Repositório RCAAP

Brucelose em Portugal : a propósito de um caso clínico atual

As complicações associadas à brucelose são situações clínicas complexas. A sua gravidade obriga a medidas preventivas gerais e exige um elevado nível de suspeição perante sintomas e sinais inespecíficos. Apresenta-se o caso de um homem de 27 anos com recorrência de infeção por Brucella e consequente espondilodiscite dorsal e sacroileíte. O quadro clínico culminou no seu internamento por 26 dias numa Unidade de Infecciologia de um Hospital Central, para posterior estudo imagiológico e tratamento. Partindo deste caso clínico, far-se-á uma explanação do tema, com particular relevo para a etiologia, epidemiologia, clínica, diagnóstico, tratamento e prevenção.

Ano

2021

Creators

Gomes, Aléxia Carla Abreu

Probing the aurone scaffold against Plasmodium falciparum: design, synthesis and antimalarial activity

A library comprising 44 diversely substituted aurones derivatives was synthesized by straightforward aldol condensation reactions of benzofuranones and the appropriately substituted benzaldehydes. Microwave enhanced synthesis using palladium catalyzed protocols was introduced as a powerful strategy for extending the chemical space around the aurone scaffold. Additionally, Mannich-base derivatives, containing a 7-aminomethyl-6-hydroxy substitution pattern at ring A, were also prepared. Screening against the chloroquine resistant Plasmodium falciparum W2 strain identified novel aurones with IC50 values in the low micromolar range. The most potent compounds contained a basic moiety, with the ability to accumulate in acidic digestive vacuole of the malaria parasite. However, none of those aurones revealed significant activity against hemozoin formation and falcipain-2, two validated targets expressed during the blood stage of P. falciparum infection and functional in digestive vacuole of the parasite. Overall, this study highlight (i) the usefulness of aurones as platforms for synthetic procedures using palladium catalyzed protocols to rapidly deliver lead compounds for further optimization and (ii) the potential of novel aurone derivatives as promising antimalarial compounds.

Ano

2014

Creators

Carrasco, Marta Newton, Ana Gonçalves, Lídia Góis, Ana Machado, Marta Gut, Jiri Nogueira, Fátima Hanscheid, Thomas Guedes, Rita C. dos Santos, Daniel J.V.A. Rosenthal, Philip J. Moreira, Rui

Overexpression of Adenosine A2A receptors in rats: effects on depression, locomotion, and anxiety

Adenosine A2A receptors (A2AR) are a sub-type of receptors enriched in basal ganglia, activated by the neuromodulator adenosine, which interact with dopamine D2 receptors. Although this reciprocal antagonistic interaction is well-established in motor function, the outcome in dopamine-related behaviors remains uncertain, in particular in depression and anxiety. We have demonstrated an upsurge of A2AR associated to aging and chronic stress. Furthermore, Alzheimer's disease patients present A2AR accumulation in cortical areas together with depressive signs. We now tested the impact of overexpressing A2AR in forebrain neurons on dopamine-related behavior, namely depression. Adult male rats overexpressing human A2AR under the control of CaMKII promoter [Tg(CaMKII-hA2AR)] and aged-matched wild-types (WT) of the same strain (Sprague-Dawley) were studied. The forced swimming test (FST), sucrose preference test (SPT), and the open-field test (OFT) were performed to evaluate behavioral despair, anhedonia, locomotion, and anxiety. Tg(CaMKII-hA2AR) animals spent more time floating and less time swimming in the FST and presented a decreased sucrose preference at 48 h in the SPT. They also covered higher distances in the OFT and spent more time in the central zone than the WT. The results indicate that Tg(CaMKII-hA2AR) rats exhibit depressive-like behavior, hyperlocomotion, and altered exploratory behavior. This A2AR overexpression may explain the depressive signs found in aging, chronic stress, and Alzheimer's disease.

Ano

2014

Creators

Coelho, Joana E Alves, Pedro Nascimento Canas, Paula M. Valadas, Jorge S. Shmidt, Tatiana Batalha, Vânia Ferreira, Diana G. Ribeiro, Joaquim A. Bader, Michael Cunha, Rodrigo A. Simões Do Couto, Frederico Lopes, Luisa V.

Copy-number variation of the neuronal glucose transporter gene SLC2A3 and age of onset in Huntington's disease

Huntington's disease (HD) is a devastating neurodegenerative disorder which is inherited in an autosomal dominant manner. HD is caused by a trinucleotide CAG repeat expansion that encodes a polyglutamine stretch in the huntingtin (HTT) protein. Mutant HTT expression leads to a myriad of cellular dysfunctions culminating in neuronal loss and consequent motor, cognitive and psychiatric disturbances in HD patients. The length of the CAG repeat is inversely correlated with age of onset (AO) in HD patients, while environmental and genetic factors can further modulate this parameter. Here, we explored whether the recently described copy-number variation (CNV) of the gene SLC2A3-which encodes the neuronal glucose transporter GLUT3-could modulate AO in HD. Strikingly, we found that increased dosage of SLC2A3 delayed AO in an HD cohort of 987 individuals, and that this correlated with increased levels of GLUT3 in HD patient cells. To our knowledge this is the first time that CNV of a candidate gene has been found to modulate HD pathogenesis. Furthermore, we found that increasing dosage of Glut1-the Drosophila melanogaster homologue of this glucose transporter-ameliorated HD-relevant phenotypes in fruit flies, including neurodegeneration and life expectancy. As alterations in glucose metabolism have been implicated in HD pathogenesis, this study may have important therapeutic relevance for HD.

Ano

2014

Creators

Vittori, Angelica Breda, Carlo Repici, Mariaelena Orth, Michael Roos, Raymund A. C. Outeiro, Tiago Giorgini, Flaviano Hollox, Edward J.

ATP modulates acute inflammation In Vivo through Dual Oxidase 1–derived H2O2 production and NF-κB activation

Dual oxidase 1 (Duox1) is the NADPH oxidase responsible for the H2O2 gradient formed in tissues after injury to trigger the early recruitment of leukocytes. Little is known about the signals that modulate H2O2 release from DUOX1 and whether the H2O2 gradient can orchestrate the inflammatory response in vivo. In this study, we report on a dominant-negative form of zebrafish Duox1 that is able to inhibit endogenous Duox1 activity, H2O2 release and leukocyte recruitment after tissue injury, with none of the side effects associated with morpholino-mediated Duox1 knockdown. Using this specific tool, we found that ATP release following tissue injury activates purinergic P2Y receptors, and modulates Duox1 activity through phospholipase C (PLC) and intracellular calcium signaling in vivo. Furthermore, Duox1-derived H2O2 is able to trigger the NF-κB inflammatory signaling pathway. These data reveal that extracellular ATP acting as an early danger signal is responsible for the activation of Duox1 via a P2YR/PLC/Ca(2+) signaling pathway and the production of H2O2, which, in turn, is able to modulate in vivo not only the early recruitment of leukocytes to the wound but also the inflammatory response through activation of the NF-κB signaling pathway.

Ano

2014

Creators

De Oliveira, Sofia López-Muñoz, Azucena Candel, Sergio Pelegrín, Pablo Calado, Ângelo Mulero, Victoriano

Defining immune engagement thresholds for in vivo control of virus-driven lymphoproliferation

Persistent infections are subject to constant surveillance by CD8+ cytotoxic T cells (CTL). Their control should therefore depend on MHC class I-restricted epitope presentation. Many epitopes are described for γ-herpesviruses and form a basis for prospective immunotherapies and vaccines. However the quantitative requirements of in vivo immune control for epitope presentation and recognition remain poorly defined. We used Murid Herpesvirus-4 (MuHV-4) to determine for a latently expressed viral epitope how MHC class-I binding and CTL functional avidity impact on host colonization. Tracking MuHV-4 recombinants that differed only in epitope presentation, we found little latitude for sub-optimal MHC class I binding before immune control failed. By contrast, control remained effective across a wide range of T cell functional avidities. Thus, we could define critical engagement thresholds for the in vivo immune control of virus-driven B cell proliferation.

Ano

2014

Creators

Godinho-Silva, Cristina Marques, Sofia Fontinha, Diana Veiga-Fernandes, Henrique Stevenson, Philip G. Simas, J Pedro

Colecção de incunábulos e impressos raros dos séculos XV-XVI' na Biblioteca Digital da Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa. Comentário ao manuscrito que serviu de capa a 'Sanctiones Apostolicae Extravagantes…', Lisboa, António Gonçalves, 1570 - Res 261"

Análise, solicitada pelo Arquivo Histórico da Biblioteca da Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa, de documento manuscrito em pergaminho que serviu de capa a "Sanctiones Apostolicae Extravagantes, et Regvlae Cancellariae Sanctissimi Domini nostri Domini Pij diuina prouidentia Papae Quinti, & quaedam aliae Sanctiones aliorum summorum Pontificum admodum vtiles", livro em latim impresso em Lisboa em 1570 na oficina de António Gonçalves (Res 261). Foi identificado, mediante análise paleográfica e histórica, como fragmento dos inícios do séc. XVI de um processo judicial ocorrido na Bretanha com registos dos finais do s. XV. Sobre o seu conteúdo, circuito e utilização, propõem-se pistas de investigação. O comentário resumido constituiu parte integrante da "Primeira Mostra do Livro Antigo” / Fev. – Mar. 2008, Lisboa, Galeria de exposições da Biblioteca da FLUL, exposição de algumas das obras mais emblemáticas da colecção de incunábulos e impressos raros dos séculos XV-XVI da FLUL. Encontra-se publicado online em http://ww3.fl.ul.pt/biblioteca/biblioteca_digital/docs/res261.pdf O mesmo texto de comentário mas na sua versão integral, mais desenvolvida, anotada e com referências bibliográficas, foi publicado em Clio. Revista do Centro de História da Universidade de Lisboa, n. série, 18/19 (2008/09), pp. 535-543.

Ano

2009

Creators

Cruz, Maria Leonor García da

Epithelial urinary bladder tumors from cows with enzootic hematuria: structural and cell cycle-related protein expression

Thirty-nine epithelial bladder tumor samples from 37 animals affected with bovine enzootic hematuria (BEH) were selected for immunohistochemical studies. The expression of structural proteins such as uroplakin III (UPIII) and cytokeratin 7 (CK7) and the cell cycle-related proteins cyclin D1 and p53 were evaluated in urothelial papillomas and carcinomas. Loss of UPIII and CK7 expression was seen in both high-grade and high-stage urothelial carcinomas (P < .001 and P < .02). Cyclin D1 expression showed no statistically significant association with grade or stage. In contrast, p53 immunoreactivity was positive in high-grade and high-stage carcinomas (P < .05 and P < .01), confirming its association with the highest malignant behavior of the bladder tumors in BEH.

Ano

2013

Creators

Cota, J. B. Carvalho, Tânia Pinto, C. Peleteiro, Maria C.

Maternal separation impairs long term-potentiation in CA1-CA3 synapses and hippocampal-dependent memory in old rats

Exposure to chronic stress during the neonatal period is known to induce permanent long-term changes in the central nervous system and hipothalamic-pituitary-adrenal axis reactivity that are associated with increased levels of depression, anxiety, and cognitive impairments. In rodents, a validated model of early life stress is the maternal separation (MS) paradigm, which has been shown to have long-term consequences for the pups that span to adulthood. We hypothesized that the early life stress-associated effects could be exacerbated with aging, because it is often accompanied by cognitive decline. Using a MS model in which rat pups were separated from their mothers for 3 hours daily, during postnatal days 2-14, we evaluated the long-term functional consequences to aged animals (70-week-old), by measuring synaptic plasticity and cognitive performance. The baseline behavioral deficits of aged control rats were further exacerbated in MS animals, indicating that early-life stress induces sustained changes in anxiety-like behavior and hippocampal-dependent memory that are maintained much later in life. We then investigated whether these differences are linked to impaired function of hippocampal neurons by recording hippocampal long-term potentiation from Schaffer collaterals/CA1 synapses. The magnitude of the hippocampal long-term potentiation induced by high-frequency stimulation was significantly lower in aged MS animals than in age-matched controls. These results substantiate the hypothesis that the neuronal and endocrine alterations induced by early-life stress are long lasting, and are able to exacerbate the mild age-associated deficits.

Ano

2014

Creators

Sousa, Vasco C. Vital, Joana Costenla, Ana Rita Batalha, Vânia Sebastião, Ana M Ribeiro, Joaquim A. Lopes, Luisa V.

Validação e implementação de um método de determinação de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (PAHs) em sedimentos marinhos

A poluição é algo que afeta não só habitats como os seres vivos que neles vivem. O meio marinho acaba inevitavelmente, de forma direta e indireta, por ser afetado pela poluição que nos rodeia, sendo cada vez mais importante desenvolver formas de monitorizar e minimizar as fontes de poluição. Os hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (PAH) são compostos orgânicos considerados poluentes face às propriedades carcinogénicas e mutagénicas que possuem. Estes compostos possuem ainda a capacidade para se depositarem e acumularem em sedimentos marinhos, pelo que a determinação da concentração dos PAH neles presentes é fundamental, para que seja possível agir em conformidade com os resultados obtidos. Face às características destes compostos orgânicos uma técnica usada para a sua análise é a cromatografia em fase gasosa acoplada à espetrometria de massa (GC-MS). Esta técnica permite identificar e quantificar compostos voláteis e semi-voláteis utilizando métodos desenvolvidos para a análise destes hidrocarbonetos, devendo esses métodos serem validados antes de serem implementados. Na primeira parte deste trabalho foi realizada a otimização das condições de aquisição de dados cromatográficos, sendo realizados estudos alterando condições de um GC-MS, nomeadamente a temperatura de injeção e da fonte iónica, os modos de injeção, o fluxo do gás de arraste e outros parâmetros inerentes ao tipo de injetor usado. A alteração destes parâmetros pressupôs a otimização da resolução, eficiência e sensibilidade dos picos cromatográficos, para ser possível identificar os analitos presentes nas amostras. Numa segunda parte, foi realizada a validação de um método para determinação de PAH em sedimentos marinhos, sendo avaliados os parâmetros: sensibilidade, gama de trabalho, linearidade, limiares analíticos, veracidade, precisão, incerteza e validação do software. Os dados para esta avaliação foram obtidos através da análise de amostras de sedimentos marinhos, que possuíam não só os PAH de interesse como também possíveis interferentes, tornando assim os dados obtidos o mais próximo possível da realidade. Inerente à validação do método, foram estabelecidos critérios para controlo interno da qualidade, nomeadamente para controlo de brancos, amostras duplicadas, amostras fortificadas, veracidade e linearidade. Estes critérios foram estabelecidos para que fosse possível garantir a qualidade dos ensaios e resultados reportados aquando da aplicação em rotina do método validado. Numa última etapa foram analisadas amostras reais para ser possível implementar o método. Verificou-se a presença de alguns PAH em níveis quantificáveis em duas das quatro amostras analisadas, mas que não excediam o limite máximo considerado de referência.

Ano

2021

Creators

André, Joana Filipa Gameiro

Breast Cancer : automatic detection and risk analysis through machine learning algorithms, using mammograms

Com 2.3 milhões de casos diagnosticados em todo o Mundo, durante o ano de 2020, o cancro da mama tornou-se aquele com maior incidência, nesse mesmo ano, considerando ambos os sexos. Anualmente, em Portugal, são diagnosticados aproximadamente sete mil (7000) novos casos de cancro da mama, com mil oitocentas (1800) mulheres a morrerem, todos os anos, devido a esta doença - indicando uma taxa de mortalidade de aproximadamente 5 mulheres por dia. A maior parte dos diagnósticos de cancro da mama ocorrem ao nível de programas de rastreio, que utilizam mamografia. Esta técnica de imagem apresenta alguns problemas: o facto de ser uma imagem a duas dimensões leva a que haja sobreposição de tecidos, o que pode mascarar a presença de tumores; e a fraca sensibilidade a mamas mais densas, sendo estas caraterísticas de mulheres com risco de cancro da mama mais elevado. Como estes dois problemas dificultam a leitura das mamografias, grande parte deste trabalhou focou-se na verificação do desempenho de métodos computacionais na tarefa de classificar mamografias em duas classes: cancro e não-cancro. No que diz respeito à classe “não cancro” (N = 159), esta foi constituída por mamografias saudáveis (N=84), e por mamografias que continham lesões benignas (N=75). Já a classe “cancro” continha apenas mamografias com lesões malignas (N = 73). A discriminação entre estas duas classes foi feita com recurso a algoritmos de aprendizagem automática. Múltiplos classificadores foram otimizados e treinados (Ntreino=162, Nteste = 70), recorrendo a um conjunto de características previamente selecionado, que descreve a textura de toda a mamografia, em vez de apenas uma única Região de Interesse. Estas características de textura baseiam-se na procura de padrões: sequências de pixéis com a mesma intensidade, ou pares específicos de pixéis. O classificador que apresentou uma performance mais elevada foi um dos Support Vector Machine (SVM) treinados – AUC= 0.875, o que indica um desempenho entre o bom e o excelente. A Percent Mammographic Density (%PD) é um importante fator de risco no que diz respeito ao desenvolvimento da doença, pelo que foi estudado se a sua adição ao set de features selecionado resultaria numa melhor performance dos classificadores. O classificador, treinado e otimizado utilizando as features de textura e os cálculos de %PD, com maior capacidade discriminativa foi um Linear Discriminant Analysis (LDA) – AUC = 0.875. Uma vez que a performance é igual à obtida com o classificador que utiliza apenas features de textura, conclui-se que a %PD parece não contribuir com informação relevante. Tal pode ocorrer porque as próprias características de textura já têm informação sobre a densidade da mama. De forma a estudar-se de que modo o desempenho destes métodos computacionais pode ser afetado por piores condições de aquisição de imagem, foi simulado ruído gaussiano, e adicionado ao set de imagens utilizado para testagem. Este ruído, adicionado a cada imagem com quatro magnitudes diferentes, resultou numa AUC de 0.765 para o valor mais baixo de ruído, e numa AUC de 0.5 para o valor de ruído mais elevado. Tais resultados indicam que, para níveis de ruído mais baixo, o classificador consegue, ainda assim, manter uma performance satisfatória – o que deixa de se verificar para valores mais elevados de ruído. Estudou-se, também, se a aplicação de técnicas de filtragem – com um filtro mediana – poderia ajudar a recuperar informação perdida aquando da adição de ruído. A aplicação do filtro a todas as imagens ruidosas resultou numa AUC de 0.754 para o valor mais elevado de ruído, atingindo assim um desempenho similar ao set de imagens menos ruidosas, antes do processo de filtragem (AUC=0.765). Este resultados parecem indicar que, na presença de más condições de aquisição, a aplicação de um filtro mediana pode ajudar a recuperar informação, conduzindo assim a um melhor desempenho dos métodos computacionais. No entanto, esta mesma conclusão parece não se verificar para valores de ruído mais baixo onde a AUC após filtragem acaba por ser mais reduzida. Tal resultado poderá indicar que, em situações onde o nível de ruído é mais baixo, a técnica de filtragem não só remove o ruído, como acaba também por, ela própria, remover informação ao nível da textura da imagem. De modo a verificar se mamas com diferentes densidades afetavam a performance do classificador, foram criados três sets de teste diferentes, cada um deles contendo imagens de mamas com a mesma densidade (1, 2, e 3). Os resultados obtidos indicam-nos que um aumento na densidade das mamas analisadas não resulta, necessariamente, numa diminuição da capacidade em discriminar as classes definidas (AUC = 0.864, AUC = 0.927, AUC= 0.905; para as classes 1, 2, e 3 respetivamente). A utilização da imagem integral para analisar de textura, e a utilização de imagens de datasets diferentes (com dimensões de imagem diferentes), poderiam introduzir um viés na classificação, especialmente no que diz respeito às diferentes áreas da mama. Para verificar isso mesmo, utilizando o coeficiente de correlação de Pearson, ρ = 0.3, verificou-se que a área da mama (e a percentagem de ocupação) tem uma fraca correlação com a classificação dada a cada imagem. A construção do classificador, para além de servir de base a todos os testes apresentados, serviu também o propósito de criar uma interface interativa, passível de ser utilizada como ficheiro executável, sem necessidade de instalação de nenhum software. Esta aplicação permite que o utilizador carregue imagens de mamografia, exclua background desnecessário para a análise da imagem, extraia features, teste o classificador construído e dê como output, no ecrã, a classe correspondente à imagem carregada. A análise de risco de desenvolvimento da doença foi conseguida através da análise visual da variação dos valores das features de textura ao longo dos anos para um pequeno set (N=11) de mulheres. Esta mesma análise permitiu descortinar aquilo que parece ser uma tendência apresentada apenas por mulheres doentes, na mamografia imediatamente anterior ao diagnóstico da doença. Todos os resultados obtidos são descritos profundamente ao longo deste documento, onde se faz, também, uma referência pormenorizada a todos os métodos utilizados para os obter. O resultado da classificação feita apenas com as features de textura encontra-se dentro dos valores referenciados no estado-da-arte, indicando que o uso de features de textura, por si só, demonstrou ser profícuo. Para além disso, tal resultado serve também de indicação que o recurso a toda a imagem de mamografia, sem o trabalho árduo de definição de uma Região de Interesse, poderá ser utilizado com relativa segurança. Os resultados provenientes da análise do efeito da densidade e da área da mama, dão também confiança no uso do classificador. A interface interativa que resultou desta primeira fase de trabalho tem, potencialmente, um diferenciado conjunto de aplicações: no campo médico, poderá servir de auxiliar de diagnóstico ao médico; já no campo da análise computacional, poderá servir para a definição da ground truth de potenciais datasets que não tenham legendas definidas. No que diz respeito à análise de risco, a utilização de um dataset de dimensões reduzidas permitiu, ainda assim, compreender que existem tendências nas variações das features ao longo dos anos, que são especificas de mulheres que desenvolveram a doença. Os resultados obtidos servem, então, de indicação que a continuação desta linha de trabalho, procurando avaliar/predizer o risco, deverá ser seguida, com recurso não só a datasets mais completos, como também a métodos computacionais de aprendizagem automática.

Ano

2022

Creators

Mendes, João Pedro Velhinho

Effects of hypoxia on coral photobiology and oxidative stress

O aquecimento e a desoxigenação dos oceanos, juntamente com o processo de acidificação, têm promovido impactos negativos nos organismos marinhos, forçando-os a alterar a sua distribuição e habitats, fenologia, dinâmica populacional e abundância. De acordo com a via de concentração representativa (RCP) 8.5, do Painel Intergovernamental para as Alterações Climáticas (IPCC), é previsto que as temperaturas globais aumentem 2,73 °C até ao final do século. Concomitantemente, este aquecimento poderá provocar um declínio entre 1,7% e 4% no conteúdo global de O2 oceânico. Actualmente existem mais de 500 locais costeiros com concentrações de oxigénio abaixo de 2 mg/l, com aumento estimado de 5,54% no número de ocorrências de eventos de hipóxia em áreas costeiras por ano. A concentração de O2 dissolvido de 2 mg/l é mais amplamente considerada como o limite de hipóxia para organismos marinhos. As áreas com baixos níveis de oxigénio nas zonas mesopelágicas são conhecidas como zonas de oxigénio mínimo (ZOMs) com alta actividade microbiana. Nessas áreas, as concentrações de O2 variam entre 0,2 a 2 mg/l e ocorrem em profundidades em torno de 100-1000 m por períodos mais longos que dependem da circulação de água e do fornecimento insuficiente de oxigénio. Os impactos antropogénicos contínuos nas áreas costeiras contribuem para o surgimento e expansão de “zonas mortas”. A extensa fertilização agrícola que atinge as zonas costeiras pelos rios é uma das principais causas para a redução de O2 nas zonas costeiras. Os corais são um grupo de invertebrados da classe Anthazoa (filo Cnidaria) cuja extensão geográfica apenas ocupa cerca de 1% da superfície global do mar, mas que desempenha um papel ecológico, económico e cultural fundamental tanto para a biodiversidade marinha como para a população humana. Efectivamente, os recifes de coral sustentam 10% da população global com seus bens e serviços ecossistémicos. O aquecimento dos oceanos e as ondas de calor marinhas, o escoamento agrícola e a intrusão de efluentes resultam em processos de eutrofização que são possivelmente os responsáveis pela perda de metade dos recifes de coral. Os corais começam a branquear com a expulsão das microalgas dinoflageladas simbióticas (do género Symbiodinium), também conhecidas como zooxantelas. Estas microalgas sustentam o seu hospedeiro através da fotossíntese e, por isso, a maioria dos corais ocupam habitats rasos com alta disponibilidade de luz. Em áreas com pouca disponibilidade diurna de luz, os corais podem também predar zooplâncton para obter os requisitos energéticos necessários. As espécies de corais possuem diferentes limites de hipóxia que estão associados à duração da exposição, temperatura e fase ontogenética. A produção de espécies reativas de oxigénio (ROS) é um dos resultados do branqueamento de corais entre outras respostas celulares, fisiológicas e moleculares. Os ROS induzem stress oxidativo ao holobionte levando à expulsão de simbiontes. O sistema de defesa antioxidante do hospedeiro contra os ROS envolve as reações enzimáticas. Essas estratégias são o processo de desintoxicação onde a superóxido dismutase (SOD) converte aniões superóxido em peróxido de hidrogénio, e outro processo enzimático onde também a catalase (CAT) transforma aniões. Quando o aumento da produção de ROS ultrapassa a sua capacidade de defesa antioxidante, os corais podem sofrer graves danos celulares, como a peroxidação lipídica, a deterioração do DNA e a oxidação de proteínas, que poderá levar à mortalidade pós-branqueamento. Nos recifes de coral, as concentrações diurnas de oxigénio dissolvido (OD) flutuam significativamente, com processos de respiração durante a noite e processos fotossintéticos durante o dia. A hipóxia durante a noite geralmente ocorre em zonas intermareais durante a maré baixa. A hipóxia noturna já foi registada no Mar Vermelho e nas costeiras das Ilhas Lizard e Heron, na Austrália. No entanto, os impactos das flutuações diurnas do oxigénio na fisiologia e fotoquímica dos corais são desconhecidos. O objetivo desta dissertação foi estudar os impactos de hipóxia noturna nos processos fisiológicos e fotobiológicos de um coral da ordem Scleractinia (Acropora spp.) O design experimental consistiu num tratamento de controle (normóxia) e um tratamento hipóxico durante a noite (<2 mgO2/l). Em ambos os tratamentos foram recolhidos dados de: i) sobrevivência, ii) parâmetros fotobiológicos (por exemplo, fluxo de energia de absorção, fluxo de energia de transporte de elétrons, a densidade do centro de reação II dentro do leito de clorofila da antena do fotossistema (PS) II), iii) concentrações de pigmentos (clorofila a, clorofila c2, feofitina a, β-caroteno, diadinoxantina, diatoxantina e peridinina) e estado de desepoxidação e iv) biomarcadores de stress oxidativo (por exemplo, danos no DNA, peroxidação lipídica e atividades de catalase e superóxido dismutase). No estudo, não foi observada mortalidade em ambos os tratamentos, e os fragmentos de coral também não exibiram quaisquer alterações visuais (e físicas) associadas a processos de branqueamento. A maioria dos parâmetros fotobiológicos também não sofreu alterações significativas entre tratamentos. Paralelamente, não foram observadas diferenças significativas, entre os tratamentos, para os pigmentos fotossintéticos. No entanto, a hipóxia induziu uma diminuição significativa no estado de des-epoxidação do coral e no aumento dos danos no DNA. Não foram também detectadas alterações significativas na peroxidação lipídica e nas atividades CAT e SOD. Assim sendo, os resultados indicam que o coral Acropora spp. parece exibir resiliência à hipóxia nocturna. Pode também haver uma forte influência genética na tolerância de Symbiodinium que suporta a estratégia de defesa antioxidante e a tolerância à desoxigenação subjacente. Deste modo, as ROS não conseguiram provocar nenhum mecanismo de morte celular (apoptose ou necrose), onde os antioxidantes não enzimáticos eliminam as ROS antes que as exposições às condições experimentais tenham tido impactos prejudiciais. Além disso, as características genotípicas com uma elevada quantidade de simbiontes poderiam explicar uma diminuição na eficiência do fotossistema II. Porém não houve diminuição no conteúdo de pigmentos celular influenciado pela hipóxia noturna. Por outro lado, a degradação das fitas de DNA provocada pelo dano oxidativo indica que o stress abiótico supera os mecanismos de defesa que reparam e restauram os danos celulares e do DNA. Poderá também haver a mudança de autotrofia para heterotrofia ocorrendo como uma aclimatação e resistência do coral e dos simbiontes às perturbações ambientais. Em condições extremas, o coral parece mudar a sua estratégia nutricional, o que pode ser fundamental para a relação simbiótica e, eventualmente, a sobrevivência dos corais e dos seus simbiontes. Para compreender os mecanismos antioxidantes e os processos de respostas ao stress oxidativo, são imporantes e necessárias novas investigações acerca da plasticidade fenotípica e da genómica evolutiva. O branqueamento de corais e o seu desaparecimento em massa são indicadores de perturbações ambientais extremas, para as quais muitas das espécies não conseguem desenvolver a tolerância necessária. A perda de biodiversidade costeira e de recife é impulsionada pelos efeitos mútuos do aquecimento e da desoxigenação do oceano. Portanto, as alterações climáticas são responsáveis por eventos massivos de branqueamento de corais. Paralelamente à desoxigenação e ao aquecimento, a acidificação e eutrofização dos oceanos têm também impactos negativos no biota marinho, especialmente a nível da quebra de mutualismos e loops de feedback positivo no ambiente. Isso é fundamental para fortalecer as percepções da dinâmica global do oxigénio do oceano e aumentar a capacidade de monitorizar áreas geograficamente não descobertas e limitadas, especialmente devido aos eventos recorrentes de branqueamento de corais mais frequentes. No entanto, ainda existe uma grande lacuna no conhecimento sobre os efeitos da hipóxia em escalas temporais maiores, algo crucial na medida em que o processo crónico de desoxigenação e o estabelecimento recorrente de zonas mortas costeiras são espectáveis no oceano do futuro.

Ano

2021

Creators

Deleja, Mark

Desenvolvimento de Aplicação Móvel de Gestão de Encomendas de Equipamento Médico

Uma das áreas tecnológicas que mais se desenvolveu nos últimos anos foi a das aplicações móveis (mobile), criando uma tendência que revolucionou por completo o dia – a - dia da grande maioria das pessoas através do uso de telefones inteligentes (smartphones). Transformou o conceito associado ao telemóvel, que passou de um dispositivo que apenas efetuava chamadas e mensagens, para algo que permite jogar, navegar na Internet, abrir e descarregar documentos e efetuar imensas outras funcionalidades, que até então eram exclusivas dos computadores. O presente projeto baseou-se no desenvolvimento de uma aplicação de gestão de encomendas de equipamento medico para a plataforma iOS. Esta tem como principal função agilizar e otimizar o trabalho dos trabalhadores da empresa cliente permitindo consultar informação relevante e efetuar pedidos médicos, tudo numa só aplicação. Permite assim substituir o método anterior de comunicação e logística das operações dos utilizadores, que era, ate então, maioritariamente realizado por email. A aplicação está atualmente na versão 1.0 e o seu lançamento está previsto para Outubro de 2021.

Ano

2021

Creators

Mena, André Gonçalves

Normative model for the diagnosis of neuropsychiatric disorders using deep learning methods

The diagnosis of neuropsychiatric disorders (NPDs) is still exclusively dependent on the analysis of the signs and symptoms of the patients since there are no biomarkers useful for clinical practice. Considering that several signs and symptoms are shared among different NPDs, the diagnosis is sometimes incorrect. Therefore, therapeutic approaches do not always succeed, which has an impact on the quality of life of neuropsychiatric patients. Furthermore, NPDs have a global economic and demographic impact. For this reason, technological solutions, such as DL, have been researched for the optimization of diagnosis, in the non-technological field of neuropsychiatry. However, the most promising studies on the diagnosis of NPDs with deep learning (DL) are based on binary classification, which may not be the most adequate approach to deal with the continuous spectrum of NPDs. Here, a DL-based normative model was developed to investigate functional connectivity abnormalities, that may contribute to the development of a novel diagnostic procedure. This method is here used to evaluate how patients deviate from a normal pattern learned by a group of healthy people. To create and evaluate the normative model, resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) data from three different databases were used. In order to maximise the balance between the amount and the quality of the data, conditions were defined to restrict the variability of the scan parameters. Subsequently, rs-fMRI data were trimmed to the lowest number of time points presented in the sample (150). Then, standard preprocessing steps were performed, including removal of the first 4 volumes of functional data, motion correction, spatial smoothing, and high pass filtering. Single-session independent component analysis (ICA) was run, and the FSL-FIX tool was used to clean noise and artefacts. The functional images were then registered to the T1-weighted brain extracted structural images, and finally to the Montreal Neurosciences Institute 152 standard space. Dual regression was applied using fourteen resting-state functional brain networks (FBN) previously identified in the literature. The Pearson’s correlation coefficient between the extracted blood oxygen level-dependent (BOLD) time series of each FBN was calculated, and a 14x14 network connectivity matrix was generated for each subject. The second part of the project consisted of the creation and optimization of a normative model. The normative model consisted of an autoencoder (AE) with three hidden layers. The AE was trained only in healthy subjects and was tested in both healthy subjects and neuropsychiatric patients, including schizophrenia (SCZ), bipolar disorder (BD), and attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) patients. The hypothesis was that the model would “fail” on reconstructing data from neuropsychiatric patients. To evaluate the model performance, graph theory metrics were applied. Besides, the mean squared error was calculated for each feature (correlation between pairs of FBN) to evaluate which regions were worse reconstructed for each group of subjects. The pipeline for NPDs was tested for a SCZ case study, with the addition of a clustering algorithm. The results of this dissertation revealed that the proposed pipeline was able to identify patterns of functional connectivity abnormality that characterize different NPDs. Moreover, the results found for the two SCZ groups of patients were similar, which demonstrated that the normative model here presented was also generalizable. However, the group-level differences did not withstand individual-level analysis, implying that NPDs are highly heterogeneous. These findings support the idea that a precision-based medical approach, focusing on the specific functional network changes of individual patients, may be more beneficial than the traditional group-based diagnostic classification. A personalised diagnosis would allow for personalised therapy, improving the quality of life of neuropsychiatric patients.

Ano

2022

Creators

Saraiva, Duarte Filipe Oliveira

Cataract surgery and functional vision : the challenge of a more objective approach in pre-operative evaluation

Com o envelhecimento da população, a necessidade da cirurgia da catarata está aumentando. Em geral, é considerada uma cirurgia de elevado sucesso e com ótima relação custo-benefício. A tecnologia de lentes intraoculares (LIOs) está avançando à medida que os objetivos da cirurgia de catarata estão se tornando mais exigentes. Vivemos numa era digital e os estilos de vida dos pacientes são diferentes dos de há 15 anos atrás. A idade da reforma é mais avançada do que antes, o que significa mais horas de trabalho. Além disso, os pacientes têm mais expectativas sobre a sua visão e frequentemente desejam a independência dos óculos após a cirurgia de catarata. Eles não esperam nenhum resultado insatisfatório. Atualmente, em consultas, os oftalmologistas contam com dados subjetivos sobre o comportamento e o estilo de vida do paciente para avaliar as necessidades refrativas, a seleção do procedimento e a escolha das LIOs. Será que a tecnologia Vivior fornecerá dados objetivos para que os cirurgiões selecionem a solução refrativa mais adequada de acordo com as necessidades dos pacientes e seu estilo de vida? O Visual Behavior Monitor (VBM) consiste em sensores que medem a distância, luz ambiente, orientação da cabeça e movimento. É colocado nos óculos e regista os dados de atividade diária do paciente por 3-5 dias. Informações objetivas sobre a distribuição de distâncias visuais ajudam os oftalmologistas a compreender o estilo de vida e as necessidades de visão dos pacientes. Portanto, é possível escolher a melhor solução de LIO para o paciente. Com o Vivior Monitor, os pacientes terão uma expectativa mais realista do que sua solução de visão personalizada pode alcançar. O objetivo deste trabalho é ter uma melhor compreensão das distâncias de trabalho dos pacientes e melhorar a visão funcional após a cirurgia de catarata com base em numa abordagem pré-operatória mais objetiva.

Ano

2021

Creators

Passos, Ana Carolina Silva

Neural stem cells in the adult human (myth or reality)

Atualmente a neurogénese no mamífero adulto não humano é aceite em duas regiões cerebrais: na zona subventricular, que contribui com neurónios destinados ao bulbo olfativo, e na zona subgranular do giro dentado. No ser humano adulto, no entanto, a evidência de neurogénese é controversa, suscitando a questão: “Será que existe evidência significativa que indique a existência de neurogénese no cérebro do adulto humano?”. Ao longo deste trabalho é apresentada uma descrição resumida da neurogénese em mamíferos não humanos, bem como uma revisão da informação disponível no ser humano. Verificou-se que apesar da adição de novos neurónios no bulbo olfativo, provenientes da zona subventricular, não ocorrer no adulto humano (facto aceite pela comunidade cientifica), no que se refere ao hipocampo existe informação contraditória. Existem dados a favor, que não podem ser totalmente refutados, mas encontram-se também trabalhos onde não é identificada neurogénese no giro dentado do adulto humano. O que todos os trabalhos realizados no ser humano têm em comum é tornarem evidente as limitações do estudo da neurogénese em humanos, bem como das técnicas que nele podem ser empregues.

Ano

2021

Creators

Rodrigues, Ana Catarina Barradas

Luzes e sombras na expansão portuguesa - um equacionar de motivações, perdas e ganhos, em fontes literárias do século XVI

Observações críticas e debates transparecem no século XVI em documentação oficial, sob forma epistolar ou obras apologéticas, tanto quanto em criações em prosa ou em verso que comentam o quotidiano nacional. O processo de Expansão portuguesa ultramarina é natural objecto de análise, com ele se relacionando a anatomia da sociedade, o olhar atento sobre virtudes e desregramentos de governantes e governados. Em passagens condenatórias buscaram, os autores do século XIX obcecados pelos problemas da sua própria época, dados suficientes ou provas incontestáveis da existência de uma decadência da nação derivada daquele processo. O presente estudo sobre discursos e contextos, procura analisar a constução historiográfica na sua interligação íntima com condicionalismos epocais, reactualizações de leituras, preconceitos e desmistificações.

Ano

1995

Creators

Cruz, Maria Leonor García da

Trombos associados a anemia ferropénica como causa de AVC isquémico : revisão sistemática da literatura

A anemia ferropénica tem sido associada à formação de trombos como causa de acidente vascular cerebral (AVC). No entanto, o mecanismo fisiopatológico que explica esta associação permanece por esclarecer. O objetivo deste trabalho é analisar as características dos AVCs isquémicos associados a trombos decorrentes da anemia ferropénica, através de uma revisão sistemática da literatura, utilizando as bases de dados Pubmed e EMBASE, e de uma revisão de casos internados na Unidade de AVC do Hospital de Santa Maria (HSM). Incluímos adultos com anemia ferropénica, avaliados pela ocorrência de acidente isquémico transitório (AIT) ou AVC isquémico, com deteção de trombos, sem evidência de alterações ateroscleróticas ou fontes cardioembólicas de alto risco. Analisamos 311 artigos pelo título e resumo, 85 por texto integral, dos quais 27 foram incluídos. De um total de 41 doentes, 36 foram incluídos pela revisão da literatura e 5 da série de doentes do HSM. A média da idade foi de 43.9 anos, com uma maior prevalência no sexo feminino (87.8%). A etiologia mais frequente da anemia ferropénica foi a hemorragia por miomas uterinos (61%). Reportou-se a ocorrência de AVC em 85.4% e de AIT em 14.6%, sendo que os locais mais frequentes de deteção de trombose foram a Artéria Carótida Interna, Artéria Carótica Comum e Arco Aórtico. Foi reportada a presença de Foramen Ovale Patente (FOP) em 17.1% dos doentes. Analiticamente, 73.2% apresentavam trombocitose e apenas 6 doentes tinham outras alterações pró-trombóticas. Além da anticoagulação com Heparina isolada ou combinada com Varfarina, foi feita a correção da anemia com transfusões sanguíneas e reposição com ferro, bem como a correção do seu fator etiológico. Em todos ocorreu a resolução total dos trombos, com um tempo mediano de 13.7 dias. Não ocorreu recorrência do evento em nenhum doente. Concluiu-se que a anemia ferropénica, com ou sem trombocitose se associa a um aumento do risco trombótico, especialmente em mulheres jovens, sendo necessários mais estudos para compreender o mecanismo fisiopatológico subjacente.

Ano

2021

Creators

Correia, Ana Catarina Cordeiro

Achado incidental de má-rotação intestinal : desafios e abordagem atual

A má-rotação intestinal é uma das malformações embrionárias mais comuns do trato gastrointestinal, estimando-se que ocorra em 1/500 nados-vivos. Resulta da ausência ou incompleta rotação intestinal em redor do eixo da artéria mesentérica superior e da fixação do mesentério na parede abdominal posterior durante o desenvolvimento fetal. É uma entidade com diferentes apresentações clínicas devido ao continuum de variações anatómicas que podem ocorrer durante o desenvolvimento embrionário. De acordo com o tipo de má-rotação intestinal, tanto poderá ser assintomática, como desencadear quadros potencialmente graves e com elevada taxa de morbilidade e mortalidade, designadamente volvo do intestino médio, isquémia intestinal e consequente síndrome do intestino curto. É diagnosticada essencialmente em idade pediátrica, sendo que cerca de 50-75% dos doentes sintomáticos são diagnosticados durante o 1º mês de vida. Contudo, dada a variabilidade anatómica e sintomática, estima-se que entre 10-30% dos doentes se tornam sintomáticos apenas a partir de 1 ano de idade. Tem-se constatado recentemente um aumento do diagnóstico incidental na população pediátrica assintomática com má-rotação intestinal, possivelmente associado ao uso crescente e maior acuidade diagnóstica dos exames imagiológicos em diversos contextos clínicos. De acordo com os resultados imagiológicos de má-rotação típica e atípica e consoante a faixa etária do doente, poderá ser necessário ponderar a necessidade de intervenção cirúrgica versus vigilância médica, para reduzir o risco de volvo do intestino médio. Apesar de a abordagem cirúrgica desta entidade clínica não ser ainda consensual, o goldstandard preconizado é a realização de procedimento de Ladd, por via laparoscópica ou por laparotomia. Com o objetivo de enfatizar a importância da abordagem multidisciplinar e da avaliação das comorbilidades nos doentes com má-rotação, destaca-se a abordagem particular da má-rotação intestinal associada a malformações congénitas, como é exemplo a síndrome de heterotaxia, destacando o contributo da avaliação no plano genético. Atendendo ao interesse clínico e atualidade do tema, o presente trabalho procurou sistematizar melhor a abordagem diagnóstica e terapêutica de má-rotação intestinal em doentes pediátricos assintomáticos, integrando uma proposta prática de intervenção. Sumarizando a metodologia, realizou-se a revisão a partir de artigos originais, revisões sistemáticas, meta-análises e recomendações de sociedades científicas no período de 2010-2021, indexadas à Medline/PubMed.

Ano

2021

Creators

Garcia, Ana Catarina de Almeida

Enantiopure Indolizinoindolones with in vitro activity against blood- and liver-stage malaria parasites

Malaria continues to be a major cause of morbidity and mortality to this day, and resistance to drugs like chloroquine has led to an urgent need to discover novel chemical entities aimed at new targets. Here, we report the discovery of a novel class of potential antimalarial compounds containing an indolizinoindolone scaffold. These novel enantiopure indolizinoindolones were synthesized, in good-to-excellent yields and excellent diastereoselectivities, by cyclocondensation reaction of (S)- or (R)-tryptophanol and 2-acyl benzoic acids, followed by intramolecular α-amidoalkylation. Interestingly, we were able to synthesize for the first time 7,13b-cis indolizinoindolones in a two-step route. The novel compounds showed promising activity against erythrocytic stages of the human malaria parasite, Plasmodium falciparum, and liver stages of the rodent parasite Plasmodium berghei. In particular, an (S)-tryptophanol-derived isoindolinone was identified as a promising starting scaffold to search for novel antimalarials, combining excellent activity against both stages of the parasite's life cycle with low cytotoxicity and excellent metabolic and chemical stability in vitro.

Ano

2015

Creators

Pereira, Nuno A. L. Monteiro, Ângelo Machado, Marta Gut, Jiri Molins, Elies Perry, Maria Jesus Dourado, Jorge Moreira, Rui Rosenthal, Philip J. Prudêncio, Miguel Santos, Maria M. M.