Repositório RCAAP

Objetivo: Medicina Geral e Familiar (MGF) e Cuidados Paliativos (CP) são duas áreas do conhecimento médico que estão altamente interligadas. Tendo em vista a alta resolutividade esperada dos Cuidados de Saúde Primários e o incremento no número de doentes com necessidades paliativas, é esperado que os internos de MGF findem a formação específica sentindo-se seguros em gerir a maior parte das necessidades paliativas dos seus doentes ou que saibam o momento adequado para referenciá-los para as equipas especializadas em CP. O presente estudo tem como objetivo avaliar as perceções dos internos de MGF de Portugal sobre o seu grau de preparação em Ações Paliativas e CP Gerais. Método: Os internos da especialização em MGF, em 2019, foram convidados a responder um questionário online com 22 itens, sendo os 6 primeiros referentes a questões sociodemográficas; 14 itens sobre Gestão de Sintomas, Nutrição Paliativa, Avaliação de Prognóstico, Comunicação, Luto e Trabalho em Equipa; e 2 itens sobre a formação em CP. Resultados: Obteve-se amostra de 109 internos. A média global da autoperceção do grau de preparação em CP foi de 2,72. O Luto (M = 3,52) foi a área em que se verificou o maior grau de preparação, seguido do Trabalho em Equipa (M = 2,88), Comunicação (M = 2,87), Gestão de Sintomas (M = 2,71), Avaliação de Prognóstico (M = 1,86) e Nutrição Paliativa (M = 1,80). Para 95,4% da amostra, a área dos CP é total ou parcialmente relevante na formação do médico de família. No entanto, 76,1% dos participantes não realizaram nenhuma disciplina ou estágio em CP durante a formação pré-graduada, 11,0% tiveram CP como disciplina ou estágios obrigatórios e 12,9% como disciplina ou estágios opcionais. No que concerne a formação específica em MGF, 51,4% dos participantes nunca realizaram disciplinas ou estágios em CP, 3,7% tiveram como disciplina ou estágios obrigatórios e 45,0% tiveram como disciplina ou estágios opcionais. Observou-se diferenças significativas em algumas temáticas ao se comparar as 5 regiões de Portugal, além de um aumento das médias da autoperceção de conhecimentos em CP ao longo dos 4 anos de internato, assim como daqueles que realizaram estágios em CP em relação aos que não realizaram. Para 87,2% dos participantes, o momento ideal para obter formação específica em CP é na formação pré-graduada e específica em MGF. Conclusões: Os internos de MGF demostraram uma autoperceção de conhecimentos insuficiente em CP. Muito embora a grande maioria considere relevante o contacto com os CP durante a formação pré e pós-graduada, os resultados indicam que apenas uma minoria frequentou disciplinas ou estágios em CP na formação pré-graduada, enquanto o índice de contacto obrigatório com CP durante a formação específica em MGF foi baixo. Os resultados indicam que os CP constituem uma lacuna na formação médica em Portugal, e em particular dos médicos de família, apesar da sua elevada relevância prática na atualidade.

Money is critical for a regenerative future. Transforming it is an unavoidable social, political, and economic endeavor that must be a global priority if we are to prevent future financial crises, reduce economic inequality and adhere to our climate agreements and sustainability goals. For this transition to occur, we urgently need new economic and monetary paradigms that address the root causes of our current unsustainability, offer a new monetary ontology and design, and, more importantly, steer our monetary regime towards the regeneration of our social, economic and ecological landscapes. We need an ecological understanding of money grounded in Ecological Economics and an Ecological Value Theory that lays down the foundations for the conscious democratization, decentralization, and diversification of money. In this work, we revisit and update the missing link between money and sustainability by proposing new ontological avenues and reviewing the design elements and degenerative processes built into the existing system. We also contribute to the development and emergence of an Ecological Monetary Economics by systematizing the ongoing monetary transition toward sustainability and by offering a set of principles drawn from the regenerative economics literature for the conscious design of monetary ecosystems that contribute positively to solving our societal challenges of the 21st century.

Introdução: O aumento global da prevalência de excesso de peso e obesidade infantis são uma tendência preocupante. Muitas crianças estão no seu dia-a-dia expostas a ambientes “obesogénicos”, nomeadamente em redor da escola, com um possível impacto no seu IMC. Este trabalho tem como objectivo avaliar a proximidade entre escolas e estabelecimentos de fast-food (EFF) de 3 perspectivas diferentes, no território de Portugal continental. Metodologia: Utilizou-se a base de dados de escolas de Portugal continental e recolheu se as localizações dos estabelecimentos das 3 principais marcas de fast-food no país. Identificou-se qual o EFF mais próximo de cada escola, bem como a respectiva distância; agregou-se os dados por NUTS3 e obteve-se o valor mediano dessa distância. Determinou-se o número de EFF num raio de 400 e 800m de cada escola; agregou-se os dados por NUTS3 e obteve-se o valor médio de EFF nesses raios. Por fim, utilizou-se a função K (de Ripley) bivariada heterogénea para determinar se a localização dos EFF é dependente das escolas. Resultados: Considerando a distância mediana ao EFF mais próximo, os NUTS3 mais críticos são a área metropolitana (AM) de Lisboa, AM Porto, Alentejo Central, Algarve, Ave, Cávado, Médio Tejo, e Beira Baixa, com uma distância mediana ao EFF mais próximo <2.18km. Considerando a média de EFF num raio de 400 e 800m, as AM Lisboa, AM Porto, o Alentejo Central e o Cávado continuam a ser, por esta perspectiva, locais de grande proximidade aos EFF, mas Oeste e Terras de Trás-os-Montes também ganham destaque. Por fim, pode-se afirmar que a localização dos EFF em Portugal continental não é independente da localização das escolas, havendo efectivamente um clustering estatisticamente significativo a partir de aproximadamente 275m, excepto nas áreas representadas pelos polígonos Urbanas. Conclusão: na maioria do território de Portugal continental os EFF têm uma tendência estatisticamente significativa para se localizar perto das escolas, havendo alguns NUTS3 em que o problema da proximidade parece ser mais marcado, nomeadamente AM Lisboa, AM Porto, o Alentejo Central e o Cávado. São necessários mais estudos para entender o real impacto deste fácil acesso à fast-food na saúde dos alunos portugueses.

Although it is an integral part of global change, most of the research addressing the effects of climate change on forests have overlooked the role of environmental pollution. Similarly, most studies investigating the effects of air pollutants on forests have generally neglected the impacts of climate change. We review the current knowledge on combined air pollution and climate change effects on global forest ecosystems and identify several key research priorities as a roadmap for the future. Specifically, we recommend (1) the establishment of much denser array of monitoring sites, particularly in the South Hemisphere; (2) further integration of ground and satellite monitoring; (3) generation of flux-based standards and critical levels taking into account the sensitivity of dominant forest tree species; (4) long-term monitoring of N, S, P cycles and base cations deposition together at global scale; (5) intensification of experimental studies, addressing the combined effects of different abiotic factors on forests by assuring a better representation of taxonomic and functional diversity across the ~73,000 tree species on Earth; (6) more experimental focus on phenomics and genomics; (7) improved knowledge on key processes regulating the dynamics of radionuclides in forest systems; and (8) development of models integrating air pollution and climate change data from long-term monitoring programs.

O cancro é um dos principais problemas de saúde pública na conjuntura atual, e estima-se que será a principal causa de morte no século XXI. O cancro colorretal, em particular, destaca-se por ser um dos cancros mais frequentes na população mundial, e é expectável que a sua incidência e mortalidade aumentem nos próximos anos. Em 2020, foram reportados 10.501 novos casos e 4275 óbitos em Portugal. Os principais fatores de risco associados a esta patologia incluem idade, sexo, alimentação rica em carnes vermelhas, história familiar e fatores genéticos, história pessoal de doença do intestino, tabaco e álcool. Os sintomas mais comuns, apesar de serem afetos a outras doenças, são: alteração do trânsito intestinal, alteração das características das fezes, sangue nas fezes, dor abdominal, emagrecimento inexplicável e fadiga prolongada. As estratégias terapêuticas mais utilizadas no tratamento deste cancro incluem a cirurgia, com o intuito de remover o tumor, a quimioterapia, que interfere com a capacidade de proliferação das células cancerosas, e a terapêutica dirigida, direcionada a características moleculares do cancro. Ainda assim, o prognóstico desta doença continua a ser pouco favorável, o que requer novas estratégias que melhorem a prevenção, o rastreio e o tratamento. A principal ferramenta para a deteção de doenças oncológicas são os exames de rastreio. No entanto, nos últimos anos têm-se desenvolvido novas estratégias para facilitar o processo de deteção. Surgem assim os biomarcadores, entidades que são mensuráveis e que indicam a ocorrência de uma determinada função patológica. Para além de poderem detetar a presença de uma determinada doença (biomarcadores de diagnóstico), os biomarcadores podem também dar indicações sobre a resposta a uma determinada terapêutica (biomarcadores preditivos) ou prever a forma como a doença pode evoluir (biomarcadores de prognóstico). É assim de extrema relevância a determinação de parâmetros, particularmente moleculares, que possam contribuir para uma melhor compreensão do cancro colorretal e consequentemente permitir o desenvolvimento de terapêuticas mais eficazes. O processo de carcinogénese do cancro colorretal é caracterizado pela acumulação de alterações genéticas e epigenéticas que levam à proliferação descontrolada de células normais, o que origina tumores benignos, denominados adenomas, e culmina na formação de tumores invasivos. A primeira etapa deste processo depende da inativação de genes supressores de tumor ou da ativação de oncogenes. De seguida, são necessárias quatro a cinco mutações para o tumor se tornar maligno. Apesar de existir uma certa ordem na ocorrência destas mutações, é a acumulação das mesmas que determina as propriedades do tumor. A perda de estabilidade genómica facilita a acumulação destas mutações e leva ao desenvolvimento do cancro colorretal. Há várias vias através das quais este processo pode ocorrer, mas a mais comum é a via da instabilidade cromossómica. Esta via tem quatro eventos chave: a perda do gene supressor de tumor APC, a ativação do oncogene KRAS, a perda do gene supressor de tumor TP53 e a perda da heterozigotia do braço longo do cromossoma 18. Destes genes, o TP53 é o mais estudado em investigação oncológica, visto estar mutado em cerca de 50% de todos os cancros humanos. O TP53 é um gene supressor de tumor que dá origem à proteína p53, que atua como fator de transcrição. A sua função como supressor de tumor deriva da sua capacidade de responder a condições de stress, que incluem danos no DNA, níveis baixos de oxigénio (hipoxia), ativação de oncogenes, escassez de nutrientes e disfunção ribossomal. Ao estar sujeita a estas condições, a proteína p53 induz a expressão de genes envolvidos na regulação do ciclo celular, na apoptose, na senescência e na reparação de danos no DNA. Deste modo, a p53 é capaz de despoletar programas apoptóticos e impedir o ciclo celular e assim limitar a proliferação de células tumorais. Quando o TP53 está mutado, para além da sua função como supressor de tumor se tornar obsoleta, pode ainda promover a proliferação das células cancerosas e por conseguinte levar ao crescimento de tumores. Pode também estar associado a fenótipos mais agressivos. Conformemente, a perda do TP53 durante a carcinogénese do cancro colorretal dá-se numa fase mais tardia e está associada à disseminação de células tumorais para órgãos distantes (metástases). O desenvolvimento do cancro não depende apenas das células tumorais em si, mas também de componentes celulares e não celulares que circunscrevem o tumor. Estes componentes formam o chamado microambiente tumoral. Este microambiente é composto por fibroblastos, células do sistema imunitário, adipócitos, células neuroendócrinas, matriz extracelular, vasos sanguíneos e linfáticos, entre outros. Numa fase inicial, o microambiente pode formar uma barreira de modo a impedir a propagação do tumor, mas, à medida que o tumor progride, pode acabar por auxiliar no seu desenvolvimento e crescimento. As células cancerosas são assim capazes de recrutar o microambiente tumoral através de diferentes fatores, incluindo oncogenes. No entanto, o microambiente pode também apresentar fatores indicadores de bom prognóstico. Têm surgido nos últimos anos diversas estratégias que procuram compreender os processos que ocorrem no microambiente de modo a integrá-los no desenvolvimento de novas terapêuticas. A elevada instabilidade genética que caracteriza o cancro colorretal dificulta o sucesso da maior parte das terapêuticas que são utilizadas atualmente. As células estromais são mais estáveis do ponto de vista genético, o que as torna alvos atrativos para terapêutica dirigida. É assim imperativo o estudo do microambiente tumoral e dos seus diferentes componentes. Um dos possíveis alvos no microambiente é o TP53. A expressão do TP53 numa determinada célula pode afetar as células circundantes através da regulação de genes que codificam fatores que podem ser secretados. Deste modo, a sua presença no microambiente tumoral pode ser crítica no desenvolvimento tumoral. Na verdade, vários estudos revelaram que a expressão do TP53, na sua forma não mutada, no microambiente tumoral pode ter efeitos diretos no desenvolvimento do tumor. Foi observado que a p53, quando presente no microambiente tumoral, é capaz de inibir a proliferação e disseminação das células tumorais em diferentes tipos de cancro, inibir o processo de angiogénese e ainda potenciar uma resposta imune antitumoral. No cancro colorretal, estipula-se que a p53 possa exercer efeitos semelhantes e estar assim associada a um prognóstico mais favorável. A análise ao estatuto da p53 no microambiente tumoral é feita maioritariamente através da microdissecção de amostras fixadas em formalina e incluídas em parafina. No entanto, estas amostras podem dar origem a artefactos, de modo que os resultados obtidos não são totalmente fidedignos. Assim, são necessários novos estudos que permitam avaliar a função e estatuto da p53 no microambiente tumoral, com a premissa de que o conhecimento obtido possa ser incorporado na prática clínica, melhorando assim os tratamentos já existentes e possibilitando o desenvolvimento de novas terapêuticas.

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O presente Relatório de Prática Letiva Supervisionada - A Expansão e o Multiculturalismo nos séculos XV e XVI – A História na Educação para a Cidadania - realizado no âmbito do Mestrado em Ensino da História no 3º Ciclo do Ensino Básico e no Ensino Secundário, teve a orientação do Professor Doutor Miguel Monteiro, coordenador do respetivo Mestrado. Como premissa na edificação do presente relatório, procurámos refletir sobre o contributo que o Ensino da História poderá ter para uma formação para uma cidadania consciente e ativa, através da exploração didática de temáticas inseridas no Currículo Nacional do Ensino Básico e nas Metas Curriculares para o 3º Ciclo, capazes de proporcionar um processo de ensino-aprendizagem que ultrapasse uma dimensão exclusivamente científica e coloque os alunos a reflectir sobre o mundo que os rodeia. Neste sentido, a educação histórica foi aqui utilizada com o sentido de possibilitar o cumprimento destes propósitos, recorrendo a metodologias ativas, centradas no aluno, para a estruturação de um ensino promotor do desenvolvimento de um espirito crítico e alicerçado numa mensagem de tolerância e aceitação perante a afirmação de sociedades cada vez mais pluralistas e heterogéneas. No âmbito da Iniciação à Prática Profissional II, dei continuidade ao trabalho desenvolvido no ano letivo de 2018/2019, ministrando 8 sessões à turma do 8ºA, no ano letivo de 2019/2020, na Escola Básica do Alto dos Moinhos. Ao longo das sessões lecionadas, procurei conferir utilidade ao estudo da História, procurando incluir os alunos no processo de construção do conhecimento Histórico como necessário para uma adequada reflexão relativa a fenómenos sociais que se vislumbram nos dias que correm, cuja origem se encontra no período histórico em análise ao longo das sessões ministradas no PES.

As provas extenuantes de longa duração ultrapassam os limites normais de intensidade e esforço, sendo os metabolismos ósseo e muscular fundamentais, tanto a nível mecânico como endócrino, interagindo entre si e com o metabolismo energético para manter a homeostasia do organismo. O processo inflamatório constitui um dos maiores riscos metabólicos, pois pode comprometer os tecidos e, assim, afetar esta interação. Este trabalho foi desenvolvido com o intuito de estudar a resposta fisiológica durante provas extenuantes de longa duração, em relação ao processo inflamatório e aos metabolismos energético, ósseo e muscular e de que forma polimorfismos genéticos os influenciam. A amostra deste estudo foi constituída por um grupo de atletas participantes na ultramaratona de ciclismo de montanha TransPortugal (n=51), e por um grupo de atletas de equipas de triatlo e ciclismo, representativo do exercício de intensidade moderada/elevada (n=26). Foram recolhidas amostras biológicas nos ultra-ciclistas antes e após a prova, e nas equipas antes e após a sua época de competições, para quantificação bioquímica de parâmetros de interesse, como 5-HT, osteocalcina, IL 6, creatinina e CRP. Os polimorfismos genéticos em 5HTT e DAT foram determinados por PCR convencional; em COMT, MTHFR e Osteocalcina por PCR/RFLP; e em BDNF, IL-6, VKORC1 e GPRC6A por endpoint genotyping. Os resultados obtidos apontam para o aumento do padrão inflamatório durante a TransPortugal, principalmente nos atletas que terminaram todas as etapas, mas sem que o catabolismo muscular e ósseo tenha sido demasiado exacerbado e danoso para os tecidos. Os polimorfismos nos genes BDNF, 5-HTT e COMT foram os que mais influenciaram a resposta inflamatória, o que sublinha os efeitos das transmissões serotoninérgica e dopaminérgica. O metabolismo energético foi afetado, principalmente, pelos polimorfismos em Osteocalcina e MTHFR, o que reforça o papel endócrino do esqueleto e a influência da epigenética. O polimorfismo em VKORC1 foi o que demonstrou exercer maior influência direta sobre o osso, através do seu poder de carboxilação sobre a OC.

Mycobacterium bovis causes tuberculosis (TB) at the human-wildlife-livestock interface. Environmental persistence of M. bovis excreted by infected hosts may cause indirect transmission to other animals. However, methodological constrains hamper assessment of M. bovis viability and molecular signature in environmental matrices. In this work, an innovative, modular, and highly efficient single-cell workflow combining flow cytometry (FLOW), fluorescence in situ hybridization (FISH), and fluorescence-activated cell sorting (FACS) was developed, allowing detection, quantification, and sorting of viable and dormant M. bovis cells from environmental matrices. Validation with spiked water and sediments showed high efficiency (90%) of cell recovery, with high linearity between expected and observed results, both in cell viability evaluation (r2 =0.93) and FISH-labelled M. bovis cells quantification (r2 ≥0.96). The limit of detection was established at 105 cells/g of soil in the cell viability step and 102 cells/g of soil in the taxonomical labelling stage. Moreover, FACS efficiency attained noteworthy recovery yield (50%) and purity (60% viable cells; 70% taxonomically labelled M. bovis). This new methodology represents a huge step for M. bovis assessment outside the mammal host, offering the rapid quantification of M. bovis cell load and cell viability, including viable but non-culturable cells, and further downstream cell analyses after FACS. Subsequent environmental data integration with the clinical component will expand knowledge on transmission routes, promising new paths in TB research and an intervention tool to mitigate the underlying biohazard.

A Brecha de Sto António é o nome comercial dado a uma rocha que é explorada na Bacia Lusitânica, mais precisamente, na Formação de Sto António-Candeeiros e na Formação Chão das Pias. Estas formações correspondem ao Jurássico médio de idade Bajociano – Batoniano, entre os 166 e os 170 Ma, e relatam o segundo episódio de rifting da Bacia Lusitânica e que expressa uma evolução na sedimentação da bacia para ambientes cada vez mais marinhos. Esta dissertação focou-se essencialmente no estudo de uma área relativamente restricta de 2 a 3 km2 onde estão inseridas duas pedreiras, a pedreira dos Bentos e a pedreira da Moliana, de onde é extraída a Brecha de Sto António. Esta rocha caracteriza-se por apresentar uma textura peculiar brecheficada e heterogénea, de cor acastanhada a creme, localmente com manchas avermelhadas e com pockets preenchidos por calcite tardia e frequentemente euédrica. Após a realização de uma cartografia de detalhe e amostragem, foi possível verificar que a zona estudada se encontra afectada por uma diversidade de episódios de carsificação e apresenta uma grande variedade de fácies que varia tanto vertical, como lateralmente. As rochas calcárias formaram-se num ambiente marinho de baixa profundidade e de hidrodinamismo alto, na proximidade de uma barreira de corais, de que resultaram a formação de alguns biostromas. A elevada porosidade destes calcários terá facilitado a posterior dolomitização, por interacção com um fluido rico em Mg e que se pensa ser a água do mar aliado a um possível refluxo de água do mar ligeiramente evaporada. Por fim, estas rochas sofreram processos de recristalização, dissolução/precipitação de calcite que se pensa serem, em parte, resultantes da percolação de fluidos per descenso de natureza meteórica, que em parte terão sido responsáveis pela carsificação destes calcários. Composicionalmente, os carbonatos estudados têm características similares aos da mesma idade noutros domínios da Bacia lusitânica, contudo apresentam valores anómalos para alguns elementos menores, nomeadamente Fe, Ba, Zn, Mn, Co e Ni, possivelmente herdados da rocha sedimentar carbonatada primária.

Mice carrying the homozygous Looptail (Lp) mutation, affecting the Vangl2 gene – a core element of the Wnt-PCP pathway – are known to develop craniorachischisis, a rare and severe neural tube defect. This derives from an impairment of convergent extensions cellular movements at the neural plate midline level, resulting in a broad floor plate and failure of the initiation of Closure 1 of the neural tube. Neurulation in an important developmental step that is strongly linked to node regression and the establishment of the notochord, both of which appear to be affected by the Lp mutation. Studies on the mouse embryonic node have focused mostly on its ventral component, as this is the one thought to contain all the properties of the organizer. Because the dorsal component of the node – or the dorsal midline primordium (DMP) – has been treated, over the years, as an extension of the epiblast, little is known about the cellular behaviour of this layer. Some evidence suggests that DMP cells may participate in notochordal formation, raising the question of whether or not the DMP contributes to cell intercalation at midline level and overall node regression. Following this hypothesis, and since (ventral) node morphology and midline formation have been shown to be affected in Vangl2Lp/Lp embryos, it is possible that the Lp mutation may also promote defects in the DMP. The main objective of the present work is to shed some light on how DMP cells behave during node regression, and how this process may affect neural plate midline establishment, later on in development. For this purpose, i) apical morphology and cells dynamics in the Vangl2+/+ DMP were characterized ii) and compared to that found in Vangl2Lp/Lp embryos; iii) the parameters found altered in the Vangl2Lp/Lp DMP were also assessed in the Vangl2+/Lp embryo; iv) possible changes at the apical level of the DMP, through its development, were assessed in different genotypes. Through whole mount immunohistochemistry and the use of an antibody against the zonula occludens 1 (ZO1) protein, it was possible to label the apical domain of DMP cells. This, coupled with image segmentation techniques, allowed a cell-by-cell approach which focused, solely, on this dorsal component of the embryonic node. Furthermore, the use of the Lp mouse strain helped to inquire how the Wnt/PCP pathway may act in the context of DMP development. The results reported here suggest an active contribution of the DMP for midline formation and that the Wnt/PCP pathway may be required for proper apical morphology within the DMP. Furthermore, the results suggest that a single copy of the Lp mutation may be sufficient to promote a defect in cell division orientation, and that this, coupled with a partial defect in apical constriction, may be a driver for the failure of Closure 1 in the NT of Vangl2Lp/Lp mice.

Insomnia, the most common sleep disorder, is highly prevalent and causes clinically significant functional distress or impairment, both at physical and psychological levels. Sleep complaints are present in a large majority of pain disorders and individuals with insomnia often suffer from pain. Pain in the orofacial region (OFR) includes the pain arising from the regions above the neck, in front of the ears, and below the orbitomeatal line, the oral cavity itself, and might be also associated with temporomandibular disorders. Few studies have been evaluating the relationship between OFR and insomnia but failed to address the triad OFR, insomnia, and associated psychosocial factors which was the purpose of the present study. For that, anonymized data of 184 adult patients with OFR, both sexes (71.2% women), aged 45.8±16.4 years were extracted from the self-screening WISE platform (Web-based Interdisciplinary Symptom Evaluation). Significant medical or psychiatric conditions, shift working, or drug treatments that may cause insomnia were exclusion criteria. Prevalence data for insomnia (ISI), stratified by severity grade, and psychometric measures (DCQ, GAD-7, IPQ, PCS, PHQ-4, PHQ-9, IEQ, and PHQstr) assessing the dysmorphic concern, anxiety, illness perception, pain related catastrophizing and disability, distress, depression, injustice experience, and psychosocial stress were performed. The correlations of psychometric scores with insomnia grades having gender, age, and employment status as putative confounders were analysed. Globally, patients had a normal weight or were pre-obese, being most of them light smokers and active workers. From the recruited patients, 34.8% reported insomnia symptoms, with 16.3% of them reaching moderate to severe insomnia which is clinically relevant. Pain intensities, psychosocial burden, and sleep disturbances were higher in women than men. Severe depression, anxiety, and distress were the most frequent symptoms (18.5-23.9%), while clinically relevant stress and dysmorphic concern were the least (5.40% and 3.80%, respectively). The results of correlation analysis of the psychometric measures and insomnia scores were as follows: DCQ, GAD-7, IPQ, PCS, PHQ-4, and PHQ-9 had moderate and strong associations (rs > 0.300) with ISI scores of all respondents and women (unlike the male group). The IEQ scores were strongly correlated with ISI scores between 8 and 21 (-0.608 < rs < 0.626). The association between PHQstr and ISI scores was only found in patients unable to work. Patients aged between 30 and 39 years had the greatest number of statistically significant correlations between the variables, while the seniors (>70 years) had none. The active workers constitute the employment status with the highest number of associations between sleep problems and impaired well-being (anxiety, pain catastrophizing, distress, and depression), followed by the retired ones. Despite the small number of data, that should be increased in the future, we may conclude that insomnia and psychosocial stressors biunivocal influence each other, with different weights, in OFR patients. Due to the high incidence of clinically relevant insomnia in OFR patients, these patients should always be screened for insomnia, at least, with a self-assessed questionnaire and appropriately counselled. In addition, our study shows how an easy-to-use self-assessment instrument, when used judiciously by the patient, can be useful in clinical practice by promoting a more complete assessment of the patient, his personalized treatment, and the strengthening of the doctor-patient relationship.

A Diabetes Mellitus do tipo 2 (DMT2) é uma desordem metabólica complexa e heterogénea, resultante de interações entre fatores genéticos e ambientais. A DMT2 é caracterizada pela incapacidade de as células responderem ao estímulo da insulina, que se denomina Resistência à Insulina. Em função deste estado de resistência, há um estímulo para o aumento da produção de insulina. Com o tempo, a produção inadequada de insulina resulta da menor produção de insulina pelas células pancreáticas. As doenças cardiovasculares (DCV) são a causa mais importante de morte entre pacientes de DM. Cerca de 60%-80% das pessoas com DMT2 desenvolvem, e eventualmente morrem de DCV. O objetivo deste estudo foi compreender o papel dos sulfatos derivados da Hcy para o desenvolvimento da doença cardiovascular em indivíduos com DMT2. Avaliar o contributo das variações genéticas da COMT e Heparanase para o desenvolvimento da doença cardiovascular em indivíduos com diabetes tipo 2; E Desenvolver um modelo predição de risco cardiovascular de indivíduos com DMT2, com base em dados bioquímicos, dietéticos e análises genéticas relacionados ao metabolismo da homocisteína. Foi realizado um estudo tipo caso-controlo com amostra constituída por 150 adultos Portugueses (n=75 DMT2 com angiopatia, n=75 DMT2 sem angiopatia) caucasianos, de ambos os géneros, na faixa etária (40-75 anos). Os polimorfismos genéticos foram avaliados por PCR, PCR-RFP e por real time PCR. O genótipo da COMT Val158Met e da HPSE (rs 4693608) foram determinados por eletroforese em gel de agarose. As demais variáveis foram obtidas por consulta da base de dados criada no âmbito do projeto “Hábitos alimentares, hiperhomocisteinémia e doença cardiovascular na diabetes do tipo 2”. A análise estatística foi realizada na linguagem python, considerando valores estatisticamente significativos para p<0.05. Os resultados demostraram que hiperhomocisteinémia e as concentrações de MAD estiveram associados ao maior risco de angiopatia em pacientes com DMT2. O polimorfismo da COMT Val158Met esteve associado à angiopatia em indivíduos com DMT2 e a valores mais elevados de MAD. O polimorfismo da HPSE foi relacionado às médias de CT e MAD. Os resultados obtidos na construção do modelo preditivo indicaram um bom desempenho, com exatidão de 0.80, precisão de 0.79, 0.80 de Recall e F1- Score de 0.79.

A ideia de que a Perturbação Depressiva é uma entidade que compreende vários subtipos e não apenas várias intensidades, tem sido debatida nas últimas décadas. Na perspetiva em que a depressão somente assume intensidades diferentes, a melancolia é encarada como o seu estado mais grave. Numa ótica mais abrangente, é sugerida uma interpretação binária, e são descritos dois tipos de depressão: a não-melancólica (reativa ou neurótica) e a melancólica (endógena ou psicótica). Os pacientes melancólicos mostram características clínicas e respostas ao tratamento distintas, razões pelas quais, ao longo do tempo, se tem tentado definir, e diferenciar, a melancolia, com o objetivo de a tornar numa categoria própria da Perturbação Depressiva. É, todavia, necessário definir os critérios de diagnóstico específicos para este subtipo. Devido a esta necessidade, o presente estudo realizou-se dando continuidade a um trabalho prévio envolvendo uma coorte de doentes deprimidos (melancólicos e não melancólicos) e outra de não deprimidos, estando a ser desenvolvido desde 1977. Este estudo tem por objetivo esclarecer se os doentes melancólicos têm caraterísticas sociodemográficas e clínicas, diferentes dos não-melancólicos. Os indivíduos foram recrutados em simultâneo entre 1977 e 1984, estando os 322 elementos de controlo (não-expostos) em regime de internamento para cirurgia de rotina (apendicectomia ou colecistectomia), no mesmo período que a coorte deprimida, de também 322 indivíduos, tendo sido angariada por consulta clínica. Os sujeitos foram novamente contactados entre 2009 e 2014 de modo a avaliar o seu estado de demência e quantificar a associação entre diferentes subtipos de depressão (nomeadamente melancólica). Para o presente estudo, procedemos, essencialmente, ao estudo comparativo entre a depressão melancólica e não-melancólica (coorte depressiva), fazendo recurso do IBM SPSS Statistics (versão 26.0) com a probabilidade estatística concluída através do teste Qui-Quadrado de Pearson e amostras independentes Teste t de Student. Considerando 133 indivíduos na coorte deprimida (47 melancólicos e 86 não-melancólicos) e 144 na coorte de controlo. Os nossos resultados confirmam uma significância estatística para a idade no 1º diagnóstico de depressão (p=0,006), para as condições socioeconómicas (p=0,008), para o número de tentativas de suicídio (p= 0,03) e para a mortalidade (p=0,05). Concluindo, o presente estudo parece corroborar com a hipótese da melancolia não ser afetada por elementos stressores e do meio ambiente, existindo uma tendência para a componente endócrina.

A infeção causada por S. agalactiae consiste em uma das principais causas de doença invasiva neonatal em todo o mundo. Este trabalho teve como objetivo fazer uma análise fenotípica e genotípica de uma coleção de 83 estirpes de S. agalactiae isoladas de recém-nascidos e bebés até os três meses de idade com doença invasiva, provenientes de diferentes instituições de saúde de Portugal entre o período de 2016 e 2019. Todas as estirpes foram caracterizadas por sequenciação genómica incluindo a técnica de Multilocus sequence typing (MLST). Os serotipos III e Ib foram os mais dominantes, juntos representando cerca de 80% de toda a coleção de estirpes. Comparativamente com o estudo anterior, houve uma mudança na prevalência dos serotipos causando infeção invasiva entre recém-nascidos com o serotipo Ib sobrepondo o serotipo inicialmente dominante Ia. Mais de metade das estirpes foram agrupadas no CC17, com destaque para a linhagem genética hipervirulenta representada pelo ST17/III/rib/PI-1+PI-2b. Um subconjunto destas estirpes apresentando apenas PI-2b, observado anteriormente em estirpes do CC17 de recém-nascidos em Portugal (2015), foi novamente encontrado também apresentando vários genes de resistência antimicrobiana. Todas as estirpes do estudo eram sensíveis a penicilina, apesar de um pequeno número de estirpes (3,6%) apresentarem a substituição G398A na PBP2x que geralmente é associada a diminuição de suscetibilidade à penicilina. A resistência à eritromicina e clindamicina foi de 29% para ambos entre 2016 e 2019, maior que a observada no estudo anterior em Portugal (2015). O aumento da resistência aos macrólidos está associado ao aumento da nova linhagem genética do Ib/ST1, resultado de um processo de substituição capsular, um fenómeno raro mas que tem sido observado em Portugal. A expansão de clones emergentes com resistência aos macrólidos e lincosamidas e de estirpes multirresistentes aos antimicrobianos destacam a necessidade urgente de vigilância contínua das infeções invasivas e não invasivas causadas por S. agalactiae.

Ao longo dos anos, tem-se verificado um aumento na realização de exames de medicina nuclear em toda a população. Embora os exames sejam cruciais para a obtenção de um diagnóstico, a utilização de radiação continua a ser um problema, especialmente para os pacientes mais jovens, sendo necessário reduzir a dose administrada nestes exames sem prejudicar a qualidade de imagem obtida. Esta dissertação tem como objetivo o desenvolvimento de uma interface para uso médico que permita abrir imagens de medicina nuclear e através da aplicação do filtro minimização da variação total (TV, do inglês ‘Total Variation’) devolverá as mesmas imagens melhoradas. Esta plataforma incluirá ainda as ferramentas de quantificação de imagem mais usadas pelos clínicos para permitir a quantificação do impacto do uso do filtro. Desta forma, será avaliada a possibilidade de que com a aplicação do filtro minimização da TV seja possível reduzir o ruído em imagens de medicina nuclear, com o objetivo de que no futuro os exames de medicina nuclear sejam realizados com uma menor dose de radiação administrada. Uma vez que, após serem processados com este método, espera-se que as imagens adquiridas com menos dose fiquem com uma qualidade de imagem igual as imagens adquiridas com maior dose e sem a aplicação do filtro. Para a realização da dissertação, utilizou-se a versão do filtro minimização da TV utilizando o modelo de ruído de Poisson, uma vez que o mesmo tem sido utilizado na redução de ruído em imagens de mamografia e tem demonstrado resultados bastante encorajadores, uma vez que, este filtro tem a capacidade de preservar os contornos e simultaneamente, reduzir o nível de ruído presente nas imagens. A plataforma criada, utilizando o módulo app designer do Matlab R2020, destaca-se pela sua simplicidade e intuitividade no que toca a sua apresentação e funcionamento, cumprindo os requisitos que lhe foram propostos. Para a sua validação comparou-se, os resultados obtidos utilizando a plataforma com resultados já publicados. De seguida, o método foi validado com imagens de PET de vários órgãos e diferentes patologias obtidas através de uma base de dados pública. Para avaliar o impacto da aplicação deste filtro para imagens de medicina nuclear, nomeadamente através de imagens PET, as imagens filtradas e não filtradas foram sujeitas a análises quantitativas, relativamente aos parâmetros obtidos nos valores de TV para a imagem original, para a imagem filtrada, o valor da variação da TV, a relação sinal ruído (SNR), a percentagem de ruído retirado e por fim o contraste. Foi também avaliado a existência de um λ ideal para imagens PET de um adenocarcinoma pulmonar. Os resultados obtidos através da aplicação do filtro em imagens de PET de vários órgãos e diferentes patologias, são bastante promissores uma vez que, o filtro minimização da TV conseguiu em todos os casos reduzir os valores de TV. Foi possível observar a redução do ruído, juntamente com o aumento dos valores de SNR. Foi unicamente nos valores de contraste que ocorreu uma ligeira diminuição face as imagens originais. Relativamente a avaliação da existência de um λ ideal para imagens PET de um adenocarcinoma pulmonar, a utilização dos valores médios de λ, nomeadamente o λ=20 para o modo ‘2D Slice’, o λ=18 para o modo ‘3D Slice-by-slice’ e λ=19 para o modo ‘3D Filter’, conseguiu em todos os casos a redução do ruído e o aumento do SNR. Demonstrando assim que os valores apresentados para λ médios possam ser bons candidatos para serem os λ ideais para imagens PET de um adenocarcinoma pulmonar, que tenham como ano de aquisição 2011, uma espessura de corte de 3 mm, uma resolução de 200 x 200 pixels, o espaçamento entre pixéis de 4,07mm x 4,07mm, e por fim adquiridas utilizando o radiofármaco FDG.

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Os ecossistemas de transição costeira como estuários e lagoas estão entre os ecossistemas aquáticos mais produtivos do planeta, reconhecidos mundialmente como uma componente fundamental das zonas costeiras em termos de relevância biológica e utilização antropogénica. Os estuários ao longo da costa portuguesa diferem nas suas características geomorfológicas e hidrológicas. Estes sistemas desempenham um papel crucial em termos de áreas de viveiro para espécies de peixes economicamente importantes. Embora vários autores tenham observado uma elevada variabilidade específica nas comunidades de peixes estuarinos ao longo da costa portuguesa, poucos estudos exploram os fatores que a influenciam. A maioria dos estudos portugueses que envolvem estas comunidades concentram-se num único estuário e, quando vários são analisados, focam-se em poucos fatores abióticos e bióticos na avaliação da variabilidade específica das comunidades. O presente trabalho visa analisar a função ecológica desempenhada pelos estuários portugueses para as comunidades de peixes, nomeadamente em termos da variação da sua riqueza específica, utilizando uma base de dados históricos de 30 anos proporcionada pela infraestrutura Rede Portuguesa de Monitorização Costeira (CoastNet). Para tal, foi desenvolvido um modelo aditivo generalizado (GAM) de forma a analisar a variação da riqueza de espécies de peixes em função das características temporais, espaciais e ambientais dos nove principais sistemas estuarinos da costa portuguesa. Os resultados do presente trabalho demonstraram diferenças significativas na riqueza de espécies de peixes no espaço (entre os nove estuários de estudo) e no tempo (à escala anual e mensal), sendo estas diferenças influenciadas por fatores abióticos como a salinidade e a temperatura. Adicionalmente, este modelo aditivo generalizado permitiu discutir cenários possíveis de variações futuras dos fatores significativos causados pelos efeitos das alterações climáticas. Este tipo de modelos poderá desempenhar um papel útil como instrumento preliminar para preparar planos de conservação a longo prazo a incluir na legislação nacional.

The general growth and improved accessibility to electronic health records demands an identical level of progress in terms of the research community regarding clinical models. The usage of machine learning techniques is key to this development, and so they are increasingly being used in large medical databases with the purpose of creating solutions that work for specified patients, no matter the task or the disease. Acute kidney injury (AKI) is a broad disease defined by abrupt changes in renal function. AKI has a high morbidity and mortality, with an increased focus on critically ill patients. The main goal of this thesis is to study the development of AKI within a patient’s stay in the intensive care unit (ICU). Data from the MIMIC-III database was used to collect information regarding the patients. After a detailed exclusion criteria, those were evaluated in terms of AKI stages, with the purpose of predicting the next value of AKI stage one hour after the sequence of information fed to the model. This can suggest the capacity of the model at predicting the aggravation of a patient’s AKI condition. The sequences used have hourly information for every feature, and were used sequences of 6h, 12h and 24h length. Self-attention mechanisms were used to make the predictions, using an adaptation for multi-variate time series built from the successfully used models on natural language processing (NLP) tasks. The predictions on this work were made for two variations of the KDIGO classification system: one where only the serum creatinine (SCr) criteria was taken into account to determine the patient’s AKI stage, and other where both SCr and urine output (UO) were considered. While most works addressing AKI only tend to use SCr values to determine the patient’s AKI condition, the results were compared using both approaches and were better when using both SCr and UO. For those experiments, the model achieved up to 68.05% accuracy predicting an episode of AKI, compared to the 66.67% accuracy achieved using only SCr values, which outperformed state-of-the-art results for both cases. Feature importance was also used for each dataset associated with the two variations of KDIGO classification system to identify what were the most important features. Furthermore, final results were compared when using all features versus only using the most 10 important ones.

This dissertion presents the study, in the millimetre and infrared, of a sample of 14 star forming regions found within dense cores in the outer Galaxy. Millimetre spectroscopic ob servations of the sources were performed, at the Yebes Observatory and at the Onsala Space Observatory, using the CO (J=1−0), 13CO (J=1−0), CS (J=1−0), and CS (J=2−1) line tran sitions. The data were reduced using the CLASS software to obtain the parameters of the lines. Emission of CO (J=1−0), 13CO (J=1−0), CS (J=1−0) and CS (J=2−1) has been detected toward the sources, confirming the existence of dense gas cores. Contour maps of the sources were made for the integrated intensity of the CS (J=1−0), CO (J=1−0), and 13CO (J=1−0) lines, and the physical parameters of the cores were derived. The cores had masses ranging from 10 to 1000 M . Near-infrared observations of the source IRAS00544+5609 were performed, at the La Palma observatory, at the J, H and Ks bands. The data were reduced using the IRAF software to obtain mosaics of the region in the direction of the source. Apperture photometry was used to obtain a list of magnitudes of the stars in the mosaics. Star density maps show a density peak overlapping the peaks of the millimetre maps, suggesting the presence of an embedded cluster within the gas core. A color-color diagram of the cluster members shows a significant number of stars with infrared excess. To acquire information pertaining to the dust content of the clouds, sub-millimetre images of the sources were retrieved from the Herschel space observatory archive. The images show strong emission in the direction of the sources, indicating the presence of great amounts of dust.