Repositório RCAAP
Experiência de utilização num portal de serviços empresarial
Experiência de utilização tem vindo a tornar-se cada vez mais relevante para os designers de interação, onde o foco é colocado não só na funcionalidade da interface, mas também na acessibilidade da informação disponibilizada, na estética e na satisfação do utilizador. Com o novo conceito de “OneNovartis”, criado pelo cliente Novartis, iniciou-se um projecto de desenvolvimento de um novo portal interno de serviços para os colaboradores. A renovação do portal de acordo com a nova imagem da Novartis foi feita com base na plataforma “ServiceNow” que, embora seja bastante personalizável, apresenta algumas restrições devido às regras e campos específicos da própria plataforma. Isto em conjunto com a lista de funcionalidades necessárias ao portal de utilizador, assim como a visão do cliente em unir todos os departamentos e serviços num único portal, exige um design de interface meticuloso com o foco na experiência de utilização. Neste trabalho desenvolvemos um novo e melhorado portal para a “OneNovartis” e realizamos um estudo comparativo entre o portal resultante deste projecto e o portal existente. O novo portal foi feito de acordo com novos requisitos e objectivos, mas mantendo as funcionalidades que já existiam, de modo a ser possível fazer uma comparação justa. No estudo, avaliamos a usabilidade dos dois portais de modo a verificar qual deles tem mais qualidade, seja de acordo com os serviços que são disponibilizados por parte da Novartis, seja pela experiência de utilização dos portais. Através da análise dos resultados dos testes verificamos que o novo portal aparenta ter sido uma melhoria em termos de usabilidade e experiência de utilização, embora ainda haja alguns factores que podem ser melhorados. Actualmente, o novo portal já se encontra em utilização e estamos a fornecer suporte a pedidos de ajuda que facilitem a transição dos trabalhadores da Novartis para este
Disentangling the lifespans of hepatitis C virus-infected cells and intracellular vRNA replication-complexes during direct-acting anti-viral therapy
The decay rate of hepatitis C virus (HCV)-infected cells during therapy has been used to determine the duration of treatment needed to attain a sustained virologic response, but with direct-acting anti-virals (DAA), this rate has been difficult to estimate. Here, we show that it is possible to estimate it, by simultaneously analysing the viral load and alanine aminotransferase (ALT) kinetics during combination DAA therapy. We modelled the HCV RNA and ALT serum kinetics in 26 patients with chronic HCV genotype 1b infection, under four different sofosbuvir-based combination treatments. In all patients, ALT decayed exponentially to a set point in the normal range by 1-3 weeks after initiation of therapy. The model indicates that the ALT decay rate during the first few weeks after initiation of therapy reflects the death rate of infected cells, with an estimated median half-life of 2.5 days in this patient population. This information allows independent estimation of the rate of loss of intracellular replication complexes during therapy. Our model also predicts that the final ALT set point is not related to the release of ALT by dying HCV-infected cells. Using ALT data, one can separately obtain information about the rate of 'cure' of HCV-infected cells versus their rate of death, something not possible when analysing only HCV RNA data. This information can be used to compare the effects of different DAA combinations and to rationally evaluate their anti-viral effects.
2025-10-28T12:21:14Z
Cardozo, Erwing Fabian Ji, Dong Lau, George Schinazi, Raymond F Chen, Guo-Feng Ribeiro, Ruy M. Perelson, Alan S
Emergence of resistance mutations in simian immunodeficiency virus (SIV)-infected rhesus macaques receiving non-suppressive antiretroviral therapy (ART)
Two SIVmac251-infected rhesus macaques received tenofovir/emtricitabine with raltegravir intensification. Viral rebound occurred during treatment and sequencing of reverse transcriptase and integrase genes identified multiple resistance mutations. Similar to HIV infection, antiretroviral-resistance mutations may occur in SIV-infected nonhuman primates receiving nonsuppressive ART. As ART administration to nonhuman primates is currently dramatically expanding, fueled by both cure research and the study of HIV-related comorbidities, viral resistance should be factored in the study design and data interpretation.
2025-10-28T12:19:40Z
Policicchio, Benjamin Bruno Sette, Paola Xu, Cuiling Haret-Richter, George Dunsmore, Tammy Pandrea, Ivona Ribeiro, Ruy M. Apetrei, Cristian
Hereditary anemia - characterization of the genetic basis and subjacent mechanisms
Anemia is a global public health problem affecting 24.8 % of the world population and is mostly caused by nutritional iron deficiencies. Additionally, molecular mechanism´s disturbances associated with the iron homeostasis may cause hereditary anemias of challenging diagnosis, such as Iron-Refractory Iron Deficiency anemia (IRIDA). Alternatively, globin chains structure or synthesis changes may lead to hemoglobinopathies, another type of hereditary anemia. Firstly, in order to explain atypical hemoglobinopathies’ phenotypes and understand underlying pathophysiological mechanisms, 15 hemoglobinopathies clinical cases were studied by PCR, gapPCR, Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA) and automated Sanger sequencing of the various globin genes. These techniques made it possible to clarify the molecular causes behind these complex phenotypes, with molecular lesions being responsible for rare hemoglobin structural variants, β- and α-thalassemias, and the presence of polymorphisms that modulate the expression of globin genes. Secondly, we focused on ten IRIDA suspects, by amplifying their TMPRSS6 gene by long-PCR followed by Next-generation Sequencing and in silico analysis for predicting the possible pathogenic effect of the detected genetic variants. Through this analysis, only the phenotype of one patient could be justified by the presence of digenic inheritance of the novel damaging mutation (TMPRSS6: c.871G>A; G291S) and 3 common modulating SNPs in the same gene (K253E, S361S and Y739Y), in addition to the co-inheritance of the –α 3.7kb -thalassemia allele, which may add up to an IRIDA-like phenotype. Thirdly, to detect the presence and understand the roles and of common SNPs in genes related to iron metabolism, a case-control study was performed to investigate the influence of TMPRSS6 (V736A and K253E) and HFE (H63D and C282Y) on the hematological and iron parameters of 317 Portuguese subjects divided into 3 groups: β-thalassemia trait (BTT), iron deficiency anemia (IDA) and controls. Subjects were genotyped using PCR-(RFLP) Restriction fragment length polymorphism and Amplification-Refractory Mutation System (ARMS)-PCR techniques. Results suggests that both heterozygous (TC) and homozygous (CC) genotypes of V736A act as a protective factor against IDA, and that in the female control group, the CC genotype had significantly increased MCV, MCH and TSAT parameters when compared to the wild type (TT). Logistic regression results detected a positive association between H63D variant and RDW in control subjects, and an association between this variant and the iron parameters of BTT subjects. Finally, we evaluated the diagnostic performance of 13 mathematical indices for differentiating microcytic anemia in BTT and or IDA subjects, to find which ones would better apply to the Portuguese population. When accessing the performance of the indices we found that for a female adult Portuguese population the best performing ones where RBC, G&K and RDWI, similarly to other Mediterranean countries, and also France and Brazil, the latter probably resulting from migratory movements and Portuguese ancestry, respectively. Results imply that these indices can aid diagnosing the condition underlying microcytic anemia, recognizing individuals suspected of BTT and forwarding them to additional biochemical and molecular tests. The study of hereditary anemia made it possible for us to assign a correct diagnostic to the studied patients, allowing for correct clinical management and genetical counselling, that in turn, improves their quality of life. Additionally, this work has reinforced the importance of the study of molecular markers and use of non-molecular tools complementary to the already implemented diagnostic techniques.
2025-10-28T12:16:21Z
Faleiro, Bárbara Düemke Coelho
The GO-DACT protocol : a multicentre, randomized, double-blind, parallel-group study to compare the efficacy of golimumab in combination with methotrexate (MTX) versus MTX monotherapy
The GO-DACT is an investigator-initiated, national, multicentric randomized placebo-controlled double-blinded trial, that assesses dactylitis as primary endpoint. Psoriatic arthritis patients naïve to methotrexate and biologic disease modifying anti-rheumatic drugs, with at least one active dactylitis, were assigned to golimumab in combination with methotrexate or placebo in combination with methotrexate, for 24 weeks. Both clinical (dactylitis severity score and the Leeds dactylitis index) and imaging (high resolution magnetic resonance imaging), among others, were assessed as outcomes. The main objective of GO-DACT is to provide evidence to improve the treatment algorithm and care of psoriatic arthritis patients with active dactylitis. In this manuscript we describe the GO-DACT protocol and general concepts of the methodology of this trial.
2025-10-28T12:18:28Z
Vieira de Sousa, Elsa Cristina Canhao, Helena Alves, Pedro Rodrigues, Ana Maria Teixeira, Filipa Tavares-Costa, José Bernardo, Alexandra Pimenta, Sofia Pimentel-Santos, Fernando Gomes, João L Aguiar, Renata Videira, Taciana Pinto, Patrícia Catita, Cristina Santos, Helena Borges, Joana Sequeira, Graça Ribeiro, Célia Teixeira, Lídia Ávila-Ribeiro, Pedro Martins, Fernando M Ribeiro, Ruy M. Fonseca, João Eurico
Generating Threat Intelligence based on OSINT and a Cyber Threat Unified Taxonomy
As ameaças cibernéticas atuais utilizam múltiplos meios de propagação, tais como a engenharia social, vulnerabilidades de e-mail e aplicações e, muitas vezes, operam em diferentes fases, tais como o comprometimento de um único dispositivo, o movimento lateral na rede e a exfiltração de dados. Estas ameaças são complexas e dependem de táticas bem avançadas, por forma a passarem despercebidas nas defesas de segurança tradicionais, como por exemplo firewalls. Um tipo de ameaças que tem tido um impacto significativo na ascensão do cibercrime são as ameaças persistentes avançadas (APTs), as quais têm objetivos claros, são altamente organizadas, têm acesso a recursos praticamente ilimitados e tendem a realizar ataques ocultos por longos períodos e com múltiplas tentativas. À medida que as organizações têm tido consciência que os ciberataques estão a aumentar em quantidade e complexidade, a utilização de informação sobre ciberameaças está a ganhar popularidade para combater tais ataques. Esta tendência tem acompanhado a evolução das APTs, uma vez que estas exigem um nível de resposta diferente e mais específico a cada organização. A informação sobre ciberameaças pode ser obtida de diversas fontes e em diferentes formatos, sendo a informação de fonte aberta (OSINT) uma das mais comuns. Também pode ser obtida por plataformas especificas de ameaças (TIPs) que ajudam a consumir, produzir e partilhar informações sobre ciberameaças. As TIPs têm múltiplas vantagens que permitem às organizações explorar facilmente os principais processos de recolha, enriquecimento e partilha de informações relacionadas com ameaças. No entanto, devido ao elevado volume de informação OSINT recebido por dia e às diversas taxonomias existentes para classificação de ciberameaças provenientes do OSINT, as TIPs atuais apresentam limitações de processamento desta, capaz de produzir informação inteligente (threat intelligence, TI) de qualidade que seja útil no combate de ciberataques, impedido assim a sua adoção em massa. Por sua vez, os analistas de segurança desperdiçam um tempo considerável em analisar o OSINT e a classificá-lo com diferentes taxonomias, por vezes, correspondentes a ameaças da mesma categoria. Esta dissertação propõe uma solução, denominada Automated Event Classification and Correlation Platform (AECCP), para algumas das limitações das TIPs mencionadas anteriormente e relacionadas com a gestão do conhecimento de ameaças, a triagem de ameaças, o elevado volume de informação partilhada, a qualidade dos dados, as capacidades de análise avançadas e a automatização de tarefas. Esta solução procura aumentar a qualidade da TI produzidas por TIPs, classificando-a em conformidade com um sistema de classificação comum, removendo a informação irrelevante, ou seja, com baixo valor, enriquecendo-a com dados importantes e relevantes de fontes OSINT, e agregando-a em eventos com informação semelhante. O sistema de classificação comum, denominado de Unified Taxonomy, foi definido no âmbito desta dissertação e teve como base uma análise de outras taxonomias públicas conhecidas e utilizadas na partilha de TI. O AECCP é uma plataforma composta por componentes que podem trabalhar em conjunto ou individualmente. O AECCP compreende um classificador (Classifier), um redutor de informação irrelevante (Trimmer), um enriquecedor de informação baseado em OSINT (Enricher) e um agregador de agregador de eventos sobre a mesma ameaça, ou seja, que contêm informação semelhante (Clusterer). O Classifier analisa eventos e, com base na sua informação, classifica-os na Unified Taxonomy, por forma a catalogar eventos ainda não classificados e a eliminar a duplicação de taxonomias com o mesmo significado de eventos previamente classificados. O Trimmer elimina a informação menos pertinente dos eventos baseando-se na classificação do mesmo. O Enricher enriquece os eventos com dados externos e provenientes de OSINT, os quais poderão conter informação importante e relacionada com a informação já presente no evento, mas não contida no mesmo. Por último, o Clusterer agrega eventos que partilham o mesmo contexto associado à classificação de cada um e à informação que estes contêm, produzindo aglomerados de eventos que serão combinados num único evento. Esta nova informação garantirá aos analistas de segurança o acesso e fácil visibilidade a informação relativa a eventos semelhantes aos que estes analisam. O desenho da arquitetura do AECCP, foi fundamentado numa realizada sobre três fontes públicas de informação que continham mais de 1100 eventos de ameaças de cibersegurança partilhados por 24 entidades externas e colecradas entre os anos de 2016 e 2019. A Unified Taxonomy utilizada pelo Classifier, foi produzida com base na análise detalhada das taxonomias utilizadas por estes eventos e nas taxonomias mais utilizadas na comunidade de partilha de TI sobre ciberameaças. No decorrer desta análise foram também identificados os atributos mais pertinentes e relevantes para cada categoria da Unified Taxonomy, através da agregação da informação em grupos com contexto semelhante e de uma análise minuciosa da informação contida em cada um dos mais de 1100 eventos. A dissertação, também, apresenta os algoritmos utilizados na implementação de cada um dos componentes que compõem o AECCP, bem como a avaliação destes e da plataforma. Na avaliação foram utilizadas as mesmas três fontes de OSINT utilizadas na análise inicial, no entanto, com 64 eventos criados e partilhados mais recentemente que os utilizados nessa análise. Dos resultados, foi possível verificar um aumento de 72% na classificação dos eventos, um aumento médio de 54 atributos por evento, com uma redução nos atributos com pouco valor e aumento superior de atributos com maior valor, após os eventos serem processados pelo AECCP. Foi também possível produzir 24 eventos agregados, enriquecidos e classificados pelos outros componentes do AECCP. Por último, foram processados pelo AECCP 6 eventos com grande volume de informação produzidos por uma plataforma externa, denominada de PURE, onde foi possível verificar que o AECCP é capaz de processar eventos oriundos de outras plataformas e de tamanho elevando. Em suma, a dissertação apresenta quatro contribuições, nomeadamente, um sistema de classificação comum, a Unified Taxonomy, os atributos mais pertinentes para cada uma das categorias da Unified Taxonomy, o desenho da arquitetura do AECCP composto por 4 módulos (Classifier, Trimmer, Enricher e Clusterer) que procura resolver 5 das limitações das atuais TIPs (gestão do conhecimento de ameaças, a triagem de ameaças, o elevado volume de informação partilhada, a qualidade dos dados e as capacidades de análise avançadas e a automatização de tarefas) e a sua implementação e avaliação.
2025-10-28T12:09:08Z
Martins, Cláudio Dinis Neves
Trypanosoma brucei parasites occupy and functionally adapt to the adipose tissue in mice
Trypanosoma brucei is an extracellular parasite that causes sleeping sickness. In mammalian hosts, trypanosomes are thought to exist in two major niches: early in infection, they populate the blood; later, they breach the blood-brain barrier. Working with a well-established mouse model, we discovered that adipose tissue constitutes a third major reservoir for T. brucei. Parasites from adipose tissue, here termed adipose tissue forms (ATFs), can replicate and were capable of infecting a naive animal. ATFs were transcriptionally distinct from bloodstream forms, and the genes upregulated included putative fatty acid β-oxidation enzymes. Consistent with this, ATFs were able to utilize exogenous myristate and form β-oxidation intermediates, suggesting that ATF parasites can use fatty acids as an external carbon source. These findings identify the adipose tissue as a niche for T. brucei during its mammalian life cycle and could potentially explain the weight loss associated with sleeping sickness.
2025-10-28T12:12:52Z
Trindade, Sandra Rijo-Ferreira, Filipa Carvalho, Tânia Neves, Daniel Guegan, Fabien Marc Aresta-Branco, Francisco Bento, Fabio Young, Simon A. Pinto, Andreia Van Den Abbeele, Jan Ribeiro, Ruy M. Dias, Sérgio Smith, Terry K. Figueiredo, Luisa M.
Chaperone activity of neuronal S100 proteins
Flutuações no metabolismo celular devido a inúmeras condições de stress, incluindo choque térmico, infeção ou inflamação, podem originar o enrolamento incorreto, a agregação e a disfunção de proteínas. Tais condições desencadeiam uma resposta fisiológica, caracterizada pela estimulação da expressão e consequente sobre-expressão de proteínas de choque térmico e chaperões moleculares. Em tais condições, estas moléculas auxiliam o processo de enrolamento de proteínas que se encontram incorretamente enroladas. Estes mecanismos de controlo de qualidade estão presentes em todas as células; contudo, em organismos superiores estas respostas desencadeiam processos de sinalização, e vários componentes atuam como moléculas sinalizadoras ou padrões moleculares associados a danos que ativam por exemplo a resposta imunitária, promovendo a reparação de tecidos e a resolução da inflamação. Os chaperões moleculares possuem várias propriedades que definem a sua atividade: reconhecem e ligam proteínas desnaturadas; e suprimem a agregação proteica, através da interação com as superfícies expostas nas proteínas desnaturadas. As proteínas S100 constituem uma família de pequenas proteínas ligantes de cálcio que interagem com um elevado número de proteínas. Esta família de proteínas possui três características únicas: (i) ligam cálcio através de dois motivos EF-hand em cada monómero, que diferem na sua sequência e nos modos de coordenação; (ii) são funcionais como dímeros ou oligómeros de maior ordem; (iii) são expressas de acordo com o tipo de célula e de tecido; e (iv) são exclusivas de vertebrados. Durante a inflamação e em resposta ao stress celular, a expressão destas proteínas aumenta consideravelmente, sugerindo que as proteínas S100 atuam em respostas celulares a situações de stress. Comunicações recentes sugerem que as S100 assistem e regulam interações ligando-complexo multichaperão. De facto, várias comunicações suportam a hipótese de que membros desta família possuem funções semelhantes a chaperões, tais como S100A1, S100A10, S100A12, S100A13 e S100B. Especificamente, neste projeto, nós estudamos a atividade como chaperões de quatro proteínas S100 (i.e., S100A6, S100B, S100A9 e S100A12), com elevada expressão no cérebro e associadas a neurodegeneração e neuroinflammação. Em primeiro lugar, foi realizado um estudo comparativo que visava verificar o efeito de temperaturas elevadas (50ºC) na conformação e estrutura secundária das proteínas em análise. Estas proteínas ocorrem em dois estados distintos de metalação: o estado apo (proteína livre de iões metálicos) e o estado holo (em que a proteína se encontra associada a um grupo prostético, neste caso cálcio). Estas propriedades levam-nos a realizar os ensaios tanto na ausência como na presença de iões cálcio. Os resultados obtidos demonstram que as proteínas S100 estudadas exibem estruturas hélice-α típicas em ambos os estados estudados. A elevação da temperatura não induziu alterações significativas na forma global dos espectros, indicando que estas proteínas conservam a sua estrutura secundária quando submetidas a altas temperaturas. No entanto, uma pequena diminuição na elipticidade dos espectros é observada, sugerindo uma perda não significativa do conteúdo em hélices-α. Estes resultados insinuam que a elevação da temperatura expôs resíduos hidrofóbicos anteriormente escondidos, o que resultou numa estrutura secundária menos compacta. Dado que o enrolamento global das proteínas S100 foi semelhante nas diferentes temperaturas estudadas, as alterações na estabilidade destas proteínas devido à ligação de cálcio foram avaliadas. Para isso, a desnaturação térmica das S100 foi monitorizada através do seguimento de alterações na elipticidade em função da temperatura, a um único comprimento de onda (222 nm). No geral, os resultados demonstram uma perda na elipticidade das proteínas em todas a condições estudadas, que corresponde à perda da estrutura secundária (hélices-α). Foram observadas transições bem definidas em todos os espectros. No entanto, a pós-transição não foi observada, sugerindo que estas proteínas possuem uma estabilidade térmica elevada, com uma temperatura de desnaturação térmica acima de 90 C. A ausência da pós-transição não permitiu a determinação do ponto médio da temperatura de desnaturação. Uma característica dos chaperões moleculares é o seu potencial para interagir com proteínas durante o seu processo de desenrolamento e para suprimir a agregação das suas proteínas substrato, em condições de stress. De modo a investigar as possíveis propriedades como chaperões moleculares das proteínas S100, o efeito das proteínas S100A6 e S100B na agregação da enzima citrato sintetase foi analisado in vitro. Como esperado para proteínas termoestáveis, as proteínas S100A6 e S100B, na ausência e na presença de iões de cálcio, não agregaram nas condições testadas, como se verificou pela ausência de alterações óticas relevantes na análise da dispersão de luz. Observou-se que estas proteínas são capazes de ligar estados não-nativos da citrato sintetase, suprimindo e adiando a agregação termicamente induzida (50 ºC) da citrato sintetase, quando adicionadas num excesso de 1.6 vezes, tanto na ausência como na presença de iões cálcio. Estes resultados sugerem que as proteínas diméricas S100A6 e S100B desempenham um papel protetor durante condições de stress térmico in vitro, exibindo propriedades anteriormente descritas para chaperões do tipo holdase, tanto no estado apo como no estado holo. Em todas as condições estudadas, a hidrolisação de ATP não foi necessária, implicando que a sua atividade como chaperão é independente de ATP. Comparando ambas as proteínas, a proteína S100B mostrou um melhor desempenho como holdase do que proteína S100A6, quando analisadas na ausência de iões cálcio. A presença de iões de cálcio, intensificou as propriedades protetoras da S100B, indicando que sua a função como holdase é superior no seu estado holo. A resistência e sobrevivência das células a temperaturas substancialmente fora da gama ótima do organismo resultam da ativação da resposta de choque térmico que, por sua vez, providência um mecanismo de defesa celular através da síntese intensa de proteínas de choque térmico e chaperões moleculares que impedem a acumulação de agregados proteicos e a consequente toxicidade proteica desta acumulação, restaurando a proteostase. A capacidade das proteínas S100 para prevenir agregação proteica em condições de stress in vivo foi estudada através sua transformação e sobre-expressão numa estirpe de Escherichia coli com deleção no gene dnaK (ΔdnaK). A expressão desta proteína de choque térmico (DnaK), é essencial para o crescimento da E. coli a temperaturas superiores a 42ºC, sendo por isso observável uma redução drástica no número de colónias formadas após a submissão da estirpe a condições de stress térmico de curta duração (50ºC, 45 minutos). Os resultados demonstraram que as células que sobre-expressavam S100A6 ou S100A12, conseguiam sobreviver quando expostas a altas temperaturas. No entanto, comparativamente com os controlos negativo (superóxido dismutase 1) e positivo (complexo DnaK-DnaJ-GrpE) realizados, a produção destas proteínas não teve efeitos significantes nas células. Por outro lado, a sobre-expressão da proteína recombinante S100B ou S100A9 em células de E. coli, aumentou a sua resistência ao stress térmico de curta duração. A razão de sobrevivência destas células é superior à obtida pelas células que produzem o controlo positivo. Estas observações sugeriram que as proteínas S100B e S100A9 interagem com certas proteínas da E. coli durante a exposição ao stress térmico, de modo a prevenir a sua agregação e reduzir a precipitação de proteínas parcialmente desnaturadas, que são toxicas para as células, restaurando a proteostase do organismo e providenciando evidencias in vivo da sua potencial atividade como chaperões. No geral, os resultados aqui apresentados, sugerem que as proteínas S100, além de serem moléculas pró-inflamatórias implicadas em diversas doenças neurodegenerativas e no envelhecimento, atuam como chaperões moleculares em situações de stress, estando deste modo envolvidas na manutenção da proteostase do cérebro, sugerindo um elo de ligação entre inflamação e a resposta ao stress celular. Estes dois conceitos estão cada vez mais a ser ligados a diversas doenças neurodegenerativas que são caracterizadas pela acumulação de proteínas desenroladas e pela deposição de agregados proteicos em neurónios. Desta forma, os resultados irão contribuir para o entendimento do papel das proteínas S100 nas vias sinalizadoras neuroinflamatórias durante o envelhecimento e doenças neurodegenerativas.
2025-10-28T12:10:04Z
Rebelo, Carina Isabel da Silva
The impact of negative lymph nodes in the survival outcomes of pN+ patients following radical gastrectomy : the inverse lymph node ratio as a better score to study negative lymph nodes
The impact of negative lymph nodes (LNs) on survival of pN+ patients has been recognized. The weight of negative LNs in an inverse lymph node ratio (nR) should be related to its prognostic impact. Five hundred and two consecutive gastric cancer patients, who underwent radical gastrectomy, were included. Patients were split into groups according to the number of harvested nodes and a cross-tabulation with pTNM stages was performed to test differences in the tumor burden. pN+ patients (n = 296) were split into groups of negative LNs harvested. We tested an alternative formula for computing a lymph node ratio: nR = total number of harvested nodes/total number of positive nodes. The median number of negative LNs was significantly different (p < 0.01) between dissection groups, but not the median of positive nodes (p > 0.05). No difference in pTNM percentage distribution was found between these groups (p > 0.05). When tested, the overall survival improved significantly for groups with larger numbers of negative LNs (p < 0.001). A cutoff of nR ≥ 6 was an independent prognostic factor for survival (p = 0.001), and the survival of pN+ patients with nR ≥ 6 was not different from pN0 patients. The impact of the number of negative LNs on the survival of the pN+ patients was demonstrated. The higher numbers in the numerator of the nR was due to the disproportion between harvested negative LNs and metastatic LNs. Larger ratios imply more negative lymph nodes in relation to positive lymph nodes, which was significantly associated with survival. We believe that the proposed nR is a friendlier to use format because of its intuitive interpretation.
2025-10-28T12:19:23Z
Costa, Paulo M. Lages, Patrícia Onofre, Susana Ribeiro, Ruy M.
Prevalence of late preterm and early term birth in Portugal
Introduction: Late preterm birth (defined as birth between 34 and 36 complete weeks' gestation) and early term birth (defined as birth between 37 and 38 complete weeks' gestation) have become a topic of recent discussion as the morbidity associated with delivery at these gestational ages has become increasingly evident. Our objective was to evaluate the characteristics of late preterm and early term birth in Portugal. Material and methods: We developed a survey questionnaire that was sent to the Obstetric Department of all public hospitals in Portugal. The questionnaire consisted on questions on prevalence and mode of delivery of late preterm and early term period and associated neonatal morbidity and mortality. The questions referred solely to single births occurred during 2013. Results: We received completed questionnaires from 14 hospitals, corresponding to nearly one third (33.5%) of total deliveries in Portugal. We report 5.4% of late preterm and 27% of early term deliveries. Approximately two thirds of late preterm and three quarters of early term deliveries were spontaneous. The cesarean section rate was higher in late preterm (39.1%) than in early term (26.4%) births. Neonatal complications were more frequent in late preterm neonates (34.2%) when compared to early term neonates (14.2%). Discussion: The prevalence of late preterm and early term birth in our cohort is comparable, although slightly reduced, to other published series. Conclusion: The obstetric community should raise efforts to limit deliveries below 39 weeks' gestation to the ones with a valid medical indication.
2025-10-28T12:19:40Z
Barros, Joana Goulão Clode, Nuno Graça, Luís M.
A resolução de problemas e o desenvolvimento da comunicação matemática : um estudo no 4º ano de escolaridade
O presente estudo tem como objectivo compreender o papel da resolução de problemas na aprendizagem da Matemática e, em especial, o seu contributo para o desenvolvimento da comunicação matemática. Com este propósito formularam-se as seguintes questões: a) O que é que os alunos aprendem de Matemática quando resolvem problemas?; b) Qual o papel do gmpo nesse processo?; c) Que interacções ocorrem na actividade de resolução de problemas capazes de desenvolver nos alunos a capacidade de comunicar? Dada a natureza do estudo, optei por uma metodologia qualitativa de cunho essencialmente interpretativo. Realizei a recolha de dados numa turma de 4.° ano de escolaridade a partir de entrevistas à Professora e a um grupo de quatro alunos sobre quem esteve focalizada a minha atenção enquanto o trabalho em gmpos decorreu, da observação directa de seis aulas de resolução de problemas e da análise documental constituída pelos registos escritos de todos os alunos. Optei por fazer apenas uma entrevista a cada participante, antes do início das observações. Os dados permitem-me afirmar que, quer os alunos com melhores níveis de desempenho, quer os mais fracos, desenvolveram compreensão e conhecimento, utilizaram conhecimentos adquiridos e testaram a sua eficácia, tanto ao nível dos processos como dos conteúdos matemáticos. Verifiquei que foi durante o trabalho de gmpo que os alunos mais se envolveram, por iniciativa própria, em processos matemáticos como reflectir, avaliar e criticar. A actividade de resolução de problemas proporcionada pelo estudo permitiu que os alunos desenvolvessem a aptidão para explicitar oralmente o raciocínio utilizado na procura de uma solução e para representar por escrito as ideias matemáticas, criando assim oportunidade para os alunos comunicarem entre si e com a professora na aula. Os conflitos existentes entre os elementos do gmpo interferiram na concretização de um trabalho conjunto mais produtivo. Contudo, ultrapassados os conflitos internos, trabalhar em grupo possibilitou momentos de interacção comunicativa entre os alunos, permitindo a partilha de conhecimento matemático entre eles. As interacções ocorridas variaram com a forma como foi feita a abordagem da resolução de problemas na sala de aula. Deste modo, verifiquei que, quer as interacções verticais, quer as horizontais foram decisivas para i) o envolvimento dos alunos na actividade; ii) a criação do espírito investigativo nos alunos; iii) o desenvolvimento da capacidade de comunicar dos alunos. Os resultados deste estudo salientam a importância dos alunos partilharem e negociarem significados entre si e com o professor na resolução de problemas matemáticos. Indicam também que o professor deverá dar especial atenção á orientação da actividade dos alunos durante a resolução de problemas, tomando uma atitude questionadora que os estimule a contribuir com frequência e a construir o seu próprio conhecimento e durante a discussão final, incentivando, conjuntamente, o questionamento do aluno ao aluno e a argumentação dos mesmos na defesa das suas ideias.
2025-10-28T12:17:32Z
Ribeiro, Deolinda Maria Guerreiro Custódio, 1961-
A Guerra e a Arte
No summary/description provided
Evocação
No summary/description provided
Agreement and accuracy using the FIGO, ACOG and NICE cardiotocography interpretation guidelines
Introduction: One of the limitations reported with cardiotocography is the modest interobserver agreement observed in tracing interpretation. This study compared agreement, reliability and accuracy of cardiotocography interpretation using the International Federation of Gynecology and Obstetrics, American College of Obstetrics and Gynecology and National Institute for Health and Care Excellence guidelines. Material and methods: A total of 151 tracings were evaluated by 27 clinicians from three centers where International Federation of Gynecology and Obstetrics, American College of Obstetrics and Gynecology and National Institute for Health and Care Excellence guidelines were routinely used. Interobserver agreement was evaluated using the proportions of agreement and reliability with the κ statistic. The accuracy of tracings classified as "pathological/category III" was assessed for prediction of newborn acidemia. For all measures, 95% confidence interval were calculated. Results: Cardiotocography classifications were more distributed with International Federation of Gynecology and Obstetrics (9, 52, 39%) and National Institute for Health and Care Excellence (30, 33, 37%) than with American College of Obstetrics and Gynecology (13, 81, 6%). The category with the highest agreement was American College of Obstetrics and Gynecology category II (proportions of agreement = 0.73, 95% confidence interval 0.70-76), and the ones with the lowest agreement were American College of Obstetrics and Gynecology categories I and III. Reliability was significantly higher with International Federation of Gynecology and Obstetrics (κ = 0.37, 95% confidence interval 0.31-0.43), and National Institute for Health and Care Excellence (κ = 0.33, 95% confidence interval 0.28-0.39) than with American College of Obstetrics and Gynecology (κ = 0.15, 95% confidence interval 0.10-0.21); however, all represent only slight/fair reliability. International Federation of Gynecology and Obstetrics and National Institute for Health and Care Excellence showed a trend towards higher sensitivities in prediction of newborn acidemia (89 and 97%, respectively) than American College of Obstetrics and Gynecology (32%), but the latter achieved a significantly higher specificity (95%). Conclusions: With American College of Obstetrics and Gynecology guidelines there is high agreement in category II, low reliability, low sensitivity and high specificity in prediction of acidemia. With International Federation of Gynecology and Obstetrics and National Institute for Health and Care Excellence guidelines there is higher reliability, a trend towards higher sensitivity, and lower specificity in prediction of acidemia.
2025-10-28T12:15:10Z
Santo, Susana Ayres de Campos, Diogo Costa Santos, Cristina Schnettler, William Ugwumadu, Austin Graça, Luís M.
Ossos
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Small-for-gestational-age babies of low-risk term pregnancies : does antenatal detection matter?
Objectives: To compare delivery route and admission rate to neonatal intensive care unit between small- and appropriate-for-gestational-age babies among low-risk term pregnancies. Methods: A retrospective study was conducted using the database of deliveries in 2014 at a tertiary hospital. Babies delivered at ≥37 weeks with birthweight <10th centile were considered small-for-gestational-age (SGA) and >90th centile were considered large-for-gestational-age. Fetal weight estimation at 30-33 weeks ultrasound <10th centile was considered antenatal detection of SGA. Results: Among 1429 low-risk term pregnancies, 11% (151/1429) had SGA babies and 5% (75/1429) had large-for-gestational-age. SGA babies were associated with higher rate of cesarean sections for nonreassuring fetal status (18/151 versus 8/1202, p < .001) and higher rate of admissions to neonatal intensive care unit (16/151 versus 18/1202, p < .001) compared to appropriate-for-gestational-age. Within SGA group, antepartum detected fetuses were associated with lower rate of operative deliveries for nonreassuring fetal status than undetected group (3/31 versus 39/120, p = .01) Conclusions: In our series, women with SGA term babies were associated with more adverse obstetric and neonatal outcome than appropriate-for-gestational age, especially among those undetected prenatally.
2025-10-28T12:12:52Z
Policiano, Catarina Fonseca, Andreia Mendes, Jorge M. Clode, Nuno Graça, Luís M.
A menina (não) fica em casa
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Link para memória do esquecimento global
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Guerra e espelhos
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Hipotensão ortostática em hipertensos
A hipotensão ortostática define-se pela redução sustentada da pressão arterial sistólica de pelo menos 20 mmHg e/ou da pressão arterial diastólica de pelo menos 10 mmHg nos três primeiros minutos desde a passagem da posição de decúbito para ortostatismo. A sua prevalência é variável e os fatores que lhe estão associados ainda não são totalmente conhecidos. Existe uma possível associação entre a presença de hipertensão arterial e hipotensão ortostática. Através da Monitorização Ambulatória da Pressão Arterial além de se identificar a Hipertensão é possível analisar o perfil tensional noturno e avaliar o controlo tensional nas 24 horas. Este é um estudo prospetivo não randomizado que decorreu na Clínica Universitária de Medicina I, Hospital de Santa Maria. Foram incluídos todos os doentes referenciados para Medição Ambulatória da Pressão Arterial independentemente do motivo do pedido. As variáveis estudadas foram obtidas através de um questionário de auto-preenchimento, dados da Medição Ambulatória da Pressão Arterial e pela pesquisa da Hipotensão Ortostática realizando-se a medição da pressão arterial em ortostatismo, após 5 minutos de repouso em decúbito, a cada minuto, durante 3 minutos. Numa amostra de 145 indivíduos (idade média 58,7 ± 13,2 anos )a prevalência de hipotensão ortostática foi de 17,93%, podendo este valor ser considerado elevado. Em média, os participantes tomam 4,2 ± 3,1 fármacos, os com hipotensão ortostática tomam 6,2 ± 3,45 (p=0,002). No que respeita ao total de fármacos anti-hipertensores, em média, os participantes tomam 1,7±1,4 e aqueles com HO 2,3 ± 1,26 fármacos (p=0,013). A toma de maior número de fármacos associa-se então à presença de hipotensão ortostática. Na avaliação por MAPA, 80 indivíduos (55,17%) apresentaram HTA, dos quais 30,34% se encontravam com HTA controlada. Não se encontraram diferenças quanto à prevalência da hipotensão ortostática quanto ao perfil tensional, perfil de dipping ou controlo da HTA.
2025-10-28T12:12:39Z
Silva, Bernardo Miguel Henriques Marques da