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O Staphylococcus aureus meticilino-resistente (MRSA) é uma bactéria Gram-positiva, com tropismo para a maior parte dos tecidos biológicos, sendo um agente frequente de infeções da pele e tecidos moles, infeções respiratórias, do aparelho músculoesquelético e endocardites. Ainda que raramente, este microorganismo consegue infetar o sistema nervoso central (SNC) de forma direta, através de procedimentos cirúrgicos, traumatismos, disseminação contígua e, embora pouco frequente, pela via hematogénea, num contexto de bacteriemia, causando infeções de extrema gravidade, como a meningite, encefalite ou o abcesso cerebral. Atualmente, as normas de orientação clínica referem que o antibiótico de eleição para as infeções do SNC, causadas pelo MRSA, é a vancomicina. No entanto, pelas propriedades farmacológicas deste fármaco, poderão existir outros fármacos com atividade anti-MRSA que se revelem como alternativas viáveis. Assim, este trabalho tem como finalidade, com base nas caraterísticas farmacológicas, e na melhor evidência disponível e atual, perceber se existem outras alternativas ao tratamento de infeções causadas por MRSA no SNC.

INTRODUÇÃO: A Disforia de género é uma condição que, apesar de ter baixa incidência, cerca de 0.6% na população estadunidense, causa grande sofrimento psíquico, com impacto negativo na qualidade de vida destas pessoas. Frequentemente, verifica-se dificuldade no acesso aos cuidados médicos para a abordagem desta condição associado ao reduzido contacto da maior parte dos médicos com a mesma. OBJETIVO: Organizar a informação recente, disponível na literatura, acerca do tratamento endocrinológico da Disforia de Género, os efeitos esperados e os potenciais riscos médicos da terapêutica endocrinológica. Analisar retrospetivamente os dados de uma amostra de 18 pacientes, seguidos em consulta de andrologia por Disforia de Género, em Portugal. MÉTODOS: A revisão da literatura foi realizada recorrendo às plataformas online da “PubMed” e “ResearchGate”, onde foram pesquisados os artigos relacionados com o tratamento endocrinológico da Disforia de Género e os seus efeitos. Foram selecionados artigos científicos, revisões sistemáticas e narrativas, e dissertações de mestrado publicados entre 2000 e 2021, em língua inglesa e portuguesa. Os termos pesquisados foram “Transgender”, “Gender Disforia”, “Endocrinology” e “Hormonal treatment”. A análise retrospetiva dos 18 pacientes, foi feita através dos registos clínicos das consultas de andrologia. RESULTADOS: Dos 18 pacientes, 17 tinham diagnostico inequívoco de Disforia de Género. Havendo 8 homens e 9 mulheres transexuais. Todos confirmaram o início das manifestações na infância, embora o diagnóstico clínico tenha sido sempre depois da puberdade. Apenas 1 ainda não tinha iniciado terapêutica hormonal e 4 tinham psicopatologia associada. CONCLUSÃO: As estratégias terapêuticas recomendadas pelas guidelines internacionais, mostram-se eficazes e seguras no processo de transição de género, com efeitos adversos clinicamente significativos muito raros. No entanto, são necessários mais estudos que englobem amostras maiores de pessoas transexuais e com seguimento após o início da terapêutica hormonal mais prolongado, de forma a identificar e caracterizar potenciais riscos a longo prazo da terapêutica da Disforia de Género.

A capsulite adesiva é uma patologia de início insidioso que causa dor de aumento gradual e restrição de movimento no ombro, quer ativo, quer passivo. Apesar de ter uma fisiopatologia incerta e desconhecida, sabe-se que é marcada inicialmente por um processo inflamatório, que progride para fibrose da cápsula da articulação gleno-umeral, resultando numa perda de amplitude de movimentos. Ainda que se acredite que seja uma patologia auto-limitada, esta pode persistir por vários anos e as algias dos doentes podem nunca cessar e o arco de mobilidade que apresentavam previamente nunca ser recuperado. A sua etiologia está proximamente associada a outras patologias, a mais relevante a diabetes, sendo que a presença concomitante de ambas resulta numa maior frequência de complicações da capsulite adesiva, e de tratamento mais difícil. As manifestações desta patologia são variadas e inespecíficas, pelo que pistas na história natural da doença e no exame físico são importantes para o correto diagnóstico. Quanto ao tratamento, ainda que a abordagem inicial seja conservadora, a cirurgia pode ser necessária em casos mais graves ou cuja evolução não é favorável. Os tratamentos são variados, mas apenas alguns demonstram eficácia em estudos clínicos. A patologia é rodeada de uma incerteza e desconhecimento que geram discórdia e abordagens divergentes. Assim, e visto que o seu impacto socio-económico continuará a aumentar com o envelhecimento da população, torna-se essencial reunir conhecimentos atuais, organizar a informação para deste modo uniformizar práticas.

Nipah virus (NiV) is a recently emerging zoonotic virus that belongs to the Paramyxoviridae family and the Henipavirus genus. It causes a range of conditions, from asymptomatic infection to acute respiratory illness and fatal encephalitis. The high mortality rate of 40 to 90% ranks these viruses among the deadliest viruses known to infect humans. Currently, there is no antiviral drug available for Nipah virus disease and treatment is only supportive. Thus, there is an urgent demand for efficient antiviral therapies. NiV F protein, which catalyzes fusion between the viral and host membranes, is a potential target for antiviral drugs, as it is a key protein in the initial stages of infection. Fusion inhibitor peptides derived from the HRC-domain of the F protein are known to bind to their complementary domain in the protein's transient intermediate state, preventing the formation of a six-helix bundle (6HB) thought to be responsible for driving the fusion of the viral and cell membranes. Here, we evaluated the biophysical and structural properties of four different C-terminal lipid-tagged peptides. Different compositions of the lipid tags were tested to search for properties that might promote efficacy and broad-spectrum activity. Fluorescence spectroscopy was used to study the interaction of the peptides with biomembrane model systems and human blood cells. In order to understand the structural properties of the peptides, circular dichroism measurements and molecular dynamics simulations were performed. Our results indicate a peptide preference for cholesterol-enriched membranes and a lipid conjugation-driven stabilization of the peptide α-helical secondary structure. This work may contribute for the development of highly effective viral fusion against NiV inhibitors.

The interaction between brain serotonin (5-HT) deficiency and environmental adversity may predispose females to excessive aggression. Specifically, complete inactivation of the gene encoding tryptophan hydroxylase-2 (Tph2) results in the absence of neuronal 5-HT synthesis and excessive aggressiveness in both male and female null mutant (Tph2-/-) mice. In heterozygous male mice (Tph2+/-), there is a moderate reduction in brain 5-HT levels, and when they are exposed to stress, they exhibit increased aggression. Here, we exposed female Tph2+/- mice to a five-day rat predation stress paradigm and assessed their emotionality and social interaction/aggression-like behaviors. Tph2+/- females exhibited excessive aggression and increased dominant behavior. Stressed mutants displayed altered gene expression of the 5-HT receptors Htr1a and Htr2a, glycogen synthase kinase-3 β (GSK-3β), and c-fos as well as myelination-related transcripts in the prefrontal cortex: myelin basic protein (Mbp), proteolipid protein 1 (Plp1), myelin-associated glycoprotein (Mag), and myelin oligodendrocyte glycoprotein (Mog). The expression of the plasticity markers synaptophysin (Syp) and cAMP response element binding protein (Creb), but not AMPA receptor subunit A2 (GluA2), were affected by genotype. Moreover, in a separate experiment, naïve female Tph2+/- mice showed signs of enhanced stress resilience in the modified swim test with repeated swimming sessions. Taken together, the combination of a moderate reduction in brain 5-HT with environmental challenges results in behavioral changes in female mice that resemble the aggression-related behavior and resilience seen in stressed male mutants; additionally, the combination is comparable to the phenotype of null mutants lacking neuronal 5-HT. Changes in myelination-associated processes are suspected to underpin the molecular mechanisms leading to aggressive behavior.

The current Russian war against Ukraine is of global concern. It builds on the annexation of Crimea in 2014 and subsequently the war in the Donbas region of Ukraine, and has become a large-scale Russian invasion of Ukraine from three directions, Crimea in the south, Russia in the east, and Belarus in the north. Despite the geopolitical background that, in the eyes of Russia, justifes its annexation of regions in and around Ukraine, we cannot turn a blind eye towards the untold miseries of the citizens of the invaded country. Although it is unclear as to how the situation will unfold, what is clear is that lives are being lost, many civilians are being injured, traumatized, and valuable assets destroyed. Taking into consideration that the population of the countries involved in this conflict totals nearly 200 million citizens, many lives on both sides will be sacrifced, millions of people displaced, Europe will be overrun with new refugees, and global world economics will be disrupted by the war itself and by the sanctions imposed on Russia.

Toxoplasmosis is a highly prevalent human disease, and virulent strains of this parasite emerge from wild biotopes. Here, we report on the potential of a histone deacetylase (HDAC) inhibitor we previously synthesized, named JF363, to act in vitro against a large panel of Toxoplasma strains, as well as against the liver and blood stages of Plasmodium parasites, the causative agents of malaria. In vivo administration of the drug significantly increases the survival of mice during the acute phase of infection by T. gondii, thus delaying its spreading. We further provide evidence of the compound's efficiency in controlling the formation of cysts in the brain of T. gondii-infected mice. A convincing docking of the JF363 compound in the active site of the five annotated ME49 T. gondii HDACs was performed by extensive sequence-structure comparison modeling. The resulting complexes show a similar mode of binding in the five paralogous structures and a quite similar prediction of affinities in the micromolar range. Altogether, these results pave the way for further development of this compound to treat acute and chronic toxoplasmosis. It also shows promise for the future development of anti-Plasmodium therapeutic interventions.

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There is an urgent need to provide healthcare professionals and midwives with validated tools as to improve fertility adjustment and promote well-being of couples with infertility. The purpose of this study was to test validity of the Fertility Adjustment Scale among people undergoing assisted reproductive techniques. A cross-sectional and methodological study was conducted, and a total of 104 Portuguese adults undergoing fertility treatment were recruited through fertility-related websites. The Fertility Adjustment Scale was administered along with the Spiritual Well-Being Questionnaire and the Resilience Scale for adults as a measure of concurrent validity. Scores revealed the sample's lack of adjustment to fertility. A significant correlation with measures of resilience provided evidence of convergent validity. There was a significant association of fertility adjustment with time of consultation and the cause of infertility. A Fertility Adjustment Scale with six items is a reliable tool that offers early recognition of patients' difficulties in adaptation to fertility problems during assisted reproductive techniques, which could be beneficial in not only an early recognition of healthcare intervention but of a more individualized approach to such patients.

Background: Vascular graft infections are a serious complication in vascular surgery. Correct antibiotic therapy targeted to the most likely infecting species is essential to treat these patients, although the bacterial epidemiology and pathogenesis are still not completely understood. We analyzed the behavior of vascular graft infections and the microbiologic patterns of resistance. Methods: A 10-year (2008-2018), single-center, retrospective cohort study was performed of all patients admitted with vascular graft infection identified by positive direct graft cultures. An extensive microbiologic study was performed to analyze the bacterial strains, antibiotic resistance and sensitivity, and prevalence stratified by the year. Results: A total of 72 vascular graft infections with positive graft cultures occurring in 65 patients were found. Their mean age was 67 ± 9.6 years, and 85% were men. Infection-related mortality was 11%. Of the 65 patients, 14 had undergone aortobifemoral bypass, 13 axillofemoral bypass, 5 femorofemoral bypass, 27 femoropopliteal bypass, and 4 femoral endarterectomy with synthetic patch angioplasty. The median interval from the index procedure to infection was longer for intracavitary than for extracavitary grafts (P = .011). Of the 72 infections, 48 were monomicrobial and 24 were polymicrobial. Gram-negative bacteria were predominantly identified in intracavitary graft infections (54%). In contrast, gram-positive bacteria were most frequent in the extracavitary graft group (58%). Multidrug-resistant bacterial species occurred more frequently in early graft infections (P = .002). Throughout the study duration, an overall decrease in gram-positive infections and an increase in gram-negative infections was observed, especially in extensively drug-resistant strains. A similar progression was found in all nosocomial infections. Conclusions: The present study has shown that vascular graft infection microbiology changed in accordance with graft location and interval to infection from revascularization surgery and had also evolved over the study period with patterns similar to those for all nosocomial infections. This highlights the importance of studying the specific microbiology of each healthcare center and its relationship to vascular graft infections to achieve the best treatment possible.

Este trabalho tenciona refletir como o realizador sérvio Emir Kusturica se apropria do conceito de extracampo na elaboração de suas narrativas fílmicas – nomeadamente, Arizona dream (1993) e Underground (1995) – a fim de suscitar a catarse no espectador. No intuito de alargar a reflexão, a pesquisa terá a análise fílmica das obras em estudo enquanto suporte adjacente a colaborar com os fundamentos expostos quando se julgar pertinente. O fundamento do extracampo se refere ao espaço imaginário fora do campo visual da tela, a “reivindicar” a abstração do espectador para que nele “ocorra” a narrativa, e, assim, o filme ganhe outros sentidos. A partir desse pressuposto, o trabalho evocará uma filmografia que opere de modo antagônico ao explorado por Kusturica, a propor uma dialética entre ambas. A cinematografia selecionada é aquela em que se nota em sua operacionalidade os conceitos de hiper-realidade e simulacro, noções propostas por Jean Baudrillard (1991). A pesquisa também irá evocar as reflexões de Roland Barthes (2015) e Gilles Deleuze (2005) a respeito da fotografia e dos atributos da imagem. Tal escolha se deve ao fato de ambas as artes partilharem dos mesmos fundamentos e recursos técnicos. A perspectivar o tema abordado e encerrar um sistema básico do cinema – de emissão e recepção de mensagem –, o trabalho evocará as reflexões de Jacques Rancière (2014) e Robert Sklar (1975), a respeito de espectatorialidade, cinema de mercado e a indústria de cinema norte-americana. Esses temas figuram como elementos basilares à compreensão do modus operandi do cinema de Kusturica, “franqueado” à abstração do espectador, condição favorável à experiência catártica. A pesquisa também terá como apoio as investigações do psicólogo russo Lev Vigotski (1999) a respeito da catarse, assim como tenciona refletir sobre como tal reação emocional provoca a “transformação” do ser humano e, por conseguinte, seu desdobramento no corpo social.

A Radioterapia é uma das modalidades principais para tratamentos de foro oncológico que visa destruir a ação proliferativa das células cancerígenas e reduzir o volume tumoral. A sua ação terapêutica através do uso de radiação ionizante tem, subjacente, a máxima de irradiar o tumor com uma elevada dose, ao mesmo tempo que os órgãos de risco (OARs) adjacentes, são tanto quanto possível protegidos. Quando um tumor se localiza no pulmão ou abdómen superior, como no fígado ou pâncreas, o seu movimento devido à respiração pode alcançar até 4 cm, especialmente na direção crânio-caudal, aumentando as incertezas relativas à posição do tumor. No Centro Clínico Champalimaud (CCC), o planeamento convencional dos tratamentos de radioterapia faz uso de uma tomografia computadorizada (CT) que é adquirida aquando da respiração livre do doente e que, por isso, apresenta geralmente artefactos que podem ser uma fonte de erro durante o planeamento. Nos casos em que o movimento do tumor é considerável, é ainda adquirida uma tomografia computadorizada quadrimensional (4DCT) que consiste entre 8 e 10 CTs que representam fases do ciclo respiratório. Posteriormente, a 4DCT é utilizada para delinear o volume interno do alvo (ITV) que engloba toda a extensão do movimento do tumor. Apesar da estratégia do ITV garantir uma adequada cobertura do volume-alvo, os OARs ficam expostos a doses de radiação desnecessárias e a um maior risco de toxicidade. Este efeito é ainda mais preocupante em tratamentos hipofracionados, onde doses mais elevadas são administradas num número reduzido de frações. Nos últimos anos têm sido desenvolvidas estratégias que visam tornar os tratamentos de radioterapia mais eficazes. Uma delas é a reconstrução de uma CT que representa a posição média do doente ao longo do ciclo respiratório (Mid-P CT). Esta estratégia resulta em volumes de tratamento menores do que a estratégia do ITV, possibilitando o aumento da dose e maior controlo tumoral local. O primeiro passo para a reconstrução do Mid-P CT é o registo deformável de imagens (DIR) entre uma das fases da respiração (uma CT da 4DCT), definida como a fase de referência, e as restantes fases. Deste processo resultam campos vetoriais deformáveis (DVF) que contém informação do deslocamento dos tecidos. Os DVFs são subsequentemente utilizados para transformar cada uma das fases da respiração para a posição média. O método do Mid-P foi implementado com sucesso no Instituto do Cancro Holandês (NKI) em 2008. Apesar dos bons resultados clínicos, o número de centros de radioterapia que utiliza esta técnica é muito reduzido. Tal deve-se, por um lado, à inexistência de soluções comerciais com esta funcionalidade e, por outro, ao esforço necessário alocar para implementar e validar soluções desenvolvidas internamente. O presente projeto teve como principal objetivo implementar a estratégia do Mid-P no CCC (Portugal). Para tal, foi otimizado um módulo – RunMidP – desenvolvido para o software 3D Slicer, que calcula o Mid-P CT e estima a amplitude do movimento do tumor e OARs com base nos DVFs. Considerando que a precisão do módulo e a qualidade de imagem do Mid-P CT devem atender os requisitos para o planeamento em radioterapia, foram realizados testes para validar o módulo. Sempre que possível, a sua performance foi comparada com outras aplicações desenvolvidas para a implementação da técnica do Mid-P, nomeadamente com um protótipo desenvolvido pela empresa Mirada Medical Ltd. (Reino Unido) – Mirada – e com o software desenvolvido no NKI (Holanda) – Wimp. Os testes foram divididos em três estudos diferentes, cada um com um conjunto de dados diferente. No primeiro estudo (estudo A), foram utilizadas 4DCT de 2 fantomas digitais, cuja função respiratória e cardíaca foi modelada de forma simplificada, e de 18 doentes com tumores localizados no pulmão (N = 8), no fígado (N = 6) e no pâncreas (N = 4). Neste estudo, foram comparados dois algoritmos DIR disponíveis no software 3D Slicer, o Plastimatch e o Elastix, em termos da precisão do registo e da qualidade de imagem do Mid-P CT reconstruído. Foi ainda avaliado a capacidade dos softwares RunMidP e Mirada representarem corretamente a posição média do doente e as diferenças das amplitudes do movimento do tumor estimadas pelos dois softwares. No estudo B, foram realizados testes de verificação semelhantes aos supre mencionados, em imagens sintéticas provenientes de 16 doentes, desta vez com a vantagem de se conhecer o “verdadeiro” Mid-P CT e as “verdadeiras” amplitudes do movimento do tumor. Estes foram comparados com os resultados obtidos com os softwares RunMidP e Mirada. Ainda, as unidades de Hounsfield (HU) no Mid-P CT reconstruído por RunMidP e Mirada foram comparadas com as HU na fase de referência, de modo a verificar se os Mid P CTs produziriam diferenças dosimétricas relevantes. No último estudo (estudo C), a qualidade de imagem do Mid-P CT foi avaliada quantitativamente e qualitativamente. Durante a análise qualitativa, foi pedido a dois médicos especialistas que avaliassem a viabilidade dos Mid-P CTs, reconstruídos pelos três softwares (RunMidP, Mirada e Wimp), para o planeamento dos tratamentos. O tempo da reconstrução do Mid-P CT a partir da 4DCT foi de cerca de 1h. Ambos os algoritmos, Plastimach e Elastix, demonstraram ser adequados para DIR de imagens do pulmão e abdómen superior, com diferenças estatisticamente não significativas (p > 0.05) em termos da precisão do registo. Contudo, o Mid-P CT reconstruído com Elastix apresentou uma melhoria na qualidade de imagem, sendo assim o algoritmo DIR escolhido para ser implementado no RunMidP. Em termos de métricas aplicadas a contornos definidos manualmente, tais como a distância de Hausdorf (HD) e coeficiente de Dice (DSC), o erro do registo de imagem foi menor que 1 mm, dentro do contorno do tumor, e 2 mm no pulmão. Os Mid-P CTs reconstruídos com o RunMidP e Mirada apresentaram maiores diferenças, relativamente ao “verdadeiro” Mid-P CT, na região do diafragma e zonas de maior homogeneidade como, por exemplo, no ar presente no intestino. Contudo, para a maioria dos doentes do estudo B, o Mid-P CT reconstruído com o software Mirada apresentou maior índice de similaridade estrutural (SSIM) relativamente ao “verdadeiro” Mid-P CT. Estes resultados podem estar na origem do uso de diferentes algoritmos DIR, mas deveram-se principalmente a uma falha na aplicação das transformações deformáveis pelo módulo RunMiP que foi corrigida posteriormente. Ainda, as diferenças entre as amplitudes estimadas e previstas foram menores que 1 mm para 37 tumores (78,9%), que resultam em diferenças menores que 0.3mm quando convertidas em margens de planeamento. Para além disso, as diferenças nos valores de HU dos Mid-P CTs comparativamente à fase de referência foram, em média, de 1 HU no tumor e OARs. Foram também observadas melhorias na qualidade de imagem do Mid-P CT, nomeadamente um aumento da relação sinal-ruído (SNR) e diminuição dos artefactos. Estes resultados estão de acordo com a avaliação dos médicos que, em geral, consideraram que os Mid-P CTs reconstruídos pelos três softwares são adequados para o planeamento dos tratamentos. No entanto, os Mid-P CTs reconstruídos com dados 4DCT provenientes do CCC apresentaram classificações inferiores aos reconstruídos com dados 4DCT do NKI. Em suma, as modificações do algoritmo DIR Plastimach para Elastix e a correção do método para aplicar as transformações deformáveis, permitiram uma melhoria na qualidade de imagem do Mid P CT e melhor performance do algoritmo, respetivamente. O módulo RunMidP, neste projeto otimizado e validado, apresenta um forte potencial para a reconstrução e implementação da estratégia do Mid-P na clínica, com performance comparável a outras aplicações existentes (Mirada e Wimp). Atenção especial deve ser dada aos dados 4DCT de input que parecem afetar a qualidade de imagem final do Mid-P CT. No futuro, valerá a pena otimizar os parâmetros de aquisição e reconstrução da 4DCT de modo a melhorar a qualidade de imagem e, ainda, o módulo RunMidP pode potencialmente ser otimizado no que respeita ao tempo de reconstrução do Mid-P CT e à precisão do DIR.

Phosphatidylethanol (PEth) is a group of direct ethanol biomarkers used to distinguish between different drinking patterns, such as heavy and social drinkers. So far, the PEth homologue most used for this purpose is PEth 16:0/18:1. This homologue is also the one determined in most of the LC-MS/MS methods developed for PEth analysis. Often one or a few PEth homologues are quantified in LC-MS/MS methods published, but recently a LC-MS/MS method for the determination of six PEth homologues was developed. The main aim of the dissertation was to develop a LC-MS/MS method for the quantitative determination of eight of the most common PEth homologues in whole blood. This can be helpful, especially for the determination of PEth in blood from people with high alcohol consumption. Chromatographic separation of the PEth homologues was tested on five UHPLC columns. Different mobile phases were investigated to optimize separation. Best chromatographic separation of the PEth homologues was achieved using an Acquity BEH C18 column (100 2.1 mm I.D., 1.7 µm particles) and a mobile phase consisting of 5 mM ammonium acetate pH 5 (Solvent A) and methanol (Solvent B). The total run time was 5.7 minutes. MS/MS parameters were optimized for each of the eight PEth homologues and internal standards. Two MRM transitions ions, those with the highest responses, were chosen for each compound. Isotope labeled internal standards were used for five of the eight PEth homologues. Two sample preparation techniques, liquid-liquid extraction (LLE) and 96-well supported liquid extraction (SLE), were investigated to extract the PEth homologues from blood. The extraction recoveries obtained were within 45-82% when LLE was used and within 68-80% when 96-well SLE was used. Matrix effects were studied and showed ion suppression for the majority of the PEth homologues, and ion enhancement for PEth 17:0/18:1. For compounds with their own internal standards, the matrix effects were corrected for their internal standard. An LC-MS/MS method for the determination of eight PEth homologues was developed and validated. The validation showed that UHPLC-MS/MS method is precise, accurate, and sensitive for its purposes.

Os efeitos da prática regular de exercício físico moderado são bem conhecidos, levando a diversos benefícios ao nível central e periférico na saúde individual. No entanto, o crescente interesse em modalidades mais exigentes - como as ultra-maratonas - exige um maior estudo sobre o impacto na saúde do exercício extenuante de longo prazo, cujas respostas e efeitos são ainda largamente desconhecidos. Com este estudo pretende-se avaliar o impacto da prática do exercício físico extenuante de longa duração em atletas de ciclismo de montanha, nas respostas neuroinflamatória, neuroendócrina e metabólica, através da análise de diversos parâmetros bioquímicos, e proceder à comparação com a prática de exercício físico de intensidade média/elevada, em atletas de triatlo, ciclismo e ciclismo de montanha. Por fim, será ainda avaliada a influência de diversos polimorfismos genéticos relacionados com as respostas em estudo, utilizando-os ainda como biomarcadores indiretos. A amostra deste trabalho é constituída por duas populações representativas de dois modelos de exercício distintos: o extenuante de longa duração (TransPortugal) e o de intensidade moderada/elevada (Equipas) (n=51, n=26). Foram recolhidas amostras biológicas na população TransPortugal antes e após a prova e na população das equipas antes e após a época de competição, para posterior quantificação de: creatinina, ácido úrico, glucose, insulina, IL-6, haptoglobina, CRP, TNF-α, serotonina, BDNF e cortisol. Os VNTR nos genes 5HTT e DAT foram determinados por PCR convencional, os SNP nos genes COMT e MTHFR foram determinados através de PCR/RFLP e as variantes nos genes BDNF, IDO1, IL-6, IL1β e TNF-α foram determinadas por qPCR. Ao nível basal, ambas as populações apresentam valores semelhantes dos vários biomarcadores. A realização da prova TransPortugal levou a um aumento dos biomarcadores de resposta inflamatória nos seus participantes, verificando-se adaptações ao nível do metabolismo energético, com concentrações superiores de BDNF nos atletas com mais etapas concluídas. A resposta inflamatória foi diferencialmente regulada pelos polimorfismos no BDNF e IDO1, revelando uma complexa interação neuroimune, moduladora da inflamação. Os polimorfismos no gene COMT e nos transportadores de ambos os neurotransmissores influenciaram também as concentrações de biomarcadores inflamatórios, estando os últimos associados a uma regulação diferencial entre genótipos das concentrações de BDNF. A variante no gene desta neurotrofina, assim como no gene da IDO1 foram ainda responsáveis por diferenças no metabolismo energético ao nível basal e no caso do BDNF, também em resposta ao exercício extenuante. Estes resultados contribuem para aumentar o ainda escasso conhecimento nesta área de interesse, demonstrando a importância do exercício extenuante como modulador de diversas respostas fisiológicas, que interagem entre si, revelando ainda a existência de uma influência de fatores genéticos sobre a resposta inflamatória e neuroendócrina ao exercício extenuante de longo termo.

Species-rich ecosystems as tropical forests are extremely vulnerable to anthropogenic destruction. Most tropical plant species rely on animals to disperse their seeds. However, patterns of mutualistic interactions have rarely been explored, and seed dispersal networks are still poorly studied in Africa. Here, we examine how forest edges’ (FE) seed dispersal networks differ from the mature forest (MF) at a West African sub-humid tropical forest within the National Park of Cantanhez (Guinea-Bissau). Additionally, we explore species’ roles within the network. MF had higher fruit availability, more frugivore visitors, and plant–frugivore interactions. Network structure was quite similar between habitats, showing signs of redundancy, and some robustness to species’ extinction. FE was more nested, modular, and specialized, whereas MF had higher connectance, interaction evenness, and robustness to extinction. Most species were generalists, but large-bodied frugivores prevailed at MF. FE showed a higher vulnerability, mostly to the loss of trees. Trees are key, keeping the structure of both networks. Large-bodied frugivores and fruiting-tree species that work as network connectors should thus be the focus of active conservation management in these forests. Only viable populations of these species will ensure a good performance of the seed dispersal network, promoting the natural regeneration of the ecosystem.

Nos últimos anos, os blooms de algas nocivas tornaram-se um objeto de estudo importante para a comunidade científica devido ao crescimento mundial do fenómeno. Contudo, os blooms de algas não são necessariamente tóxicos, apesar de nocivos. Existem dois modos para serem consideradas nocivos: a primeira é pela produção de toxinas pelas próprias algas; a segunda pela acumulação de biomassa que, por morte das células, provocam condições de anoxia (ausência de oxigénio), lesivas para o ecossistema. No entanto, os mecanismos físicos e biológicos que os desencadeiam não são totalmente conhecidos. Os mecanismos físicos (a temperatura da superfície do mar, a estratificação da coluna de água, o forçamento do vento, entre outros) controlam a biomassa fitoplanctónica possibilitando, em certos casos, uma acumulação da mesma devido à disponibilidade de nutrientes na coluna de água. Daí, é importante compreender de que forma os mecanismos físicos podem produzir as condições favoráveis ao aparecimento de blooms de algas nocivas. Um destes é o afloramento costeiro, mecanismo abordado na dissertação. O objetivo da tese é o estudo da variação espácio-temporal da biomassa fitoplanctónica no Noroeste da Península Ibérica (Figueira da Foz, Portugal) durante um episódio de afloramento costeiro. De forma a avaliar a distribuição espácio-temporal do fitoplâncton recorreu-se a dados de deteção remota e dados in situ (concentração em clorofila-a, Chl-a, índice de biomassa do fitoplâncton), obtidos durante uma campanha oceanográfica de 12 a 19 de setembro de 2019. O presente trabalho foca as duas primeiras semanas de setembro de 2019, período no qual ocorreu uma campanha oceanográfica. Esta tese foi realizada no âmbito do Projeto HabWAVE, com o objetivo de estudar a formação dos blooms de algas nocivas no noroeste da costa portuguesa através de processos físicos e biológicos, aplicando os dados de deteção remota e in situ. A primeira etapa do trabalho consistiu em verificar quais as imagens de satélite disponíveis, de onde foram analisadas as concentrações da clorofila-a (Chl-a) e a temperatura da superfície do mar (SST- Sea Surface Temperature). Em diversos dias houve ausência de imagens devido à cobertura nebulosa presente durante o mês de setembro de 2019. A SST foi igualmente obtida a partir da solução numérica do modelo ROMS. Recorreu-se a produtos de satélites com resoluções espaciais iguais ou inferiores a 1 km, para a concentração de clorofila-a e para a temperatura da superfície do mar. Por turno, o forçamento do vento e as correntes oceânicas foram obtidas a partir das soluções numéricas de diferentes modelos: o ECMWF-IFS e o ROMS, respetivamente. No caso dos produtos de clorofila-a fez-se uma análise prévia dos algoritmos disponíveis através da sua comparação com os dados in situ existentes (matchups). A análise dos matchups foi efetuada a partir de dois parâmetros estatísticos, o erro quadrático médio e o viés, que permitiram averiguar qual o produto de Chl-a mais apropriado para representar a sua variabilidade espacial na região de estudo. Com base nestes critérios foi selecionado o algoritmo de Chl-a “Piscismod Iberia” em relação aos algoritmos da Chl_NN e Chl_OC4Me (provenientes do sensor Ocean and Land Colour Instrument – OLCI), e do Ocean Colour Climate Change Iniciative (OC - CCI). O produto de SST selecionado é proveniente do sensor Sea and Land Surface Temperature Radiometer (SLSTR), do Group of High Resolution Sea Surface Temperature (GHRSST). Este sensor permite estimar a temperatura da superfície do mar através da calibração altamente precisa de três canais infravermelhos (S7-S8-S9). Os resultados mostram sucessivos ciclos de intensificação e relaxamento do forçamento do vento favorável ao afloramento (componente along-shore) nas duas primeiras semanas de setembro de 2019. A variabilidade no campo do vento afeta a distribuição espacial da SST, ou seja, a intensificação da componente along-shore do vento produzirá uma intensificação do afloramento costeiro e um relaxamento do vento causará uma regressão do afloramento costeiro. A comparação entre as soluções do modelo hidrodinâmico para a temperatura da superfície mostrou que o modelo reproduz valores semelhantes aos do satélite, no entanto, com uma subestimação dos valores da SST. A análise das distribuições de concentração de clorofila-a mostrou uma forte correlação com a distribuição espacial da SST, com elevados valores de Chl-a associados a baixos valores de SST. Contudo, a partir do dia 10 de setembro de 2019 em diante, observa-se que os valores elevados de clorofila-a não se associam necessariamente a temperaturas mais frias e em algumas áreas de baixa temperatura os valores de clorofila-a também são baixos. De forma a compreender este fenómeno estudou-se a variabilidade da costa para o largo (cross-shore), de onde se observou que a fraca concentração de clorofila-a está dependente da intensificação do forçamento do vento que, por sua vez, fortalece a componente cross shore do transporte de Ekman. De acordo com a literatura, a interpretação sobre o desfasamento visual entre a Chl-a e a SST, observadas no dia 11 de setembro, dever-se-á à forte divergência, e consequentemente afloramento de águas subsuperficiais, induzida pelo aumento da componente along shore do vento. Posteriormente, analisaram-se, em pormenor, os dias 5, 10 e 11 de setembro, por apresentarem os maiores picos de ventos favoráveis ao afloramento costeiro. Nestes dias, a concordância visual entre as correntes oceânicas (modeladas pelo modelo ROMS) com a distribuição espacial da Chl-a e da SST mostraram que o modelo tem um melhor desempenho com as imagens de satélite para a distribuição espacial na região costeira, facto não verificado para o oceano aberto. De seguida, calcularam-se e comparam-se os campos da divergência horizontal que permitem inferir os locais onde o maior afloramento costeiro é mais intenso. O máximo de divergência costeira offshore observada é coincidente com as baixas concentrações clorofila-a, na mesma faixa de latitudes e longitudes. De seguida, três latitudes distintas (40.30°N, 40.19°N e 40.11°N) foram representadas em profundidade, para as correntes oceânicas e para a temperatura do mar. Com o decorrer do tempo foi visualizada uma progressão das camadas mais frias, associadas a uma intensificação do campo do vento. No caso das correntes oceânicas, uma componente maioritariamente para sul é observada em todos os dias. Contudo, nos dias 10 e 11, que correspondem aos dias de máxima intensidade do vento, verifica-se a formação de um jato costeiro confinado na região costeira. Logo, a baixa concentração de clorofila-a é justificada pela intensificação da componente along-shore do forçamento do vento que produz um máximo de divergência costeira. O máximo de divergência costeira observado não se encontra junto da linha costeira devido à interação entre a camada de Ekman da superfície e a camada de Ekman do fundo nas regiões menos profundas. Com a persistência do forçamento do vento, o campo de divergência vai progredir para fora com a evolução do afloramento costeiro. Por sua vez, permite a formação de um jato costeiro para sul coincidente com o sinal de baixa concentração de clorofila-a observada pelos dados de satélites.

The simulation and analysis of future land use and land cover—LULC scenarios using artificial neural networks (ANN)—has been applied in the last 25 years, producing information for environmental and territorial policy making and implementation. LULC changes have impacts on many levels, e.g., climate change, biodiversity and ecosystem services, soil quality, which, in turn, have implications for the landscape. Therefore, it is fundamental that planning is informed by scientific evidence. The objective of this work was to develop a geographic model to identify the main patterns of LULC transitions between the years 2000 and 2018, to simulate a baseline scenario for the year 2036, and to assess the effectiveness of the Chapecó River ecological corridor (an area created by State Decree No. 2.957/2010), regarding the recovery and conservation of forest remnants and natural fields. The results indicate that the forest remnants have tended to recover their area, systematically replacing silviculture areas. However, natural fields (grassland) are expected to disappear in the near future if proper measures are not taken to protect this ecosystem. If the current agricultural advance pattern is maintained, only 0.5% of natural fields will remain in the ecological corridor by 2036. This LULC trend exposes the low effectiveness of the ecological corridor (EC) in protecting and restoring this vital ecosystem.

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Seawater intrusion is an increasingly widespread problem in coastal aquifers caused by climate changes –sea-level rise, extreme phenomena like flooding and droughts– and groundwater depletion near to the coastline. To evaluate and mitigate the environmental risks of this phenomenon it is necessary to characterize the coastal aquifer and the salt intrusion. Geophysical methods are the most appropriate tool to address these researches. Among all geophysical techniques, electrical methods are able to detect seawater intrusions due to the high resistivity contrast between saltwater, freshwater and geological layers. The combination of two or more geophysical methods is recommended and they are more efficient when both data are inverted jointly because the final model encompasses the physical properties measured for each methods. In this investigation, joint inversion of vertical electric and time domain soundings has been performed to examine seawater intrusion in an area within the Ferragudo-Albufeira aquifer system (Algarve, South of Portugal). For this purpose two profiles combining electrical resistivity tomography (ERT) and time domain electromagnetic (TDEM) methods were measured and the results were compared with the information obtained from exploration drilling. Three different inversions have been carried out: single inversion of the ERT and TDEM data, 1D joint inversion and quasi-2D joint inversion. Single inversion results identify seawater intrusion, although the sedimentary layers detected in exploration drilling were not well differentiated. The models obtained with 1D joint inversion improve the previous inversion due to better detection of sedimentary layer and the seawater intrusion appear to be better defined. Finally, the quasi-2D joint inversion reveals a more realistic shape of the seawater intrusion and it is able to distinguish more sedimentary layers recognised in the exploration drilling. This study demonstrates that the quasi-2D joint inversion improves the previous inversions methods making it a powerful tool applicable to different research areas.