Repositório RCAAP

O principal objectivo desta tese foi fazer um estudo do comportamento magnético de nanopartículas magnéticas inseridas em sistemas diamagnéticos amorfos. Neste trabalho estudaram-se dois sistemas: nanopartículas de ouro (Au) dispersas em celulose e nanopartículas de óxido de níquel (NiO) dispersas em vidro. No primeiro caso, as nanopartículas de ouro foram diluídas em celulose com diferentes concentrações pretendendo-se analisar o comportamento magnético das amostras em função da concentração de nanopartículas e do estiramento da celulose. A dimensão média das nanopartículas de ouro utilizadas é aproximadamente 2.85nm, dimensão a que é esperado comportamento magnético (a dimensão das partículas foi estimada a partir de resultados de microscopia electrónica de transmissão (TEM)). No segundo caso, as nanopartículas de óxido de níquel (NiO) foram crescidas em vidro de sílica nanoporoso. O óxido de níquel é antiferromagnético mas na forma de nanopartículas, o efeito de superfície implica não compensação dos momentos magnéticos e torna as partículas magnéticas. Neste caso, estudaram-se 3 distribuições de tamanhos médios diferentes, caracterizadas por TEM, que permitiram fazer um estudo do comportamento magnético em função da dimensão e a sua evolução após tratamento térmico. Em todas as situações e para todas as amostras, de ouro e de óxido de níquel, foram realizadas medidas de magnetização a diferentes temperaturas e para diferentes valores de campo magnético. Nesta dissertação faz-se inicialmente uma introdução aos diferentes comportamentos magnéticos dos materiais e descrevem-se as técnicas experimentais utilizadas para obtenção dos resultados. Em seguida apresentam-se e discutem-se separadamente os resultados experimentais obtidos para cada um dos sistemas referidos e as principais conclusões a que conduziram.

Multicomponent synthesis are convergent reactions in which three or more starting materials react in a single step to form the product. In the discovery and development of new drugs, multicomponent reactions offer several advantages over traditional synthesis: shorter experiment time, less need for laboratory techniques and scalability. Thus, the objective of this work was to perform the multicomponent synthesis of a hexahydroquinoline compound whose pharmacological activity has been described previously. The synthesis product was characterized by spectroscopic techniques such as Fourier transform infrared spectrometry and 1H, 13C and HMQC nuclear magnetic resonance (NMR). The mechanism of the reaction was proposed to include a conjugated Michael addition. Subsequently, inclusion complexes (ICs) at 1:1 and 1:2 stoichiometries were prepared with the appropriate cyclodextrin to increase the aqueous solubility and bioavailability of this molecule. Kneading and lyophilization (LYO) methods were used to prepare the inclusion complexes, which were evaluated by phase solubility and 1H NMR spectroscopy, with LYO at a 1:2 stoichiometry having the best results. The ICs were then characterized by differential scanning calorimetry, near-infrared spectroscopy and in vitro dissolution tests, which verified a slower release of the compound with the potential to improve its biological properties.

Este estudo insere-se no âmbito da formação inicial de professores, mais precisamente sobre a prática pedagógica desenvolvida num curso de formação de professores, numa Escola Superior de Educação. Tem como principal objectivo descrever e analisar as necessidades e dificuldades assim como os êxitos de duas estagiárias relativamente à sua prática pedagógica, nas disciplinas de Ciências da Natureza e Matemática. A metodologia do estudo enquadra-se num contexto de investigação qualitativa e interpretativa. A vertente empírica desenvolveu-se durante a última prática pedagógica, que as duas estagiárias participantes realizaram durante a sua formação inicial. Este estudo apresenta dois estudos de caso que incluem histórias resultantes de uma análise sociolinguística das narrativas. Em termos gerais, este estudo permitiu compreender as percepções das estagiárias relativamente à sua formação, à prática pedagógica que desenvolveram, aos problemas que sentiram, à forma como os resolveram assim como aos seus êxitos, o que levou a um maior conhecimento destes aspectos, podendo contribuir para uma reflexão sobre a formação inicial, nas instituições de formação. Relativamente às necessidades de formação, ao nível do conhecimento da área científica, da didáctica e da pedagogia, as estagiárias, em termos gerais consideraram que a formação inicial as prepara suficientemente ao nível dos conhecimentos pedagógicos e didácticos. Mas salientam a deficiente formação que recebem para leccionar no 1º ciclo do ensino básico. Durante a prática pedagógica as estagiárias debatem-se com algumas dificuldades, tais como: a) a organização e dinâmica das aulas que planificam, as quais são normalmente demasiado extensas; b) o “choque” inicial resultante dos primeiros contactos com o contexto escolar, c) o controlo da dinâmica da aula, ao nível do ritmo com que são apresentadas e realizadas as actividades com os alunos e d) as questões imprevistas dos alunos. Em relação ao que mais temem pode-se salientar: 1) a insuficiente exploração das actividades; 2) as incorrecções científicas; 3) não conseguir controlar o mau comportamento dos alunos e 4) a avaliação da prática pedagógica. Uma das formas de resolver as suas dificuldades é através da reflexão sobre a acção, a qual pode levar, por exemplo, a reformulações das suas planificações. Relativamente ao seu desenvolvimento profissional, neste estudo compreende-se que os primeiros contactos com o contexto profissional são momentos de grande ansiedade, conflito e até mesmo desânimo, ou seja, passam pela chamada fase de sobrevivência e descoberta. Para as estagiárias a relação e o apoio das professoras cooperante e supervisoras é um dos factores determinantes para o sucesso do seu desempenho durante a prática pedagógica, assim como as suas experiências anteriores em contexto de sala de aula, a turma, e a relação e apoio da colega de grupo.

Wastewater treatment plants (WWTPs) are significant reservoirs of bacterial resistance. This work aims to identify the determinants of resistance produced by Gram-negative bacteria in the influent and effluent of two WWTPs in Portugal. A total of 96 wastewater samples were obtained between 2016 and 2019. The numbers of total aerobic and fecal contamination bacteria were evaluated, and genomic features were searched by polymerase chain reaction (PCR) and Next-Generation Sequencing (NGS). Enterobacteriaceae corresponded to 78.6% (n = 161) of the 205 isolates identified by 16sRNA. The most frequent isolates were Escherichia spp. (57.1%, n = 117), followed by Aeromonas spp. (16.1%, n = 33) and Klebsiella spp. (12.7%, n = 26). The remaining 29 isolates (14.1%) were distributed across 10 different genera. Among the 183 resistant genes detected, 54 isolates produced extended spectrum β-lactamases (ESBL), of which blaCTX-M-15 was predominant (37 isolates; 68.5%). A KPC-3 carbapenemase-producing K. oxytoca was identified (n = 1), with blaKPC-3 included in a transposon Tn4401 isoform b. A higher number of virulence genes (VG) (19 genes) was found in the E. coli 5301 (O25b-ST131-B2) isolate compared with a commensal E. coli 5281 (O25b-ST410-A) (six genes). Both shared five VG [Enterobactin; Aerobactin, CFA/1 (clade α); Type1 (clade γ1); Type IV]. In conclusion, this work highlights the role of relevant clinical bacteria in WWTPs, such as KPC-3-producing K. oxytoca, and, for the first time, a CTX-M-15-producing Ochromobactrum intermedium, a human opportunistic pathogen, and a SED-1-producing Citrobacter farmeri, an uncommon CTX-M-type extended-spectrum beta-lactamase.

Staphylococcus aureus é um patobionte que coloniza a mucosa nasal e a pele de vários mamíferos, incluindo o Homem. As estirpes comensais de S. aureus podem, em situações específicas, quebrar barreiras naturais, ganhando acesso a tecidos mais profundos, e causando infeções com gravidade muito variável. Esta espécie possui uma notável diversidade metabólica, adaptabilidade ecológica, e resistência a xenobióticos. Esta resiliência tem por base a formação de biofilmes. Grande parte das infeções provocadas por S. aureus estão associadas a biofilmes, nos quais se desenvolvem subpopulações persistentes que exibem tolerância a múltiplas drogas e se evadem da ação do sistema imunitário. O processo de formação de biofilmes em S. aureus engloba vários determinantes genéticos envolvidos na adesão e colonização de superfícies; o operão ica envolvido na produção de PIA, importante para a matriz extracelular; outras adesinas que medeiam interações intercelulares consolidando o biofilme; o operão agr associado à deteção de quórum; entre outros determinantes. Embora, nos últimos anos, se tenha expandido o conhecimento sobre o processo de formação de biofilmes em S. aureus, muitos aspetos permanecem por esclarecer, nomeadamente a base molecular subjacente à heterogeneidade fenotípica observada neste domínio em isolados de diferentes origens. Também pouco se conhece sobre os loci genéticos que estão sob pressão seletiva para a expressão do fenótipo de biofilme. Assim, o principal objetivo deste trabalho foi o de contribuir para o aumento do conhecimento sobre as bases fenotípicas e genéticas da formação de biofilmes em Staphylococcus aureus, através de uma abordagem integrada, combinando análise fenotípica, genómica comparativa e evolução adaptativa experimental. Para o efeito, foram caracterizados 115 isolados de S. aureus obtidos de animais selvagens, javali (n = 68), veado-vermelho (n = 36) e gamo (n = 11), em seis locais de amostragem. Os isolados foram comparados na sua capacidade de formação de biofilme in vitro após crescimento, durante 48 horas a 37 ºC, em microplacas de 24 poços contendo meio de cultura MuellerHinton (MH), sem agitação. Os 115 isolados foram classificados em três categorias: fracos produtores de biofilme (WBP, 9.57% dos isolados), produtores moderados de biofilme (MBP, 76.52%) e produtores fortes de biofilme (SBP, 13.91%). Registou-se que, dos 115 isolados, os isolados multirresistentes apresentavam produção média de biofilme significativamente maior quando comparada aos grupos suscetível e resistente. Após sequenciação completa do genoma dos 115 isolados, classificou-se in silico cada isolado no seu genótipo spa-type e no perfil alélico gerado por Multilocus sequence typing (MLST), com o objetivo de explorar eventuais correlações entre o genótipo e o fenótipo (i.e. formação de biofilme). Nas condições estudadas, verificou-se que os isolados com spa-type t034 produzem significativamente maior quantidade de biofilme em comparação com a maioria dos isolados doutros spa-types. Os isolados com spa-type t3583 e t701 foram associados a reduzida formação de biofilme. Em contraste, os isolados com perfil alélico (sequence-type) ST6133, associados ao spa-type t034 e complexo clonal CC398, destacam-se dos restantes, devido à sua forte capacidade de produção de biofilme. Apesar da literatura descrever que os operões agr e ica desempenham papéis essenciais no processo de formação de biofilmes, neste trabalho não se registaram correlações significativas entre a quantidade de biofilme formado e os quatro grupos de agr existentes. Apenas os isolados do agr-type I apresentaram menor produção de biofilme (diferenças estatisticamente não significativas). Quando se comparou o posicionamento filogenético dos isolados pertencentes às duas categorias extremas de produção de biofilme (fracos e fortes produtores de biofilme), não se registaram grupos monofiléticos, quando se examinou as sequências concatenadas do operão ica, ou do operão agr. Para aferir a base genética subjacente a diferentes fenótipos de formação de biofilmes, explorouse abordagens de genómica comparativa dos 115 isolados, focando especificamente as sequências de 15 genes anteriormente associados na literatura ao processo de desenvolvimento do biofilme. A análise filogenética dos isolados resultante do alinhamento das sequências concatenadas dos 15 genes não segregou os isolados SBP dos isolados WBP, apenas evidenciou que o posicionamento filogenético dos isolados é determinado pelo seu perfil alélico MLST (grupos monofiléticos). Os perfis alélicos ST5, ST3224 e ST6133 apresentavam exclusivamente isolados SBP, enquanto o ST72 estava associado apenas a isolados WBP. Os polimorfismos encontrados nestes 15 loci foram analisados com maior detalhe para identificar variantes exclusivas (ou mais frequentes) de SBP. Comparando-se os polimorfismos encontrados em, pelo menos, 40% dos isolados WBP e dos isolados SBP, foram encontradas 50 variantes potencialmente relevantes para descrever o fenótipo de formação de biofilme. Estas mutações estavam presentes em 9 dos 15 genes selecionados. As mutações foram mais frequentes nos genes fnbA, ebpS e clfA, que codificam adesinas, associadas às primeiras etapas de formação de biofilme (adesão). Os genes icaB e icaC mutados em isolados de SBP podem afetar positivamente a produção de PIA. Paralelamente, foi aplicada uma metodologia de evolução adaptativa experimental (ALE) para selecionar artificialmente isolados com maior produção de biofilme, seguida de sequenciação do genoma dos isolados evoluídos, visando explorar as variantes genómicas emergentes. Os isolados de S. aureus ST0563 e ST0719 (WBP) e ST0645 (SBP) foram selecionados para este estudo. O ensaio estabelecido promoveu ciclos de recolonização e dispersão do biofilme. Nas duas linhagens dos isolados WBP, registou-se um aumento consistente da capacidade de formação de biofilme dos isolados amostrados semanalmente, independente da presença da esfera. Nas linhagens do isolado ST0645 não foi observado o mesmo aumento. A análise assente em genómica comparativa evidenciou que a maioria dos polimorfismos acumulados nos isolados evoluidos são SNPs, dos quais mais de 50% correspondem a alterações missense com elevado impacto. Nos isolados evoluídos das linhagens ST0563 foram encontradas variantes nos genes mraY, purR, ebh, nrnA, agrA, esaA e apt. Nos isolados evoluídos de ST0645 foram encontradas mutações nos genes apt, saeR, saeS e arlS. Por último, nos isolados evoluídos das linhagens de ST0719 foram encontrados polimorfismos nos genes purR, copA, pbuG, clpC, purA, pepF1_1, fadR, tarS, bem como nos genes cujos produtos são uma proteína PhoH-like e uma farnesil difosfato sintetase. A biogénese da membrana/envelope e transcrição foram as categorias funcionais COG das variantes associadas a um maior impacto (cerca de 600% de aumento) na formação de biofilme deste estudo. Por outro lado, detetaram-se variantes em loci associados a transdução de sinal e ao transporte e metabolismo de nucleótidos nos isolados evoluídos nos quais se registou um aumento de biofilme de 300% e 400%, respetivamente. Foram também conduzidos ensaios de ALE para selecionar artificialmente isolados com maior tolerância ao linezolide (antibiótico de importância crítica). Este ensaio teve por objetivo explorar as variantes genómicas de isolados evoluídos com foco no aumento da concentração mínima inibitória (MIC) e o impacto subjacente à formação de biofilmes. A estirpe S. aureus ATCC 25923 foi sujeita a ciclos de exposição a elevadas concentrações de linezolide (20x a MIC) durante 7 ou 14 dias de tratamento. Durante este período, registou-se uma ligeira diminuição da viabilidade celular nas três linhagens evoluídas. Ao longo do ensaio, diminuiu o número de bactérias com a MIC original (MIC = 4 mg/L). Na Linhagem 1, obteve-se três isolados nos quais se registou o aumento em quatro vezes da MIC (MIC = 16 mg/L); na Linhagem 2, apenas um isolado; e, na Linhagem 3, também três isolados. Para quantificação do biofilme produzido, foram selecionados todos os isolados de todas as linhagens com MIC = 16 mg/L, e todos os isolados obtidos nos dias 7 e 14 que apresentavam MIC = 8 mg/L. Não se registaram variações significativas na quantidade de biofilme formado pelos isolados evoluídos, por comparação com o isolado parental. Em contraste, dois isolados da Linhagem 1 apresentaram redução significativa da formação de biofilme. Sequenciou-se o genoma completo de alguns dos isolados resistentes de cada linhagem que apresentavam maior produção de biofilme. Foram identificados sete polimorfismos nos isolados selecionados das Linhagens 1 e da 2, enquanto na Linhagem 3, sujeita a menos ciclos de exposição a linezolide (sete dias) registou-se apenas um polimorfismo com efeito sinónimo numa proteína hipotética. A maioria dos outros polimorfismos encontrados são SNPs, a maioria com efeito missense. Foram encontradas mutações nos genes nanE, fadR, atl_2, mdrP_1, apt e ogt. Variantes genómicas nas categorias funcionais COG transporte e metabolismo de carbohidratos foram associadas a maior impacto na quantidade de formação de biofilmes dos isolados evoluídos, tendo-se registado uma diminuição drástica da quantidade de biofilme (superior a 60%), quando comparada com o biofilme original. Por outro lado, e em linha com o ensaio ALE anterior, variantes categorizadas na função transcrição, foram detetadas em isolados evoluídos nos quais se registou um aumento (25%) na quantidade de biofilme produzido. Em suma, neste trabalho, verificou-se que a especialização para o crescimento em biofilme ocorre rapidamente, com alterações genómicas várias e complexas, em associação com a remodelação de determinantes da adesão e da matriz extracelular, bem como a acumulação de polimorfismos em efetores de diferentes níveis de regulação. Foram identificados vários genes com um papel putativo na formação de biofilmes que poderão ser explorados no futuro como biomarcadores deste fenótipo e potenciais alvos terapêuticos.

Baltasar da Silva Lisboa foi um homem de ciência luso-brasileiro considerado o precursor das ideias ambientalistas no Brasil através do desenvolvimento de uma política de conservação das florestas que visava, para além da preservação das árvores com um fim comercial, garantir estes recursos às gerações futuras e o bem vital das florestas. Vale salientar que a sua prática da História Natural esteve sempre aliada à expressão de convicções filosóficas e políticas. Este artigo refere e analisa um manuscrito inédito, guardado pelo Instituto Histórico e Geográfico Brasileiro, de sua autoria sobre visões sócio-políticas do período colonial e imperial do Brasil que possibilita uma crítica historiográfica sobre a Independência do Brasil. As considerações apresentadas resultaram de um amplo estudo das fontes e da historiografia pertinente ao assunto.

A temperatura da superfície do solo (ou LST, do inglês land surface temperature) é uma variável importante da superfície terrestre que governa as trocas de água e energia entre a superfície e a atmosfera através da evapotranspiração, fluxos radiativos e fluxos de calor turbulentos. A única forma prática de se obter uma cobertura global e continua de LST é através de estimativas a partir de satélite. Estas são habitualmente baseadas em medições radiométricas na janela atmosférica do infravermelho térmico (ou TIR, do inglês thermal infrared) que abrange os comprimentos de onda 8 a 13 µm. A extensa cobertura espacial e temporal proporcionada por medições de satélite permite a utilização de LST no estudo do clima da Terra, na análise de climas urbanos ou ainda na monitorização de campos agrícolas ou incêndios florestais. Apesar dos atuais produtos operacionais de LST, baseados em medições de satélite, terem incertezas abaixo de 1 °C em condições de céu limpo, os métodos de estimativa de LST ainda têm algumas limitações que reduzem a sua precisão em certas condições. Uma limitação é a estimativa de LST durante elevadas concentrações de poeiras. Atualmente, os algoritmos de estimativa de LST utilizados em contextos operacionais não consideram inteiramente o efeito de aerossóis e vários estudos indicam que estes produtos têm erros significativos em situações de elevada concentração de aerossóis. No sentido de melhorar as estimativas de LST nessas condições, esta dissertação apresenta um estudo do efeito radiativo de um tipo de aerossóis— as poeiras — sobre estimativas de LST e explora uma forma de melhorar essas estimativas através de uma calibração do algoritmo generalized split-window (GSW) dependente da concentração de aerossóis. A análise do efeito radiativo das poeiras é realizada através de simulações com o modelo de transferência radiativa RTTOV. As simulações mostram que este tipo de aerossóis, tal como o vapor de água, causam absorção diferencial da radiação TIR emitida pela superfície nas duas bandas geralmente utilizadas na técnica split-window, em torno de 10.8 e 12.0 µm. Contudo, como a absorção diferencial das poeiras é oposta à do vapor de água, a correção atmosférica realizada pelo algoritmo GSW, quando as concentrações de aerossóis são elevadas, é incorreta e resulta na subestimação da LST. Esta absorção diferencial correspondente a uma diminuição da transmissividade da atmosfera mais intensa no canal dos 10.8 do que dos 12.0 µm. Quando a concentração de poeiras, exprimido pela espessura ótica (ou DuAOD, do inglês dust aerosol optical depth), é elevada (DuAOD ≈ 2.0), a transmissividade do canal 10.8 µm pode diminuir até 40%. Isto significa que, nestas condições, de toda a radiação TIR emitida pela superfície somente 60% chega ao topo da atmosfera (ou TOA, do inglês top of the atmosphere) e é medida pelo sensor abordo do satélite. No entanto, as simulações mostram que para DuAOD ≈ 2.0 a diminuição de radiância total que atinge o TOA é de cerca 4%, devendo-se ao aumento de emissão por parte dos aerossóis suspensos na atmosfera que balançam a redução de radiação vinda da superfície. Com base na absorção diferencial das poeiras revelada pelas simulações com o RTTOV, tendo em conta que a abordagem split-window tem a capacidade característica de corrigir a atenuação atmosférica com base na absorção diferencial, é explorada uma nova calibração do algoritmo GSW, adicionando uma dependência dos coeficientes GSW em DuAOD. Para esse efeito criou-se uma base de dados de calibração que representa uma ampla gama de condições atmosféricas e de superfície para várias classes de DuAOD, de forma a de garantir a robustez do algoritmo em todos os cenários possíveis. A seleção dessas condições é realizada utilizando uma metodologia que calcula a dissimilaridade entre duas condições atmosféricas com base nos perfis de temperatura, humidade e aerossóis. Como os perfis de temperatura têm uma variabilidade vertical muito diferente da humidade e dos aerossóis, o peso que os perfis de cada variável têm sobre o cálculo da dissimilaridade entre duas condições atmosféricas não é igual. Na sua forma original desta metodologia, que não inclui os perfis de aerossóis, os perfis de temperatura têm um peso igual a um e os perfis de humidade têm um peso igual a 1/9. Para esta nova base de dados, onde os perfis de aerossóis têm de ser incluídos, foram testados três pesos diferentes (0.1, 0.2 e 0.3) para os aerossóis, mantendo os pesos dos perfis de temperatura e humidade da metodologia original. Um peso maior implica que as diferenças entre os perfis de aerossóis têm mais importância no calcula da dissimilaridade entre duas condições atmosféricas do que um peso menor. Uma análise das condições selecionadas com os três pesos mostra que um peso maior melhora a representatividade dos perfis de aerossóis, mas diminui a representatividade dos perfis de temperatura. Por outro lado, um peso menor melhora a representatividade dos perfis de temperatura, diminuindo a representatividade dos perfis de aerossóis. Os perfis de humidade não são significativamente afetados pelos diferentes pesos. Com base nesta análise, escolheu-se o valor intermédio (0.2) para criar a base de dados de calibração. Os dados atmosféricos e de superfície são obtidos, respetivamente, da 4ª-geração da reanálise global de composição atmosférica da CAMS (Copernicus Atmosphere Monitoring Service), EAC4, e da 5ªgeração da reanálise climática do Centro Europeu de Previsão do Tempo a Médio Prazo (ou ECMWF, do inglês European Centre for Medium-Range Weather Forecasts), ERA5. Com esta nova base de dados calibrou-se um algoritmo GSW com dependência no DuAOD, lembrando que um GSW tradicional só tem dependência no conteúdo atmosférico de vapor de água, no ângulo de visão do satélite e na emissividade. O desempenho deste novo algoritmo é testado face a um algoritmo GSW tradicional que não inclui aerossóis no processo de calibração. O algoritmo GSW dependente de DuAOD apresenta resultados promissores, indicando melhorias na precisão da LST de pelo menos 2 °C para valores de DuAOD acima de 0.4. Uma vez que a área total da terra onde DuAOD atinge valores de 0.4 ou mais é extensa, abrangendo todos os desertos quentes globais e as regiões circundantes afetadas pela advecção das poeiras, a implementação de um algoritmo para a estimativa de LST que seja robusto às poeiras (e outros tipos de aerossóis) pode melhorar significativamente a precisão geral dos produtos de LST e aumentar sua utilidade para aplicações como estudos climáticos. Apesar destes resultados promissores, trabalhos futuros terão de considerar diversos aspetos antes da implementação desta metodologia para a estimativa de LST em condições em que a concentração de aerossóis é elevada. Por exemplo, a precisão das estimativas de LST num contexto operacional utilizando um algoritmo GSW dependente de DuAOD dependerá da precisão das previsões de DuAOD utilizadas. Assim sendo, é necessário realizar uma análise de sensibilidade de forma a determinar o impacto das incertezas do DuAOD nas precisões da LST. Este tipo de análise também permitirá definir o limiar de DuAOD acima do qual o novo algoritmo GSW tem um desempenho melhor do que um GSW tradicional, tendo em conta as incertezas dos algoritmos e das previsões de DuAOD. Além disso, uma vez que a correção atmosférica realizada pelo GSW assume uma linearidade na absorção diferencial pelo vapor de água, é necessário investigar se essa linearidade também ocorre no caso das poeiras. Se esse não for o caso, uma formulação diferente do split-window poderá ter um desempenho melhor do que o GSW dependente do DuAOD apresentado neste trabalho.

A presente comunicação incide especificamente no tema “a transversalidade da ciência nas suas relações com a vida” enfocando a responsabilidade social na prática científica e tecnológica. A época que estamos vivendo, profundamente marcada pela pandemia do coronavírus COVID-19, pelas suas consequências na vida dos povos e das nações, e pelos mecanismos e fórmulas encontradas para atenuar e combater os seus efeitos, encaixa perfeitamente no tema supracitado, uma vez que as ferramentas tecnológicas que temos ao dispor revelaram-se importantíssimas para atenuar os efeitos das medidas sanitárias tomadas pelos Estados para abrandar o impacto deste novo coronavírus na vida cotidiana, assim como, mais uma vez na história da humanidade, a ciência se revelou fundamental para o combate a esta doença, revelando uma notável capacidade de resposta e superando barreiras temporais que há poucas décadas atrás se revelariam inultrapassáveis. Procurou-se igualmente fazer uma retrospectiva dos modos de ver e pensar a ciência e a tecnologia segundo o olhar de alguns dos principais pensadores dos últimos séculos, desde as luzes do século XVIII até à contemporaneidade. Fez-se também uma reflexão sobre o uso da ciência e da tecnologia para fins bélicos e quais as consequências para a humanidade de uma ausência de ética e de sentido de responsabilidade social no uso e manejo da ciência e da tecnologia. A comunicação finaliza com algumas sugestões que as diferentes comunidades poderão considerar no período pós-COVID-19 de forma a corrigir eventuais desigualdades provocadas pela situação pandêmica e a potenciar novos paradigmas provocados pela presente revolução digital.

Background Antimicrobial resistance (AMR) represents one of the most crucial threats to public health and modern health care. Previous studies have identified challenges with estimating the magnitude of the problem and its downstream effect on human health and mortality. To our knowledge, this study presents the most comprehensive set of regional and country-level estimates of AMR burden in the WHO European region to date. Methods We estimated deaths and disability-adjusted life-years attributable to and associated with AMR for 23 bacterial pathogens and 88 pathogen–drug combinations for the WHO European region and its countries in 2019. Our methodological approach consisted of five broad components: the number of deaths in which infection had a role, the proportion of infectious deaths attributable to a given infectious syndrome, the proportion of infectious syndrome deaths attributable to a given pathogen, the percentage of a given pathogen resistant to an antimicrobial drug of interest, and the excess risk of mortality (or duration of an infection) associated with this resistance. These components were then used to estimate the disease burden by using two counterfactual scenarios: deaths attributable to AMR (considering an alternative scenario where infections with resistant pathogens are replaced with susceptible ones) and deaths associated with AMR (considering an alternative scenario where drug-resistant infections would not occur at all). Data were solicited from a wide array of international stakeholders; these included research hospitals, surveillance networks, and infection databases maintained by private laboratories and medical technology companies. We generated 95% uncertainty intervals (UIs) for final estimates as the 25th and 975th ordered values across 1000 posterior draws, and models were cross-validated for out-of-sample predictive validity. Findings We estimated 541 000 deaths (95% UI 370 000–763 000) associated with bacterial AMR and 133 000 deaths (90 100–188 000) attributable to bacterial AMR in the whole WHO European region in 2019. The largest fatal burden of AMR in the region came from bloodstream infections, with 195 000 deaths (104 000–333 000) associated with resistance, followed by intra-abdominal infections (127 000 deaths [81 900–185 000]) and respiratory infections (120 000 deaths [94 500–154 000]). Seven leading pathogens were responsible for about 457 000 deaths associated with resistance in 53 countries of this region; these pathogens were, in descending order of mortality, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecium, Streptococcus pneumoniae, and Acinetobacter baumannii. Methicillin-resistant S aureus was shown to be the leading pathogen–drug combination in 27 countries for deaths attributable to AMR, while aminopenicillin-resistant E coli predominated in 47 countries for deaths associated with AMR. Interpretation The high levels of resistance for several important bacterial pathogens and pathogen–drug combinations, together with the high mortality rates associated with these pathogens, show that AMR is a serious threat to public health in the WHO European region. Our regional and cross-country analyses open the door for strategies that can be tailored to leading pathogen–drug combinations and the available resources in a specific location. These results underscore that the most effective way to tackle AMR in this region will require targeted efforts and investments in conjunction with continuous outcome-based research endeavours. Funding Bill & Melinda Gates Foundation, Wellcome Trust, and Department of Health and Social Care using UK aid funding managed by the Fleming Fund.

Klebsiella pneumoniae is an important nosocomial infectious agent with a high antimicrobial resistance (AMR) burden. The application of long read sequencing technologies is providing insights into bacterial chromosomal and putative extra-chromosomal genetic elements (PEGEs) associated with AMR, but also epigenetic DNA methylation, which is thought to play a role in cleavage of foreign DNA and expression regulation. Here, we apply the PacBio sequencing platform to eight Portuguese hospital isolates, including one carbapenemase producing isolate, to identify methylation motifs. The resulting assembled chromosomes were between 5.2 and 5.5Mbp in length, and twenty-six PEGEs were found. Four of our eight samples carry blaCTX-M-15, a dominant Extended Spectrum Beta Lactamase in Europe. We identified methylation motifs that control Restriction–Modification systems, including GATC of the DNA adenine methylase (Dam), which methylates N6-methyladenine (m6A) across all our K. pneumoniae assemblies. There was a consistent lack of methylation by Dam of the GATC motif downstream of two genes: fosA, a locus associated with low level fosfomycin resistance, and tnpB transposase on IncFIB(K) plasmids. Overall, we have constructed eight high quality reference genomes of K. pneumoniae, with insights into horizontal gene transfer and methylation m6A motifs.

Klebsiella pneumoniae is a rod-shaped, encapsulated, Gram-negative bacteria associated with multiple nosocomial infections. Multidrug-resistant (MDR) K. pneumoniae strains have been increasing and the therapeutic options are increasingly limited. Colistin is a long-used, polycationic, heptapeptide that has regained attention due to its activity against Gram-negative bacteria, including the MDR K. pneumoniae strains. However, this antibiotic has a complex mode of action that is still under research along with numerous side-effects. The acquisition of colistin resistance is mainly associated with alteration of lipid A net charge through the addition of cationic groups synthesized by the gene products of a multi-genic regulatory network. Besides mutations in these chromosomal genes, colistin resistance can also be achieved through the acquisition of plasmid-encoded genes. Nevertheless, the diversity of molecular markers for colistin resistance along with some adverse colistin properties compromises the reliability of colistin-resistance monitorization methods. The present review is focused on the colistin action and molecular resistance mechanisms, along with specific limitations on drug susceptibility testing for K. pneumoniae.

A expressão génica nos eucariotas envolve um número de etapas interligadas desde a transcrição do material genético até à tradução em proteína, sendo os RNAs mensageiros (mRNAs) os intermediários chave ao longo deste processo. Embora a complexidade da expressão génica dos eucariotas permita um controlo da produção proteica a vários níveis, também torna este processo vulnerável a erros. As células eucariotas desenvolveram mecanismos elaborados de controlo de qualidade do mRNA que asseguram a fidelidade da expressão génica através da detecção e degradação de transcritos anómalos. Como exemplo destes mecanismos de controlo de qualidade temos: o NMD (Nonsense-mediated mRNA Decay), que reconhece e elimina mRNAs que contenham codões prematuros de terminação da tradução, e o NSD (Nonstop mRNA Decay) que elimina mRNAs que não possuem codões de terminação em fase na grelha de leitura. O exossoma é um complexo proteico evolutivamente conservado que possui actividade ribonucleolítica e que se encontra presente tanto no núcleo como no citoplasma das células eucariotas. Uma das várias funções do exossoma é participar na degradação de mRNAs anómalos portadores de mutações nonsense ou de mutações nonstop. Como consequência da recente identificação de uma nova ribonuclease, a hDis3L1, como parte integrante do exossoma, este trabalho teve como objectivo avaliar o envolvimento desta subunidade do exossoma humano na degradação inerente ao NMD e ao NSD. Para tal, usaram-se variantes do gene da β-globina humana: um gene portador de mutação nonsense e sensível ao mecanismo de NMD (β39, com uma mutação nonsense no codão 39), um gene sem qualquer codão de terminação em fase (βnonstop) e o correspondente gene normal (βn), como genes modelo. Estes genes clonados em vectores de expressão foram usados para transfectar transitoriamente células HeLa em cultura. Simultaneamente, foram realizados testes de RNA interference (RNAi) através da transfecção de small interference RNAs (siRNAs) específicos para o transcrito que codifica hDis3L1 e, como controlo, siRNAs para um transcrito não específico (luciferase). Nestas condições de inibição da expressão da hDis3L1 ou em condições normais, as células em cultura foram colhidas para extracção do RNA total. O nível de mRNA das globinas foi quantificado por RT-qPCR (quantitative reverse transcription polymerase chain reaction), enquanto que o nível de inibição da expressão de cada transcrito sujeito a RNAi foi avaliado por RT-PCR (semi-quantitative reverse transcription polymerase chain reaction). Em condições de baixa expressão de hDis3L1 na célula, pretendeu-se verificar se os transcritos β39 e βnonstop aumentam de expressão, o que indicaria que o mecanismo de NMD e/ou o mecanismo de NSD ficariam inibidos, sugerindo que a ribonuclease hDis3L1 estaria envolvida no processo de degradação de transcritos com mutações nonsense ou non-stop, respectivamente. De facto, os resultados obtidos neste trabalho sugerem que a hDis3L1 participa no mecanismo de NMD, uma vez que se verificou um aumento dos níveis de transcritos nonsense aquando da inibição da hDis3L1. Por outro lado, sugerem também que a hDis3L1 não participa no mecanismo de NSD, uma vez que não se verificaram alterações nos níveis dos transcritos nonstop em condições de inibição desta subunidade do exossoma. Estes resultados contribuem assim para melhor compreender estes processos de degradação envolvidos no controlo de qualidade da expressão génica e podem contribuir para um possível desenvolvimento de ferramentas específicas para a manipulação do processo de NMD, o qual pode levar ao estabelecimento de terapias específicas direccionadas a patologias, como cancro e muitas doenças genéticas, associadas a este tipo de mutações nonsense.

Tuberculosis (TB), caused by Mycobacterium tuberculosis, is one of the deadliest infectious diseases worldwide. Multidrug and extensively drug-resistant strains are making disease control difficult, and exhausting treatment options. New anti-TB drugs bedaquiline (BDQ), delamanid (DLM) and pretomanid (PTM) have been approved for the treatment of multi-drug resistant TB, but there is increasing resistance to them. Nine genetic loci strongly linked to resistance have been identified (mmpR5, atpE, and pepQ for BDQ; ddn, fgd1, fbiA, fbiB, fbiC, and fbiD for DLM/PTM). Here we investigated the genetic diversity of these loci across >33,000 M. tuberculosis isolates. In addition, epistatic mutations in mmpL5-mmpS5 as well as variants in ndh, implicated for DLM/PTM resistance in M. smegmatis, were explored. Our analysis revealed 1,227 variants across the nine genes, with the majority (78%) present in isolates collected prior to the roll-out of BDQ and DLM/PTM. We identified phylogenetically-related mutations, which are unlikely to be resistance associated, but also high-impact variants such as frameshifts (e.g. in mmpR5, ddn) with likely functional effects, as well as non-synonymous mutations predominantly in MDR-/XDR-TB strains with predicted protein destabilising effects. Overall, our work provides a comprehensive mutational catalogue for BDQ and DLM/PTM associated genes, which will assist with establishing associations with phenotypic resistance; thereby, improving the understanding of the causative mechanisms of resistance for these drugs, leading to better treatment outcomes.

Genomic-based surveillance on the occurrence of drug resistance and its transmission dynamics has emerged as a powerful tool for the control of tuberculosis (TB). A whole-genome sequencing approach, phenotypic testing and clinical-epidemiological investigation were used to undertake a retrospective population-based study on drug-resistant (DR)-TB in Rio Grande do Sul, the largest state in Southern Brazil. The analysis included 305 resistant Mycobacterium tuberculosis strains sampled statewide from 2011 to 2014, and covered 75.7% of all DR-TB cases identified in this period. Lineage 4 was found to be predominant (99.3%), with high sublineage-level diversity composed mainly of 4.3.4.2 [Latin American and Mediterranean (LAM)/RD174], 4.3.3 (LAM/RD115) and 4.1.2.1 (Haarlem/RD182) sublineages. Genomic diversity was also reflected in resistance of the variants to first-line drugs. A large number of distinct resistance-conferring mutations, including variants that have not been reported previously in any other setting worldwide, and 22 isoniazid-monoresistant strains with mutations described as disputed in the rpoB gene but causing rifampicin resistance generally missed by automated phenotypic tests as BACTEC MGIT. Using a cut-off of five single nucleotide polymorphisms, the estimated recent transmission rate was 55.1%, with 168 strains grouped into 28 genomic clusters. The most worrying fact concerns multi-drug-resistant (MDR) strains, of which 73.4% were clustered. Different resistance profiles and acquisition of novel mutations intraclusters revealed important amplification of resistance in the region. This study described the diversity of M. tuberculosis strains, the basis of drug resistance, and ongoing transmission dynamics across the largest state in Southern Brazil, stressing the urgent need for MDR-TB transmission control state-wide.

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Ancient sublineage of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype is endemic and prevalent in East Asia and rare in other world regions. While these strains are mainly drug susceptible, we recently identified a novel clonal group Beijing 1071-32 within this sublineage emerging in Siberia, Russia and present in other Russian regions. This cluster included only multi/extensive drug resistant (MDR/XDR) isolates. Based on the phylogenetic analysis of the available WGS data, we identified three synonymous SNPs in the genes Rv0144, Rv0373c, and Rv0334 that were specific for the Beijing 1071-32-cluster and developed a real-time PCR assay for their detection. Analysis of the 2375 genetically diverse M. tuberculosis isolates collected between 1996 and 2020 in different locations (European and Asian parts of Russia, former Soviet Union countries, Albania, Greece, China, Vietnam, Japan and Brazil), confirmed 100% specificity and sensitivity of this real-time PCR assay. Moreover, the epidemiological importance of this strain and the newly developed screening assay is further stressed by the fact that all identified Beijing 1071-32 isolates were found to exhibit MDR genotypic profiles with concomitant resistance to additional first-line drugs due to a characteristic signature of six mutations in rpoB450, rpoC485, katG315, katG335, rpsL43 and embB497. In conclusion, this study provides a set of three concordant SNPs for the detection and screening of Beijing 1071-32 isolates along with a validated real-time PCR assay easily deployable across multiple settings for the epidemiological tracking of this significant MDR cluster.

Partindo do estudo de algumas peças seiscentistas seriadas no Rijksmuseum, aponta-se a evidência de miscigenações artísticas cujos programas reflectem sinergias e visões globalizantes na arte holandesa de então. Tais obras – naturezas-mortas, retratos, biombos Namban, berços indianos, porcelanas e azulejos – são analisadas de forma comparativa, por meio de study-cases e recorrendo também a outras peças em museus e colecções portuguesas, numa visão microartística que, com a sua dimensão ora periférica ora transcontinental, só pode ser entendida dentro dos conceitos de iconologia do intervalo de Aby Warburg, da transfiguração de Arthur C. Danto ou da antropologia da arte de Hans Belting. O denominador comum que relaciona todas estas peças reflecte a circulação de modelos, viagens de artistas e relações globais que atingiam o seu clímax com uma Economia-Mundo antes centrada em Lisboa e Sevilha e que, no século XVII, se desloca para Amsterdam. A Holanda passa a destacar-se, assim, entre as sociedades absolutistas e nobiliárquicas do Antigo Regime. Procurando novas formas de governo e equilíbrio social nas Províncias Unidas, os interesses da nova República são contra o domínio católico dos Habsburgo. A partir da União de Utrecht (1579), a burguesia protestante das sete províncias rebeldes liga-se a interesses independentistas e fundem-se com objectivos comerciais através da criação de Companhias monopolistas (VOCVereeniegde Oostindische Compagnie, e WIC-West Indische Compagnie) como forma de afrontar os interesses da Península Ibérica. A nova República constrói-se sob a égide do desenvolvimento comercial e da tolerância religiosa, acolhendo muitos judeus peninsulares fugidos da Inquisição, que se tornam membros da cidade e, em alguns casos, accionistas da VOC. A nível do governo das Províncias Unidas, os Estados Gerais estabelecem-se como órgão de soberania, sendo o Stathouder, de forma efectiva, o Governador Geral do Estado. O quadro cultural deste século de ouro holandês explica-se também pelo desenvolvimento de uma economia monetária e especulativa, de que é exemplo a bolha da Tulipomania (1636-1637). Em Amsterdam, o papel da Bolsa (1602) e do Wisselbank (1609), considerado o primeiro banco central do Mundo, prova a modernidade destas práticas. A jurisprudência e o Direito internacional servem os interesses económicos por meio dos escritos do jurista Hugo Grotius (1609), que legitima a liberdade dos mares contra Tordesilhas, pois as pretensões hegemónicas e transoceânicas da República contrariavam direitos históricos de portugueses e espanhóis. Salientam-se duas figuras cujas acções contribuíram para o domínio da República: Jan Huyghens van Linschoten, autor do Itinerario (1596), e Jan Pieterszoon Coen, fundador de Batávia, sede da VOC no Oriente, epítome do expansionismo holandês na Ásia. Para perceber as obras artísticas em apreço, analisamos melhor a expansão da VOC, a sua estrutura organizacional de Companhia-Estado que rivaliza directamente com os portugueses, tanto na Ásia como na sua relação com o Bakufu do Japão. Por outro lado, a WIC cobiçava, no espaço atlântico, as riquezas brasileiras, resultando numa ocupação holandesa deste território, denominado Nieuw Holland, contra a qual a diplomacia portuguesa, e o Pe António Vieira, entre outros, sempre combateram. O desenvolvimento desta Economia-Mundo centrada em Amsterdam, facilitada pelo dinâmico sector naval das Províncias, levou ao crescimento de inúmeros conflitos militares, crescimento de rotas comerciais, locais e transatlânticas e o desenvolvimento de gostos exóticos, resultantes de um fascínio pela Ásia. Também os encontros de culturas, e as formas transmigradas daí resultantes, são provindas das inúmeras viagens, aliadas a uma intensa circulação de produtos de luxo e de consumos artísticos, surgindo códigos de vestir próprios. A nível artístico, se as províncias católicas do Sul (Frandres) dominadas pela Espanha acolhem bem o Barroco e as directivas de Trento, nas províncias rebeldes do Norte, protestantes, dominadas pela Holanda, verificam-se surtos de iconoclastia, rapidamente ultrapassados por uma produção artística maioritariamente laica, com temas clacissizantes, de influência italiana, mantendo-se a tradição holandesa da natureza-morta, do retrato, da alegoria moral e da paisagem, imbuídas agora de exotismos provenientes das viagens ao Oriente e da circulação de artigos de luxo nos mercados dos Países-Baixos. Trata-se eminentemente de uma cultura visual, produto de uma sociedade rica e empreendedora, que valoriza a actividade comercial e o lucro, cheia de alegria de viver, apreciadora de luxos e confortos domésticos, das artes, pinturas, flores e jardins, formas de fruição e símbolos de estatuto social e comercial.

Diferentemente do espanhol e do alemão, que possuem duas conjunções coordenativas adversativas distintas (pero e sino; e aber e sondern, respetivamente), o português europeu (PE) possui apenas o morfema mas, veiculando quer o valor de negação de expectativas quer o de correção. Nestas línguas que têm apenas um mas, como o PE e o francês (veja-se Anscombre & Ducrot, 1977), assume-se classicamente que o valor de correção está principalmente associado a construções do tipo não X mas Y (cf. Horn, 2001). Por outro lado, frases com a estrutura X mas não Y, têm sido frequentemente descuradas quanto à definição do seu valor. No entanto, Vicente (2010) e Steindl (2017) assumem que em espanhol e alemão é possível nesta construção ocorrerem as conjunções adversativas pero e aber, típicas de contextos de negação de expectativas, com partículas de polaridade no segundo termo coordenado, veiculando o valor de correção. Apresentámos evidência empírica de que as frases adversativas devem ser analisadas da seguinte forma: (i) as frases com negação frásica (no primeiro termo) devem ser analisadas como coordenação de dois constituintes subfrásicos, sendo que apenas o primeiro está sob o escopo da negação, por questões de localidade e também pelo facto de mas bloquear a negação para o segundo termo; (ii) quanto aos casos com negação de constituintes, a análise adotada será de coordenação de sintagmas (sem elipse) mesmo quando são CPs; (iii) por fim, para frases com negação frásica no segundo termo coordenado, seguindo Saab (2008) para espanhol e Matos (2017) para o PE, assumimos que estas construções são casos de Elipse de TP com itens de polaridade, como também foi assumido por Vicente (2010 ) para frases com pero + itens de polaridade, que, na sua investigação, correspondem a coordenação frásica + elipse. Quanto aos valores da conjunção adversativa, nesta investigação, de forma a complementar a análise teórica, construímos duas tarefas de Compatibilidade Contexto-Frase, em que os participantes eram expostos a uma frase-alvo e dois contextos: um com valor de correção e outro de negação de expectativas. Na tarefa, foi-lhes solicitado que avaliassem qual o contexto mais compatível com a frase-alvo ou, alternativamente, se ambos eram. A primeira tarefa incluiu frases com negação frásica e de constituintes, no primeiro termo coordenado. Os dados obtidos sugerem uma preferência pela leitura cumulativa de correção e negação de expectativas, e não apenas de correção. Os dados também revelaram que, diferentemente do que é referido na literatura, a negação de constituintes não facilita a interpretação corretiva. Na segunda tarefa, as frases-alvo foram manipuladas e a negação (frásica ou de constituintes) surgia no segundo termo coordenado, correspondendo, assim, a frases com Elipse de TP e Contraste Sintagmático. Os resultados indiciam uma preferência pela leitura de negação de expectativas, em ambas as construções. Porém, a leitura corretiva não foi rejeitada, provando, assim, que é possível ter um elemento negativo no segundo termo coordenado e obter uma interpretação de correção. Estes dados analisados nesta investigação mostram que a ligação assumida por alguns autores entre os valores da conjunção e a configuração sintática não é robusta. Vicente (2010), por exemplo, afirma que frases corretivas correspondem a coordenação frásica + elipse (cf. Clause-Only Coordination Hypothesis), diferentemente de construções com valor de negação de expectativas que podem ser analisadas como coordenação subfrásica ou frásica. Quanto às frases corretivas, Toosarvandani (2013) e Steindl (2017) consideram que é possível aceitar uma análise de coordenação frásica + elipse, embora os argumentos não sejam suficientemente robustos para excluir a hipótese de coordenação subfrásica. Os nossos resultados mostram que não há uma ligação direta entre estrutura sintática e valor semântico (num sentido amplo e estrito). Os participantes do nosso estudo revelaram uma preferência por uma leitura cumulativa ou de negação de expectativas, e estas leituras não se correlacionam com a sintaxe. Nesta tese também exploramos construções incoordenadas, que se caracterizam pela presença de mas e de uma frase, que ocorre na posição do segundo termo, e que possui o valor de negação de expectativas (cf. Kuteva et al, 2017). Retomamos o trabalho de Kuteva et al e propomos uma análise para frases incoordenadas e para o estatuto do conector coordenativo que nelas ocorre. Propomos a existência de dois tipos de frases incoordenadas, dependendo de como é legitimada a sua ocorrência. Distinguimos entre verdadeiras incoordenadas e pseudo-incoordenadas: as primeiras são legitimadas pela sua conexão com um contexto não-linguístico; as últimas têm um primeiro termo omitido, que pode ser recuperado pelo conteúdo linguístico do fragmento discursivo anterior. Quanto ao estatuto de mas nestas construções, levantamos a hipótese de que mantém a sua natureza conjuncional, e que possui o traço [± coordenativo]. Este traço será valorado como [+ coordenativo] em frases coordenadas ou pseudo-incoordenadas, por ter, nestas construções, uma função coordenativa; e o valor [- coordenativo] será associado às verdadeiras incoordenadas, revelando sua natureza não coordenativa. Também propomos que mas incoordenado não verifica todas as propriedades associadas às conjunções, por, na verdade, algumas serem propriedades da coordenação. No geral, este trabalho lança luz sobre a interação entre sintaxe, discurso e valores semânticos/pragmáticos associados a construções adversativas. Além disso, acreditamos que nossa investigação sobre a incoordenação mostra que este processo estende a sintaxe às estruturas discursivas.

Numerous models exist for users to simulate land change to communicate with an audience concerning futureland change. This article raises four fundamental questions to help model users decide whether to use anymodel: (1) Can the user understand the model? (2) Can the audience understand the model? (3) Can the usercontrol the model? (4) Does the model address the goals of the specific application? This article applies thesequestions to the popular cellular automata–Markov (CA–Markov) model as IDRISI’sCA–Markov moduleexpresses. Sensitivity analysis examines 120 ways to set the module’s parameters. Verification compares themodule’s behavior to the software’s documentation. Results show that the cellular automata’s allocation fails tofollow the quantity of change that the Markov module computes. The module’s behavior is likely to cause usersto misinterpret the validation metrics and to miscommunicate with audiences. Thus, the answers to the fourquestions were not satisfactory for this article’s case study. This article’s framework helps users to judge amodel’s appropriateness for a specific application by combining sensitivity analysis with verification in amanner that helps to interpret validation. Users should answer the four questions as they decide whether to useany software’s modules.

Large wildfires have been landmark events in continental Portugal during the last decades, producing catastrophic damages and shaping the socio-economics of the country. In this work, the role of the wind field in wildfires in the last two decades is analyzed to assess the role in triggering or exacerbating these events. Furthermore, this thesis reinforces the need to incorporate information about wind direction in meteorological fire danger indexes. Two intra-annual peaks of fire activity were found, a mostly human-inflicted smaller peak in March and a major one in the summer period. No significant relation was found between the number of ignitions and burned area, akin to previous studies. Spatially, it was found that ignitions are more frequent in highly populated areas, whereas the larger burned areas are found in the inland, with dense forestation and less population. This discrepancy translates into the fact that only 0.06% of ignitions accounted for nearly 50% of all burned area. The meteorological fire danger, through the Fire Danger Index (FWI), was analyzed per ignition observation, with ignitions which individually originated burned areas above 1000 ha being markedly associated to the conditions of higher fire danger. Analysis of the wind field in continental Portugal during the warmest period of the year presented a strong northwesterly component while days with more than 1000 ha of burned area, had a prevalence of easterly winds in the ignition points. Principal component analysis was used to identify long shape wildfires, which were furthermore associated with the most intense winds. Considering the wildfires which had their prevalent direction and wind field direction closely aligned (forming an angle less than 45º), they represent 24.2% of all burned area for the 2001-2020 period, although corresponding to only 0.03% of all ignitions. These mostly occur where topography is more complex, in inland Portugal.