RCAAP Repository

Campylobacter coli and C. jejuni, the causing agents of campylobacteriosis, are described to be undergoing introgression events, i.e., the transference of genetic material between different species, with some isolates sharing almost a quarter of its genome. The participation of phages in introgression events and consequent impact on host ecology and evolution remain elusive. Three distinct prophages, named C. jejuni integrated elements 1, 2, and 4 (CJIE1, CJIE2, and CJIE4), are described in C. jejuni. Here, we identified two unreported prophages, Campylobacter coli integrated elements 1 and 2 (CCIE1 and CCIE2 prophages), which are C. coli homologues of CJIE1 and CJIE2, respectively. No induction was achieved for both prophages. Conversely, induction assays on CJIE1 and CJIE2 point towards the inducibility of these prophages. CCIE2-, CJIE1-, and CJIE4-like prophages were identified in a Campylobacter spp. population of 840 genomes, and phylogenetic analysis revealed clustering in three major groups: CJIE1-CCIE1, CJIE2-CCIE2, and CJIE4, clearly segregating prophages from C. jejuni and C. coli, but not from human- and nonhuman-derived isolates, corroborating the flowing between animals and humans in the agricultural context. Punctual bacteriophage host-jumps were observed in the context of C. jejuni and C. coli, and although random chance cannot be fully discarded, these observations seem to implicate prophages in evolutionary introgression events that are modulating the hybridization of C. jejuni and C. coli species.

Klebsiella pneumoniae is an increasing threat to public health and represents one of the most concerning pathogens involved in life-threatening infections. The resistant and virulence determinants are coded by mobile genetic elements which can easily spread between bacteria populations and co-evolve with its genomic host. In this study, we present the full genomic sequences, insertion sites and phylogenetic analysis of 150 prophages found in 40 K. pneumoniae clinical isolates obtained from an outbreak in a Portuguese hospital. All strains harbored at least one prophage and we identified 104 intact prophages (69.3%). The prophage size ranges from 29.7 to 50.6 kbp, coding between 32 and 78 putative genes. The prophage GC content is 51.2%, lower than the average GC content of 57.1% in K. pneumoniae. Complete prophages were classified into three families in the order Caudolovirales: Myoviridae (59.6%), Siphoviridae (38.5%) and Podoviridae (1.9%). In addition, an alignment and phylogenetic analysis revealed nine distinct clusters. Evidence of recombination was detected within the genome of some prophages but, in most cases, proteins involved in viral structure, transcription, replication and regulation (lysogenic/lysis) were maintained. These results support the knowledge that prophages are diverse and widely disseminated in K. pneumoniae genomes, contributing to the evolution of this species and conferring additional phenotypes. Moreover, we identified K. pneumoniae prophages in a set of endolysin genes, which were found to code for proteins with lysozyme activity, cleaving the β-1,4 linkages between N-acetylmuramic acid and N-acetyl-D-glucosamine residues in the peptidoglycan network and thus representing genes with the potential for lysin phage therapy.

G-quadruplex (G4)-interactive small molecules have a wide range of potential applications, not only as drugs, but also as sensors of quadruplex structures. The purpose of this work is the synthesis of analogues of the bis-methylquinolinium-pyridine-2,6-dicarboxamide G4 ligand 360A, to identify relevant structure–activity relationships to apply to the design of other G4-interactive small molecules bearing bis-quinoline or bis-isoquinoline moieties. Thermal denaturation experiments revealed that non-methylated derivatives with a relative 1,4 position between the amide linker and the nitrogen of the quinoline ring are moderate G4 stabilizers, with a preference for the hybrid h-Telo G4, a 21-nt sequence present in human telomeres. Insertion of a positive charge upon methylation of quinoline/isoquinoline nitrogen increases compounds’ ability to selectively stabilize G4s compared to duplex DNA, with a preference for parallel structures. Among these, compounds having a relative 1,3-position between the charged methylquinolinium/isoquinolinium nitrogen and the amide linker are the best G4 stabilizers. More interestingly, these ligands showed different capacities to selectively block DNA polymerization in a PCR-stop assay and to induce G4 conformation switches of hybrid h-Telo G4. Molecular dynamic simulations with the parallel G4 formed by a 21-nt sequence present in k-RAS gene promoter, showed that the relative spatial orientation of the two methylated quinoline/isoquinoline rings determines the ligands mode and strength of binding to G4s.

O presente artigo, escrito por uma bibliotecária e uma professora universitária, pretende salientar a cooperação institucional efectivamente conseguida no Ensino Superior entre a Biblioteca e o corpo docente da Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa no âmbito da formação de utilizadores (estudantes da graduação e da pós‐graduação, docentes e investigadores) e da sua aplicação aos curricula. Através da apresentação de uma experiência conjunta de anos, procuram evidenciar as potencialidades de tal formação, quer em recursos electrónicos quer em literacia da informação, no ensino universitário pós‐Bolonha. Decorrente da mudança de paradigma educacional apontam como perspectiva viável o desenvolvimento de conteúdos e sessões formativas em tecnologias e‐learning.

Os conceitos de avaliação formativa e de avaliação sumativa foram inicialmente elaborados há cerca de 40 anos atrás no contexto da chamada avaliação de programas (Scriven, 1967). Nessa altura prevaleciam concepções acerca da aprendizagem que, fundamentalmente, decorriam das teorias da psicologia associacionista e comportamentalista, e ainda colhiam bastante aceitação concepções de currículo e de escola muito subordinadas às ideias de Taylor, que se consubstanciavam no chamado currículo da eficiência social. É, pois, neste contexto que surgem as concepções de avaliação propostas por Scriven. Uma avaliação formativa que, em contextos educativos, se destinava a ir corrigindo e ajustando o ensino e a aprendizagem e uma avaliação sumativa que, no essencial, fazia um balanço e emitia um juízo final acerca do que os alunos sabiam e eram capazes de fazer. Bloom, Hastings e Madaus (1971) enquadram conceptualmente a avaliação formativa com base em princípios behavioristas e neo-behavioristas de ensino e de aprendizagem. Isto significa que, em geral, a avaliação é um processo de recolha de informação que incide primordialmente em produtos de aprendizagem que se medem tendo em conta um conjunto de objectivos definidos em termos comportamentais. Ou seja, definidos de tal forma que se traduzem em comportamentos observáveis. Consequentemente, atribui-se uma relevância particular à utilização de instrumentos, normalmente testes ou grelhas de observação, que permitam medir com rigor e, fundamentalmente, de forma quantitativa, as aprendizagens dos alunos. Neste quadro, a avaliação formativa ocorre normalmente após um dado período de ensino para verificar se os objectivos previamente definidos foram ou não alcançados. Neste último caso, como consequência da avaliação formativa, o professor propõe tarefas de remediação para que o aluno possa ultrapassar os problemas detectados. Trata-se de uma avaliação de regulação retroactiva pois as dificuldades dos alunos são identificadas após um dado período de ensino e aprendizagem e não durante esse mesmo período. Estas breves considerações iniciais destinam-se a enquadrar a discussão a desenvolver neste trabalho que, no essencial, se irá orientar com base nas seguintes ideias (Fernandes, 2005): 1. A avaliação que prevalece nos sistemas educativos é de natureza primordialmente sumativa e orientada para a atribuição de classificações. 2. A avaliação formativa, quando ocorre, é do tipo da que acima se descreveu; ou seja, de referência neo-behaviorista, não integrada nos processos de ensino e aprendizagem e incidindo sobretudo nos resultados. As concepções teóricas que lhe estão subjacentes continuam a predominar largamente nos sistemas educativos. 3. A avaliação formativa de referência cognitivista e construtivista, fundamentalmente orientada para melhorar e regular as aprendizagens e o ensino, mais centrada aos processos e integrada no ensino e na aprendizagem é uma alternativa à anterior. As concepções teóricas que lhe estão subjacentes são emergentes e pouco conhecidas nos sistemas educativos. 4. A clarificação teórica é condição essencial para o desenvolvimento de práticas mais sustentadas e duradouras de avaliação formativa alternativa cuja função primordial é a de apoiar os alunos no desenvolvimento das suas aprendizagens.

Apresenta-se uma breve descrição da experiência lectiva desenvolvida no 2º semestre de 2013/2014 em duas unidades curriculares do curso de 1º ciclo de História da FLUL, com ensino presencial (aulas e conferências) e online, implicando inovação pedagógica no desenvolvimento de pesquisas, em avaliação contínua ou de preparação a exame. Note-se experiência lectiva alargada aos três ciclos do Ensino Superior, a nível de recursos electrónicos, tecnologias digitais, elearning e b-learning.

A cooperação desenvolvida entre a Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa e a Universidade do Estado do Rio de Janeiro, cumprindo objectivos de um acordo geral, manifestase de forma intensa desde 2005 no Programa de Estudos Imagética. Este Programa interdisciplinar, sediado no Centro de História da Universidade de Lisboa, orienta projectos de investigação e acções em coordenação com o Ensino Superior, liderando uma rede de investigadores-docentes de diferentes instituições académicas no seu corpo de investigação e em comissões científicas de colóquios, seminários e publicações. Em 10 anos de actividade muito se tem avançado no estudo de imagens e de representações identitárias, numa perspectiva comparada, reunindo pesquisadores de diferentes formações que perspectivam o fenómeno político, social, antropológico, mental, económico, linguístico, religiososo, de forma inovadora e, quantas vezes, aplicando saber e técnicas no aprofundamento da realidade brasileira. Tem sido em crescendo a colaboração em seminário de investigadores de variadas regiões do Brasil a reequacionar comentários de fontes e interpretações que se repercutem numa relação de excelência pedagógica e científica que aprofunda e actualiza a própria investigação.

A representação de lobos e de raposas, tradicionalmente escolhidos como representantes da ameaça às ovelhas que compunham a Cristandade liderada pelo Papa, Pastor de almas, foram animais usados do ponto de vista positivo e do negativo na literatura religiosa e profana, em bestiários, livros de emblemas e na “Iconologia” de César Ripa já nos finais do século XVI. Com base sobretudo neste último e num confronto com o pensamento político e os movimentos de espiritualidade quinhentistas, procurarei explicar significados nas representações textuais e pictóricas da época, numa abordagem que se insere no “Programa de Estudos Imagética” do Centro de História da Universidade de Lisboa.

A highly stereoselective, one-pot, multicomponent method has been developed to synthesize pyrrolizidine- and N-methyl pyrrolidine-substituted spirooxindole derivatives. The [3 + 2] cycloaddition reaction involves the reaction between the dipole azomethine ylides, generated in situ from the reaction between isatin and secondary amino acids such as L-proline or sarcosine, and α,β-unsaturated carbonyl compounds as the dipolarophile. The reaction condition was optimized to achieve excellent regio- and stereoselectivity. Products were obtained in good yield using ethanol as a solvent at the reflux temperature. The newly synthesized spirooxindole derivatives were evaluated for their antiproliferative efficacy against National Cancer Institute (NCI)-60 cancer cell lines and DNA G-quadruplex (G4) interaction capacity. Compound 14b produced selective cytotoxicity against leukemia, renal, colon, and prostate cancer cell lines at a 10 μM concentration. The G4 interaction studies further suggested that these spirooxindole derivatives were devoid of any activity as DNA G4 ligands.

Development of new immunogens eliciting broadly neutralizing antibodies (bNAbs) is a main priority for the HIV-1 vaccine field. Envelope glycoproteins from non-B-non-C HIV-1clades have not been fully explored as components of a vaccine. We produced Vaccinia viruses expressing a truncated version of gp120 (gp120t) from HIV-1 clades CRF02_AG, H, J, B, and C and examined their immunogenicity in mice and rabbits. Mice primed with the recombinant Vaccinia viruses and boosted with the homologous gp120t or C2V3C3 polypeptides developed antibodies that bind potently to homologous and heterologous envelope glycoproteins. Notably, a subset of mice immunized with the CRF02_AG-based envelope immunogens developed a cross-reactive neutralizing response against tier 2 HIV-1 Env-pseudoviruses and primary isolates. Rabbits vaccinated with the CRF02_AG-based envelope immunogens also generated potent binding antibodies, and one animal elicited antibodies that neutralized almost all (13 of 16, 81.3%) tier 2 HIV-1 isolates tested. Overall, the results suggest that the novel CRF02_AG-based envelope immunogens and prime-boost immunization strategy elicit the type of immune responses required for a preventive HIV-1 vaccine.

Two contemporary 16th century authors, close to the ideas of Christian humanism, one Portuguese, Gil Vicente, the other English, Thomas More, write in the first quarter of the 16th century using the created image of a perfect principality (Castle/Kingdom and the Island of Utopia). This supposedly real archetype is revealed following exploratory land and sea voyages, depending on the case. In comparison with societies whose experience moves away from that model (European societies mainly of Portugal and England), they critically and sarcastically analyse social and mental flaws by way of the use of a carnivalesque narrative discourse. At the same time, they reveal virtues desirable in political ethics and put forward practical civic solutions to correct the regime. The comparative analysis of two testimonials from that era, Utopia by Thomas More (1516) and Frágua d’Amor (Love Forge) by Gil Vicente (c.1525), of their similarities in terms of objectives and discursive techniques but also of their own definitions of identity, enrich our knowledge of mentalities in the Modern Age.

Developing controversies from the historical past of Portugal supposedly divided into cycles of progress and decadence, historians, scholars, politicians and economists from 19th century Portugal resorted to testimonies of previous centuries to prove their theses. The testimonies selected from the 16th and 17th centuries helped them consolidate a black legend of the Portuguese Empire, mostly because of the fragmentation and lack of contextualization to which such discourses were subject. There must be a revision of contemporary concepts and interpretation that requires a close rereading and objective analysis of the discourse of 16th century authors, their complete works, deepening their philosophy of History and the factors that they valued in their time as conditions of progress and decadence, comparing them with each other and with other different testimonies.

Ao abordar o tema das práticas inanceiras na Época Moderna, pode perspectivar-se a análise sob o ângulo da história económica ou da sociologia iscal. Não faltarão, contudo, factores condicionantes sob o ângulo da contabilidade, do direito, da política e mentalidades, da história da arte e da espiritualidade. As fontes de informação da época (textuais/pictóricas) obrigam a metodologias de inquérito e a comentários próprios cujos resultados contribuirão, numa conjugação de esforços interdisciplinares, para um estudo mais aprofundado do tema. Demonstra-se neste artigo como o investigador, face a extensa bibliograia e fontes de tipologia variada, se deve colocar na encruzilhada de vários saberes para pesquisar e esclarecer o estudo do dinheiro e das suas representações, do crédito, dos mercadores e dos mercados, dos agentes de cobrança de impostos, dos poderes políticos e das avaliações sociais, inventariando, enim, e percorrendo uma série de tópicos de relexão necessários ao esclarecimento das matérias a analisar.

Estudo sobre terras e povoamento processual na capitania régia da Baía de Todos Santos criada em 1548, nomeadamente as Ilhas de Itaparica e Itamarandiba tornadas em 1556 capitania hereditária vinculada a um morgado existente no reino e a mais terras do Rio Vermelho associadas desde então às primeiras no que respeita à sucessão, segundo princípios de excepção relativamente aos Bens da Coroa. Na época e posteriormente, práticas que se procuram de aperfeiçoamento e rentabilidade, não apenas numa perspectiva económica e geopolítica, mas também de criação de novas sociedades, mistas, muito embora inspiradas por padrões mentais e de comportamento lusos. Sesmarias e aforamentos. Objectivos geoestratégicos.

Nas Ordenações portuguesas e mais textos jurídicos quinhentistas incentiva-se oficiais da Justiça e da Fazenda, agentes da Casa real e do governo das cidades, vilas e lugares, naturalmente abastados, a uma conduta que não ocasione “corrupção” da Justiça régia. Estabelecem-se recompensas para denunciantes, abrandamento de pena para confissões, sanções (multas, confisco de bens, degredo) para quem presenteia e para quem recebe peitas. Conhecem-se denúncias em Cortes, em escritos e nas artes, e devassas que poderiam macular a imagem régia. Até que ponto as regras do sistema administrativo permitem aos agentes conciliar o ofício com compromissos políticos, lealdades familiares e pessoais?

Under the supervision of Rubén Cucuzza and Pablo Pineau, this work brings together in a complementary and diachronic form a set of studies drawn up by a group of eight researchers. The study consists of an introduction and twelve chapters, whose chronology is situated between the "colonial catechism" and the adoption by Parliament, in July 1952, of La Razón de Mi Vida (supposed autobiography of Eva Péron), as the sole school textbook for the final years of primary school. We are therefore before a long timescale in the history of the teaching and reading and writing, in the contexts of englightenment, liberalism and the nation-state.

This text aims to highligh the action and the social appraisal of mainly mercantile and financial negotiators in the early modern period. The historical background in which they act, that of modernity, leads us to ask questions related to eras and to shifting paradigms, given the promotion of financial and commercial practices in different European regions and their interconnection, and in a much bigger and systematic extension at intercontinental and planetary level. Hence the highlighting of novelties and continuities in the specific dynamics of merchants and in their inclination to be included in social groups, as well as in the techniques and the way they can promote new social and cultural practices as well as a new mind‐set.

Tendo por suporte textos e elaborações pictóricas, procura-se a imagem criada no século XVI que melhor traduza correntes de pensamento político, social e espiritual. Cruzam-se produções de uma centúria (das belas-artes e das belas-letras) que visam o esclarecimento de reflexões sobre o teor divino e a capacidade humana no homem, suas técnicas de organização social, suas opções de conduta moral. Confrontam-se artistas com diferente formação e experiência buscando na sua contemporaneidade confluências e dicotomias.

Atravessando vastos tempos e espaços, a simbologia da Fénix revela-se em contos lendários da China, da Índia ou da Pérsia, variando em pormenores, construindo-se um mito que o Ocidente herdou do Egipto e que ajuda a consolidar na época clássica, medieval e moderna, com projecções ainda na contemporaneidade. Será que a Fénix europeia nada tem de comum com a Fénix chinesa ou seja a Feng-Huang, para lá da criação mítica relacionada com heranças da humanidade e um inconsciente colectivo, depósito de imagens e de símbolos (Jung)? Numa comparação de pormenores acentua-se de comum a carga espiritual, da rara beleza à virtude divina, da santificação e pureza ao amor eterno, à prosperidade e boa governação, da singularidade e excelência ao renascimento e à eternidade.

The period of time in which Francisco Vitória published his discourses on the power of the Church and on the condition of the American Indian was one of tensions involving lay people, jurists and theologians. The Chamber of Conscience (Mesa da Consciência) was institutionalised in 1532 with its ethical and political dimension closely linked to the sovereign. At the same time, the changes introduced in this nation that generated an Empire and in a church that needed reform are highlighted in moralistic discourses and in texts of an ecclesial nature based on pre-tridentine guidelines. Sometimes echoes of Luther appeared to be heard in the theatre… Strong disturbances occurred all over Europe, inciting new currents of spirituality, coming from Christian humanism or Lutheranism, reactions of differing intensities, of compliance or repulsion, demanding de facto political and social readjustments. Until the institutionalisation in 1536 of the Inquisition in Portugal, an instrument of ethical and religious nature and also of social discipline, the crime of heresy was politicised in France under Francis I, the wars of religion were increasingly intense in the Germany of Charles V, and the Act of Supremacy of the English monarch irremediably divided Christianity. This communication, vis-à-vis sensitivities and concerns differing in terms of space, sought to compare attempts to address problems that were so often common and that revealed facets of a simultaneously political and confessional consciousness at the level of regional or state authorities.