e evaporações, o que permitiu a melhoria da qualidade das wafers, contrariamente ao verificado no processo de oxidação térmica que culminou numa redução da mesma.

O jazigo de Estação situa-se no extremo NE da vila de Aljustrel e corresponde a uma massa de sulfuretos maciços rejeitada, em cerca de 600 m, pela falha da Represa, relativamente ao depósito de Feitais, com o qual formaria um corpo mineralizado único. Este jazigo, até hoje não explorado, apresenta uma morfologia tipicamente lenticular com 600 m de comprimento, 480 m de largura e até 100 m de possança, ocorrendo no flanco normal do designado anticlinal de Feitais. A re-interpretação geoestrutural levada a cabo nesta investigação permitiu reconstituir por completo a geometria da massa de Estação, com base no estudo detalhado de três sondagens de superfície (ES13001; ES13002; ES12001), implantadas ao longo de três perfis geológicos perpendiculares à estrutura, de cujos testemunhos foi possível selecionar uma amostragem muito representativa, quer dos minérios maciços e de stockwork, quer dos vários litótipos e fácies de alteração presentes na sequência encaixante do depósito. Os vulcanitos félsicos que hospedam o corpo mineralizado de Estação encontram-se invariavelmente afetados por alteração hidrotermal de carácter regional, pré-mineralização, que resultou de regimes de circulação convectiva de água do mar pouco modificada através de uma sequência vertical de rochas vulcaniclásticas permeáveis. Apesar dos efeitos metassomáticos deste evento, o carácter riolítico e as principais características texturais destes litótipos, estabelecidas no passado por diversos autores (Munhá 1983b; Barriga, 1983), foram consubstanciados neste estudo através de sólidas evidências petrográficas e geoquímicas. A sequência litoestratigráfica que hospeda as mineralizações de Estação foi definida, da base para o topo, por riólitos dos tipos EA, EB e EC, que exprimem a evolução do quimismo magmático nas rochas da região. Estes riólitos apresentam assinaturas geoquímicas totalmente correlacionáveis com os riólitos classificados por Barrett et al. (2008) em Aljustrel, facto suportado por comparação entre razões de elementos de comportamento relativamente imóvel. Estes riólitos apresentam uma textura maioritariamente vulcaniclástica e correspondem a fácies do tipo brecha rica em fiamme e fenocristais (Rosa et al. 2010). A alteração hidrotermal mineralizante sobreposta às rochas félsicas encaixantes da massa de Estação, imprimiu um conjunto de assinaturas paragenéticas, texturais, mineralógicas e geoquímicas, amplamente conhecidas e descritas para esta tipologia de depósitos. Estas características são definidoras de padrões e zonalidade de alteração hidrotermal que foram perfeitamente identificados neste estudo e que mimetizam de forma muita aproximada, outros casos análogos em Aljustrel (e.g. Barriga, 1983; Relvas, 1991). O estudo sequencial, mas integrado, das paragéneses, texturas e variabilidade geoquímica dos litótipos de Estação, permitiu estabelecer três padrões principais de alteração e correspondente zonalidade temporal e espacial, num contexto evolutivo das suas condições físico-químicas e metalogenéticas. A zona de alteração do tipo 1 (clorítica) corresponde ao núcleo do sistema hidrotermal mineralizante e apresenta um padrão de alteração caracterizado pela associação mineralógica secundária clorite + quartzo + sulfuretos + carbonatos ± sericite, que espelha as condições termo-químicas mais intensas do sistema. A alteração nesta zona é extremamente pervasiva e evidencia uma proeminente profusão de veios que mimetizam as paleo-condutas de fluidos mineralizantes ascendentes do sistema. A lixiviação de álcalis e alcalino-terrosos (K, Na e Ca,) nesta zona revelou-se intensa e, em sentido inverso, a cloritização e sulfuretização traduziram-se num sistemático predomínio de Fe + Mg, posto em evidência pelos dados mineralógicos. A mineralogia sulfuretada nesta zona é dominada por pirite ± calcopirite + esfalerite + galena. A zona de alteração do tipo 2 constitui um halo periférico relativamente ao núcleo clorítico do sistema hidrotermal, que se traduz numa gradual intensificação da sericitização e silicificação das rochas, com evidente diminuição da cloritização e de veios mineralizados. O padrão de alteração característico desta zona é dominado pela associação mineralógica sericite + quartzo ± clorite + sulfuretos + carbonatos. A teto da massa mineralizada de Estação foi possível identificar uma sequência de rochas que, do ponto de vista mineralógico e geoquímico, nos remetem para uma alteração ultraperiférica do tipo 3. O incremento de molécula paragonítica (Na) nas sericites destas amostras, sobrepõese a expressões texturais condizentes com zonas mais proximais do sistema hidrotermal. Este tipo de alteração revela-se mais subtil e apresenta uma associação mineralógica dominada por sericite rica em sódio + quartzo + carbonatos. As clorites apresentam variações em Fe, Mg e Al que são função da sua proximidade ao núcleo do sistema. A razão Fe/(Fe+Mg) permitiu discriminar as clorites mais ferrosas como sendo as mais proximais ao eixo do sistema hidrotermal mineralizante e onde a influência dos fluidos mineralizantes sobre as rochas é maior, nomeadamente em zonas de extensas redes de veios (zona 1). As sericites apresentam uma variabilidade composicional do Na e K que é expressa pela razão Na/(Na+K). Esta variabilidade permitiu a discriminação de sericites fortemente potássicas (zona 2a) e sericites progressivamente mais sódicas (zona 2b) podendo chegar a paragonites quase puras, típicas de zonas mais distais. Consequentemente, o empobrecimento progressivo de Na nas sericites e alguma incorporação progressiva de Fe+Mg na respetiva estrutura cristaloquímica, constituem vetores que apontam no sentido do núcleo do sistema hidrotermal. De entre os carbonatos analisados, as anquerites tardi-metalogenéticas, com Fe e Mg na sua composição, discriminam-se composicionalmente em função do perfil considerando. Foi possível constatar a presença de anquerites com mais Fe no perfil central (mais proximal ao eixo do sistema) do que em zonas mais afastadas, nomeadamente no perfil NW. A utilização de diagramas do tipo “Alteration box-plot” (Large et al., 2001) no âmbito deste estudo, permitiu relacionar os dados da geoquímica de rocha total com a alteração hidrotermal mineralizante através da identificação de trends que definem sequências e paragéneses de alteração. Identificou-se um trend 4, de associação clorite – carbonatos – pirite, de aproximação ao eixo do sistema, que sugere a presença mais proeminente nas amostras de carbonatos de caráter ferroso, provavelmente siderite em finas frações matriciais. Em amostras de rochas pouco mineralizadas, esta ferramenta permitiu identificar dois outros trends composicionais no sentido da aproximação ao núcleo do sistema mineralizante. Um trend 3 (clorite + sericite + pirite) e um trend 2 (sericite + clorite ± pirite) que se revelaram perfeitamente consistentes com os padrões de alteração anteriormente descritos. Como vimos, a análise de microssonda das principais fases secundárias de alteração (clorites, sericites e carbonatos) complementou e reforçou os critérios paragenéticos e texturais utilizados na definição da zonalidade de alteração hidrotermal mineralizante. Em última análise, a transversalidade da presença destes minerais no contexto das várias zonas de alteração, e a sua variação, permitiram estabelecer valiosos critérios de prospeção mineral, critérios esses que foram harmoniosamente corroborados pelos dados da geoquímica de rocha total. A litogeoquímica colocou igualmente em destaque aspetos críticos relativamente aos mecanismos que promoveram a mineralização das rochas vulcânicas que hospedam o jazigo de Estação. O comportamento relativamente imóvel de vários elementos menores em rochas fortemente mineralizadas constituiu um precioso recurso neste sentido. Uma vez estabelecidas as correlações entre elementos (Ta, Nb, Zr, Hf e Y) de rochas pouco mineralizadas e suas congéneres variavelmente alteradas (stockwork e minério maciço), foi possível determinar uma correspondência entre as assinaturas dos dois grupos de rochas, o que representa uma evidência direta de um mecanismo de substituição. Por outro lado, a evolução composicional da SiO2 e do Al2O3 espelha o balanço de massa do sistema hidrotermal mineralizante durante o processo de mineralização (cf. Relvas et al., 2006a). Nesta evolução composicional, ainda que ambos os elementos sejam afetados pelos fluidos mineralizantes, fazem-no de modo diferenciado. Tanto a sílica como a alumina são subtraídas do sistema por lixiviação, mas de forma desfasada. A sílica, mais solúvel, é primeiramente lixiviada, seguindo-se-lhe a alumina sob condições físico-químicas mais extremas. Este processo conduz à substituição total da fração silicatada da rocha, por sulfuretos. Estas duas evidências demonstram claramente a existência de um estilo de mineralização por substituição na sub-superfície associado ao jazigo de Estação. A oportunidade de trabalhar com o MLA (Mineral Liberation Analyser) nos laboratórios da EPDM em Aljustrel, permitiu a obtenção de um precioso conjunto de dados de mineralogia automática. Entre estes, destacam-se os dados de análise modal expressos pela percentagem em área de cada fase mineral. Estes dados revelaram-se coerentes com as observações e resultados obtidos através da petrografia, química mineral e litogeoquímica. Na análise da alocação de elementos químicos pelas diversas fases minerais e da libertação mineral (de extrema importância para a empresa mineiras em termos geometalúrgicos), optou-se por uma abordagem essencialmente descritiva e qualitativa dos dados que se revelou absolutamente consistente com os restantes resultados obtidos, observações efetuadas e interpretações preconizadas.

Os grafos de conhecimento biomédicos são cruciais para sustentar aplicações em grandes quantidades de dados nas ciências da vida e saúde. Uma das aplicações mais comuns dos grafos de conhecimento nas ciências da vida é o apoio à comparação de entidades no grafo por meio das suas descrições ontológicas. Estas descrições suportam o cálculo da semelhança semântica entre duas entidades, e encontrar as suas semelhanças e diferenças é uma técnica fundamental para diversas aplicações, desde a previsão de interações proteína-proteína até à descoberta de associações entre doenças e genes, a previsão da localização celular de proteínas, entre outros. Na última década, houve um esforço considerável no desenvolvimento de medidas de semelhança semântica para grafos de conhecimento biomédico mas, até agora, a investigação nessa área tem-se concentrado na comparação de conjuntos de entidades relativamente pequenos. Dada a diversa gama de aplicações para medidas de semelhança semântica, é essencial apoiar a avaliação em grande escala destas medidas. No entanto, fazê-lo não é trivial, uma vez que não há um padrão ouro para a semelhança de entidades biológicas. Uma solução possível é comparar estas medidas com outras medidas ou proxies de semelhança. As entidades biológicas podem ser comparadas através de diferentes ângulos, por exemplo, a semelhança de sequência e estrutural de duas proteínas ou as vias metabólicas afetadas por duas doenças. Estas medidas estão relacionadas com as características relevantes das entidades, portanto podem ajudar a compreender como é que as abordagens de semelhança semântica capturam a semelhança das entidades. O objetivo deste trabalho é desenvolver um benchmark, composto por data sets e métodos de avaliação automatizados. Este benchmark deve sustentar a avaliação em grande escala de medidas de semelhança semântica para entidades biológicas, com base na sua correlação com diferentes propriedades das entidades. Para atingir este objetivo, uma metodologia para o desenvolvimento de data sets de referência para semelhança semântica foi desenvolvida e aplicada a dois grafos de conhecimento: proteínas anotadas com a Gene Ontology e genes anotados com a Human Phenotype Ontology. Este benchmark explora proxies de semelhança com base na semelhança de sequência, função molecular e interações de proteínas e semelhança de genes baseada em fenótipos, e fornece cálculos de semelhança semântica com medidas representativas do estado da arte, para uma avaliação comparativa. Isto resultou num benchmark composto por uma coleção de 21 data sets de referência com tamanhos variados, cobrindo quatro espécies e diferentes níveis de anotação das entidades, e técnicas de avaliação ajustadas aos data sets.

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