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Taking fascist ideology seriously, our study uses a conceptual approach to analyze the ideology of fascist leaders. We thus argue that fascist ideology can be approach like any other ideology and that the leaders can be an interesting source of information about this topic. This conceptual approach can grasp both the main features of a generic fascist ideology as well as some of the most important permutations. Focusing on the interlinkages between concepts, we untangled a configuration for generic fascism: Nation, State, Corporatism, Revolution, Authority, Violence and Empire. After this, we were able to analyze the ideological content of seven different fascist leaders, highlighting the different possible interactions between core concepts and adjacent concepts. We were thus able to identify the recurrent patterns of conceptual interlinkages that fascist leaders could use to structure the ideology of their movement.

A vacinação contra o vírus da hepatite B (VHB) começou a ser administrada a adolescentes em 1994, e a recém-nascidos em 2000. Contudo, populações vulneráveis, nomeadamente utilizadores de drogas injetáveis (UDI) e reclusos, são suscetíveis a adquirirem infeção por VHB devido aos seus comportamentos de risco. Este estudo teve como objetivo detetar a presença de DNA viral em UDI com anticorpos para hepatite C, determinar os genótipos de VHB em circulação numa população de reclusos, e identificar mutações de resistência ao tratamento da hepatite B. Foram analisadas amostras de dois subgrupos de UDI, distribuídos segundo a sua origem geográfica, 140 nascidos em Portugal (antes de 1971) e 31 nascidos fora de Portugal, e ainda de 41 reclusos com hepatite B crónica. Metodologias utilizadas englobaram a pesquisa de AgHBs em pools de plasma, extração de DNA dos plasmas positivos, amplificação por PCR, e sequenciação das regiões S e Core do genoma do VHB. As sequências obtidas foram genotipadas por análise filogenética e submetidas a análise de mutações de resistência ao tratamento. Nos UDI nascidos em Portugal (idade média de 50,3 anos), presumivelmente não vacinados, foi detetado DNA viral em dois (1,4%) indivíduos, um deles infetado com o genótipo E. A infeção por VHB não foi detetada em UDI nascidos fora de Portugal (45,2% de naturalidade africana). A população de reclusos apresentou uma variedade de genótipos (A, 41,5%; D, 29,3%; E, 26,8% e F, 2,4%), nomeadamente em reclusos portugueses (idade média de 37,4 anos), supostamente vacinados na adolescência. Não foram detetadas mutações de resistência ao tratamento. Embora a prevalência do VHB em Portugal seja baixa, este vírus continua bastante presente noutros países e casos de infeção podem ser importados para Portugal. Assim sendo, vigilância do VHB combinada com estratégias de vacinação, é essencial para evitar a disseminação deste vírus em populações vulneráveis.

In this dissertation we study the Hamiltonian p-Median Problem, a combinatorial optimization problem in which, given an undirected graph G = (V, E) and a cost for each edge, the objective is to find the cheapest way to partition the set of nodes into p subsets with each subset being connected by a single cycle. This is a problem which may therefore be seen as a generalization of the Travelling Salesman Problem (TSP). When working with MILP models for the TSP, sets of constraints to prevent feasible solutions with more than one cycle are added to an assignment formulation. Similarly, when working with such models for the HpMP, sets of constraints to prevent feasible solutions with more than p cycles can also be added to an assignment formulation, and these are often very similar to sets of constraints already used in models for the TSP, albeit with some modifications. However, these sets are not sufficient to guarantee every feasible solution has exactly p cycles, since it may have fewer than p cycles. To this end, additional sets of constraints for preventing solutions with less than p cycles may be introduced, and these will be the focal point of this work. The work begins with a brief introduction to the problem and some literature review. After that, several compact formulations for this problem are presented. The presentation of these models will be split into three parts. In the first part, a model upon which all other models are built is presented. The second part focuses on a model used to prevent solutions with more than p cycles, while the third part focuses on two models used to prevent solutions with less than p cycles (in which nodes are assigned to depots or cycles), accompanied by some valid inequalities. Finally, some of the models presented in this work are tested and the results and possibilities for future work are discussed.

O estágio “Análise comparativa de duas Metodologias de Gestão de Projetos”, realizado de 6 de outubro de 2020 a 10 abril de 2021, na Fidelidade Informação e Tecnologia (FIT) da Fidelidade, teve como objetivo a introdução a uma área de Gestão de Projeto e o conhecimento sobre as metodologias Waterfall e Agile. Deste modo, durante a realização do mesmo, foram acompanhadas várias atividades de projetos das duas metodologias em fases distintas, tendo tido participação ativa nos processos, prestando auxílio aos gestores de projeto no decorrer das atividades e na condução de várias sessões, bem como na elaboração de documentos e atualização de plataformas. No final do estágio, que contou também com uma fase de introdução aos conceitos e às diferentes dinâmicas, foi possível apontar várias vantagens e desvantagens das diferentes metodologias, além de algumas variações e ajustes existentes nos diversos projetos.

Local government in Portugal had a good opportunity to modernise through the Programa de Formação para as Autarquias Locais (Foral) [Training programme for local authorities], implemented between 2000 and 2005. Substantial financial resources were made available through the programme to retrain local government human resources in order to improve coordination between services, respond to requests from local inhabitants, and equip municipalities with technical and human resources. The programme was in operation for six years and its development and outcomes can now be assessed. Starting from an analysis of local authority ‘social balance sheets’ in two key years (2000 and 2005) and from information obtained as part of a process for assessing the impact of the Foral programme (2006), some of the changes brought about in local government due to the effects of the programme are presented and discussed.

Hepatic Ischemia and Reperfusion Injury, a medical condition derived from Hepatic Ischemia and Reperfusion, a clinical phenomenon commonly associated with medical interventions, such as a hepatic resection, is a very complex biological process that is associated with poor hepatic functional recovery, mortality and morbidity in humans. This complex process has numerous variables that can influence the outcome of existing treatments, which can only mitigate partially the damage. A possible treatment option is the administration of natural compounds extracted from plants that display antioxidant and/or anti-inflammatory properties, both of which are hallmarks of Hepatic Ischemia and Reperfusion Injury, such as resveratrol, curcumin, or quercetin. Quercetin not only displays these properties but also has protective effects against Hepatic Ischemia and Reperfusion Injury in rats. However, there are some drawbacks to quercetin’s administration in humans, such as low bioavailability, lack of systematic data about quercetin as a nutraceutical in humans and the existence of side effects and drug interactions as a supplement, all of which can possibly limit quercetin’s use. For that reason, the main goal of this research project is to discover a viable solution to overcome some of quercetin’s administration issues by incorporating quercetin into a liposomal formulation. To develop this quercetin liposomal formulation, it was first determined the optimal quercetin-to-lipid molar ratio to use for the formulation preparation, using a saturation curve of the incorporation of quercetin in the lipid bilayer of the liposomes. Preliminary data from this saturation curve indicated that the optimal quercetin-to-lipid molar ratio to be used was 1:10 (mol/mol). Next, the effect of free quercetin and the optimal quercetin liposomal formulation were compared for their effect against oxidative stress and toxicity caused by rotenone, a Complex I mitochondrial respiratory chain inhibitor, in C6 rat glioma cells. Cell viability was analyzed after 24 and 48 hours of rotenone incubation and oxidative stress after 4 and 16 hours of incubation, using MTT Assays and Flow Cytometry, respectively. Preliminary results indicated that, although neither quercetin form had any protective effect against rotenone-induced toxicity, both quercetin forms reduced similarly rotenone-induced oxidative stress. These preliminary results suggest that, in vitro, quercetin can be a good treatment option for conditions that involve oxidative stress and that this liposomal formulation can be a viable solution for quercetin cell delivery. Ultimately, these results suggest that the developed quercetin liposomal formulation is a possible pharmacological treatment for Hepatic Ischemia and Reperfusion Injury. However, this in vitro cell model does not reflect the entirety of the Hepatic Ischemia and Reperfusion Injury process and the biological clearance mechanisms for liposomal formulation. For that reason, it is required to conduct further studies to evaluate if this quercetin liposomal formulation can be a viable pharmacological treatment for Hepatic Ischemia and Reperfusion Injury.

Since the late 1960s, a different set of technologies has been designed and implemented in parallel to assist in automating industrial and manufacturing processes. These systems, created parallel to IT (Information Technologies), became known as OT (Operational Technologies). Unlike IT technologies, these were developed with a different set of requirements. With a focus on resilience to adverse environmental conditions – such as temperature, humidity, and electromagnetic interference – and a need for high availability and near-real-time performance, these technologies took a back seat to other requirements. Such as information integrity and confidentiality. However, the need to automate processes has developed. Today, it is not only industrial areas – such as heavy manufacturing, oil and gas industries, electrical networks, water distribution processes, or sewage treatment – that need to increase their efficiency. The production areas of a manufacturing company also benefit from these two types of technologies – IT and OT. Furthermore, it is on the shop floor – i.e., in a production area – that the two meet and merge and interconnect the two networks to become a blended system. Often the requirements for the operation of one technology are the weak point of the other. A good example is an increasing need for IT devices to connect to the Internet. On the other hand, OT devices that often have inherent difficulty with authentication and authorization processes are exposed to untrusted networks. In recent years, and aggravated by the socio-political changes in the world, incidents in industrial and production areas have become larger and more frequent. As the impact of incidents in these areas has the potential to be immense, companies and government organizations are increasingly willing to implement measures to defend them. For information security, this is fertile ground for developing new methodologies or experimenting and validating existing ones. This master’s work aims to apply a threat model in the context of a production area, thus obtaining a set of the most relevant threats. With the starting point of these threats, the applicability and value of two security monitoring solutions for production areas will be analyzed. In this dissertation’s first part, and after reviewing state-of-the-art with the result of identifying the most mentioned security measures for industrial and manufacturing areas, a contextualization of what a production area will be performed—followed by an example, based on what was observed in the course of this work. After giving this background, a threat model will be created using a STRIDE methodology for identifying and classifying potential threats and using the DREAD methodology for risk assessment. The presentation of an attack tree will show how the identified threats can be linked to achieving the goal of disrupting a production area. After this, a study will be made on which security measures mentioned initially best mitigate the threats identified. In the final part, the two solutions will be analyzed with the functionalities of detecting connected devices and their vulnerabilities and monitoring and identifying security events using network traffic observed in an actual production area. This observation aims to verify the practical value of these tools in mitigating the threats mentioned above. During this work, a set of lessons learned were identified, which are presented as recommendations in a separate chapter.

A presente dissertação teve como objeto de estudo o Sistema Aquífero Bacia Tejo-Sado/Margem Direita (T1). Este, nunca foi alvo de um estudo pormenorizado, encontrando-se essencialmente descrito no livro “Sistemas Aquíferos de Portugal Continental” e nos “Planos de Gestão da Região Hidrográfica do Tejo”. Neste trabalho procurou-se aprofundar o conhecimento deste sistema aquífero, dando especial ênfase à evolução hidrogeoquímica da massa de água associada ao mesmo. Recorrendo a modelos geoquímicos de balanço de massa e modelos diretos, procurou-se validar hipóteses que permitissem explicar a ocorrência de fácies pouco comuns no ambiente que carateriza o sistema. O Sistema Aquífero Bacia Tejo-Sado/Margem Direita (T1), engloba parte das áreas dos distritos de Lisboa e Santarém, intersetando território de 14 concelhos. Geologicamente, é composto por formações com idades compreendidas entre o Paleogénico e o Quaternário, destacando-se, pela sua predominância, as formações de Alcoentre e de Almoster. Para a obtenção de dados, começou-se por identificar pontos de observação, dentro dos limites do sistema aquífero, e posterior seleção com vista à recolha de amostras de água. O trabalho de campo foi desenvolvido em duas campanhas de campo, tendo sido recolhidas amostras de água em nove pontos, com o objetivo de realizar uma análise de elementos maiores. Os dados obtidos, após a análise destas amostras, foram completados recorrendo a outras bases de dados existentes. A análise dos dados permitiu verificar que as águas apresentam uma grande variabilidade de fácies, predominando as bicarbonatadas cálcicas e/ou magnesianas, com uma forte presença de fácies bicarbonatada sódica. Estes dados químicos foram sujeitos a tratamento estatístico, (análise de cluster hierárquica e análise fatorial utilizando o método de componentes principais). A análise de cluster hierárquica permitiu dividir as amostras em dois grupos, considerando uma determinada distância. Contudo, quando analisadas as amostras de um mesmo grupo, verifica-se que estas não apresentam coerência no que diz respeito as formações captadas, pelo que, não é possível associar cada um dos grupos a uma formação geológica em concreto. A análise fatorial possibilitou a identificação de três grupos de pares de iões que se correlacionam bem entre si, especificamente, o Ca2+/HCO3 - , Mg2+/Cl- e Na+ /Cl- . No decorrer desta análise ainda foi possível determinar que 89% da variância das amostras é explicada por três componentes, a que se associam os elementos Ca2+/HCO3 - , Cl- /Na+ e SO4 2- . Tendo por base o contexto geológico da área em estudo, considerou-se que os processos reativos que melhor explicariam a variabilidade das fácies presentes, seria a dissolução de carbonatos e processo de troca catiónica, mais concretamente, entre o Ca2+ e o Na+ . O software PHREEQC foi usado para modelar um conjunto de amostras tendo com premissa o descrito anteriormente. Os resultados da modelação revelaram-se satisfatórios, pois explicam bem a variabilidade de fácies que ocorrem no sistema aquífero. Contudo, como sempre acontece em exercícios de modelação, é possível existirem outros processos que não foram considerados, nomeadamente a transição entre ambientes marinhos e continentais. A partir da análise dos dados hidroquímicos, não foi possível confirmar a separação do sistema aquífero em dois aquíferos com litologias distintas.

O aumento de bactérias resistentes a antibióticos constitui um problema de saúde pública a nível global. Os microrganismos podem ser naturalmente resistentes ou adquirir resistência, facilitada pela transferência horizontal de genes. O uso generalizado de antimicrobianos, principalmente antibióticos, promove o aumento de bactérias resistentes, diminuindo a eficácia dos agentes no tratamento de infeções. Fatores como a presença de antibióticos na água, geram uma pressão seletiva que promove a aquisição dos genes que conferem resistência a diversos antibióticos. As águas residuais são um dos ambientes propícios à propagação de bactérias resistentes a antibióticos pelo meio ambiente. Deste modo, o desenvolvimento de sistemas de desinfeção eficientes, principalmente no tratamento de águas, é fundamental para controlar os riscos para a saúde que os microrganismos podem trazer. Ao mesmo tempo, a falta de acesso a água potável para consumo humano é também um problema mundial. Em diversos países em desenvolvimento ainda não existem sistemas de tratamento de águas, e por isso existe um grande consumo de água contaminada, que é um fator de risco para doenças infeciosas, como cólera e diarreia. Estes ambientes, além da propagação de doenças infeciosas, são propícios ao aparecimento de bactérias resistentes a antibióticos, que também contribuem para a propagação das mesmas doenças dificultando o seu tratamento. É por isso importante desenvolver sistemas capazes de reter e inativar microrganismos patogénicos, incluindo bactérias resistentes a antibióticos, e outros contaminantes, como pesticidas e metais pesados presentes na água, contribuindo assim para um consumo seguro. Neste trabalho, um tratamento com díodos emissores de luz ultravioleta foi testado na inativação de isolados de Escherichia coli resistentes a antibióticos provenientes de três matrizes de água reais: água do mar, água do rio e água residual tratada. As três matrizes de água foram analisadas em termos de coliformes totais, Escherichia coli e enterococcus. Os resultados demonstraram que a água residual tratada tem os valores mais altos para estes três parâmetros, revelando ter a maior diversidade microbiana. A análise em termos de microrganismos totais revelou também que, mais uma vez, a água residual tratada apresenta valores muito superiores aos obtidos para a água do mar e água do rio. Foi ainda realizada uma análise em termos de bactérias resistentes a seis antibióticos, representativos no total de seis classes. Um dos antibióticos testado foi o imipenemo, que normalmente é utilizado em ambiente hospitalar e em último recurso. A contagem de isolados resistentes estimada para este antibiótico revelou ser superior ao esperado, o que poderá dever-se à instabilidade do imipenemo. Dos isolados resistentes a cada um dos seis antibióticos, foram escolhidos 10 que foram previamente identificados como E. coli. Estes 10 isolados, cinco multirresistentes, foram posteriormente submetidos a um tratamento de inativação. Assim, díodos emissores de luz com comprimentos de onda de 255 nm e 265 nm foram escolhidos, pois 255 nm é próximo do comprimento de onda de emissão das lâmpadas de mercúrio (254 nm), e 265 nm é o comprimento de onda de absorção do DNA, podendo, por isso, provocar mais danos no DNA bacteriano. Estes dois comprimentos de onda foram utilizados quer para o tratamento por fotólise direta, quer para o tratamento utilizando reatores híbridos que combinam fotólise e filtração com díodos emissores de luz ultravioleta e membranas de carbeto de silício, respetivamente. Este tipo de membranas já foram testadas e comprovaram ser eficazes na retenção e inativação de microrganismos com a ajuda de díodos emissores de luz ultravioleta. Aplicando apenas o tratamento com díodos emissores de luz ultravioleta que emitem nos 255 nm foi possível obter uma redução logarítmica superior a 4. O tratamento com os díodos emissores de luz ultravioleta que emitem no comprimento de onda dos 265 nm permitiu uma taxa de desinfeção mais elevada, cerca de 7 log, aplicando uma dose de ultravioleta de 4 mJ/cm2 . Estes valores correspondem a um tempo de exposição à radiação de 5 min. Comparativamente, utilizando díodos emissores de luz ultravioleta que emitem no comprimento de onda dos 255 nm, com o mesmo tempo de exposição de 5 min, o valor mais alto foi de 5 log correspondente a uma dose de ultravioleta de 2 mJ/cm2 . A suspensão bacteriana foi ainda exposta à mesma dose de ultravioleta de 2 mJ/cm2 para ambos os comprimentos de onda. Esta dose corresponde a 5 min de exposição ao comprimento de onda de 255 nm e 2,5 min de exposição a 265 nm. Estas amostras foram analisadas em termos de dímeros de ciclobutano de pirimidina. Os dímeros de pirimidina revelam o dano causado pela radiação ultravioleta no DNA bacteriano. Os resultados demonstraram que efetivamente a radiação aplicada causou danos no DNA das bactérias, incluindo as multirresistentes, sendo provável obter uma maior concentração de dímeros com maiores tempos de exposição. Uma amostra de água residual tratada foi também submetida a este tratamento com díodos emissores de luz, e os valores de desinfeção foram ligeiramente mais baixos uma vez que se trata de uma matriz real e por isso contém mais matéria orgânica que pode interferir com a penetração da radiação. Após submeter a suspensão bacteriana a um sistema de filtração utilizando membranas de carbeto de silício em combinação com díodos emissores de luz ultravioleta, uma rejeição superior a 99,845% foi atingida, revelando a capacidade das membranas para reter E. coli. Apenas a filtração, sem a aplicação de radiação ultravioleta, reteve 75,655% dos microrganismos. O sistema de díodos emissores de luz revelou-se também eficiente não só na capacidade de obter um permeado limpo, como também no tratamento do retentado. A aplicação do sistema de díodos emissores de luz permitiu assim efetuar filtração de uma amostra contaminada com E. coli e, ao mesmo tempo inativar as bactérias presentes na amostra que não é filtrada, com um tratamento superior a 99,985%. Bactérias bioluminescentes foram também testadas neste trabalho, utilizando a bioluminescência como um método alternativo para inativar bactérias resistentes a antibióticos. A bioluminescência pode ser observada em diversos organismos, mas os mais comuns são as bactérias bioluminescentes que atuam muitas vezes em relações de simbiose com outros organismos vivos, como o peixe-lanterna. As bactérias bioluminescentes já são exploradas em áreas da biotecnologia e recentemente têm vindo a ser estudadas no desenvolvimento de sistemas de iluminação independentes de energia. Neste trabalho, foi utilizada uma estirpe de E. coli geneticamente modificada. A bactéria foi previamente transformada com um vetor de expressão com vários elementos: gene de resistência à kanamicina como marcador, e o promotor do operão lac para controlar a expressão dos genes do operão lux. O operão lux proveio de Photobacterium leiognathi subsp. mandapamensis 27561. Adicionalmente tinha ainda um gene extra, luxF, que permite obter uma maior intensidade da bioluminescência. Assim, uma suspensão de bactérias bioluminescentes em conjunto com membranas fotocatalíticas modificadas com ureia foi utilizada para verificar se a bioluminescência é capaz de ativar as superfíciesfotocatalíticas e assim levar à inativação de bactérias resistentes a antibióticos. Os resultados mostraram que a bioluminescência, a uma intensidade de 10 u.a., não foi suficiente para induzir a inativação de bactérias resistentes a antibióticos. No entanto, este método deve ser novamente testado uma vez que pode ter um futuro promissor na criação de sistemas de tratamento de água independentes de energia. Díodos emissores de luz ultravioleta continuam a revelar ser altamente eficientes na inativação bacteriana, e devem continuar a ser estudados de forma a alcançar a inativação de genes de resistência a antibióticos.

As zonas húmidas estão entre os habitats mais produtivos do planeta e são habitats essenciais para aves aquáticas. No entanto, as zonas húmidas naturais têm diminuído globalmente por via de ação humana, contrastando com o aumento de zonas húmidas artificiais, como os arrozais. Estes tornam-se um habitat alternativo para aves aquáticas onde as populações de Íbispreta (Plegadis falcinellus) e Cegonha-branca (Ciconia ciconia) têm aumentado significativamente, em particular na Península Ibérica. Este trabalho foi realizado nos arrozais da Lezíria Grande de Vila Franca de Xira com o objetivo de (1) caracterizar a abundância de Íbispreta e Cegonha-branca ao longo do ciclo do arroz, (2) descrever a sua dieta, (3) avaliar a disponibilidade de alimento para estas espécies e (4) avaliar a sua seleção de habitat. Foi ainda (5) estimada a perda económica associada a danos nos arrozais e (6) avaliada a eficácia dos espantamentos de aves promovidos pelos produtores de arroz. A abundância de Íbis-preta foi máxima em dezembro, no início da época do lavradio e a de Cegonha-branca em setembro, imediatamente antes da colheita. O Lagostim-vermelho-do-Louisiana foi a principal presa consumida por Íbis-preta e Cegonha-branca. Na época da colheita, a Íbis-preta mostrou preferência por campos colhidos e posteriormente, antes da sementeira, por campos lavrados. Já a Cegonha-branca não apresentou preferência por um habitat em particular ao longo ciclo do arroz. Os danos registados nos arrozais correspondem a perdas de 1% na produção (ca.100000€ de prejuízo). A eficácia dos espantamentos de aves promovidos pelos orizicultores foi afetada principalmente pela distância das aves ao espantador. Os resultados reiteram a importância dos arrozais como habitat alternativo para diversas espécies de aves aquáticas, nomeadamente para a Íbis-preta e para a Cegonha-branca, especialmente no contexto global, onde a perda de zonas húmidas naturais é um motivo de preocupação do ponto de vista da conservação.

O software do ARTSOFT é um ERP (enterprise resource planning), em português planeamento dos recursos empresariais, um programa que ajuda empresas a gerir as suas atividades relacionadas com: contabilidade; recursos humanos; projetos; produção; entre outras. Neste software, esteve-se encarregue de testar os módulos, secções do programa: workflows; produção e assistências técnicas. Um workflow é uma máquina de estados que armazena o estado de um objeto em um determinado momento e pode mudá-lo através de ações baseadas no input que recebe. No ARTSOFT, os workflows são usados para gerir fluxos de trabalho de uma empresa com o objetivo de automatizar os processos desta e aumentar a eficiência de trabalho. O módulo de produção gere a estruturação dos processos de produção de materiais, que consiste no planeamento, organização e controlo dos stocks dos diversos materiais tal como a coordenação dos pedidos dos clientes dos produtos finais. Desta forma, uma empresa pode controlar efetivamente quanto stock é que precisam de um determinado material e quando o precisam de começar a produzir para conseguirem entregar ao cliente o produto. O módulo também permite definir tarefas para cada trabalhador, definindo o seu papel na produção de uma ordem, e registar quaisquer custos relacionados com a produção dos materiais. As assistências técnicas, referem-se a serviços pós-venda, como reparações; substituições; revisões; entre outros. Assim, no ARTSOFT, foi elaborado este módulo para ajudar na gestão dos equipamentos sobre os quais os serviços vão ser realizados os serviços; na gestão das informações dos clientes associados aos equipamentos; na gestão do estado em que o serviço está e os custos que vão sendo acumulados devido ao serviço. Quality Assurance é um processo que garante aos clientes um software com o nível de qualidade pretendido, ou seja, tem os requisitos pedidos pelos clientes e os mesmos não tenham quaisquer erros e tenham um funcionamento correto. Assim, o trabalho de um tester é desenvolver os testes necessários, automáticos ou manuais e Black-Box ou White-box, conforme o que seja melhor para o software em questão. De forma a poder escolher qual a melhor forma de testar um programa ou uma certa funcionalidade é preciso saber quais as vantagens e desvantagens entre os testes manuais e os testes automáticos. Contudo, é normal ser usado uma combinação entre os dois tipos de teste. Em black-box é possível encontrar bugs que os programadores nem sequer tinham pensado em testar, como o programa está a ser testado como um utilizador o utilizaria. Também é possível encontrar erros enquanto o software está em desenvolvimento, ajudando a poupar tempo aos programadores, visto que podem continuar o desenvolvimento com os erros identificados em mente. Contudo, muitas das vezes pode-se acabar por gastar mais tempo do que o suposto pois esteve-se a testar um comportamento que não era um requisito da aplicação. Para evitar esta situação, convém a equipa de programadores e testers estarem continuamente a partilhar conhecimento entre si. Para se poder testar a qualidade dos módulosforam elaborados ficheiros de scripts, código de linguagem C que contêm o automatismo para testar todas as funcionalidades existentes nos módulos. Os testes automáticos são uma forma de teste em que são usadas ferramentas para executar os casos de teste, sem ser preciso interferência humana. Com estas ferramentas podemos abordar diversos inputs permitidos, e não permitidos, pelo programa a testar e validar o resultado obtido com o esperado. Logo, permitem a testagem de casos de teste repetitivos e com ligação a vários serviços, que, caso contrário, levariam bastante mais tempo a testar. Para além destes testes automáticos, realizou-se testes manuais de black-box sempre que era feita uma correção de um bug reportado pelos parceiros/clientes. Ao longo do projeto, foram atribuídos eventos diariamente para proceder à testagem das alterações feitas. A testagem foi elaborada através de testes manuais, onde é necessário ter conhecimentos profundos sobre a funcionalidade sobre a qual se está a testar. Desta forma, se quando começa a analisar um evento, para além de se analisar o contexto do mesmo, é necessário ir à documentação do programa para estudar qual o comportamento esperado do software tal como que outras funcionalidades podem ter sido afetadas com as alterações efetuadas. À medida que se vai analisando a documentação, num ficheiro à parte, anota-se os casos de teste a realizar. Após ter os casos de teste descritos, é preciso ter o ambiente de teste preparado para os executar. Isto envolve preparar uma base de dados, com as configurações e os critérios que são indicados no evento. Neste projeto, os meus ambientes de testes consistiram em cópias das bases de dados dos clientes, para ter a certeza de que estou a simular os passos que os futuros utilizadores iram seguir. Com os casos de teste e o ambiente de teste preparados, executam-se os testes. No caso de eventos, os testes elaborados foram do tipo black-box, que, como descrito na Subsecção 2.2.1, são testes realizados do ponto de vista do cliente sem o tester ter acesso à parte interna do software. No fim da testagem, registam-se os resultados obtidos e comparam-se com os esperados para verificar que o programa está a funcionar corretamente. Quando dos testes se obtêm resultados corretos é dado como concluído a tarefa de testagem e transferese o evento para que as alterações possam ser disponibilizadas aos clientes nas próximas versões do programa. Por outro lado, se os resultados esperados forem diferentes dos obtidos é preciso rever a suposta correção ou alteração feita ao código. Para isso o evento é transferido para o programador que realizou as modificações para que possam verificar a situação e corrigir. Como o ARTSOFT é um software em que os vários módulos estão interligados entre si com bastantes configurações, antes de se poder realizar testes, teve-se de ter uma formação sobre as funcionalidades do programa. O mesmo ocorreu antes de começar a elaborar ficheiros de scripts. Houve uma formação sobre o software de testes que é usado pela empresa, TestComplete. O TestComplete é um programa de testes automatizados de UI (user interface), em português interface do utilizador, desenvolvido pela Smartbear. Neste software foram desenvolvidos os scripts e corrigidos sobre todas as versões do programa ARTSOFT que estivessem para sair, verificando se ocorria algum erro na sua execução. Com o desenvolvimento de técnicas de testagem de software, várias ferramentas capazes de testar diferentes tipos de programas foram realizadas com o objetivo de ajudar os testers de software na automatização do seu trabalho. No entanto, com várias ferramentas veem múltiplas escolhas de qual utilizar e quando. Assim, nos últimos anos, foram realizados estudos que comparam ferramentas de automatização de testes disponíveis no mercado a escolha de qual usar seja eficaz, mais rápida e certa. Nas próximas Subsecções são descritas três das mais populares ferramentas de executar testes automáticos disponíveis, as suas caraterísticas e, no final, qual a melhor a ser usada no meu projeto e porquê. O principal objetivo deste projeto, é que todas as versões que sejam entregues aos parceiros e clientes da empresa ARTSOFT não tenham nenhuns bugs, erros no programa, principalmente os módulos a que este projeto se dedica. De modo, a que a qualidade do software seja melhorada tal como a impressão dos utilizadores sobre a empresa e o programa. De onde vem a pergunta de pesquisa deste projeto: Os testes e scripts aumentam a qualidade do código?

Uma proporção de pacientes com doenças de neuro desenvolvimento, tem uma mutação genética diretamente ligada à sua doença. A Perturbação do Espectro do Autismo (PEA) é uma patologia de neuro desenvolvimento com apresentação clínica muito heterogênea (Cummings et al., 2005). PEA é caracterizada por ter padrões de ações ou interesses repetitivos, dificuldades/limitações em interações sociais e comunicação que se manifestam desde a infância. Estes sintomas afetam mais homens que mulheres e podem variar em severidade. Talvez o maior avanço em perceber a fisiopatologia do PEA é ter sido reconhecido a contribuição genética para a etiologia do PEA com a ajuda do aparecimento de métodos NGS e WES (Daniel H. Geschwind, 2011; Asif et al., 2018). Há vários genes e mutações associados com o PEA o que aponta a uma origem heterogenia da doença. A combinação de uma arquitetura genética complexa e pouco compreendida, heterogeneidade fenotípica e o envolvimento de múltiplos loci que interagem entre si dificulta a descoberta dos genes com mutações específicas que levam ao PEA. Consequentemente, a etiologia genética dos distúrbios relacionados ao PEA permanece em grande parte desconhecida (Gupta et al., 2006). Vários estudos demonstraram que duplicações ou deleções de segmentos do genoma denominados de Variantes de Número de Cópias (CNVs), polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e variantes de nucleotídeo único (SNVs) provavelmente têm um papel causal na PEA (Chang et al., 2014; Soler et al., 2018). O estabelecimento da relação entre os diferentes genes com as variantes do fenótipo do PEA pode facilitar o diagnóstico dos pacientes e, assim, possibilitar que os pacientes obtenham o tratamento mais eficiente e específico numa idade mais jovem. Devido aos recentes avanços nas tecnologias genómicas, os estudos genéticos em larga escala estão a revelar um grande número de variantes genéticas que potencialmente contribuem para o risco de doenças. O objetivo global deste trabalho foi propor um pipeline para identificar a manifestação fenotípica de variantes genéticas putativas causadoras de doenças. Para isso, foram estabelecidos dois objetivos específicos: • Identificação de clusters de genes funcionalmente semelhantes; • Inferir o fenótipo da doença para cada cluster separadamente. Para alcançar estes objetivos, neste estudo foi usado um dataset que contem 3707 genes de pacientes diagnosticados com PEA. A este dataset são aplicadas ferramenta como o DishIn e GoSemSim para calcular o valor da semelhança semântica em pares de genes, obtendo no fim uma matriz quadrada de semelhança semântica. Este valor é obtido pelas ferramentas ao quantificar a informação partilhada entre dois termos GO, associados a cada gene, como o conteúdo de informação do ancestral comum mais informativo de dois termos. As medidas para calcular a semelhança semântica do conteúdo de informação usadas neste trabalho são Lin, Jiang & Conrath e Rel. Através da matriz de semelhança semântica é calculada a matriz de distâncias à qual são aplicados os algoritmos de clustering DBSCAN, Kmeans e hierárquico, de modo a obter grupos de genes que sejam funcionalmente semelhantes. Após a análise dos resultados, foi possível concluir que variantes genéticas podem ser agrupados usando cálculos de semelhança semântica. Demonstrou-se que os genes que foram agrupados são funcionalmente semelhantes, estavam inseridos em redes de interação genética e podem levar a diferentes grupos de fenótipos de PEA. Os genes agrupados foram enriquecidos para diferentes pathways e sub fenótipos relacionados ao PEA.

Neste projeto foi estudada e desenvolvida uma solução para a anonimização automática de dados estruturados, que e um requisito legal para a partilha de dados com informação sensível sobre indivíduos. A solução e capaz de detetar um conjunto abrangente de campos de uma base de dados que contem dados que podem ser associados a algum indivíduo e anonimiza-los. A falta de ferramentas de anonimização que possam tornar todo este processo mais rápido e ainda um problema para muitas entidades que o fazem manualmente, sendo este um processo que poderá ser bastante moroso ou até inviável. Para tentar resolver este problema, foi desenvolvida uma framework, que e descrita ao longo desta tese, baseando-se numa base de dados existente com dados fictícios e avaliada numa nova base de dados não conhecida. Esta solução sugere que campos da base de dados devem ser anonimizados, tendo o utilizador que validar a sugestão e escolher o processo de anonimização a aplicar, sendo que diferentes métodos têm diferente complexidade e impacto na utilidade dos dados anonimizados. Em síntese, esta solução irá permitir uma maior privacidade dos dados pessoais de indivíduos e um processo mais rápido e automático para a tarefa de anonimização de dados estruturados.

A Fonética Experimental é uma disciplina que foi inicialmente estudada por cientistas, até que a sua relevância linguística despertou o interesse dos académicos das Faculdades de Letras. Laboratórios de Fonética Experimental começaram a sediar-se nestas faculdades, sem, no entanto, perderem os seus hábitos experimentais, uma hibridação que complexificou a sua categorização. Desta forma, esta tese propõe-se analisar a cientificidade da Fonética Experimental, primeiramente através do caso de estudo do Primeiro Laboratório de Fonética Experimental Português; e posteriormente, estudando a atualidade da disciplina. Esta análise será feita à luz das teorias filosóficas mais tradicionais sobre a questão da natureza da ciência – Positivismo Lógico; falsificacionismo de Karl Popper; e a Teoria de Thomas Kuhn.

Os espaços públicos sempre desempenharam um papel importante, contribuindo para a transformação das cidades ao longo do tempo. Tendo em consideração a premência dos espaços públicos para a população, revela-se como necessário que os poderes públicos criem novos espaços públicos ou requalifiquem os já existentes, de modo a satisfazer as necessidades da população. Estas intervenções devem considerar não apenas a dimensão física e material, mas também outras dimensões, como a social, a ambiental, assim como a própria identidade cultural dos espaços públicos intervencionados, de forma a promover a sua utilização por parte da população. Este trabalho tem como objetivo estudar os impactos de projetos de requalificação do espaço público. No decorrer de um estágio realizado na Câmara Municipal de Lisboa, analisamos o programa ‘Uma Praça em cada Bairro’, desenvolvido por esta instituição. Após atualizarmos uma matriz de avaliação desta instituição, usamos os projetos desenvolvidos na Rua Actriz Palmira Bastos e na Alameda Manuel Ricardo Espírito Santo, como casos de estudo. Tendo em consideração a pesquisa realizada, é possível concluir que as intervenções de requalificação urbana realizadas aos espaços públicos selecionados alcançaram parte dos objetivos inicialmente definidos. Também é possível concluir que a atualização da matriz de avaliação revelou-se como acertada, pela sua abrangência, por incluir mais dimensões de análise do que a matriz inicial. Pela sua abrangência, esta matriz atualizada pode ser mobilizada na avaliação de futuros projetos de requalificação urbana com incidência no espaço público.

This paper presents findings from two case studies carried out in two Portuguese universities in order to analyse and understand the implications of two participatory methods of teaching and learning: portfolio and project led-education. Case 1 involved the use of portfolio as a strategy for enhancing students’ self-regulated learning. Case 2 was a project-led course (one-year project) during which students were asked to design and develop a training course for a real/professional context for a real group of professionals in a given institution. Active and cyclical model of self-regulation learning occurs according to three phases: forethought, performance (volitional) control, and selfreflection; development of competencies (disciplinary and non-disciplinary); team work; and articulation university/professional context are some of the key features of these methods. Findings suggest a better understanding of teaching and learning dimensions at higher education, namely in regard to processes and outcomes of learning, skills development, and changes both conceptual and attitudinal. In the paper, students’ perceptions about participatory methods are discussed, as well as the factors that contribute to students’ active engagement and ways of promoting the effective use of these kinds methods. Overall, a number of dimensions were identified: i) the transition from a single towards a plural perspective; ii) the transition from a teaching-centred approach towards a learning-centred one; iii) the transition from discourse to action; iv) the transition from a an outcome approach to assessment towards a continuous and formative one; v) the transition from a disciplinary approach towards a cross-disciplinary one.

O uso indevido de antibióticos acelera a aquisição e disseminação de genes de resistência a antibióticos (ARGs) na comunidade microbiana afetando a Saúde Humana, Animal e Ambiental. A crescente deteção de ARGs, fora de ambientes hospitalares, como em recursos hídricos e solos, e em microrganismos não patogénicos, tem vindo a alertar para o contributo do ambiente na disseminação de resistência a antibióticos, pelo que este problema é hoje em dia enquadrado através da abordagem “Uma Só Saúde”. As cianobactérias encontram-se amplamente distribuídas no meio aquático, onde estão expostas a vários fatores ambientais que podem contribuir para esta disseminação. Contudo, o seu papel no resistoma hídrico ainda se encontra por esclarecer. Desta forma, este projeto teve como objetivo a clarificação do papel das cianobactérias na resistência aos antibióticos, procedendo-se à caracterização da comunidade microbiana presente em 35 amostras de água, provenientes de albufeiras portuguesas, bem como à pesquisa de genes de resistência e elementos genéticos móveis nessas amostras. A identificação da comunidade microbiana foi efetuada através de uma abordagem metagenómica, através da sequenciação da região V3-V4 do 16S rDNA, por sequenciação de nova geração (NGS, MiSeq). Para a pesquisa de genes de resistência e elementos genéticos móveis, nas albufeiras em estudo, recorreu-se a duas abordagens complementares: screening por PCR de genes que conferem resistência a diferentes classes de antibióticos, e, sequenciação total do genoma (WGS, Albufeira A1, Lb80) através da plataforma MinION. A comunidade microbiana presente nas albufeiras estudadas encontra-se maioritariamente distribuída pelas classes: Gammaproteobacteria, Bacteroidia, Cyanobacteria, Verrucomicrobiae e Actinobacteria, às quais pertencem bactérias Gram-negativas, que normalmente apresentam maior resistência a antibióticos. Foram detetados 6 géneros de bactérias com potencial impacto na Saúde Humana e Animal, destacando-se Aeromonas, Rhodococcus, Mycobacterium, Pseudomonas, Legionella e Moraxella, das quais a Pseudomonas é a mais alarmante pois está incluída no grupo ESKAPE. Em relação às cianobactérias encontradas, estas pertencem principalmente aos géneros Microcystis, Pseudanabaena, Planktothrix e Cyanobium. Estes géneros de cianobactérias poderão ter impacto na Saúde Pública, uma vez que incluem espécies produtoras de toxinas. Por outro lado, algumas estirpes de Microcystis spp. e Planktothrix spp., foram previamente associadas (Dias et al., 2015 e 2019) a fenótipo de suscetibilidade reduzida a antibióticos. Neste trabalho não foram detetados genes de resistência a antibióticos nas albufeiras, através do screening realizado por PCR convencional. Através de WGS foram encontrados putativos genes de resistência gyrA, gyrB, CRP, adeL, fabI, OleC, ugd, dfrA21, tetA(48), tetB(48), tcr3, tetM, tetB(P), sul4, rpoB, rpoB2 e EF-TU numa das albufeiras (A1, Lb80). Não foram encontrados fagos nem integrões, mas a foram identificados putativos genes de resistência a metais pesados, designadamente os genes CznC e BepG, determinantes associados a resistência a antibióticos. Os resultados permitem concluir que as albufeiras monitorizadas não apresentam um cenário preocupante do ponto de vista da resistência a antibióticos, o que pressupõe a baixa contaminação com microrganismos resistentes. Contudo, é importante manter este tipo de monitorização das águas doces superficiais, pois mesmo não tendo sido encontrados genes de resistência, os putativos genes detetados devem servir para alertar para futuras resistências. Assim, a estratégia experimental adotada neste trabalho, permitiu destacar a mais-valia do uso de sequenciação de nova geração para monitorização de recursos hídricos, sugerindo-se a implementação desta metodologia em análises de rotina bem como para gestão de risco de ocorrência de microrganismos patogénicos, tóxicos e potencialmente associados à problemática da resistência a antibióticos.

Atualmente, a identidade de género não dita claramente o tipo de tarefas que homens e mulheres desempenham, especialmente as relacionadas com a casa/o lar. Esta é uma realidade que se nota cada vez mais no espaço urbano, não obstante, no espaço rural também se têm vindo a alterar os papéis sociais de género. Em contexto rural, e apesar de já não ser caracterizado apenas pela predominância das atividades agrícolas e pela ruralidade, ainda mantêm algumas das características que antes o definiam, como alguns hábitos conservadores associados à dominação masculina sobre as mulheres, evidenciando desigualdade de condições de vida. Porém, ao longo dos anos e especialmente as mulheres residentes em espaço rural, após terem adquirido independência financeira, porque entraram para o mundo do trabalho remunerado, têm alterado os seus hábitos e preferências que, em muitos casos, não estão diretamente relacionadas com os afazeres da casa, como acontecia no passado. Com efeito, nas sociedades ocidentais, as mulheres têm-se tornado cada vez mais esclarecidas quanto aos seus direitos e com objetivos de vida mais bem definidos relativamente ao trabalho remunerado. Contudo, muitas destas mulheres, especialmente aquelas casadas e/ou com filhos, para além de um cargo profissional remunerado, ainda realizam a maioria das tarefas domésticas e de cuidado, que lhes exigem, para além das horas de trabalho não remunerado, dispensar mais do seu tempo com estas tarefas. Simultaneamente, também exigem uma distribuição mais justa de tarefas entre os membros do agregado familiar, em particular dos cônjuges, bem como, outros aspetos da vida quotidiana dos casais começam a ganhar um destaque, como por exemplo, a gestão das carreiras profissionais, a emancipação financeira e a participação na esfera pública. Apesar da evolução verificada no espaço rural, no que diz respeito à distribuição do trabalho doméstico e de cuidado, ainda existe uma parte da população, especialmente em agregados familiares de uma faixa etária mais velha e com um nível de escolaridade baixo ou nulo, que consideram as tarefas domésticas e de cuidado exclusivas das mulheres e, entendem os homens como os provedores da casa, reproduzindo os tradicionais papéis de género, algo que vai ser confirmado através desta investigação, realizada numa aldeia localizada no concelho de Alenquer, com recurso ao método de entrevistas semiestruturadas feitas aos agregados familiares residentes.

No início do ano de 2020 o mundo parou para assistir às notícias que davam conta do aparecimento de um novo vírus, que mais tarde assumiria o nome de Covid-19. O aparecimento inesperado e o rápido desenvolvimento até ao nível de pandemia, fizeram com que este vírus colocasse à prova todos os países do mundo. O desconhecimento das causas e consequências que dele poderiam advir, tornou esta luta numa luta diária e por vezes pouco coerente, do ponto de vista da população, levando os países a adotar os mais diversos tipos de medidas. Este trabalho servirá acima de tudo para analisar algumas das medidas tomadas em Portugal e discutir possíveis alterações significativas que poderiam ter sido benéficas para o país. Em primeiro lugar, será feita uma comparação entre dois países que adotaram medidas muito distintas desde o início da pandemia: Portugal e Suécia. Esta comparação será feita por meio da análise de gráficos realizados com o auxílio dos valores de mortalidade e número de casos diários em ambos os países. Com esses gráficos e informações sobre as medidas aplicadas, será feita uma reflexão sobre as diferentes formas utilizadas no combate à pandemia. Serão também realizados testes estatísticos para reforçar algumas das afirmações que serão feitas neste trabalho. Posteriormente, será dada maior atenção aos dados relativos a Portugal, nomeadamente dados hospitalares: internamentos, acesso a urgências, número de cirurgias realizadas, etc. Para além da análise dos internamentos por Covid-19 e consequente gestão de camas que foi aplicada, também será feita uma breve comparação entre os valores dos anos de 2020 e 2021, e os valores para anos anteriores à pandemia, para entender o impacto dos mesmos em episódios hospitalares, não apenas relacionados com a Covid-19. Também serão discutidos alguns tópicos, como o uso de máscaras de proteção individual, a importância da vitamina D, o impacto nas audiências televisivas e como as várias gerações foram afetadas pela passagem deste vírus. Este último ponto será discutido com o auxílio de um questionário realizado online e entregue em duas escolas do concelho de Lisboa. O objetivo nunca será refutar qualquer decisão tomada, mas sim questionar e discutir o que poderia ter sido realizado de outra forma.

It has been long recognized that the poor distinction between /l/ and /ɾ/ is one of the most perceptible characteristics in Chinese-accented Portuguese. Recent empirical research revealed that this notorious L2 speech learning difficulty goes beyond the confusion between two L2 categories, as L1-Mandarin learners’ acquisition of Portuguese /l/ and /ɾ/ seems to be subject to the interaction among different prosodic positions, speech modalities and representational levels. This thesis aims to deepen our current understanding of this L2 speech learning process, by exploring what constrains the development of L2 phonological categories across syllable positions and how different modalities interact during this process. To achieve this goal, both experimental tasks and theoretical modelling were employed. The first study of this thesis explores the role of cross-linguistic influence and orthography on L2 category formation. In order to elicit cross-linguistic influence directly, a delayed-imitation task was performed with L1-Mandarin naïve listeners. This task examined how the Mandarin phonology parses the Portuguese input ([l], [ɾ]) in intervocalic onset and in word-internal coda position. Moreover, whether orthography plays a role during the construction of L2 phonological representation was tested by manipulating the input types that were given in the experiment (auditory input alone vs. auditory + written input). Our study shows that naïve Mandarin listeners’ responses corroborated with that of L1-Mandarin learners, suggesting that cross-linguistic influence is responsible for the observed L2 prosodic effects. Moreover, the Mandarin [ɻ] (a repair strategy for /ɾ/) occurred almost exclusively when the written form was given, providing evidence for the cross-linguistic interaction between phonological categorization and orthography during the construction of L2 categories. In the second study, we first investigate the interaction between speech perception and production in L2 speech learning, by examining whether the L2 deviant productions stem from misperception and whether the order of acquisition in L2 speech perception mirrors that in production. Secondly, we test whether L2 phonological categories remain malleable at a mid-late stage of L2 speech learning. Two perceptual experiments were performed to test L1-Mandarin learners on their discrimination ability between the target Portuguese form and the deviant form employed in L2 production. Expanding on prior research, in this study, the perceptual motivation for L2 speech difficulties was assessed in different syllable constituents (onset and coda) and at both segmental and suprasegmental levels (structural modification). The results demonstrate that some deviant forms observed in L2 production indeed have a perceptual motivation ([w] for the velarised lateral; [l] and [ɾə] for the tap), while some others cannot be attributed to misperception (deletion of syllable-final tap). Furthermore, learners confused the intervocalic /l/ and /ɾ/ bidirectionally in perception, while in production they never misproduced the lateral (/ɾ/ → [l], */l/ → [ɾ]), revealing a mismatch between two speech modalities. By contrast, the order of acquisition (/ɾ/coda > /ɾ/onset) was shown to be consistent in L2 perception and production. The correspondence and discrepancy between the two speech modalities signal a complex relationship between L2 speech perception and production. To assess the plasticity of L2 categories /l/ and /ɾ/, two groups of L1-Mandarin learners who differ substantially in terms of L2 experience were recruited in the perceptual tasks. Our study shows that both groups behaved similarly in terms of the discrimination performance. No evidence for a role of L2 experience was found. The implication of this null result on L2 phonological development is discussed. The third study of the thesis aims to contribute to bridging the gap between the L2 experimental evidence and formal theories. Adopting the Bidirectional Phonology and Phonetics Model, we formalise some of the experimental findings that cannot be elucidated by current L2 speech theories, namely, the between and within-subject variation in L2 phonological categorization; the interaction between phonological categorization and orthography during L2 category construction; and the asymmetry between L2 perception and production. Overall, this thesis sheds light on the complex nature of L2 phonological acquisition and provides a formal account of how different modalities interact in shaping L2 speech learning. Moreover, it puts forward testable predictions for future research and suggestions for improving foreign language teaching/training methodologies.