Repositório RCAAP

Controvérsias sociocientíficas em pesquisas desenvolvidas em Portugal: um estudo sobre as potencialidades e limites na promoção da reflexão sobre natureza da ciência

A inserção de abordagens sobre a Natureza da Ciência (NdC) no Ensino de Ciências tem recebido atenção por parte de documentos oficiais, bem como de pesquisadores da área, uma vez que esta pode possibilitar que o aluno compreenda a construção do conhecimento científico como um processo histórico, em estreita relação com as condições sociais, políticas e econômicas de uma determinada época. Todavia, a implementação de abordagens que possibilitem reflexões sobre NdC ainda é um desafio. Tendo por base tais argumentos, este estudo tem como objetivo investigar quais as potencialidades e/ou limites das Controvérsias Sociocientíficas na promoção da reflexão sobre a Natureza da Ciência. A constituição dos dados foi realizada a partir de um mapeamento das teses e dissertações desenvolvidas no Instituto de Educação da Universidade de Lisboa, na área de ensino de ciências, no período de 2009 a 2019 e subsequente envio de uma questão aos pesquisadores: “Com base na tese ou dissertação que realizou, qual ou quais são as potencialidades e/ou limites da sua investigação na promoção da reflexão sobre Natureza da Ciência?”. Portanto, o corpus desta investigação corresponde às respostas dadas pelos pesquisados a esta questão, sendo a análise realizada por meio da Análise Textual Discursiva (ATD). Quanto aos resultados, no que se refere às potencialidades, esteve em primeiro plano a instrumentalização para intervenção social, bem como o desenvolvimento da comunicação oral e escrita. Em relação às limitações, foram citadas dificuldades na gestão do tempo, currículos muito extensos e lacunas relativas à formação de professores.

Ano

2025-10-28T12:11:16Z

Creators

Aires, Joanez Aparecida Reis, Pedro

Programa formativo sobre el activismo colectivo basado en la indagación para la formación inicial de profesorado

En este trabajo se describe el diseño y la puesta en práctica de un programa formativo sobre activismo colectivo basado en la indagación científica (ACBI), sobre problemas locales de relevancia social y que tengan alguna relación con la ciencia, llevado a la práctica con profesorado en formación inicial de educación infantil y de educación primaria. El programa consta de tres fases: I) Presentación y análisis de un vídeo como ejemplo de lo que se les pide que desarrollen después de un proceso de indagación para hacer propuestas de acciones que ayuden a solucionar el problema que planteen. II) Planteamiento e indagación de un problema local socialmente relevante y que tenga conexiones con la ciencia. III) Creación y proyección de los vídeos elaborados a partir del proceso de indagación. Las tecnologías utilizadas han sido las anotaciones de vídeo para analizar el vídeo puesto como ejemplo con CoAnnotation y el uso de evaluaciones colaborativas entre pares de los vídeos finales con CoRubric. Los estudiantes han mostrado una actitud positiva hacia el desarrollo del programa de activismo en las aulas de infantil y primaria y valoran especialmente el trabajar con problemas cercanos y la creación de los vídeos. Se finaliza el capítulo con consideraciones sobre la puesta en práctica de este programa formativo basadas en la experiencia de tres cursos académicos.

Ano

2025-10-28T12:29:12Z

Creators

Cébrian-Robles, Daniel España-Ramos, Enrique Reis, Pedro

Assessment of promising agricultural management practices

iSQAPER project - Interactive Soil Quality Assessment in Europe and China for Agricultural Productivity and Environmental Resilience - aims to develop an app to advise farmers on selecting the best Agriculture Management Practice (AMPs) to improve soil quality. For this purpose, a soil quality index has to be developed to account for the changes in soil quality as impacted by the implementation of the AMPs. Some promising AMPs have been suggested over the time to prevent soil degradation. These practices have been randomly adopted by farmers but which practices are most used by farmers and where they are mostly adopted remains unclear. This study is part of the iSQAPER project with the specific aims: 1) map the current distribution of previously selected 18 promising AMPs in several pedo-climatic regions and farming systems located in ten and four study site areas (SSA) along Europe and China, respectively; and 2) identify the soil threats occurring in those areas. In each SSA, farmers using promising AMP's were identified and questionnaires were used to assess farmer's perception on soil threats significance in the area. 138 plots/farms using 18 promising AMPs, were identified in Europe (112) and China (26).Results show that promising AMPs used in Europe are Crop rotation (15%), Manuring & Composting (15%) and Min-till (14%), whereas in China are Manuring & Composting (18%), Residue maintenance (18%) and Integrated pest and disease management (12%). In Europe, soil erosion is the main threat in agricultural Mediterranean areas while soil-borne pests and diseases is more frequent in the SSAs from France and The Netherlands. In China, soil erosion, SOM decline, compaction and poor soil structure are among the most significant. This work provides important information for policy makers and the development of strategies to support and promote agricultural management practices with benefits for soil quality.

Ano

2025-10-28T12:15:24Z

Creators

Barão, Lúcia Alaoui, Abdallah Ferreira, Carla Basch, Gottlieb Schwilch, Gudrun Geissen, Violette Sukkel, Wijnand Lemesle, Julie Garcia-Orenes, Fuensanta Morugán-Coronado, Alicia Mataix-Solera, Jorge Kosmas, Costas Glavan, Matjaž Pintar, Marina Tóth, Brigitta Hermann, Tamás Vizitiu, Olga Petruta Lipiec, Jerzy Reintam, Endla Xu, Minggang Di, Jiaying Fan, Hongzhu Wang, Fei

Problem-Based Learning in an online course of health education

The objectives of this project were to: i) describe the experience of implementing Problem-Based Learning in an online course over three consecutive academic years, ii) analyse the learning environment generated, iii) discuss impacts on students’ active participation, based on the analysis of their interactions. The participants were 30 students, working in five groups, and four tutors. All the interactions of each member of the five groups and their tutors in the discussion forums were identified and counted. The interactions identified were subjected to content analysis. The results showed a great variability in the degree of participation of each member of the group as well as the development of a group dynamic that did not appear to depend on the activity of each tutor. Moreover, in most groups, tutors reduced their participation during the semester. Regarding the ways students participated, and despite the individual variability observed, most students kept actively involved in the work contrarily to what research has shown about the uneven students’ participation in online courses. Two categories of interactions were identified in the groups according to the underlying objectives: learning-problem solving and group functioning. Whereas all groups were able to solve the problems under investigation, only a few demonstrated self-regulation capabilities leading to a great cohesion among the group members. The discussion of the results generated some guidelines for future investigations regarding the use of PBL in online environments.

Ano

2025-10-28T12:29:27Z

Creators

Chagas, Isabel Faria, Cláudia Mourato, Dulce Pereira, Gonçalo Santos, Afonso

El θυμός en Eurípides y la peripecia trágica

Abstrat: The θυμός is a concept that comes from the Homeric poems, in which it characterizes the hero. In Euripides’ tragedies we see it associated with the change of tragic fate (περιπάθεια). The word is found in eleven plays: Medea, Heraclidae, Hippolytus, Hecuba, Supplicants, Heracles, Electra, Iphigenia among the Tauros, Phoenicians, Iphigenia in Aulis and Bacchae. In the tragedy Medea the concept is connected with the controversial infanticide. Our analysis associates the word with the essence of the Self, with its reasoning and with the impetus that changes the tragic destiny of characters like Jason, Hippolytus, Eteocles, Hecuba and Pentheus. The disturbing polysemy of the word will also lead us to love and marriage. The study of the contexts of θυμός in Medea will be very fruitful because, in this tragedy, we find all the complexity of the concept that the other dramatic works of Euripides prove. In truth, the poet used an epic word and wore it in tragic clothes.

Ano

2025-10-28T12:14:01Z

Creators

Sousa, Ana Alexandra Alves de

O processo de implementação do currículo de Ciências Físicas e Naturais numa escola de Lisboa: Perspetiva dos professores

O currículo português de Ciências Físicas e Naturais esteve organizado em competências gerais e específicas a desenvolver pelos alunos, sendo entendido competência como “saber em uso”, em que o indivíduo ativa conhecimentos, capacidades e atitudes face a determinada situação. O professor enquanto construtor do currículo é parte integrante e ativa do processo curricular, estando em permanente interação com os seus pares, alunos, assuntos e meio social. A autonomia das escolas e dos professores preconizada pelo currículo visa a interdisciplinaridade, em particular entre as disciplinas de Ciências Naturais e Ciências Físico-Químicas, bem como uma contextualização do processo de ensino-aprendizagem. Este estudo de caso teve como principal objetivo compreender de que forma os professores de Ciências Físicas e Naturais de uma escola de Lisboa se apropriaram do currículo, a forma como o implementam e as dificuldades que enfrentam. O estudo foi de natureza qualitativa. Os dados foram recolhidos através de entrevistas e questionários aos diferentes intervenientes (docentes e alunos) e análise dos documentos oficiais da escola. Os dados recolhidos foram sujeitos a análise de conteúdo. Verificou-se que a implementação do currículo de Ciências Físicas e Naturais na escola em análise decorreu numa perspetiva de adaptação. Observa-se na prática docente um esforço de adaptação do currículo ao contexto e aos seus alunos, mas sem que estes tenham uma participação ativa, observando-se no entanto alguma inovação e interdisciplinaridade.

Ano

2025-10-28T12:17:19Z

Creators

Coelho, Ana Faria, Cláudia Galvão, Cecília

Processos de desenvolvimento de software

A instituição de acolhimento onde este projecto foi realizado foi a Outsystems, uma empresa de desenvolvimento de software que se caracteriza por utilizar uma metodologia Ágil. O principal produto da OutSystems é OutSystems Agile Platform, uma plataforma de desenvolvimento que em conjunto com a metodologia Ágil, permite à OutSystems a entrega de aplicações Web desenvolvidas em semanas em vez de meses. O tema principal deste projecto é o processo de desenvolvimento do produto. Na OutSystems, o processo de desenvolvimento do produto da empresa é bastante importante pois tem uma relação directa com a qualidade do produto. Assim, quanto mais optimizado e mais eficiente é o processo de desenvolvimento melhor é a qualidade do produto produzido. No processo de desenvolvimento as equipas que desenvolvem o produto necessitam de ferramentas auxiliares que lhes permitam gerir, controlar e organizar as várias tarefas. Na OutSystems, existem um conjunto de ferramentas que auxiliam a equipa de desenvolvimento na gestão dos projectos: organizador dos testes do produto, o gestor de projectos, entre outros. A ferramenta de gestão de projectos (Issues Project Manager) utilizada pela equipa de desenvolvimento encontrava-se com alguns problemas: falta de usabilidade, falta de funcionalidades, entre outros. Devido a estes problemas a equipa de desenvolvimento já não utilizava a aplicação, e por isso a tarefa de gestão, controlo e organização das tarefas necessárias para o desenvolvimento do produto não era realizada. Para resolver este problema foi iniciado este projecto cujo objectivo inicial é o melhoramento do processo de desenvolvimento de software da OutSystems, através da melhoria das ferramentas de auxílio ao desenvolvimento do produto. Com a melhoria das ferramentas que auxiliam a equipa de desenvolvimento do produto, o objectivo é tornar estas equipas mais produtivas, e concretizar um produto com melhor qualidade. Nas primeiras etapas do projecto foi realizada uma Análise das funcionalidades existentes, de modo a ser mais fácil a percepção do modelo de domínio da ferramenta. Foi então realizada a listagem e organização de todos os requisitos iniciais do projecto, de modo a construir um plano de tarefas. E só após esta listagem ter sido realizada é que é iniciado o processo de implementação. Ao longo da execução do projecto, como a OutSystems segue a metodologia Àgil os requisitos do projecto eram revistos e reorganizados de modo a concretizarem os objectivos do projecto mais facilmente. Por fim são concretizados todos os objectivos do projecto. Por último, pode-se concluir que a ferramenta Issues Project Manager foi melhorada, desde a sua usabilidade, o tempo de execução, entre outros. Sendo mais utilizada pelos membros da equipa de desenvolvimento do produto da OutSystems, possibilitando-lhes uma melhor gestão do seu trabalho e consequentemente um melhor controlo dos seus projectos.

Ano

2025-10-28T12:23:53Z

Creators

Silva, Susana Rodrigues da

Promoting science outdoor activities for elementary school children: Contributions from a research laboratory

The purposes of the study were to analyse the promotion of scientific literacy through practical research activities and to identify children's conceptions about scientists and how they do science. Elementary school children were engaged in two scientific experiments in a marine biology research laboratory. A total of 136 students answered a questionnaire about their previous habits towards science and carried out the following actions: (1) a guided visit to the laboratory, (2) a brief presentation of the research theme, (3) the development of two experiments, and (4) a questionnaire about the experiments and science conceptions. The research methods included observation, document analysis, and content analysis of the answers to the questionnaires. Additionally, each visit was video recorded in order to design learning materials. The results revealed that most of the pupils were able to follow every stage of experimentation. However, some of them misinterpreted results and conclusions. One implication of the study is that this type of outdoor activity is extremely important to promote meaningful science learning in children, but more care should be taken in practical science activities so that children can overcome some common difficulties when performing scientific inquiry.

Ano

2025-10-28T12:17:46Z

Creators

Boaventura, D.M. Faria, Cláudia Chagas, Isabel Galvão, Cecília

Investigating school guided-visits to an Aquarium: what role for science teachers?

The main goals of this study were to understand the different roles played by teachers and students during a school-guided tour to an aquarium and to analyse their different perspectives about the visit. The study focused on students’ and teachers’ behaviour during school-guided visits to an aquarium; students’ and teachers’ perspectives about this type of school visits; and the reasons provided by teachers to engage in a guided tour to a science museum. Direct observations of 39 guided tours were performed in order to describe the structure of the visit and the participants’ behaviour. A questionnaire was given to 145 teachers and 191 students after the visit, in order to describe their perspectives about the visit, and an online questionnaire was sent to a sample of 11 teachers, in order to understand their ideas about school visits to science museums. Data analysis showed that the guided visits, although well evaluated by both students and teachers, were mainly guide-directed and lecture-oriented, giving students and teachers very little choice and control over the learning agenda. Moreover, teachers showed a very passive role during the visit and reported limited plans for preparation and follow-up activities that would support the visit. Despite this scenario, the teachers who were questioned preferred guided visits to non-guided visits and recognized the potential of museums for learning. The possible role of teachers in establishing the necessary connection between guided tours and school science, and helping to bridge school curriculum, museum content, and student inquiries is discussed.

Ano

2025-10-28T12:13:06Z

Creators

Faria, Cláudia Chagas, Isabel

The construction of a reasoned explanation of a health phenomenon: an analysis of competencies mobilized

Mobilizing scientific knowledge for understanding the natural world and for critically appraise socio-scientific situations and make decisions are key competencies for todays' society. Therefore, it is essential to understand how students at the end of compulsory schooling use scientific knowledge for understanding the surrounding world. The objective of this study is to understand how students construct a scientifically oriented explanation while making sense of a phenomenon related to health. We analysed 526 answers to a question of a Portuguese national 9th grade science exam. The results reveal that most students present difficulties in explaining a phenomenon related to health supported by logical and clear reasoning, and in mobilizing scientific knowledge for connecting different scientific domains. We reaffirm the need to reconceptualize the role of health education within science education. Developing reading, writing and discussion activities related to health, which requires the use of scientific knowledge from different domains, would facilitate students' understanding and appropriation of scientific knowledge and its transference. This is a fundamental competence for promoting active and informed citizenship.

Ano

2025-10-28T12:28:20Z

Creators

Faria, Cláudia Freire, Sofia Baptista, Mónica Galvão, Cecília

Composition and origins of decorated glass from Umayyad Cordoba (Spain)

Recent archaeological excavations carried out in the western suburbs of Cordoba (Spain) brought to light numerous fragments of archaeological glass from the caliphal period (929–1031 CE). The typological and compositional analysis by laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry (LA-ICP-MS) of 66 fragments enabled the identification of different types of base glass and glass working techniques, identifying local productions, imports and decorative imitations of eastern models. The studied fragments include Mesopotamian, Levantine, Egyptian and possibly Sicilian soda-rich plant ash glass categories, and various glass-decorating techniques such as mould-blowing, pressing, cutting, staining or gilding. The systematic comparison of the trace element patterns of several relief-cut objects identified both imported ware and a locally manufactured sample, whereas all mould-blown pieces were made from locally sourced raw materials. Iberian glassworkers seem to have preferred mould-blowing, probably because of the distinct working properties of locally available high lead glass. The results thus confirm the continuous long-distance exchange of vitreous material, as well as the existence of multiple glassmaking centres in the Iberian Peninsula, illustrating a link between secondary glass working techniques and chemical composition. Furthermore, the identification of several fragments belonging to the same object based on chemical composition allowed us to reconstruct entire vessels and thereby expand the repertoire of known typologies circulating in Umayyad Spain.

Ano

2025-10-28T12:26:34Z

Creators

De Juan Ares, Jorge Cáceres Gutiérrez, Yasmina Moreno Almenara, Maudilio Schibille, Nadine

Making the implicit explicit: environmental teacher as a “reflective practitioner”

This forum article consists on a commentary on the article by Alandeom W. Oliveira, Patterson Rogers, Cassie F. Quigley, Denis Samburskiy, Kimberly Barss and Seema Rivera. The authors emphasized the need for environmental teachers to expand the focus of their instructional efforts beyond rational argumentation and reasoning, taking into account the complex emotional aspects of the human relationship with nature. In this commentary, I attempt to extend the conversation regarding these issues to the need for teachers to be aware about their own environmental beliefs, which could be guiding their teaching. I close with a consideration for the need for environmental teachers to be reflective practitioners, using reflection upon the ends of education, their environmental values and ideas and the moral and ethical aspects of teaching, for challenging students’ beliefs and empowering them to make informed environmental decisions, contributing thereby to the building of more just and environmental sustained societies.

Ano

2025-10-28T12:12:12Z

Creators

Faria, Cláudia

“Como trabalham os cientistas?” Potencialidades de uma atividade de escrita para a discussão acerca da natureza da ciência nas aulas de ciências

Vários estudos em educação têm salientado a natureza da ciência como sendo uma componente importante da educação em ciência. Neste trabalho, é apresentada uma atividade de escrita e discussão de histórias imaginadas sobre cientistas, e são discutidas as suas potencialidades para a exploração das ideias dos alunos sobre a atividade científica. Os dados foram recolhidos através de entrevistas com professores e alunos. Foi também efetuada a análise de documentos escritos e a observação das sessões de discussão. Os resultados revelaram a presença, nos alunos, de ideias inadequadas acerca do que é a atividade científica. Revelaram, também, dificuldades por parte dos professores na gestão da discussão e no confronto dessas ideias, que dificultam a compreensão acerca da natureza do conhecimento científico. É sugerido que esta atividade possa ser enriquecida pela sua integração num contexto real, que facilite o estabelecimento de conexões com o trabalho de cientistas reais.

Ano

2025-10-28T12:14:01Z

Creators

Faria, Cláudia Freire, Sofia Galvão, Cecília Reis, Pedro Figueiredo, Orlando

Science inquiry-based activities in elementary education: how to support teachers’ practices?

This investigation was done to understand how to support teachers to adopt innovative inquiry based science practices at elementary education. Here we present the results of two inquiry-based activities that were done in three elementary schools, involving six teachers and a total of 140 students. To understand the process of implementation of each activity by the teachers and its impacts on students, a qualitative methodology was used. The teachers were actively involved in the activities, however, the process followed by them was considerably different in what concerns time allocation. Additionally, instead of joining experiments from the different areas of conceptual knowledge, some of them chose only one separate subject. As a consequence, the students’ achievements were also different in each class. In the classes where the students had more time for discussion, more adequate answers were given to the initial questions, whereas, in the classes that devoted less time to the activity some competences, like observation skills and planning experiments were not achieved. It is suggested that although the creation of new curriculum materials can facilitate the adoption of new practices by teachers, this is not sufficient. Teacher's ownership of the activities is perhaps the keystone of this entire process.

Ano

2025-10-28T12:17:46Z

Creators

Boaventura, D.M. Faria, Cláudia

History of science and science museums: an enriching partnership for elementary school science

The activity presented in this article is intended for elementary school students and focus on the pioneering oceanographic work of the Portuguese King Carlos I. This activity involves the exploration of the exhibits belonging to two different science museums, the Aquarium Vasco da Gama and the Maritime Museum. Students were asked to study fish adaptations to deep sea, through the exploration of a fictional story, also based on historical data from the work of the King that served as a guiding script for all the subsequent tasks. In both museums, students had access to observations of: historical collections of organisms, oceanographic biological sampling instruments, fish gears and ships. They could also observe the characteristics and adaptations of diverse deep-sea fish species. The present study aimed to analyse the impact of this activity on students’ scientific knowledge, on their understanding of the nature of science and on the development of transversal skills. All students considered the project very interesting. The obtained results suggest that the activity promoted not only the understanding of scientific concepts, but also the development of knowledge about science itself and the construction of scientific knowledge. This emphasizes the relevance of creating activities informed by the history of science. As a final remark we suggest that the partnership between elementary schools and museums should be seen as an educational project approach, in which the teacher has to assume a key, mediating role between the school and the museums.

Ano

2025-10-28T12:17:19Z

Creators

Faria, Cláudia Guilherme, Elsa Gaspar, Raquel Boaventura, D.M.

Exploring how marine fish are adapted to their habitat: a successful journey

In this paper we propose a hands-on activity about fish adaptations which engage primary students (seven to eleven years old) in a visit to a fish market (or the supermarket) and two experimental tasks to be performed in the classroom. This activity is focused on adaptations of fish to marine environment and in particular to their habitat and way of life. The main activity allows students to discover the biodiversity of marine fishes through the relationship between the external structures and their function. It also promotes investigative skills like direct observation, respect for the evidence, collection of data, and the use of drawing to record real data.

Ano

2025-10-28T12:09:08Z

Creators

Faria, Cláudia Gaspar, Raquel

An inquiry based science activity based on the effects of climate change on ocean ecosystems

We propose an inquiry-based science activity under the theme of climate change effects on ocean ecosystem. This activity, can be explored not only to improve acquisition of knowledge on climate change effects but also to promote inquiry skills, such as, researching and reading, selecting relevant information, identifying a problem, focusing on a research question, making predictions, planning experiments, observing and registering data, drawing conclusions, developing explanations and communicating findings to class. The activities are suitable for 8 to 13 year old students and can be in the classroom.

Ano

2025-10-28T12:14:42Z

Creators

Boaventura, D.M. Faria, Cláudia

In silico analysis of miRNA promoters

Os microRNAs (miRNAs) contribuem de uma forma abundante para a fracção de RNAs não-codificantes eucariotas. Estes estão envolvidos na regulação negativa póstranscricional da expressão genética através da ligação com a região 3'-UTR dos transcritos de mRNA nascente, conjuntamente com várias outras proteínas ajudantes. Em mamíferos, manifesta-se principalmente através da inibição da síntese proteica. Actualmente, sabe-se que estas moléculas de RNA são reguladores moleculares mestre envolvidos em processos celulares que englobam a diferenciação, transdução de sinal, divisão celular e cancro. A expressão dos microRNAs parece ter uma assinatura específica para cada um dos tecidos. Ainda não está claro quais são os principais factores que controlam esta especificidade, porém vários autores têm postulado a existência de circuitos de regulação entre os factores de transcrição que controlam a expressão de miRNA e a regulação exercida pelo miRNA sobre a expressão do factor de transcrição. Recentemente, as sequências de DNA de todos os promotores de miRNA humanos foram caracterizados por imunoprecipitação da cromatina por Marson et al [1]. Começamos com estes dados e a primeira coisa que se fez foi recolher todas estas sequências, usando a versão do UCSC Genome Browser indicada no estudo anterior e tendo em conta as posições nele indicadas para cada um dos 550 promotores. Para este efeito, foi necessário escrever um pequeno programa. O presente trabalho tem como objectivo principal realizar uma caracterização in silico de todos estes promotores, estudando os factores de transcrição que possivelmente controlam a expressão de miRNAs. Procurou-se factores de transcrição que regulassem a expressão de cada um destes miRNAs e que, simultaneamente, fossem proteínas codificadoras alvo desses mesmos miRNAs. O primeiro passo na análise dos circuitos de regulação entre os microRNA e os factores de transcrição foi a predição dos locais de ligação (TFBS) destes últimos para todas as sequências de promotores de miRNA obtidas. Ou seja, dadas as sequências de promotores de cada um dos miRNAs, era necessário saber quais os factores de transcrição que a elas se poderiam ligar e regular sua transcrição dos respectivos miRNAs. Actualmente, existem vários programas disponíveis. No entanto, apesar de todos os esforços, esses algoritmos às vezes produzem muitos falsos positivos ou falsos negativos. Assim, um dos maiores problemas ainda existentes é como encontrar o software apropriado. Consequentemente, os investigadores costumam usar vários dos programas existentes. Nós usamos o TFSEARCH 1.3, MAPPER 2, Match 1,0, Patch 1.0, P-Match 1.0, PROMO 3.0.2 e o TFBind. A primeira diferença entre todos estes programas é a maneira como as sequências dos promotores lhes podem ser enviadas. O MAPPER 2, foi o único que foi capaz de processar um arquivo FASTA contendo todas as sequências de promotores. Para o TFSEARCH 1.3 foi possível descarregar o EZRetrieve. Esta é uma ferramenta gratuita que se baseia no TFSEARCH e também processou o arquivo FASTA completo. Para o TFBind concebemos uma ferramenta similar ao EZRetrieve. Este programa lê um arquivo FASTA e envia cada sequência à ferramenta TFBind que está disponível online. Em seguida, guarda os ficheiros HTML que podem ser obtidos quando se realizam as pesquisas online. Para todas as outras ferramentas, era necessário um registo prévio nos locais onde elas se encontram disponíveis e, como tal, é necessário fazer o login antes de começar a usar essas ferramentas. Por este motivo, não foi possível conceber qualquer ferramenta para realizar esta pesquisa automaticamente. A única solução foi dividir nosso arquivo FASTA em vários arquivos pequenos e submeter cada um deles a cada uma dessas ferramentas. Tendo esta quantidade enorme de dados proveniente dos sete programas, foi necessário, então, uniformizá-los e prepará-los para serem analisados, tendo sido necessário desenvolver diversos programas para o efeito. As principais questões surgidas durante este processo foram o facto de algumas das aplicações usadas não permitirem restringir os resultados a genes de Homo Sapiens e, para além disso, a identificação dos genes não ser feita de forma uniforma, em virtude de os mesmos terem diversas designações. Para o efeito, descarregamos todos os genes de Homo Sapiens existentes na base de dados GenBank do NCBI. Além dos símbolos oficiais de cada gene, esta base de dados também contém os seus sinónimos. Depois de comparar os nomes dos genes, foi possível identificar a maioria dos genes obtidos nas aplicações de TFBS. No entanto, muitos deles permanecem por classificar ou não são genes de Homo Sapiens. Hoje em dia, é evidente que os processos pós-transcricionais desempenham um papel muito mais importante na regulação da expressão génica do que o anteriormente esperado. Assim, um passo crucial para a análise de funções reguladoras dos miRNAs é a previsão de seus alvos. Actualmente, existem diversos programas e bases de dados disponíveis. Nós usamos o Diana micro-T, Miranda, miRWalk, miRTarBase e uma base de dados publicada em 2010 por Saito T e P Sætrom [44]. Por comparação com o processo de análise das bases de dados de TFBS, estas revelaram uma melhoria considerável na forma de identificação dos genes, pois algumas delas usam identificadores únicos, quer sejam do GenBank ou do sistema Ensemble. Dado que os dados dos genes extraídos do GenBank também incluem os identificadores Ensemble, esta questão da identificação dos genes nas bases de dados de targets não obrigou a tanto esforço e permitiu certamente resultados mais fiáveis. A principal questão surgida com a análise das bases de dados de targets foi o volume de dados das mesmas. Estas bases de dados contêm geralmente milhões de registos e, apesar de os formatos das mesmas serem de muito mais fácil tratamento, obrigam a que se desenvolvam ferramentas para a extracção dos dados pretendidos. Refira-se que a maior destas bases de dados por nós usadas contém cerca de 20 milhões de registos. Depois de analisar todos os dados seleccionados, encontramos 38.773 loops, cobrindo 285 diferentes factores de transcrição e 417 miRNAs distintos. Estes loops envolvem factores de transcrição que regulam a expressão de um miRNA e que, simultaneamente, são proteínas codificadoras alvo desse mesmo miRNA. No entanto, cada loop é composto por um único factor de transcrição e um único miRNA. Uma vez que um único miRNA pode regular múltiplos genes e um único gene pode ser regulado por múltiplos miRNAs, é bastante natural pensar que miRNAs e factores de transcrição possam cooperar na regulação dos genes-alvo tanto a nível transcricional como a nível pós-transcricional. Na verdade, factores de transcrição e miRNAs funcionam juntos em redes reguladoras de genes que ainda não estão completamente identificadas nem compreendidas. Consequentemente, todos os loops identificados por este estudo devem ser vistos como componentes de módulos reguladores, em vez de loops isolados. Embora isto seja verdade, também podemos analisar individualmente cada um destes loops. Tendo em mente o facto de que esta é uma análise in silico, devemos estar cientes que a grande maioria de todos os loops detectados têm uma probabilidade muito baixa de serem loops reais. Portanto, futuras investigações devem começar pela definição de critérios de fiabilidade de todos os dados obtidos. Na verdade, todos estes dados exigem futuras investigações e necessitam de validações experimentais. Assim, este trabalho permitiu reunir e catalogar loops de regulação mistos entre factores de transcrição e miRNAs, em humanos, tendo sido todos os dados processados e armazenados numa base de dados relacional. Além disso, foi desenvolvida uma plataforma web de modo a permitir futuras investigações, pois apesar de ainda não compreendermos perfeitamente o significado biológico destes circuitos, eles são provavelmente um importante mecanismo de regulação da expressão génica. Esta base de dados tem 36 tabelas e armazena mais de 2,5 milhões de registos. A interface web permite a procura de loops usando vários critérios de pesquisa e permite a análise de todos os detalhes de cada um dos loops, tais como os TFBS previstos, os targets, as pontuações associadas a cada previsão, etc.

Ano

2025-10-28T12:13:47Z

Creators

Martins, Fernando Manuel Magalhães, 1969-

Como gostariam os médicos de receber a comunicação de um mau prognóstico no caso de doença grave pessoal?

Introdução: Inevitavelmente, qualquer médico terá que fazer, ao longo do seu percurso profissional, uma comunicação de más notícias (CMN). 1–5 A CMN está pouco investigada tendo como sujeito de estudo, o médico. Objetivos: Determinar como é que os Médicos em Portugal gostariam de receber uma CMN em caso de doença pessoal grave e verificar se existe alguma semelhança entre a forma como o pessoal médico gostaria de receber a CMN e o modo como os doentes referiram tê-la recebido. Tipo de Estudo: Qualitativo, voluntário, anónimo e aleatório Participantes: médicos licenciados a exercer clínica em Portugal Intervenção: resposta a questionário online composto por 11 perguntas sobre a CMN. Resultados: Participaram 220 médicos. A maioria concordava totalmente que lhes perguntassem o quanto queria saber, preferiam receber a CMN sozinhos, logo na consulta do diagnóstico e de forma completa. A maioria concordava que explorassem o que estavam a sentir e que o lugar fosse selecionado previamente à CMN. Gostariam também de saber tudo sobre a doença e de estar totalmente envolvidos na decisão terapêutica. No entanto, só concordavam em parte em ter pessoas externas envolvidas na decisão terapêutica. Concordavam totalmente que toda a informação fosse resumida, antes da CMN terminar. Conclusões: As preferências dos médicos, por vezes, variaram das preferências dos doentes, principalmente relativamente à forma como preferiam que fosse feita a CMN. No entanto, tanto os doentes como os médicos mostraram valorizar a CMN e concordavam que esta deveria ocorrer o mais cedo possível. Relativamente ao resumo no fim da consulta, nem sempre as ações dos médicos refletiram a opinião deles, apesar de médicos e doentes terem opiniões semelhantes.

Ano

2025-10-28T12:15:10Z

Creators

Jardim, Joana Isabel Gama

Implantes cocleares : história, avanços recentes e perspetivas futuras

Este trabalho tem como um dos objetivos expor a história que se encontra por trás do desenvolvimento dos implantes cocleares desde as primeiras experiências de estimulação elétrica da audição até ao desenvolvimento dos mesmos nos vários países. Por outro lado, tem ainda como objetivo abordar os avanços mais recentes da tecnologia dos implantes cocleares, assim como o possível melhoramento dos mesmos. Apesar dos implantes cocleares terem sido criados há cerca de 60 anos, as primeiras tentativas de estimulação elétrica do aparelho auditivo ocorreram há cerca de 200 anos através das experiências realizadas por Alessandro Volta. Desde então ocorreram várias tentativas de estimulação até que essas notícias chegaram a William House, aquele que é considerado o “pai dos implantes cocleares”, criando o primeiro implante coclear em 1961. Os implantes cocleares são dispositivos protésicos implantados cirurgicamente e funcionam através da estimulação elétrica do nervo auditivo. Estão indicados na surdez neurossensorial severa e profunda e nos casos de insucesso nas tentativas anteriores de reabilitação auditiva através de aparelhos auditivos convencionais. A tecnologia dos implantes cocleares sofreu várias modificações ao longo dos 60 anos até chegar aos dispositivos de hoje, porém existem ainda várias possibilidades de inovação e melhoramento como por exemplo a criação de implantes cocleares totalmente implantáveis, a minimização do trauma provocado pela implantação e a estimulação ótica das fibras nervosas.

Ano

2025-10-28T12:15:53Z

Creators

Fernandes, João Carlos Freitas