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Invasive bacterial infections (IBI) are leading causes of global morbidity and mortality. Successful treatment of the patients depends on a rapid and accurate diagnosis. The current golden standard procedure for bacterial identification in clinical context requires bacterial culture and biochemical analysis—a slow, culture-dependent and possible subjective approach, presenting several limitations. Bacteria identification based on 16S rRNA gene represents a faster, culture-independent and objective alternative for diagnostic. Here, we give a general overview of 16S rRNA genomics as diagnosing tool for IBI, briefly presenting and discussing the most significant technical approaches for 16S rRNA-mediated diagnosis.

Here, we present the draft genome sequences of 29 Colombian Helicobacter pylori strains. These strains were isolated in Bogotá, Colombia, from patients diagnosed with chronic gastritis. The genomic characterization of these strains will provide more information on the genetic composition of H. pylori strains from Colombia.

O presente Relatório de Prática Profissional intitulado A Importância da Arte para o Ensino da História – exemplos em sala de aula – foi realizado no âmbito da conclusão do Mestrado em Ensino de História no 3.º Ciclo do Ensino Básico e no Ensino Secundário, orientado pelo Professor Doutor Miguel Monteiro. Na atualidade apelar à sensibilidade dos jovens é cada vez mais importante visto que nos encontramos numa sociedade cada vez menos humanizada e cada vez mais maquinizada. Utilizar a arte para compreender a sociedade é um bom partido para que os nossos jovens consigam tornar-se em seres sociais e dotados não só de uma sensibilidade artística, mas também de um espirito crítico capaz de os levar a discutir assuntos e formular pensamentos. Ao longo do primeiro semestre do Ano Letivo de 2019/2020 realizei a Iniciação à Prática Profissional na Escola Secundária D. Pedro V, localizada nas Laranjeiras, com as turmas do 12º 5,7 e 8, lecionando um total de sete aulas de 90 minutos cada. Em três das sete aulas lecionadas procurei utilizar a análise das obras de arte bem como períodos artísticos com o objetivo de explorar tanto os períodos históricos, as mentalidades das sociedades da época a fim de partir das mesmas para lecionar os conteúdos. Foi explorado o cartaz de propaganda política de Juan Miró apelidado de Ajudem a Espanha, foi analisada a Cultura de Massas com o objetivo dos alunos compreenderem o porquê dessas praticas surgirem no século XX, por fim foram apresentadas aos alunos diversas obras provenientes do movimento artístico de Vanguarda de forma a dar a conhecer aos alunos as transformações sociais e culturais que aconteceram no terceiro quartel do século XX. A exploração destas temáticas através da análise de obras de arte teve como principal objetivo dar a conhecer aos alunos a abrangência de possibilidades que as obras de arte nos trazem, assim como demonstrar-lhes que podemos sair dos documentos históricos ditos convencionais para explorar igualmente períodos históricos.

A Síndrome da Apneia Obstrutiva do Sono (SAOS) é um dos distúrbios respiratórios do sono mais comuns. É caracterizada pela cessação (apneia) ou redução (hipopneia) do fluxo aéreo nas vias aéreas superiores durante o sono, na presença de esforço respiratório. A prevalência da apneia obstrutiva do sono é frequentemente subestimada, afetando entre 9% a 38% da população adulta em geral, sendo mais elevada nos indivíduos do género masculino e nos idosos. Os sintomas mais comuns durante o sono são o ressonar alto, sensação de asfixia, apneias visualizadas, movimentos corporais bruscos, agitação e despertares frequentes. Quando acordado, as principais queixas referidas são a sensação de sono não reparador, cefaleia matinal, sonolência diurna, fadiga e alterações de humor, da memória e da concentração. O diagnóstico standard é a polissonografia noturna realizada num laboratório de sono. Os Home Sleep Apnea Tests (HSAT) podem ser realizados em determinados doentes, mas são geralmente considerados menos precisos. A pressão positiva contínua das vias aéreas (CPAP) é a primeira linha de tratamento, no entanto, outras modalidades terapêuticas incluem a redução do peso, dispositivos de aplicação oral, estimulação do nervo hipoglosso, farmacoterapia, cirurgia para correção anatómica e até, tratamento adjuvante com cirurgia bariátrica. As diferenças entre géneros são evidentes: as mulheres apresentam uma sintomatologia atípica, menor suscetibilidade de colapso das vias aéreas, menor redução da função pulmonar e diferenças hormonais em comparação com os homens. Em relação à idade: o idoso não tem uma apresentação clínica clássica da doença, apresenta maior colapsibilidade das vias aéreas, défices de múltiplos domínios cognitivos e modificações estruturais e funcionais do cérebro. Concluindo, o estudo das características distintas entre idades e géneros são importantes para uma melhor compreensão da doença e para um diagnostico precoce da mesma que se traduzirá num tratamento mais atempado.

Introdução: A Fibromialgia é uma doença crónica caracterizada frequentemente por dor músculo-esquelética generalizada, acompanhada de fadiga, sono não reparador, alterações cognitivas, entre outros sintomas. Apesar de não reduzir a esperança de vida, tem uma repercussão significativa na qualidade de vida dos pacientes e condiciona o agravamento das suas comorbilidades. Os Médicos de Família constituem, na maioria dos casos, o primeiro ponto de contacto, dispondo de uma posição privilegiada para uma abordagem diagnóstica atempada. Todavia, a presença de uma longa lista de diagnósticos diferenciais e a ausência de achados característicos nos exames laboratoriais e de imagem tornam a concretização do diagnóstico desafiante e, particularmente, difícil. Objetivos: Pretendo reunir informação relevante acerca da marcha diagnóstica da Fibromialgia e expor alguns Critérios Diagnósticos recentemente publicados, que possam ser aplicados no reconhecimento da doença nos Cuidados de Saúde Primários. Esta Revisão Narrativa poderá auxiliar os Médicos de Família na sua prática clínica e contribuir, em parte, para a redução do subdiagnóstico, da requisição excessiva de exames e da referenciação rotineira dos doentes para outras especialidades. Metodologia: A revisão da bibliografia foi realizada através da leitura de artigos publicados na PubMed e na B-On, pesquisa de informação em bases de dados médicas e consulta de Guidelines, Normas de Orientação Clínica e páginas da internet consideradas relevantes para o tema. Conclusão: O diagnóstico da Fibromialgia é clínico, baseando-se na anamnese e no exame físico. De entre os critérios de diagnóstico mais recentes, é de destacar a Revisão de 2016 dos Critérios do American College of Rheumatology e os Critérios da ACTTION-APS Pain Taxonomy de 2019. Apesar de todos os avanços na área da Fibromialgia, sabe-se que a doença permanece subdiagnosticada e estigmatizada, sendo necessária uma investigação contínua, com vista à sua legitimação e aceitação completa.

O sistema nervoso autónomo é responsável pela manutenção do normal funcionamento cardíaco, através de vias dinâmicas de feedback aferente e eferente entre os seus diferentes níveis. A doença cardíaca pode levar a um “remodelling” neuronal e disfunção simpatovagal, o que tem sido implicado na iniciação e manutenção de arritmias cardíacas auriculares e ventriculares. Os mecanismos complexos através dos quais a desregulação autonómica predispõe à arritmogénese são diferentes entre arritmias. Na fibrilhação auricular, o aumento da atividade de ambos os sistemas simpático e parassimpático é proarrítmico. Em contraste, na fibrilhação ventricular no contexto de isquemia miocárdica, a ativação simpática é o desencadeante mais comum. Na maioria dos síndromes de arritmias hereditárias, a estimulação simpática induz taquiarritmias ventriculares e morte súbita cardíaca. A identificação de desencadeantes autonómicos específicos tem sugerido que várias terapêuticas de neuromodulação poderão contribuir para a prevenção e tratamento de diferentes arritmias. A neuromodulação é uma terapêutica bem estabelecida no síndrome do QT longo, mas continua ainda sob investigação quanto à sua utilização em outras arritmias. Nesta revisão, iremos apresentar um breve resumo da anatomia e fisiologia básicas do sistema nervoso autónomo cardíaco e explicar o seu papel na patogénese de arritmias cardíacas, incluindo fibrilhação auricular e arritmias ventricualres, particularmente no contexto de isquémia miocárdica e canalopatias hereditárias. Por fim, iremos apresentar os avanços recentes bem como as potenciais limitações da neuromodulação, uma estratégia emergente na gestão de doentes com arritmias refratárias, por permitir restaurar o equilíbrio entre as componentes simpática e parassimpática do sistema nervoso autónomo.

A síndrome Unha-patela (SUP) é uma doença multisistémica rara com hereditariedade autossómica dominante. Esta síndrome caracteriza-se por displasia das unhas e alterações típicas do esqueleto ósseo. As manifestações renais, embora raras, são um fator determinante da mortalidade e podem constituir a sua única manifestação. Apresenta-se o caso de uma doente do sexo feminino, previamente saudável, com diagnóstico de síndrome nefrótica aos 23 anos. Na investigação etiológica foram excluídas doenças auto-imunes e virais e realizada biópsia renal que foi compatível com doença de lesões mínimas. Por apresentar resistência aos corticóides foi repetida biópsia renal que confirmou o primeiro diagnóstico histológico. A IS foi alterada para um inibidor da calcineurina e, após um ano, por ausência de remissão completa optou-se por terceira linha de IS com micofenolato de mofetil associado a corticoterapia. A doente manteve proteinúria subnefrótica e a terceira biópsia renal, doze anos após o diagnóstico inaugural, confirmou a doença de lesões mínimas. Dezasseis anos após o diagnóstico, na tentativa de suspensão de corticoterapia, foi administrado rituximab sem benefício na redução da proteinúria. Apesar da ausência de história familiar, realizou-se o estudo genético de síndromes nefróticas que revelou mutação no gene LMX1B em heterozigotia. O diagnóstico de SUP permitiu a suspensão de imunossupressão, mantendo-se a proteinúria controlada com medidas anti-proteinúricas. Este caso ilustra a dificuldade de diagnosticar síndromes hereditárias raras na ausência de história familiar e de manifestações extra-renais e a importância de serem consideradas as causas genéticas perante uma síndrome nefrótica resistente à imunossupressão.

Neste relatório apresenta-se o trabalho desenvolvido, no âmbito da prática de ensino supervisionada, numa turma de Clássicos da Literatura, do 12º ano de escolaridade, na Escola Secundária de Camões, no ano letivo de 2020/2021, ano marcado pela pandemia da Covid-19. Teve como objeto a exposição oral e como objetivo principal dotar os alunos de estratégias que lhes permitissem planificar e produzir com sucesso as suas exposições orais, relativas a temas literários, tendo como modelo as TED Talks. Desenhou-se e implementou-se uma intervenção didática, constituída por seis aulas de 90 minutos, que se dividiu em três partes. A primeira parte foi constituída por um pré-teste. A segunda parte foi constituída pela sequência didática aplicada, composta por quatro oficinas formativas. Nelas foram trabalhadas estratégias de planificação da exposição oral: estratégias de seleção e de organização da informação, assim como estratégias linguísticas, a utilização dos marcadores discursivos. Por fim, a terceira parte foi constituída por um pós-teste. Os resultados obtidos mostraram uma evolução da classificação final dos alunos do momento do pré-teste para o momento do pós-teste, tanto ao nível da planificação da exposição oral, como ao nível da produção oral. Esta evolução notou se em quase todos os parâmetros avaliados, mas foi mais expressiva no parâmetro de avaliação relativo à utilização dos marcadores discursivos. Os alunos que inicialmente demonstraram mais dificuldades no domínio do género registaram uma evolução mais significativa do pré-teste para o pós-teste. Os dados recolhidos na autoavaliação mostraram que os alunos consideraram o seu desempenho no momento do pós-teste superior ao do pré-teste. Numa análise comparativa constatou-se que as classificações atribuídas pela professora superaram as classificações propostas pelos alunos na sua autoavaliação.

We describe ReorientExpress, a method to perform reference-free orientation of transcriptomic long sequencing reads. ReorientExpress uses deep learning to correctly predict the orientation of the majority of reads, and in particular when trained on a closely related species or in combination with read clustering. ReorientExpress enables long-read transcriptomics in non-model organisms and samples without a genome reference without using additional technologies and is available at https://github.com/comprna/reorientexpress

Background: COVID-19 is caused by SARS-CoV-2 infection and has reached pandemic proportions. Since then, several clinical characteristics have been associated with poor outcomes. This study aimed to describe the morbidity profile of COVID-19 deaths in Portugal. Methods: A study was performed including deaths certificated in Portugal with "COVID-19" (ICD-10: U07.1 or U07.2) coded as the underlying cause of death from the National e-Death Certificates Information System between 16 March and 31 December 2020. Comorbidities were derived from ICD-10 codes using the Charlson and Elixhauser indexes. The resident Portuguese population estimates for 2020 were used. Results: The study included 6701 deaths (death rate: 65.1 deaths/100,000 inhabitants), predominantly males (72.1). The male-to-female mortality ratio was 1.1. The male-to-female mortality rate ratio was 1.2; however, within age groups, it varied 5.0-11.4-fold. COVID-19 deaths in Portugal during 2020 occurred mainly in individuals aged 80 years or older, predominantly in public healthcare institutions. Uncomplicated hypertension, uncomplicated diabetes mellitus, congestive heart failure, renal failure, cardiac arrhythmias, dementia, and cerebrovascular disease were observed among COVID-19 deceased patients, with prevalences higher than 10%. A high prevalence of zero morbidities was registered using both the Elixhauser and Charlson comorbidities lists (above 40.2%). Nevertheless, high multimorbidity was also identified at the time of COVID-19 death (about 36.5%). Higher multimorbidity levels were observed in men, increasing with age up to 80 years old. Zero-morbidity prevalence and high multimorbidity prevalences varied throughout the year 2020, seemingly more elevated in the mortality waves' peaks, suggesting variation according to the degree of disease incidence at a given period. Conclusions: This study provides detailed sociodemographic and clinical information on all certificated deaths from COVID-19 in Portugal during 2020, showing complex and extreme levels of morbidity (zero-morbidity vs. high multimorbidity) dynamics during the first year of the pandemic in Portugal.

Glutaredoxin, Grx, is a small protein containing an active site cysteine pair and was discovered in 1976 by Arne Holmgren. The Grx system, comprised of Grx, glutathione, glutathione reductase, and NADPH, was first described as an electron donor for Ribonucleotide Reductase but, from the first discovery in E.coli, the Grx family has impressively grown, particularly in the last two decades. Several isoforms have been described in different organisms (from bacteria to humans) and with different functions. The unique characteristic of Grxs is their ability to catalyse glutathione-dependent redox regulation via glutathionylation, the conjugation of glutathione to a substrate, and its reverse reaction, deglutathionylation. Grxs have also recently been enrolled in iron sulphur cluster formation. These functions have been implied in various physiological and pathological conditions, from immune defense to neurodegeneration and cancer development thus making Grx a possible drug target. This review aims to give an overview on Grxs, starting by a phylogenetic analysis of vertebrate Grxs, followed by an analysis of the mechanisms of action, the specific characteristics of the different human isoforms and a discussion on aspects related to human physiology and diseases.

Bioactive small molecules isolated from animals, plants, fungi and bacteria, including natural antimicrobial peptides, have shown great therapeutic potential worldwide. Among these peptides, snake venom cathelicidins are being widely exploited, because the variation in the composition of the venom reflects a range of biological activities that may be of biotechnological interest. Cathelicidins are short, cationic, and amphipathic molecules. They play an important role in host defense against microbial infections. We are currently facing a strong limitation on pharmacological interventions for infection control, which has become increasingly complex due to the lack of effective therapeutic options. In this review, we will focus on natural snake venom cathelicidins as promising candidates for the development of new antibacterial agents to fight antibiotic-resistant bacteria. We will highlight their antibacterial and antibiofilm activities, mechanism of action, and modulation of the innate immune response.

Showcasing texts by Portuguese and Luso-Brazilian authors, this volume demonstrates the wealth of the political thought of early modern Portugal and its empire. Gathering together important texts on social order, government, and politics by authors who made a significant contribution to the development of early modern Portugal, it demonstrates that Portugal was the setting for vibrant political debate, often shaped by, and emerging in response to, very particular assumptions, circumstances, and concerns. Combining a chronological approach with in-depth thematic sections, the book explores how some controversies that took place in Portugal centred on themes similar to those in other European countries, while others were linked to the specific nature and history of the Portuguese monarchy and its interactions with other polities. It thus offers an overview of the main debates on politics and government and contributes to a more nuanced understanding of the multifaceted history of European political ideas.

Purpose: To study radial peripapillary capillary (RPC) density in the early stages of diabetic retinopathy (DR), using optical coherence tomography angiography. Methods: A cross-sectional evaluation of RPCs was performed using optical coherence tomography angiography (Avanti RTVue-XR 100, Optovue Inc, Fremont, CA). Annular RPC density was the primary outcome. Global density and retinal nerve fiber layer thickness were secondary outcomes. Diabetic eyes were divided into three groups: no DR, mild nonproliferative DR (mild NPDR), and moderate NPDR. Multilevel mixed-effects univariate and multivariate linear regression models were used. Results: We included 155 eyes (n = 42 control; n = 27 no DR; n = 28 mild NPDR; and n = 58 moderate NPDR) from 86 subjects (mean [SD] age 63.39 [10.70] years; 46.45% male). When compared with controls, a significant decrease in annular RPC density was found in all groups of diabetic eyes on multivariate analysis (no DR: β = -2.95, P < 0.001; mild NPDR: β = -1.76, P = 0.017; and moderate NPDR: β = -2.82, P < 0.001). We also detected a significant decrease in retinal nerve fiber layer thickness in diabetic eyes (even in the no DR group). Furthermore, in diabetic eyes, annular RPC density and retinal nerve fiber layer thickness correlated significantly (R = 0.4874, P < 0.001). Conclusion: Peripapillary neurovascular changes occur early in the course of DR. Their significance in the progression of DR warrants further research.

The bacterium Helicobacter pylori colonize the stomach in approximately half of the world’s population. Infection with this bacterium is associated with gastritis, peptic ulcer, adenocarcinoma, and gastric mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma. Besides being a pathogen with worldwide prevalence, H. pylori show increasingly high antibiotic resistance rates, making the development of new therapeutic strategies against this bacterium challenging. Furthermore, H. pylori is a genetically diverse bacterium, which may be influenced by the presence of mobile genomic elements, including prophages. In this review, we analyze these issues and summarize various reports and findings related to phages and H. pylori, discussing the relationship between the presence of these elements and the genomic diversity, virulence, and fitness of this bacterium. We also analyze the state of the knowledge on the potential utility of bacteriophages as a therapeutic strategy for H. pylori.

The aim of this case-control study was to evaluate whether 47 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in steroid hormone-related genes are associated with the risk of RA and anti-TNF drug response. We conducted a case-control study in 3 European populations including 2936 RA patients and 2197 healthy controls. Of those, a total of 1985 RA patients were treated with anti-TNF blockers. The association of potentially interesting markers in the discovery population was validated through meta-analysis with data from DREAM and DANBIO registries. Although none of the selected variants had a relevant role in modulating RA risk, the meta-analysis of the linear regression data with those from the DREAM and DANBIO registries showed a significant correlation of the CYP3A4rs11773597 and CYP2C9rs1799853 variants with changes in DAS28 after the administration of anti-TNF drugs (P = 0.00074 and P = 0.006, respectively). An overall haplotype analysis also showed that the ESR2GGG haplotype significantly associated with a reduced chance of having poor response to anti-TNF drugs (P = 0.0009). Finally, a ROC curve analysis confirmed that a model built with eight steroid hormone-related variants significantly improved the ability to predict drug response compared with the reference model including demographic and clinical variables (AUC = 0.633 vs. AUC = 0.556; PLR_test = 1.52 × 10-6). These data together with those reporting that the CYP3A4 and ESR2 SNPs correlate with the expression of TRIM4 and ESR2 mRNAs in PBMCs (ranging from P = 1.98 × 10-6 to P = 2.0 × 10-35), and that the CYP2C9rs1799853 SNP modulates the efficiency of multiple drugs, suggest that steroid hormone-related genes may have a role in determining the response to anti-TNF drugs.KEY POINTS• Polymorphisms within the CYP3A4 and CYP2C9 loci correlate with changes in DAS28 after treatment with anti-TNF drugs.• A haplotype including eQTL SNPs within the ESR2 gene associates with better response to anti-TNF drugs.• A genetic model built with eight steroid hormone-related variants significantly improved the ability to predict drug response.

The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) poses innumerous challenges, like understanding what triggered the emergence of this new human virus, how this RNA virus is evolving or how the variability of viral genome may impact the primary structure of proteins that are targets for vaccine. We analyzed 19471 SARS-CoV-2 genomes available at the GISAID database from all over the world and 3335 genomes of other Coronoviridae family members available at GenBank, collecting SARS-CoV-2 high-quality genomes and distinct Coronoviridae family genomes. Additionally, we analyzed 199,984 spike glycoprotein sequences. Here, we identify a SARS-CoV-2 emerging cluster containing 13 closely related genomes isolated from bat and pangolin that showed evidence of recombination, which may have contributed to the emergence of SARS-CoV-2. The analyzed SARS-CoV-2 genomes presented 9632 single nucleotide variants (SNVs) corresponding to a variant density of 0.3 over the genome, and a clear geographic distribution. SNVs are unevenly distributed throughout the genome and hotspots for mutations were found for the spike gene and ORF 1ab. We describe a set of predicted spike protein epitopes whose variability is negligible. Additionally, all predicted epitopes for the structural E, M and N proteins are highly conserved. The amino acid changes present in the spike glycoprotein of variables of concern (VOCs) comprise between 3.4% and 20.7% of the predicted epitopes of this protein. These results favors the continuous efficacy of the available vaccines targeting the spike protein, and other structural proteins. Multiple epitopes vaccines should sustain vaccine efficacy since at least some of the epitopes present in variability regions of VOCs are conserved and thus recognizable by antibodies.

Klebsiella pneumoniae is an increasing threat to public health and represents one of the most concerning pathogens involved in life-threatening infections. The resistant and virulence determinants are coded by mobile genetic elements which can easily spread between bacteria populations and co-evolve with its genomic host. In this study, we present the full genomic sequences, insertion sites and phylogenetic analysis of 150 prophages found in 40 K. pneumoniae clinical isolates obtained from an outbreak in a Portuguese hospital. All strains harbored at least one prophage and we identified 104 intact prophages (69.3%). The prophage size ranges from 29.7 to 50.6 kbp, coding between 32 and 78 putative genes. The prophage GC content is 51.2%, lower than the average GC content of 57.1% in K. pneumoniae. Complete prophages were classified into three families in the order Caudolovirales: Myoviridae (59.6%), Siphoviridae (38.5%) and Podoviridae (1.9%). In addition, an alignment and phylogenetic analysis revealed nine distinct clusters. Evidence of recombination was detected within the genome of some prophages but, in most cases, proteins involved in viral structure, transcription, replication and regulation (lysogenic/lysis) were maintained. These results support the knowledge that prophages are diverse and widely disseminated in K. pneumoniae genomes, contributing to the evolution of this species and conferring additional phenotypes. Moreover, we identified K. pneumoniae prophages in a set of endolysin genes, which were found to code for proteins with lysozyme activity, cleaving the β-1,4 linkages between N-acetylmuramic acid and N-acetyl-D-glucosamine residues in the peptidoglycan network and thus representing genes with the potential for lysin phage therapy.

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Campylobacter coli and C. jejuni, the causing agents of campylobacteriosis, are described to be undergoing introgression events, i.e., the transference of genetic material between different species, with some isolates sharing almost a quarter of its genome. The participation of phages in introgression events and consequent impact on host ecology and evolution remain elusive. Three distinct prophages, named C. jejuni integrated elements 1, 2, and 4 (CJIE1, CJIE2, and CJIE4), are described in C. jejuni. Here, we identified two unreported prophages, Campylobacter coli integrated elements 1 and 2 (CCIE1 and CCIE2 prophages), which are C. coli homologues of CJIE1 and CJIE2, respectively. No induction was achieved for both prophages. Conversely, induction assays on CJIE1 and CJIE2 point towards the inducibility of these prophages. CCIE2-, CJIE1-, and CJIE4-like prophages were identified in a Campylobacter spp. population of 840 genomes, and phylogenetic analysis revealed clustering in three major groups: CJIE1-CCIE1, CJIE2-CCIE2, and CJIE4, clearly segregating prophages from C. jejuni and C. coli, but not from human- and nonhuman-derived isolates, corroborating the flowing between animals and humans in the agricultural context. Punctual bacteriophage host-jumps were observed in the context of C. jejuni and C. coli, and although random chance cannot be fully discarded, these observations seem to implicate prophages in evolutionary introgression events that are modulating the hybridization of C. jejuni and C. coli species.