RCAAP Repository

Para uma avaliação de professores com sentido social e cultural

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Year

2009

Creators

Fernandes, Domingos

Perder um animal de companhia: rituais e práticas sociais de luto

Quais são as dimensões sociais do luto por perda de um animal de companhia? Como é vivido no quotidiano, em práticas e rituais? E que implicações tem para a redefinição das fronteiras entre os humanos e os outros animais? Cruzando contributos dos Estudos dos Animais e da Sociologia da Vida Pessoal, este artigo propõe uma interpretação do luto por um animal a partir de um olhar triplo. Primeiro, a partir do lugar que os animais de companhia ocupam nas redes pessoais dos portugueses, e da relacionalidade da vida contemporânea. Segundo, olhando para as práticas e rituais específicos que, após a perda de um animal, continuam a tecer a fina teia que os integra nas vidas dos humanos. Terceiro, considerando as desigualdades que atravessam o luto em função da espécie, e que fazem não só com que se perpetue a excecionalidade do humano face aos outros animais, como que certas espécies não--humanas sejam vistas como mais dignas de luto do que outras.

Year

2022

Creators

Policarpo, Verónica

Analysis of interpretability methods applied to DCE-MRI of Breasts Images

O cancro da mama é uma doença que afeta um elevado número de mulheres a uma escala mundial [1]. Os exames físicos e a mamografia são as formas mais eficazes de detetar lesões e nódulos na mama. Contudo, estes métodos podem revelar-se inconclusivos. Uma maneira de solidificar o diagnóstico de cancro da mama é a realização de testes suplementares, tal como a ressonância magnética. O exame de ressonância magnética mais comum para detetar cancro da mama é DCE-MRI, um exame que obtém imagens através da injeção de um agente de contraste [2]. A consolidação do diagnóstico pode também ser realizada via meios de machine learning. Vários métodos de machine learning têm vindo a ajudar técnicos a realizar tarefas como deteção e segmentação de tumores. Apesar destes métodos serem eficazes, as tarefas que este realizam são caracterizadas por um elevado grau de responsabilidade visto que estão diretamente relacionadas com o bem-estar de um ser humano. Isto leva à necessidade de justificar os resultados destes métodos de maneira a aumentar a confiança nos mesmos. As técnicas que tentam explicar os resultados de métodos de machine learning pertencem à área de Explainable Artificial Intelligence [3]. Esta dissertação foca-se em aplicar e analisar métodos state-of-the-art de Explainable Artificial Intelligence a modelos de machine learning. Como estes modelos foram construídos tendo como base imagens de DCE-MR de mamas, os métodos aplicados a estes modelos visam explicar os seus resultados visualmente. Um dos métodos aplicados foi SHAP, SHapley Addictive exPlanations. Este método pode ser aplicado a uma variedade de modelos e baseia-se nos Shapley Values da teoria de jogos para explicar a importância das características da imagem de acordo com os resultados do modelo [4]. Outro método aplicado foi Local Interpretable Model-agnostic Explanations, ou LIME. Este método cria imagens alteradas e testa-as nos modelos criados. Estas imagens perturbadas têm um peso de acordo com o grau das perturbações. Quando testadas nos modelos, LIME calcula quais as perturbações que influenciam a mudança do resultado do modelo e, consequentemente, encontra as áreas da imagem que são mais importantes para a classificação da imagem de acordo com o modelo [5]. O último método aplicado foi o Gradient-weighted Class Activation Mapping, ou Grad-CAM. Este método pode ser aplicado em diversos modelos, sendo uma generalização do método CAM [6], mas apenas pode ser aplicado em tarefas de classificação. O método de Grad-CAM utiliza os valores dos gradientes específicos de classes e as feature maps extraídas de convolutional layers para realçar áreas discriminativas de uma certa classe na imagem. Estas layers são componentes importantes que constituem o corpo dos modelos. Para lá destes métodos, extraiu-se e analisou-se matrizes convolucionais, chamadas de filtros, usadas pelas convolutional layers para obter o output destas layers. Esta tarefa foi realizada para observar os padrões que estão a ser filtrados nestas camadas. Para aplicar estes métodos, foi necessário construir e treinar vários modelos. Nesse sentido, três modelos com a mesma estrutura foram criados para realizar tarefas de regressão. Estes modelos têm uma arquitetura constituída por três convolutional layers seguidas de uma linear layer, uma dropout layer e outra linear layer. Um dos modelos tem como objetivo medir a área do tumor em maximum intensity projections dos volumes. Os outros dois modelos têm como objetivo medir a percentagem de redução do tumor quando introduzido dois maximum intensity projections. A diferença entre estes dois modelos está nas labels criadas para os inputs. Um dos modelos usa valores calculados através da diferença entre a área dos tumores dos duas maximum intensity projections, enquanto o outro modelo usa valores da regressão da área do tumor fornecidos por técnicos. A performance destes modelos foi avaliada através da computação dos coeficientes de correlação de Pearson e de Spearman. Estes coeficientes são calculados usando a covariância e o produto do desvio-padrão de duas variáveis, e diferem no facto de o coeficiente de Pearson apenas captar relações lineares enquanto o coeficiente de Spearman capta qualquer tipo de relação. Do modelo que teve como objetivo medir a área do tumor calculou-se os coeficientes de Pearson e de Spearman de 0.53 e 0.69, respetivamente. O modelo que teve como objetivo calcular a percentagem de redução do tumor e que usou valores calculados como labels teve a melhor performance dos três modelos, com coeficientes de Pearson e de Spearman com valores de 0.82 e 0.87, respetivamente. O último modelo utilizado não conseguiu prever corretamente os valores fornecidos pelos técnicos e, consequentemente, este modelo foi descartado. De seguida, os métodos de visualização de filtros e SHAP foram aplicados aos dois restantes modelos. A técnica de visualização de filtros permitiu demonstrar as partes da imagem que estão a ser filtradas nas convolutional layers, sendo possível observar certos padrões nestes filtros. O método SHAP realçou áreas da mama que contribuíram para as previsões dos modelos. Como ambas as tarefas se focam em calcular algo através da área dos tumores, consideramos imagens SHAP bem-sucedidas aquelas que realçam áreas do tumor. Com isto em mente, as imagens obtidas através do método SHAP tiveram um sucesso de 57% e de 69% para o modelo que mede a área do tumor e para o modelo que mede a percentagem de redução do tumor, respetivamente. Outro modelo foi construído com o objetivo de classificar pares de maximum intensity projections de acordo com percentagem de redução de área do tumor. Cada par foi previamente classificado numa de quatro classes, sendo que cada classe corresponde a uma redução incremental de 25%, ou seja, a primeira classe corresponde a uma redução do tumor de 0% a 25%, enquanto a última classe corresponde a uma redução do tumor de 75% a 100%. Este modelo tem uma arquitetura semelhante à de um modelo de Resnet18 [7]. A performance deste modelo foi avaliada através de uma matriz de confusão. Através desta matriz podemos observar um sucesso de 70% no que toca a previsões corretas feitas pelo modelo. De seguida, os três métodos, SHAP, LIME e Grad-CAM, foram aplicados neste modelo. Como o objetivo deste modelo baseia-se em classificar as imagens de acordo com a percentagem de redução de tumor, também se considerou imagens de SHAP com sucesso aquelas que realçam áreas do tumor. Tendo isto em conta, observou-se uma taxa de sucesso de 82% em realçar a zona do tumor nas maximum intensity projections. As perturbações criadas para serem aplicadas no método LIME correspondem a áreas quadradas na imagem. O método LIME cria imagens atribuindo valores nulos a estas áreas aleatoriamente. O método LIME atribui um peso às imagens perturbadas de acordo com o nível de perturbação que estas sofrem. Neste trabalho, duas diferentes perturbações foram criadas, sendo a primeira perturbação áreas quadradas de 10 por 10 pixéis e a segunda áreas quadradas de 25 por 25 pixéis. Após a perturbação das imagens, estas foram inseridas novamente no modelo e as diferenças na previsão do modelo foram aprendidas pelo algoritmo do LIME. Imagens criadas com as perturbações mais pequenas tiveram uma maior taxa de sucesso que as perturbações maiores, realçando perturbações na área do tumor com uma certidão de 48%. Apesar deste facto, as imagens criadas com as perturbações de 25 por 25 pixéis tiveram os resultados mais claros no que toca a localizar o tumor visto que o tamanho das perturbações permitiu englobar todo o tumor. Por último, o método Grad-CAM foi aplicado a todas as importantes convolutional layers do modelo. Este método foi bastante eficaz a localizar as áreas discriminativas de uma certa classe, visto que conseguiu localizar o tumor bastante facilmente quando aplicado na última convolutional layer. Para lá deste facto, foi possível observar as áreas discriminativas de uma certa classe nas imagens quando se aplica este método a convolutional layers intermédias. Concluindo, a aplicação destas técnicas permitiu explicar parte das decisões feitas pelos modelos de machine learning no âmbito da análise de imagens de DCE-MRI de cancro da mama.

Year

2022

Creators

Neto, João Pedro dos Santos

Aires Francisco Nicéforo de Sousa (1905-1980): perfil biográfico

A radiologia conheceu, neste período, em Lisboa, um apreciável incremento. Para isso em muito contribuíram cinco professores: Aleu Saldanha, Bénard Guedes, Pereira Caldas, Carlos Santos (filho) e Aires de Sousa. Esta época precede o desenvolvimento ulterior da Imagiologia. Aires de Sousa trabalhou também na criação da Angioquimografia. Segundo o próprio, terá ficado a dever a sua formação, enquanto especialista, ao Professor Aleu Saldanha. Trabalhou com o Professor Lopo de Carvalho (Hospital do Desterro) no estudo angiográfico da circulação pulmonar (angiopneumografia). Dedicou-se à História da Medicina, em especial a do Oriente.

Year

2022

Creators

Sousa, Aires Francisco Nicéforo de, (1905-1980)

Antero Manuel Guimarães da Palma Carlos (1933-2019): perfil biográfico

Foi discípulo de Armando Ducla Soares e da escola de Pulido Valente. A sua contribuição em diversos organismos internacionais deu visibilidade à alergologia nacional.

Year

2022

Creators

Palma Carlos, Antero Manuel Guimarães da, (1933-2019)

Artur Torres Pereira (1924-2015): perfil biográfico

Sucedeu a Cândido da Silva na Cátedra de Bacteriologia. A microbiologia surgiu e desenvolveu-se, entre nós, sob a sua regência. Na sequência do 25 de Abril de 1974, teve papel relevante na tentativa de recuperar o antigo edifício da escola médica para pólo complementar de ensino das cadeiras básicas. Nos largos períodos em que ocupou cargos de direcção em diversas estruturas na Universidade de Lisboa, nomeadamente na FMUL e também na Sociedade de Ciências Médicas, ficaram bem patentes as suas capacidades de liderança e organização.

Year

2022

Creators

Torres Pereira, Artur, (1924-2015)

Augusto César de Almeida Vasconcelos Correia (1867-1937): perfil biográfico

Interpolou a sua carreira política com a clínica, até que, em 1926, lhe foi concedida licença sem vencimento abandonando a carreira médica e docente. Presidiu à Sociedade da Nações (1935), deixando o seu magistério ligado à resolução da “Questão do Chaco”, pondo termo ao conflito armado resultante da disputa desse território entre a Bolívia e o Paraguai. Deve-se-lhe em grande parte a legislação sobre a criação das Faculdades de Medicina (Lisboa e Porto) bem como cedência do Hospital de Santa Marta para Hospital Escolar.

Year

2022

Creators

Correia, Augusto César de Almeida Vasconcelos, (1867-1937)

Carlos Pinto da Cruz e Mello (1888-1933): perfil biográfico

Regeu a cadeira de Otorrinolaringologia com proficiência e reconhecida técnica cirúrgica. A sua gestão do Hospital de Santa Marta foi muito apreciada. Não chegou a atingir a jubilação, tendo falecido com 45 anos.

Year

2022

Creators

Mello, Carlos Pinto da Cruz, (1888-1933)

Carlos Queiroz Salazar de Sousa (1904-1980): perfil biográfico

Filho do Professor Jaime Salazar de Sousa, foi também pediatra e professor de Pediatria e Puericultura após a reforma do Professor Castro Freire. Em Pediatria dedicou-se particularmente ao estudo da nutrição e puericultura. Fundou a Revista Portuguesa de Pediatria e Puericultura já com o objectivo da criação de uma sociedade de pediatria, o que aconteceria só dez anos depois, em 1948, por iniciativa de Manuel Cordeiro Ferreira.

Year

2022

Creators

Salazar de Sousa, Carlos Queiroz, (1904-1980)

Longitudinal association between grip strength and the risk of heart diseases among European middle-aged and older adults

Background: Few multi-country European studies have investigated the association between grip strength and heart diseases incidence. Thus, the aim of this study is to analyse the longitudinal relationship between grip strength and the diagnosis of heart diseases in European middle-aged and older adults. Method: A prospective cohort study was conducted using data from the Survey of Health, Aging and Retirement in Europe (2004-2017). Participants were 20,829 middle-aged and older adults from 12 countries. GS was objectively measured by a dynamometer and heart diseases diagnosis was self-reported. Incidence rate of heart diseases was calculated and a Cox proportional hazard regression was performed. Results: The heart diseases incidence rate decreased from 930 per 100,000 person-years in the lowest quartile to 380 per 100,000 person-years in the highest grip strength quartile. During the 13 years of follow-up, compared to being in the lowest grip strength quartile, being in the highest quartile decreased the hazard of being diagnosed with a heart disease in 36 % (95 % confidence interval [CI]: 0.53, 0.78) for the whole sample, 35 % (95 % CI: 0.51, 0.84) for men and 46 % (95 % CI: 0.40, 0.73) for women. Conclusions: Grip strength seems to be inversely associated with the incidence of heart diseases among European middle-aged and older adults. Scientific evidence has highlighted the potential role of grip strength as a risk stratifying measure for heart diseases, suggesting its potential to be included in the cardiovascular risk scores used in primary care. However, further research is still needed to clarify it.

Year

2023

Creators

Peralta, Miguel Dias, Carlos Matias Marques, Adilson Henriques-Neto, Duarte Sousa-Uva, Mafalda

Vinte e cinco anos de avaliação das aprendizagens: Uma síntese interpretativa de livros publicados em Portugal

Nos últimos 25/30 anos foram publicados, por autores portugueses, algumas centenas de trabalhos de natureza diversa no domínio da avaliação das aprendizagens dos alunos. Este facto, em si mesmo, torna clara a necessidade de se desenvolver investigação que sintetize o que é que, em Portugal, tem vindo a ser produzido no domínio da avaliação das aprendizagens e que seja capaz de: a) caracterizar globalmente o que tem sido produzido pelos investigadores e estudiosos portugueses; b) identificar e discutir os problemas e os temas que mais têm merecido a sua atenção; c) analisar como é que esses problemas têm sido abordados; e d) contribuir para o desenvolvimento teórico e prático de um domínio científico e pedagógico de reconhecida importância. A investigação foi desenvolvida tendo em conta as seguintes questões orientadoras: 1. Como é que se poderão caracterizar globalmente os livros analisados? 2. Como é que se poderão caracterizar as abordagens utilizadas pelos autores em áreas tão relevantes como a avaliação formativa ou a avaliação sumativa? 3. Que sínteses e reflexões se poderão elaborar relativamente à literatura revista? Esta síntese interpretativa mostrou que muito há ainda a fazer no domínio da avaliação das aprendizagens e, muito particularmente, no que se refere à avaliação formativa. Mas também revelou que há um caminho que foi percorrido ao longo de 25 anos que não devemos ignorar. O que se procurou fazer nesta investigação foi dar-lhe sentido e significado para que se possam prosseguir os esforços já realizados e contribuir para que a avaliação para aprender seja uma realidade cada vez mais presente nas escolas e nas salas de aula. Mas tudo isto é indissociável do desenvolvimento de uma agenda forte no domínio da investigação empírica que possa abrir caminho à construção teórica e à transformação e melhoria das práticas.

Year

2007

Creators

Fernandes, Domingos

Body composition variations between injured and non-injured professional soccer players

Professional soccer is characterized by its physical demands, making players' exposure to high injury risks a growing problem. It is crucial to study the factors associated with injuries in professional soccer. This study aimed to investigate the relationship between age, body composition, and others variables related with the injury profile of professional soccer players of a specific Portuguese team. Also, it analyzed the impact of the injury profile on soccer's variations in body fat (BF%), skeletal muscle mass (SMM) and total body water (TBW) throughout the season. The sample comprised 31 male professional soccer players competing in the First Portuguese Soccer League. Older players had a higher prevalence of muscular injuries. Midfielders and forwards showed the highest number of muscular injuries during the season being quadriceps the most affected zone. Considering players' BF% [Wilks' Lambda = 0.42, F (7, 23) = 4.61, p = 0.002, r = 0.58], SMM [Wilks' Lambda = 0.59, F (6, 23) = 2.70, p = 0.039, r = 0.41] and TBW [Wilks' Lambda = 0.54, F (7, 23) = 2.80, p = 0.029, r = 0.46] there was a substantial main effect for the assessments performed throughout the season and the injury status. Age assumes relevance in explaining the injury profile. The impact of the injury profile on soccer's variations in BF%, SMM and TBW throughout the season must be analyzed considering the clinical relevance.

Year

2022

Creators

Martins, Francisco França, Cíntia Henriques, Ricardo Ihle, Andreas Przednowek, Krzysztof Marques, Adilson Lopes, Hélder Sarmento, Hugo Gouveia, Elvio

MAMMALS IN PORTUGAL : A data set of terrestrial, volant, and marine mammal occurrences in P ortugal

Mammals are threatened worldwide, with 26% of all species being includedin the IUCN threatened categories. This overall pattern is primarily associatedwith habitat loss or degradation, and human persecution for terrestrial mam-mals, and pollution, open net fishing, climate change, and prey depletion formarine mammals. Mammals play a key role in maintaining ecosystems func-tionality and resilience, and therefore information on their distribution is cru-cial to delineate and support conservation actions. MAMMALS INPORTUGAL is a publicly available data set compiling unpublishedgeoreferenced occurrence records of 92 terrestrial, volant, and marine mam-mals in mainland Portugal and archipelagos of the Azores and Madeira thatincludes 105,026 data entries between 1873 and 2021 (72% of the data occur-ring in 2000 and 2021). The methods used to collect the data were: live obser-vations/captures (43%), sign surveys (35%), camera trapping (16%),bioacoustics surveys (4%) and radiotracking, and inquiries that represent lessthan 1% of the records. The data set includes 13 types of records: (1) burrowsjsoil moundsjtunnel, (2) capture, (3) colony, (4) dead animaljhairjskullsjjaws, (5) genetic confirmation, (6) inquiries, (7) observation of live animal (8),observation in shelters, (9) photo trappingjvideo, (10) predators dietjpelletsjpine cones/nuts, (11) scatjtrackjditch, (12) telemetry and (13) vocalizationjecholocation. The spatial uncertainty of most records ranges between 0 and100 m (76%). Rodentia (n=31,573) has the highest number of records followedby Chiroptera (n=18,857), Carnivora (n=18,594), Lagomorpha (n=17,496),Cetartiodactyla (n=11,568) and Eulipotyphla (n=7008). The data setincludes records of species classified by the IUCN as threatened(e.g.,Oryctolagus cuniculus[n=12,159],Monachus monachus[n=1,512],andLynx pardinus[n=197]). We believe that this data set may stimulate thepublication of other European countries data sets that would certainly contrib-ute to ecology and conservation-related research, and therefore assisting onthe development of more accurate and tailored conservation managementstrategies for each species. There are no copyright restrictions; please cite thisdata paper when the data are used in publications.

Year

2022

Creators

Grilo, Clara Afonso, Beatriz C. Afonso, Filipe Alexandre, Marta Aliácar, Sara Almeida, Ana Alonso, Ivan Prego Álvares, Francisco Alves, Paulo Alves, Paulo Célio Alves, Pedro Duarte, Beatriz Duro, Virginia Encarnação, Cláudia Eufrázio, Sofia Fael, António Falé, João Salvador Faria, Sandra Fernandes, C Fernandes, Margarida Lopes, Susana Rosalino, L. M. Costa, Gonçalo Ferrão Ferreira, Clara Ferreira, Diogo F. Ferreira, Eduardo Ferreira, Joaquim Pedro Ferreira, João Ferreira, Diana Fonseca, Carlos Fontes, Inês Fragoso, Ricardo Rosário, Inês T. López-Baucells, Adrià Franco, Claudia Freitas, Tamira Gabriel, Sofia I. Gibb, Rory Gil, Patricia Gomes, Carla Patricia Jorge Horta, Pedro Gomes, Pedro Gomes, Verónica Rossa, Mariana Grilo, Ana Filipa Amado, Anabela Guedes, Américo Guilherme, Filipa Gutiérrez, Iván Harper, Henry Herrera, José M. Hipólito, Dário Infante, Samuel Jesus, José Russo, Danilo Loureiro, Armando Loureiro, Filipa Lourenço, Rui Lourenço, Sofia Lucas, Paula Magalhães, Ana Maldonado, Cristina Marcolin, Fabio Marques, Sara Marques, J. Tiago Sá, Pedro Amendoeira, Vitor Marques, Carina Marques, Paulo Marrecas, Pedro Caetano Martins, Frederico Martins, Raquel Mascarenhas, Miguel Mata, Vanessa A. Mateus, Ana Rita Matos, Milene Sabino‐Marques, Helena Medinas, Denis Amorim, Francisco Mendes, Tiago Mendes, Gabriel Mestre, Frederico Milhinhas, Catarina Mira, António Monarca, Rita I. Monteiro, Norberto Monteiro, Barbara Salgueiro, Vânia Monterroso, Pedro Nakamura, Mónia Silva Aparício, Guilherme Negrões, Nuno Nóbrega, Eva K. Nóvoa, Miguel Nunes, Manuel Nunes, Nuno Jardim Oliveira, Flávio Oliveira, José Miguel Santos, Helena M. Palmeirim, Jorge Pargana, João Paula, Anabela Araújo, Ricardo Paupério, Joana Pedroso, Nuno M. Pereira, Guilherme Pereira, Pedro F. Pereira, José Pereira, Maria João Ramos Santos, Joana Petrucci-Fonseca, Francisco Pimenta, Miguel Pinto, Sara Pinto, Nuno Ascensão, Fernando Pires, Rosa Pita, Ricardo Pontes, Carlos Quaresma, Marisa Queirós, João Barbosa, A. Márcia Queirós, Luís Rainho, Ana Graça Ramalhinho, Maria Ramalho, Patrícia Raposeira, Helena Augusto, Margarida Rasteiro, Francisco Rebelo, Hugo Regala, Frederico Tátá Reto, Dyana Jones, Kate E. Ribeiro, Sérgio Bruno Rio‐Maior, Helena Rocha, Ricardo Rocha, Rita Gomes Rodrigues, Luísa Román, Jacinto Bandeira, Victor Roque, Sara Santos, João P. V. Santos, Nuno Santos, Sara Santos, Carlos Pedro Santos-Reis, Margarida Serronha, Ana Sierra, Pablo Silva, Bruno Silva, Carla S. G. M. Silva, Clara Laborde, Marina I. Barbosa, Soraia Silva, Diogo Silva, Luís P. Silva, Ricardo Silva, Carmen Silva Júnior, Flavio Manoel Rodrigues Sousa, Pedro Sousa‐Guedes, Diana Spadoni, Giulia Tapisso, Joaquim T. Oliveira, Luís Lamas Teixeira, Daniela Barbosa, Sérgio Teixeira, Sérgio Teixeira, Nuno Torres, Rita T. Travassos, Paulo Vale‐Gonçalves, Hélia Cidraes‐Vieira, Nuno Merten, Sophie Luz Mathias, Maria Leitão, Inês Barreiro, Silvia Barros, Paulo Barros, Tânia Barros, Filomena Pinto Basto, Mafalda Bernardino, Joana Bicho, Sara Biedma, Luis Eduardo Borges, Marta Braz, Luis Lemos, Rita Brito, José Carlos Brito, Tiago Cabral, João Alexandre Calzada, Javier Camarinha, Cláudia Carapuço, Mafalda Cardoso, Paulo Carmo, Mário Carrapato, Carlos Silva Carrilho, Maílis Lima, Cátia Carvalho, Diogo Filipe T. C. S. Carvalho, Filipe Carvalho, João Castro, Diana Castro, Guilherme Castro, Joana Castro, Luis Roma Catry, Filipe Xavier Cerveira, Ana M. Cid, André Linck, Paloma Clarke, Rafael Conde, Conceição Conde, José Costa, Jorge Costa, Mafalda Costa, Pedro Costa, Cristina Couto, André Pedro Craveiro, João Dias, Marta Lopes, Hugo Dias, Sofia

The potential and shortcomings of mitochondrial DNA analysis for cheetah conservation management

There are only about 7,100 adolescent and adult cheetahs (Acinonyx jubatus) remaining in the wild. With the majority occurring outside protected areas, their numbers are rapidly declining. Evidence-based conservation measures are essential for the survival of this species. Genetic data is routinely used to inform conservation strategies, e.g., by establishing conservation units (CU). A commonly used marker in conservation genetics is mitochondrial DNA (mtDNA). Here, we investigated the cheetah’s phylogeography using a large-scale mtDNA data set to refine subspecies distributions and better assign individuals to CUs. Our dataset mostly consisted of historic samples to cover the cheetah’s whole range as the species has been extinct in most of its former distribution. While our genetic data largely agree with geography-based subspecies assignments, several geographic regions show conflicting mtDNA signals. Our analyses support previous findings that evolutionary forces such as incomplete lineage sorting or mitochondrial capture likely confound the mitochondrial phylogeography of this species, especially in East and, to some extent, in Northeast Africa. We caution that subspecies assignments solely based on mtDNA should be treated carefully and argue for an additional standardized nuclear single nucleotide polymorphism (SNP) marker set for subspecies identification and monitoring. However, the detection of the A. j. soemmeringii specific haplogroup by a newly designed Amplification-Refractory Mutation System (ARMS) can already provide support for conservation measures.

Year

2022

Creators

Meißner, René Winter, Sven Westerhüs, Uta Sliwa, Alexander Greve, Carola Bottriell, Lena Godsall Bottriell, Paul Fernandes, C Vercammen, Paul Hunter, Luke T. B. Abramov, Alexei V. Khalatbari, Leili Horin, Petr Burger, Pamela A. Prost, Stefan

Drivers of extreme burnt area in Portugal: fire weather and vegetation

Fire weather indices are used to assess the effect of weather on wildfire behaviour and to support fire management. Previous studies identified the high daily severity rating percentile (DSRp) as being strongly related to the total burnt area (BA) in Portugal, but it is still poorly understood how this knowledge can support fire management at a smaller spatial scale. The aims of this study were to (1) assess whether the 90th DSRp (DSR90p) threshold is adequate for estimating most of the BA in mainland Portugal; (2) analyse the spatial variability of the DSRp threshold that explains a large part of BA, at higher resolution; and, (3) analyse whether vegetation cover can justify the DSRp spatial variability. We used weather reanalysis data from ERA5-Land, wildfire and land use data from Portuguese land management departments for an extended summer period (15 May to 31 October) from 2001 to 2019. We computed and related DSRp to large wildfires (BA > 100 ha) and land use to clarify the effectiveness of the DSRp for estimating BA in Portugal and assess how vegetation influences it. Results revealed that the DSR90p is an adequate indicator of extreme fire weather days and BA in Portugal. In addition, the spatial pattern of the DSRp associated with most of the total BA shows variability at the municipality scale. Municipalities where large wildfires occur with more extreme weather conditions have most of the BAs in forests and are in coastal areas. By contrast, municipalities where large wild fires occur with less extreme weather conditions are predominantly covered by shrublands and are situated in eastern and inland regions. These findings are a novelty for fire science in Portugal and should be considered by fire managers and fire risk assessors.

Year

2022

Creators

Menezes, Tomás Benali, Akli Pereira, Mário Gonzalez Silva, João M. N. Nunes, João Pedro

A produção escrita no ensino-aprendizagem do português como língua estrangeira (PLE) no Senegal

A presente investigação de Mestrado, subordinada ao tema "A PRODUÇÃO ESCRITA NO ENSINO-APRENDIZAGEM DO PORTUGUÊS COMO LÍNGUA ESTRANGEIRA (PLE) NO SENEGAL", pretende contribuir para a caracterização do ensino e da avaliação da produção escrita em PLE, no ensino público no Senegal. O estudo justifica-se, por um lado, pela importância do ensino do Português no currículo senegalês, tendo início, como disciplina opcional, no colégio, na turma de 4ème (equivalente ao 9.o ano do Ensino Básico do sistema português), e estendendo-se até ao final do ensino secundário. Justifica-se igualmente pelo peso atribuído à produção escrita nas examinações oficiais de PLE no Senegal, realizadas no final da escolaridade obrigatória, condicionando, entre outros aspetos, o acesso a cursos superiores na área do Português. A escrita em PLE no Senegal não foi, até à data, objeto de estudo. Dados empíricos (experiência pessoal do candidato, no terreno) levam a crer que existe uma escassez de orientações ao nível dos documentos oficiais e dos materiais didáticos em uso nas escolas. Muitos professores de PLE, ademais, parecem atribuir pouca importância ao desenvolvimento de competências escritas nas suas aulas. O presente estudo visa descrever detalhadamente e problematizar esta situação, assim preparando o caminho para um ensino da escrita mais sistemático e mais fundamentado na disciplina de PLE no Senegal. O estudo assenta numa análise de conteúdos de três tipos de documentos: programas, materiais didáticos e provas de avaliação sumativa. Pretende-se identificar as orientações que são facultadas nestes documentos para o ensino e a avaliação da produção escrita, levando em consideração aspetos como o tema, a dimensão, a estrutura ou o tipo de texto a produzir. A fim de melhor contextualizar as orientações na área do PLE, será ainda feita uma comparação com as orientações para a escrita existentes em programas, materiais e provas de duas outras línguas estrangeiras ensinadas no Senegal, nomeadamente o Inglês e o Espanhol.

Year

2022

Creators

Mendy, Adrien Modeste

Randomized trials fit for the 21st century. A joint opinion from the European Society of Cardiology, American Heart Association, American College of Cardiology, and the World Heart Federation

Randomized controlled trials are the cornerstone for reliably evaluating therapeutic strategies. However, during the past 25 years, the rules and regulations governing randomized trials and their interpretation have become increasingly burdensome, and the cost and complexity of trials has become prohibitive. The present model is unsustainable, and the development of potentially effective treatments is often stopped prematurely on financial grounds, while existing drug treatments or non-drug interventions (such as screening strategies or management tools) may not be assessed reliably. The current ‘best regulatory practice’ environment, and a lack of consensus on what that requires, too often makes it unduly difficult to undertake efficient randomized trials able to provide reliable evidence about the safety and efficacy of potentially valuable interventions. Inclusion of underrepresented population groups and lack of diversity also remain among the challenges.

Year

2022

Creators

Bowman, Louise Weidinger, Franz Albert, Michelle A. Fry, Edward T. A. Pinto, Fausto J. Achenbach, Stephan Bowman, Louise Casadei, Barbara Collins, Rory Devereaux, Philip J. Douglas, Pamela S. Frobert, Ole Goto, Shinya Grines, Cindy Harrington, Robert A. Haynes, Richard Hochman, Judith S. Charney, Leon H. James, Stefan Kirchhof, Paulus Komajda, Michel Lam, Carolyn S. P. Landray, Martin Maggioni, Aldo McMurray, John Medhurst, Nick Mehran, Roxana Neal, Bruce Rydén, Lars Thiele, Holger Van Gelder, Isabelle Wallentin, Lars Yusuf, Salim Zannad, Faiez

Obesity and cardiovascular disease: mechanistic insights and management strategies. A joint position paper by the World Heart Federation and World Obesity Federation

The ongoing obesity epidemic represents a global public health crisis that contributes to poor health outcomes, reduced quality of life, and >2.8 million deaths each year. Obesity is relapsing, progressive, and heterogeneous. It is considered a chronic disease by the World Obesity Federation (WOF) and a chronic condition by the World Heart Federation (WHF). People living with overweight/obesity are at greater risk for cardiovascular (CV) morbidity and mortality. Increased adiposity (body fat), particularly visceral/abdominal fat, is linked to CV risk and CV disease (CVD) via multiple direct and indirect pathophysiological mechanisms. The development of CVD is driven, in part, by obesity-related metabolic, endocrinologic, immunologic, structural, humoral, haemodynamic, and functional alterations. The complex multifaceted nature of these mechanisms can be challenging to understand and address in clinical practice. People living with obesity and CVD often have concurrent chronic physical or psychological disorders (multimorbidity) requiring multidisciplinary care pathways and polypharmacy. Evidence indicates that intentional weight loss (particularly when substantial) lowers CVD risk among people with overweight/obesity. Long-term weight loss and maintenance require ongoing commitment from both the individual and those responsible for their care. This position paper, developed by the WOF and the WHF, aims to improve understanding of the direct and indirect links between overweight/obesity and CVD, the key controversies in this area and evidence relating to cardiometabolic outcomes with available weight management options. Finally, an action plan for clinicians provides recommendations to help in identifying and addressing the risks of obesity-related CVD (recognizing resource and support variances between countries).

Year

2022

Creators

Lopez-Jimenez, Francisco Almahmeed, Wael Bays, Harold Cuevas, Ada Di Angelantonio, Emanuele le Roux, Carel W. Sattar, Naveed Sun, Marie Chan Wittert, Gary Pinto, Fausto J. Wilding, John P. H.

Handwashing adherence during the COVID-19 pandemic: a longitudinal study based on protection motivation theory

Rationale: The associations between the number of COVID-19 cases/deaths and subsequent uptake of protective behaviors may reflect cognitive and behavioral responses to threat-relevant information. Objective: Applying protection motivation theory (PMT), this study explored whether the number of total COVID-19 cases/deaths and general anxiety were associated with cross-situational handwashing adherence and whether these associations were mediated by PMT-specific self-regulatory cognitions (threat appraisal: perceived vulnerability, perceived illness severity; coping appraisal: self-efficacy, response efficacy, response costs). Method: The study (#NCT04367337) was conducted in March-September 2020 among 1256 adults residing in 14 countries. Self-reports on baseline general anxiety levels, handwashing adherence across 12 situations, and PMT-related constructs were collected using an online survey at two points in time, four weeks apart. Values of COVID-19 cases and deaths were retrieved twice for each country (one week prior to the individual data collection). Results: Across countries and time, levels of adherence to handwashing guidelines were high. Path analysis indicated that smaller numbers of COVID-19 cases/deaths (Time 0; T0) were related to stronger self-efficacy (T1), which in turn was associated with higher handwashing adherence (T3). Lower general anxiety (T1) was related to better adherence (T3), with this effect mediated by higher response efficacy (T1, T3) and lower response cost (T3). However, higher general anxiety (T1) was related to better adherence via higher illness severity (T1, T3). General anxiety was unrelated to COVID-19 indicators. Conclusions: We found a complex pattern of associations between the numbers of COVID-19 cases/deaths, general anxiety, PMT variables, and handwashing adherence at the early stages of the pandemic. Higher general anxiety may enable threat appraisal (perceived illness severity), but it may hinder coping appraisal (response efficacy and response costs). The indicators of the trajectory of the pandemic (i.e., the smaller number of COVID-19 cases) may be indirectly associated with higher handwashing adherence via stronger self-efficacy.

Year

2023

Creators

Szczuka, Zofia Siwa, Maria Abraham, Charles Baban, Adriana Brooks, Sydney Cipolletta, Sabrina Danso, Ebrima Dombrowski, Stephan U. Gan, Yiqun Gaspar, Tania Matos, Margarida Gaspar de Griva, Konstadina Jongenelis, Michelle Keller, Jan Knoll, Nina Ma, Jinjin Abdul Awal Miah, Mohammad Morgan, Karen Peraud, William Quintard, Bruno Shah, Vishna Schenkel, Konstantin Scholz, Urte Schwarzer, Ralf Taut, Diana Tomaino, Silvia C.M. Vilchinsky, Noa Wolf, Hodaya Luszczynska, Aleksandra

Shedding light on the lifestyle and participation of portuguese adolescents with chronic conditions: data from the HBSC 2018 study

Variables associated with lifestyle can constitute either risk or protective factors for the development and progression of chronic conditions (CC). This study intends to explore the differences between adolescents with and without CC and between adolescents whose school participation is affected/not affected by the existing CC with regard to variables related to lifestyle (i.e., sleep, physical activity, BMI, and leisure). In addition, it also intends to analyze the influence of these variables (i.e., CC and lifestyle) regarding the adolescents' quality of life (QoL). This work is part of the Portuguese HBSC 2018 study. A total of 8215 adolescents participated (52.7% female), with an average age of 14.36 years (SD = 2.28). The results showed that the adolescents with CC and whose school attendance and participation are affected by their CC exhibit more sleep difficulties (i.e., they experience lower sleep quality and have a higher degree of sleepiness), higher BMI levels (i.e., higher values of overweight and obesity), less participation in leisure activities, and a lower perception of QoL. A higher perception of QoL is associated with school participation unaffected by the existing CC, sleeping well, a low level of sleepiness, a more frequent practice of physical activity, a lower BMI, and a greater involvement in leisure activities. Adolescent health and well-being are a prominent issue in terms of public policies, with behavior and lifestyle playing a significant role in this domain. This message needs to be reinforced in regard to families, educators, healthcare professionals, and public sector policies, particularly concerning students with CC.

Year

2022

Creators

Cerqueira, Ana Guedes, Fábio Botelho Gaspar, Tania Godeau, Emmanuelle Matos, Margarida Gaspar de