Repositório RCAAP
Does nutrition influence quality of life in cancer patients undergoing radiotherapy?
Purpose: To investigate in cancer patients referred for radiotherapy (RT): (1) quality of life (QoL), nutritional status and nutrient intake, at the onset and at the end of RT; (2) whether individualised nutritional counselling, despite symptoms, was able to enhance nutrient intake over time and whether the latter influenced the patient's QoL; and (3) which symptoms may anticipate poorer QoL and/or reduced nutritional intake. Material and methods: One hundred and twenty-five patients with tumours of the head-neck/gastrointestinal tract (high-risk: HR), prostate, breast, lung, brain, gallbladder, uterus (low-risk: LR) were evaluated before and at the end of RT. Nutritional status was evaluated by Ottery's Subjective Global Assessment, nutritional intake by a 24-h recall food questionnaire and QoL by two instruments: EUROQOL and the European Organisation for the Research and Treatment of Cancer (EORTC) Quality of Life Questionnaire (QLQ)-C30. Results: Baseline malnutrition was prevalent in HR vs. LR (P=0.02); nutritional intake was associated with nutritional status (P=0.007); the latter did not change significantly during RT. In LR, baseline energy intake was higher than EER (P=0.001), and higher than HR' intake (P=0.002); the latter increased (P<0.03), in spite of symptom increase anew and/or in severity (P=0.0001). According to both instruments, QoL was always better in LR vs. HR (P=0.01); at the end of RT, QoL improvement in HR was correlated with increased nutritional intake (P=0.001), both remained stable in LR. Conclusions: Individualised nutritional counselling accounting for nutritional status and clinical condition, was able to improve nutritional intake and patients' QoL, despite self-reported symptoms.
2025-10-28T12:19:54Z
Ravasco, Paula Monteiro Grillo, Isabel Camilo, Maria
Clinical and neurophysiological evaluation of progression in amyotrophic lateral sclerosis
There is a need for a sensitive neurophysiological measure of disease progression in following the course of patients with amyotrophic lateral sclerosis (ALS). We studied two groups of nine ALS patients, one with slow progression (Group A) and the other with rapid progression (Group B). We evaluated muscle strength scores using the Medical Research Council (MRC) scale in limb and trunk muscles, forced vital capacity (FVC), and ALS functional rating scale (ALS-FRS) scores. Maximal voluntary isometric contraction (MVIC) of the abductor digiti minimi muscle (ADM) was measured, using a digital device. We also measured M-wave amplitude and area in the ADM, and the distal motor latency and F-wave frequency in the ulnar nerve; from these data, the neurophysiological index (NI) was calculated, as described previously. In both groups, the NI was the most sensitive measure of change, with the smallest coefficient of variation. We conclude that the NI, which requires no special technology and no new clinical or technical skills to use, is sensitive to change, and therefore may be useful in clinical trials, as well as in a clinical setting.
2025-10-28T12:25:54Z
Carvalho, Mamede Scotto, Manuel Lopes, Arminda Swash, Michael
Comparative analysis of 454 pyrosequencing data from coffee transcriptomes
Understanding the mechanisms beyond the resistance of coffee plants (Coffea spp.) to leaf rust (caused by Hemileia vastatrix) is of vital importance for breeding coffee varieties with durable resistance. However, loss of resistance due to the appearance of new rust races is occurring, but some genotypes are still resistant to all known H. vastatrix races, such as HDT832/2. Previous studies show that the resistance to H. vastatrix in this genotype shares common immunity components with the nonhost resistance. 454 pyrosequencing transcriptomic data representing HDT832/2 host and nonhost resistance, along a healthy plant control, were analyzed with the purpose of better understanding this resistance. Expressed sequence tags (ESTs) are a very common and interesting solution for transcriptomic studies because they lack the non-expressed part of the genome. The small amount of reads generated for this project present a limitation that has not an established solution. To analyze this dataset, two different assembly strategies (individual assembly versus global assembly) and two different assemblers (Newbler versus MIRA) were used, and the results of all four assemblies are reported and analyzed. Assemblies were compared by assessing the number of transcripts shared by the three libraries, by a blast searches against NCBI nr protein and Coffea spp. EST databases and searching for previously studied genes. Overall the global assembly strategy performed better than the individual strategy, and Newbler performed better than MIRA in most but not all parameters. Here we provide a good strategy for small budget transcriptome projects to optimize their data and we present an annotated transcriptome of coffee line HDT832/2 resistance response to rust in host and nonhost interactions.
2025-10-28T12:17:46Z
Santos, Diogo André Passagem dos, 1987
Globalização e alterações constitucionais
A globalização é um fenômeno multidimensional que tem, por meio de alterações constitucionais, redefinido o papel do Estado. Em particular, a globalização política caracteriza-se pela união de Estados em blocos plurinacionais e pelo desenvolvimento de um sistema universal de direitos humanos. Por sua vez, a globalização econômica relaciona-se com o neoliberalismo e com a difusão de um poder econômico transnacional. Este trabalho procura explorar a relação dessas dimensões da globalização com a transformação do modelo de constitucionalismo centrado no Estado para um constitucionalismo cosmopolita multinível, bem como com a introdução, no modelo do constitucionalismo social, dos fundamentos econômicos neoliberais. Os objetivos específicos são: analisar como a globalização induz alterações constitucionais em ordenamentos alinhados ao constitucionalismo social; examinar a legitimidade dessas alterações constitucionais à luz das cláusulas pétreas e da identidade constitucional; e averiguar como a globalização influencia a elaboração de novas Constituições. O trabalho é dividido em seis capítulos. Os capítulos 2 e 3 cuidam de questões conceituais sobre a trajetória histórica do Estado e do constitucionalismo, do paradigma liberal ao pós-social, bem como da sistematização das alterações constitucionais expressas e implícitas. O capítulo 4 estuda a relação da globalização com as mutações informais e com as emendas constitucionais. O capítulo 5 cuida da relação entre a globalização e a elaboração de novas Constituições. Entre as conclusões, verificou-se que a análise das influências da globalização difere quando se trata de mutações informais ou de emendas constitucionais. No primeiro caso, as principais questões relacionam-se com a legitimidade das alterações que ocorrem à revelia da deliberação do legislador constitucional. No que concerne às emendas constitucionais, o que se põe em causa é a validade das alterações em face dos limites materiais e da identidade constitucional. Por fim, sustentou-se que a globalização impõe restrições de natureza extrajurídica ao exercício do poder constituinte.
Empty voting : excepção à regra consagrada no nº1, do artigo 384.º do CSC
Na presente dissertação desenvolve-se um tema que tem sido bastante discutido nos últimos anos no seio do Direito, nomeadamente no Direito Societário, e que veio alterar a forma de atuação das sociedades e das suas administrações, quando se veem a braços com os problemas causados por alguém que apenas é titular do direito de voto, sem terem a si associados a ação e até o risco. Em regra, e como consta do Código das Sociedades Comerciais, aquele que é detentor de uma ação também é detentor do direito de voto, salvo as exceções que se encontram previstas na lei. Nos anos 60, mas principalmente nos anos 90, apareceu e começou a estudar-se de forma mais aprofundada uma nova forma de compra e exercício do direito de voto que veio abalar com os princípios e deveres ligados às sociedades e aos sujeitos que a compõem. O aparecimento e desenvolvimento desta nova forma de compra do direito de voto, esvaziamento do voto (empty voting), deveu-se ao desenvolvimento e evolução dos mercados financeiros e ainda ao aparecimento de novos investidores/ fundos. O esvaziamento de voto caracteriza-se pelo facto do voto não estar agregado à ação, havendo assim duas pessoas, uma titular da ação e outra titular do direito de voto, não se verificando o princípio uma ação, um voto. Contudo, o seu uso tem suscitado alguns problemas, nomeadamente quanto ao interesse social, isto é, saber qual é o interesse de quem usa esta figura, e em caso de o mesmo ser contrário ao interesse da sociedade e levar a uma situação de conflitos de interesses e consequente inibição do direito de voto, em quem se verifica os seus efeitos, se no terceiro ou no sócio, como ainda pode originar situações de desequilíbrio e desproporção, levando a uma situação de desigualdade dentro da sociedade.
2025-10-28T12:19:54Z
Pimentel, Ana Cláudia Marques
Teoria geral da elegibilidade e da inelegibilidade no Brasil
A dissertação aborda a teoria da elegibilidade no Brasil, que consiste no direito de ser votado e faz parte do conjunto dos direitos políticos, ostentando a natureza de direito fundamental na ordem jurídica constitucional. Serão objeto de análise as principais características da elegibilidade, os seus elementos constitutivos e, em destaque, os fatores de impedimento a seu exercício, notadamente as causas de inelegibilidade. O trabalho reafirma, em essência, os fundamentos centrais da teoria clássica da elegibilidade, predominante na doutrina e jurisprudência brasileiras, mediante o enfrentamento de teorias contrapostas e com a apresentação de críticas e novas ideias para compreensão e aperfeiçoamento dos institutos jurídicos relacionados à elegibilidade. Inicialmente, serão estudados os direitos políticos em geral, no contexto da democracia e da soberania popular, e explicitadas as hipóteses constitucionais e legais de perda e suspensão desses direitos. Depois, serão tratados os contornos dogmáticos que definem a elegibilidade e a inelegibilidade, estabelecendo as diferenças conceituais e normativas entre as condições de elegibilidade, as causas de inelegibilidade e os encargos formais exigidos para se obter o registro de candidato, bem assim apontando cada um dos requisitos positivos da elegibilidade. Em acréscimo, serão enfrentados temas polêmicos sobre a inelegibilidade, como a natureza sancionatória ou não de suas espécies legais, a possibilidade de sua aplicação a fatos pretéritos e a eventual colidência do marco inicial para sua incidência com relação ao princípio constitucional da presunção de inocência. Também serão apreciados outros óbices ao exercício da elegibilidade, que são as penalidades de cassação ou cancelamento do registro de candidatura, diploma ou mandato pela prática de atos ilícitos na campanha eleitoral e a sanção de inabilitação para o exercício de função pública, justificando a autonomia dessas cominações perante a inelegibilidade. Ao final, serão discutidos os parâmetros para aferição pela Justiça Eleitoral, no processo de registro de candidatura, do descumprimento das condições de elegibilidade e da incidência de causas de inelegibilidade.
Migrant Women: Trapped in the Vicious Circle of Harassment and Inequality
Migrants customarily embark on perilous journeys and endure arduous circumstances to protect themselves from immediate and often unavoidable harm in a determined effort to improve their lives. Since 1960 the number of international migrants has more than tripled. Today there are 272 million migrants worldwide, of which 48% are women.1 According to the International Labour Organisation, female migrants represent a large proportion of the total number of migrant workers globally and outnumber the nonmigrant women in labor participation. Their jobs are mostly concentrated in high- and middle-income countries. However, many remain stuck in low-paying jobs, often without employment rights or access to even minimum social and health protection.
Decisões verde em tempos de crise : um estudo sobre os rótulos ecológicos europeus, seu papel nas compras públicas e sua influência no comportamento do consumidor
O objetivo fulcral deste trabalho é estudar sobre o Rótulo Ecológico Europeu, o papel que ele exerce nas compras públicas e como ele pode influenciar o comportamento do consumidor. Em dias tão marcados pelo consumismo desenfreado e por diversas crises sociais e ambientais, a relação que se estabelece frente às estratégias de mercado influenciará diretamente o rumo pelo qual a economia poderá trilhar, concorrendo para o desenvolvimento e fortalecimento de uma geração envolvida com a proteção do meio ambiente ou com uma sociedade que não inova, que continua com um comportamento antiquado e próprio de uma geração acomodada. As políticas públicas para a rotulagem ambiental buscam reforçar os valores éticos e ambientais tão presentes nas estratégias adotadas pela União Europeia, como também pretende atuar no processo de percepção dos consumidores do rótulo verde, a fim de informá-los e orientá-los sobre as atribuições, as características e os benefícios dos produtos e serviços ecológicos. Compreender a evolução legislativa também facilitará na condução do trabalho e traçará um fio condutor da evolução das políticas públicas ambientais, mostrando o rótulo ecológico como instrumento de fomentação da economia e outrora como instrumento de proteção do meio ambiente. Discutirá, também, o mercado econômico na perspectiva da Economia Verde e como os processos produtivos podem ser aplicados em prol do bem-estar humano, da igualdade social e da minimização dos impactos ambientais negativos. Não obstante, cumpre analisar o papel da contratação pública sustentável e a sua importância na promoção da tutela dos interesses públicos coletivos, através da qual, poderá a Administração Pública atuar observando os critérios ambientais para a compra, estimulando o crescimento do consumo sustentável. A implementação do rótulo ecológico não impactua apenas as decisões dos consumidores, mas ele exige uma adequação das empresas aos critérios ambientais, como forma de resgatar valores e promover mudanças ecológicas no mundo dos negócios.
2025-10-28T12:23:01Z
Costa, Mariana Bedêgo Santos
Direito fundamental de acesso à justiça : o uso indiscriminado do poder judiciário
O presente trabalho trata do uso desregrado do Poder Judiciário, decorrente da interpretação abrangente e sem limites do direito fundamental de acesso à justiça. Propôs-se a aplicação das normas de conformação e técnicas de limitação aos direitos fundamentais, como a reserva legal e o princípio da proporcionalidade em sentido amplo, de modo a resolver parte dessa celeuma. Em termos metodológicos, foi utilizado o método de abordagem dedutivo, optando-se pela pesquisa estatística, bibliográfica e jurisprudencial. Apresentou-se a estatística, elaborada pelo Conselho Nacional de Justiça e relacionada ao Judiciário brasileiro. Há um resultado negativo com a utilização nociva e desenfreada do direito fundamental de acesso à justiça. Verificou-se o aumento excessivo de demandas, muitas das quais poderiam ser solucionadas por meio de métodos extrajudiciais, como acordos, procura dos órgãos administrativos, notificações extrajudiciais, arbitragem, etc. Há alguns anos, o Brasil vem repensando as causas do ajuizamento desenfreado de tantas ações, as quais trazem como um dos problemas, a impossibilidade de uma rápida solução dos litígios, o que pode, inclusive, comprometer a efetividade do direito no caso concreto. Elencaram-se pontos que propiciam o ajuizamento desregrado de ações, de forma direta ou indireta, e que devem ser repensados, entre eles a facilidade de se obter a gratuidade da justiça sem provas da hipossuficiência, o ativismo judicial e as ações sem comprovação de prévio requerimento administrativo, como demonstração do interesse processual.
As invalidades formais dos regulamentos administrativos
A presente dissertação versa sobre a matéria das invalidades dos regulamentos administrativos, mais focalmente nas invalidades formais dos regulamentos administrativos e a norma do n.º 2 do artigo 144.º do actual Código do Procedimento Administrativo, quanto ao desvalor associado àqueles vícios. O regulamento é, na administração moderna de um Estado Social, uma ferramenta da actividade administrativa quase tão utilizada como a figura mítica da teoria geral do direito administrativo, o acto administrativo. Dada a proliferação destes normativos, não é de menos a importância que se deve dar à figura, desde logo aos vícios que os afectam, às possíveis lesões e violações que podem impor na esfera dos particulares/administrados e, por conseguinte, qual a resposta do próprio direito para sancionar a violações da Administração na emissão de um regulamento ilegal, materialmente e formalmente. O novo Código do Procedimento Administrativo veio, assim, consagrar ex-novo um regime substantivo dos regulamentos administrativos, criando igualmente um regime para a invalidade destes. Todavia, parece haver dúvidas no âmbito da invalidade formal e o desvalor associado que ficam por esclarecer face àquilo que é o regime da invalidade do acto administrativo e a unidade que se pretende do sistema jurídico-administrativo.
A responsabilidade por créditos laborais nas relações entre sociedades comerciais
A dinâmica das relações entre sociedades comerciais surpreende o intérprete do direito no mundo e, também, em Portugal. Da realidade de atividade econômica executada por uma sociedade comercial de forma individual, estruturada para a produção de todos os componentes necessários para os seus produtos e, ao final, interagindo com o mercado consumidor através de departamento comercial próprio, encontramos estruturas complexas como as de sociedades sistemistas na produção de automóveis, onde em um mesmo complexo encontra-se a planta da sociedade principal, que monta o veículo, e ao seu redor várias outras sociedades comerciais, interligadas à principal, cada uma produzindo um ou vários componentes para o veículo, com especificações determinadas pela montadora. Todas as sociedades comerciais tendo personalidade jurídica própria e sem participação acionária umas nas outras, e nem uma das sociedades tendo domínio societário sobre as demais ou um contrato de subordinação na formatação do Código das Sociedades Comerciais, mas, ao mesmo tempo, todas restando interligadas por conta do objetivo principal, qual seja, a produção de um determinado produto final. Algumas não tem relação relevante para sua existência com a montadora, como, por exemplo, uma fábrica de pneus, mas outras sim, sendo completamente dependentes economicamente da montadora, como, na hipótese de uma fábrica de estofados para o veículo e que somente tenha sua atividade naquele sistema. E, na ponta final os distribuidores dos veículos, com uma relação também relevante com a montadora, dependendo dos negócios com esta para sua existência no mercado. Nestas relações relevantes entre sociedades comerciais, que por força de contratos se revelam das mais variadas possíveis, questiona-se qual a garantia que se dá aos créditos dos trabalhadores. Na busca de resposta para esta questão é realizado estudo a partir de norma do Código do Trabalho de Portugal que assegura ao trabalhador a garantia de seu crédito não só por parte de seu empregador, mas também e de forma solidária, de outras sociedades comerciais que com ele tenham relações comerciais de relevo, notadamente, pela letra da norma responsabilidade solidária entre sociedades coligadas na forma de relação de participação recíproca, de domínio ou de grupo, nos termos dos artigos 481º e seguintes do Código das Sociedades Comerciais. O caminho percorrido passa pelo exame das garantias dos créditos dos trabalhadores no Código do Trabalho de Portugal, pelos conceitos de coligações societárias do Código das Sociedades Comerciais e da garantia dos credores destas coligações, pela comparação entre a responsabilidade solidária prevista no Código do Trabalho e a prevista no Código das Sociedades Comerciais, seguindo-se exame dos contratos de cooperação e de distribuição entre sociedades comerciais, para, a seguir, ter-se uma visão da Análise Económica do Direito com relação aos contratos entre sociedades comerciais. No percurso são adquiridos os conceitos necessários para a interpretação da norma do Código do Trabalho e que trata de responsabilidade solidária entre sociedades comerciais por créditos de seus trabalhadores. Ao final, através da reconstrução do pensamento legislativo, da verificação da unidade do sistema jurídico e do estabelecimento das circunstâncias em que a norma foi elaborada e das condições do tempo em que é aplicada, é extraída a regra que responde ao questionamento formulado, através de interpretação extensiva do preceito.
2025-10-28T12:16:21Z
Oliveira, Marcelo Gonçalves de
A proteção dos direitos humanos na Federação Russa e a Convenção Europeia dos Direitos Humanos
De forma muito geral, a presente dissertação concentra-se em duas principais propostas: ajudar a compreender a atual situação dos Direitos Humanos na Federação Russa, e promover os direitos humanos em todo o mundo. O significado científico e prático da pesquisa sobre o tema da dissertação exige um estudo abrangente na investigação da posição da Convenção Europeia dos Direitos Humanos (“CEDH”) e dos seus Protocolos no sistema de fontes jurídicas, deixando de fora todas as convenções relativas a direitos ou destinatários específicos. Acresce a examinação do papel das sentenças do Tribunal Europeu dos Direitos Humanos (“TEDH”), a sua natureza vinculativa e os efeitos produzidos na ordem jurídica. Destacamos que, o facto de a Rússia ter aderido, em 1998, ao mecanismo da CEDH e aos seus Protocolos, para a sua interpretação e aplicação e, ao mesmo tempo, reconhecer a jurisdição vinculativa do TEDH e a implementação obrigatória dos acórdãos proferidos pelo TEDH, impõem, atualmente, vários desafios à Rússia no que toca à sua ordem jurídica. Estas dificuldades surgem da articulação entre o crescente número, nos últimos anos, das alegadas queixas contra a Rússia neste Tribunal, que atingiram 15 000 em 2019, com a falta de prática por parte do judiciário nacional e outras autoridades habilitadas para a aplicação das normas da CEDH e dos seus Protocolos; várias perspetivas de entendimento por parte do Tribunal Constitucional Russo no que toca a preservação da soberania do Estado Russo e, sobretudo, a dificuldade e demora no processo de ajustamento da legislação, segundo as padrões do sistema da Convenção e da jurisprudência do Tribunal de Estrasburgo. São questões que nos colocam a refletir sobre as causas e as consequências de tal fenómeno, que diz respeito ao impacto negativo que está a surgir, quer no cenário internacional, quer na ordem doméstica do próprio Estado. Surge, igualmente, um impacto bastante positivo, vindo desta interação da Rússia com o TEDH, há mais de vinte anos, quer na justiça internacional quer na própria doutrina russa. Além disso, há um ponto que deve ser esclarecido. No presente estudo, não pretendemos construir um modelo de medidas que a Rússia precisa de adotar para desenvolver os mecanismos mais eficazes, com intuito de ajustar as práticas da aplicação da lei segundo os padrões do sistema da Convenção e a jurisprudência do TEDH (no seio do Conselho da Europa existe um órgão específico, o Comité de Ministros, que desenvolve recomendações sobre a aplicação da CEDH e as sentenças do TEDH no processo judicial nacional; faz a sua monitorização e supervisão e sugere aos Estados Parte que adotem as medidas relativas ao ajustamento da lei nacional), uma vez que o ajustamento da legislação interna, ou certas disposições, sempre dependem da vontade e dos interesses políticos do Estado, podendo, estas disposições constar na Constituição e apenas serem revistas ou revogadas caso seja adotada uma nova Constituição.
Serviços e reestruturação produtiva: utilização de serviços pelas explorações agrícolas da Raia Central e desenvolvimento regional
O objectivo desta dissertação é estudar de que forma se efectuaram os processos de desmaterialização dos sistemas produtivos e como isso afectou a agricultura, procurando depois verificar como essa reestruturação das actividades económicas influenciou o desenvolvimento económico e social de uma região, como a Raia Central de Portugal, interferindo no dinamismo e na diferenciação do desenvolvimento territorial.
2025-10-28T12:27:00Z
Pereira, Maria Teresa Mendes Almeida Alves
"Ler contigo, ler melhor" : programa de promoção da fluência de leitura oral para 2.º ano do 1.º ciclo
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Desafios éticos, metodológicos e práticos na pesquisa qualitativa em saúde: um olhar a partir de um estudo em torno do processo de morrer
Partindo de uma experiência de investigação em torno do processo de morrer, este artigo procura discutir alguns dos desafios que emergiram no âmbito de uma pesquisa qualitativa de natureza etnográfica no campo da saúde. A sensibilidade do tema e a vulnerabilidade dos participantes conduziu à necessidade de criar estratégias que mitigassem potenciais efeitos indesejados para os atores envolvidos. Desta forma, discutem-se questões ético-metodológicas e o impacto que a pesquisa assumiu para os participantes e investigador. As principais conclusões apontam, por um lado, para a necessidade de criar diretrizes bem definidas no que diz respeito à pesquisa com sujeitos humanos e, por outro, para a importância de adequar os instrumentos de recolha no sentido de criar proximidade e salvaguardar o bem-estar de todos os intervenientes. Este artigo procura contribuir para um debate em torno dos “bastidores” da pesquisa, dando a conhecer dilemas transversais à investigação.
2025-10-28T12:14:15Z
Hilario, Ana Patricia Augusto, Fábio Rafael
Testing the impacts of wildfire on hydrological and sediment response using the OpenLISEM model. Part 1: Calibration and evaluation for a burned Mediterranean forest catchment
Models are typically applied to estimate the potential adverse effects of fire on land degradation and water resources and the potential benefits of post-wildfire rehabilitation treatments. However, few modeling studies have been conducted for meso-scale catchments, and only a fraction of these studies include transport and deposition of eroded material within the catchment or represent spatial erosion patterns. This study presents an application and evaluation of the OpenLISEM physically-based and spatially-distributed hydrological and soil erosion model for a burned Mediterranean meso-scale catchment (18.5 km2) in a data-scarce environment, using a robust parameterization and calibration procedure: (1) integrating satellite imagery and the topographic wetness index to support model parameterization; (2) event-based automated calibration using the Model-Independent Parameter Estimation and Uncertainty Analysis and parameters ensemble for before and after the fire; (3) a jack-knife cross-validation for model evaluation. The study shows that this procedure used in OpenLISEM provides reasonable results for pre- and post-wildfire catchment discharge and sediment transport (r2 and NSE > 0.5; absolute PBIAS < 25% for discharge and 55% for sediment transport). This may serve the needs of model applications in data-scarce burned areas. The results also provide recommended model parameters for burned areas with high severity such as random roughness (rr) = 2.41cm, and slope manning’s n (n) = 0.038; or post-wildfire to pre-wildfire ratios of model parameters such as saturated hydraulic conductivity (Ks) = 0.98×, channel manning’s n (chn) = 0.44×, grain size (d50) = 0.61×. The simulation results indicate that wildfire did not lead to significantly enhanced hydrological responses and soil erosion at the catchment outlet, partly explained by the spatial patterns of soil erosion. For both pre- and post-wildfire conditions, higher soil erosion was simulated in areas located far from the catchment outlet. The wildfire led to enhanced hillslope erosion, mostly in the upper part of the catchment, providing ample opportunities for transported sediment to deposit before reaching the outlet.
2025-10-28T12:17:04Z
Wu, Jinfeng Nunes, João Pedro Baartman, Jantiene Faúndez Urbina, C.A.
Testing the impacts of wildfire on hydrological and sediment response using the OpenLISEM model. Part 2: Analyzing the effects of storm return period and extreme events
Wildfires can have strong negative effects on soil and water resources, especially in headwater areas. The spatially explicit OpenLISEM model was applied to a burned catchment in southern Portugal to quantify the individual and combined impacts of wildfire and rainfall on hydrological and erosion processes. The companion paper has calibrated and assessed model performance in this area before and after a fire. In this study, the model was applied with design storms of six different return periods (0.2, 0.5, 1, 2, 5, and 10 years) to simulate and evaluate pre- and post-wildfire hydrological and erosion responses at the catchment scale. Our results show that rainfall amount and intensity played a more important role than fire occurrence in the catchment discharge and sediment yields. Fire occurrence was found to be an important factor for peak discharge, indicating that high post-fire hydro-sedimentary responses are frequently related to extreme rainfall events. The results also suggest a partial shift from runoff to splash erosion after fire, especially for higher return periods. This can be explained by increased splash erosion in burned upstream areas saturating the sediment transport capacity of surface runoff, limiting runoff erosion in downstream areas. Therefore, the pre-fire erosion risk in the croplands of this catchment was partly shifted to a post-fire erosion risk in upper slope forest and natural areas, especially for storms with lower return periods, although erosion risks in croplands were important both before and after fires. These findings have significant implications to identify areas for post-wildfire stabilization and rehabilitation, which is particularly important given the predicted increase in the occurrence of fires and extreme rainfall events with climate change.
2025-10-28T12:27:13Z
Wu, Jinfeng Baartman, Jantiene Nunes, João Pedro
Resolving a taxonomic and nomenclatural puzzle in mantellid frogs: synonymization of Gephyromantis azzurrae with G. corvus, and description of Gephyromantis kintana sp. nov. from the Isalo Massif, western Madagascar
The genus Gephyromantis belongs to the species-rich family Mantellidae and is currently divided in six subgenera. Among these is the subgenus Phylacomantis, which currently includes four described species: Gephyromantis pseudoasper, G. corvus, G. azzurrae, and G. atsingy. The latter three species are distributed in western Madagascar, and two of them (G. azzurrae and G. corvus) occur in the Isalo Massif. Based on the analysis of molecular data (a fragment of the 16S rRNA gene), morphological inspection of museum specimens, and photographic comparisons, G. azzurrae is synonymised with G. corvus and the second Phylacomantis lineage of Isalo is described as G. kintana sp. nov. This medium-sized frog species (adult snout-vent length 35–44 mm) is assigned to this subgenus according to genetic and morphological similarities to the other known species of Phylacomantis. Gephyromantis kintana sp. nov. is known only from the Isalo Massif, while new records for G. corvus extend its range to ca. 200 km off its currently known distribution. These two taxa seem to occur in syntopy in at least one locality in Isalo, and the easiest way to distinguish them is the inspection of the ventral colouration, dark in G. corvus and dirty white in G. kintana.
2025-10-28T12:27:00Z
Cocca, Walter Andreone, Franco Belluardo, Francesco Rosa, Gonçalo M. Randrianirina, Jasmin E. Glaw, Frank Crottini, Angelica
Bacterial persistence is essential for susceptible cell survival in indirect resistance, mainly for lower cell densities
Antibiotic-susceptible bacteria may survive bactericidal antibiotics if other co-inhabiting bacteria detoxify the medium through antibiotic degradation or modification, a phenomenon denominated as indirect resistance. However, it is unclear how susceptible cells survive while the medium is still toxic. One explanation relies on the speed of detoxification, and another, non-exclusive explanation, relies on persistence, a state of bacterial dormancy where cells with low metabolic activity and growth rates are phenotypically tolerant to antibiotics and other cytotoxic substances. Here we simulated the fate of susceptible cells in laboratory experiments in the context of indirect resistance to understand whether persistence is necessary to explain the survival of susceptible cells. Depending on the strain and experimental conditions, the decay of persister populations may follow an exponential or a power-law distribution. Therefore, we studied the impact of both distributions in the simulations. Moreover, we studied the impact of considering that persister cells have a mechanism to sense the presence of a toxic substance–a mechanism that would enable cells to leave the dormant state when the medium becomes nontoxic. The simulations show that surviving susceptible cells under indirect resistance may originate both from persister and non-persister populations if the density of detoxifying cells is high. However, persistence was necessary when the initial density of detoxifying cells was low, although persister cells remained in that dormancy state for just a few hours. Finally, the results of our simulations are consistent both with exponential and power-law decay of the persistence population. Whether indirect resistance involves persistence should impact antibiotic treatments.
2025-10-28T12:28:20Z
Rebelo, João Domingues, Célia P. F. Monteiro, Francisca Nogueira, Teresa Dionisio, Francisco
Glyphosate-Based Herbicide Toxicophenomics in Marine Diatoms: Impacts on Primary Production and Physiological Fitness
Glyphosate is the main active component of the commercial formulation Roundup®, the most widely used chemical herbicide worldwide. However, its potential high toxicity to the environment and throughout trophic webs has come under increasing scrutiny. The present study aims to investigate the application of bio-optical techniques and their correlation to physiological and biochemical processes, including primary productivity, oxidative stress, energy balance, and alterations in pigment and lipid composition in Phaeodactylum tricornutum, a representative species of marine diatoms, using the case study of its response to the herbicide glyphosate-based Roundup® formulation, at environmentally relevant concentrations. Cultures were exposed to the herbicide formulation representing effective glyphosate concentrations of 0, 10, 50, 100, 250, and 500 μg L−1. Results showed that high concentrations decreased cell density; furthermore, the inhibition of photosynthetic activity was not only caused by the impairment of electron transport in the thylakoids, but also by a decrease of antioxidant capacity and increased lipid peroxidation. Nevertheless, concentrations of one of the plastidial marker fatty acids had a positive correlation with the highest concentration as well as an increase in total protein. Cell energy allocation also increased with concentration, relative to control and the lowest concentration, although culture growth was inhibited. Pigment composition and fatty acid profiles proved to be efficient biomarkers for the highest glyphosate-based herbicide concentrations, while bio-optical data separated controls from intermediate concentrations and high concentrations.
2025-10-28T12:21:27Z
Cruz De Carvalho, Ricardo Feijão, Eduardo Matos, Ana Rita Cabrita, Maria Teresa Novais, Sara C. Lemos, Marco F. L. Caçador, Isabel Marques, João Carlos Reis-Santos, Patrick Fonseca, Vanessa F. Duarte, Bernardo